兽医流行病学资料课件

兽医流行病学研究资料的来源与收集流行病学研究是建立在事实和材料的基础之上。好的研究材料才能得出好的研究结果。流行病学研究所要求的的资料应该具有真实性、可靠性、完整性、可比性。如果资料缺乏真实性、可靠性、完整性、可比性，无论使用怎样精巧的统计方法或其它方法整理统计分析，都弥补不了其根本缺陷，研究也失去了价值。本章将介绍兽医流行病学资料的性质、来源、收集和贮存。一、概述所谓资料是指收集在一起用作参考或信息的事实，尤其是数字事实。资料可能与临诊症状、治疗和死亡剖检及实验室检查有关。如是进行前瞻性调查研究，必须决定应收集哪些资料。如是进行回顾性调查研究，则可以利用畜牧兽医站、畜禽屠宰场、诊断实验室和其他机构已经收集的资料。因此需要知道所收集的资料类型是否适合于具体的研究所需。第一节 研究资料的性质如：病因推断涉及将动物个体分为有病组和无病组——确定两组的病因因素是否不同：有些资料是观察现象，例如记录腹泻症状。有些资料是观察现象的解释，例如诊断是对临床症状、病变和实验室检查结果等一系列观察现象的解释。解释可能是错误的，即诊断与实际情况不符，结果是某

动物被错误地归入有某病的一组。根据这种错误分类进行分析研究，作出因素和疾病之间联系的任何推断都可能是错误的。体重、奶产量、发病率和死亡率等定量资料都是度量，用于分析这类资料的统计学方法决定于度量的类型。二、资料要素（data

elements)（一）疾病的命名和分类疾病一般按特异病因、病变或机能紊乱以及症状表现三个不同水平命名（图5.la)。例如细小病毒感染（病因）、肝炎（病变）和运动失调（症状）的命名。还有一些疾病是以最初发现的人名或地名来命名的，例如鸡马立克氏病和新城疫。（实际上按病因来命名）。图5.l显示疾病分类有两种方法：根据症状和病变表现；根据病因。流行病学因果研究试图确定病因因素和疾病之间的联系，因为进行研究时一种或几种病因组分还不清楚。这种情况下所研究的疾病常按表现命名。如图5.1b，所研究的疾病按表现（运动失调）命名，则运动失调动物可能由不同病因引起。这里有4种充分原因，它们包括不同的病因组分。这种情况使因果推断非常困难。但如果所有被归入有病的动物都只有一个共同的充分原因，则病因推断就要简单得多。按病因命名有利于病因推断，因为共同的充分原因可能在被归入有病的所有病例中显现。（二）诊断评价诊断评价主要包括诊断指标和标准、敏感性和特异性、可靠性和真实性。1．诊断指标和标准诊断指标分为客观指标和半主观指标。客观指标是用仪器测定的，如用体温计测量体温，用ELISA检测仪测定抗体滴度等。半主观指标是根据诊断者的主观感知判断，如肿块的硬度、肺部的啰音、排出物的气味，可视粘膜的颜色。（客观指标为最好。在兽医上无主观指标，来自畜主的陈述是半主观指标。）

诊断标准又称诊断界限，是用来区分患某病动物和健康动物的诊断指标值。诊断资料的结果常以发病率、患病率、死亡率来表示。如果诊断标准不一致则所得出的率就不一样。如牛布鲁氏菌病血清凝集价，有些患者为1：50，而有些健康动物也可以有这种凝集价。在流行病学调查时应严格按规定的标准进行诊断，不允许随意更改。这样就应该允许有一定程度的

假阳性错误（误诊）或假阴性错误（漏诊）。2．敏感性和特异性如按所定的诊断标准将畜群中的动物分

组，则可出现真阳性、假阳性、真阴性、假阴性四种情况（表5.1)。

表5.1中的金标准（goldstandard）是指目前临床应用的敏感性和特异性都最高

的标准方法，按金标准诊断最接近真实。如用冠状动脉造影诊断冠心病，用分离鉴定细菌的方法诊断产肠毒素性大肠埃希氏菌引起的仔猪黄痢。诊断方法的可靠性是指在重复时产生相似的结果。可重复性。克服的方法是诊断方法的标准化，观察者经过严格训练并采用盲法。三、资料编码资料通常用文字和数字来表示，也可用编码来表示，即将内容和数字用标准化缩写形式的密码来表示。密码通过电脑处理比文字内容更容易、更经济。密码可分为字母密码、数字密码、字母数字密码和符号密码。密码是一种速记形式，比其文字记录简短。如记录密码号274比写出牛传染性胸膜肺炎的内容要简单迅速。（一）密码结构动物资料分两类。第一类是永久性的，如种、品种、出生日期和性别等，又称“墓碑资料”；第二类是与生命期间变化事件有关的资料，如发病日期、病变、试验结果、症状和诊断。（二）数字密码（numeric

codes）以数表示内容，例如用6327代表皮脂溢性皮炎。常用的数字密码系统是北美建立的兽医疾病和手术命名系统，用双轴法编码疾病和手术：疾病通过病变和部位编码，手术通过方法和部位编码。例如：3900.0=由变态反应引起的细支52=输尿管吻合术

诊断：3530气管炎。治疗：723

在例中，诊断包括一部位组分（3530=细支气管）和一病因组分（3900.0=变态反应），治疗也按部位（723)和方法（52)两组分来编码。相继密码和层次密码是常用的数字密码。相继密码是用相继的数字表示资料，例如：层次密码优点：第一，在没有准确的辅助诊断技术，因而不能作出精确诊断时，可以用粗的密码来定义疾病。第二，资料收集者可以根据各自不同的要求确定层次，例如有些人对化疗有专门兴趣，他们可以记录具体的抗生素，而对另一些人记录已使用抗生素就够了，不需明确何种抗生素。（四）字母数字密码（alphanumeric

codes）：用字母和数字两者结合的密码。例如用三轴系统表示疾病的病名、部位和病因（表5.3)：第一根轴的第一部分（字母）与粗的疾病分类有关；第二部分（数字）为细部描述，是简单的层次编码，第二根轴按涉及的解剖系统将疾病分类；第三根轴按病因将疾病分类。如果使用适当的标点符号，字母数字密码可以取代全部文字内容。四、资料度量数字密码可用于表示动物的一种特征，例如患某种疾病。但在兽医学中更常见的是用数字度量患病率、发病率、奶产量、体重、温度和抗体滴度的大小。度量往往是统计分析的基础。不同的度量用不同的统计分析方法。度量可分为离散度量和连续度量。第二节 资料的来源一、概述资料可从基层兽医、农场、诊断实验室、畜禽屠宰场和兽医诊疗所得到。资料收集需要费用。这包括寄调查表的费用和实验室检查的费用。因此资料的价值必须按收集它们花去的费用来判断。

对于不同的资料来源，其资料性质、合作程度、偏倚程度、追溯情况和收集费用有很大差异，这些都是应考虑的问题。疾病地理分布的资料可能难于收集，因为不能追溯患病动物的来源，例如在畜禽屠宰场发现的患病动物。追溯可能很有价值，如追溯与狂犬病患犬有过接触的人和动物。兽医流行病学资料的来源可能是偏倚的，常见的是选择偏倚，所以在收集资料时

应该注意。在发展中国家，资料收集还有问题。诊断实验室设备和技术薄弱、交通不便，资料记录制度不健全和有关人员的素质差都给资料收集带来困难。二、资料的来源（一）政府兽医机构大多国家都设置政府兽医机构。我国政府兽医机构设置包括中央（农业部畜牧兽医局）、省（市、自治区）、地区（市）、县（市）各级。政府兽医机构都有检查报告（表5.5)。各级兽医机构的月报表是重要的资料来源（表7.3)。但有的国家是机密，一般不对外公布。联合国粮农组织FAO、国际兽疫局和世界卫生组织，向各成员国提供动物疫病流行的信息。（二）基层兽医乡、县两级兽医机构，城市里以狗、猫等伴侣动物为服务对象的私人开业兽医——可提供马、奶牛、肉牛、狗、猫等动物的疾病流行情况（表5.6)。对于此资料应注意偏倚问题。（三）畜禽屠宰场屠宰加工设有专职的肉品卫生检验兽医，记录屠宰检验的结果（表5.7）。在检验中详细记录所发现的异常情况，具有流行

病学价值，例如人类暴发疾病与动物疾病的联系。利用屠宰场的病料和样品还可以对血液、痰液、

淋巴结和其他组织作辅助性诊断试验，进行专门

的调查和研究。

肉品检验所检查的动物都来自各畜禽生产单位和地区。如果要把疾病与农场和地区联系起来，就需要追溯有病动物的来源。（四）产业部门畜禽生产单位，尤其是奶牛场，集约化养猪场和养禽场，大都保存完整的生产记录和疾病记录（表5.8)。但资料的准确性和精密性有很大差异。小规模经营的农户，资料的参考价值较小。药物和农业销售部门的记录——提供间接估价动物疾病发生情况的资料。如抗生素销量，可粗略估计细菌性疾病的发生情况。但此估计可能不准确。有关动物生产的记录，例如肉产量、乳产量、蛋产量等，虽不能提供与疾病有直接关系的资料，但却能提供动物群体的组成和分布等有关资料。（五）血清库血清样本的贮存收藏称为血清库。动物血清样品多在作特定疾病的血清学调查时收集。

血清样品在确定优先防疫接种的疾病、流行的周期性、感染的空间分布及新发现传染病的来源等方面可提供有用的流行病学信息。（六）其他来源计划、经济和统计等非兽医政府部门都记录动物数量和分布的资料，人医卫生防疫部门也记录人兽共患病的统计资料。高等或中等农业院校和有关兽医科研机构资料，但研究群体常是偏倚的。动物园和野生动物组织也是提供动物疾病资料的来源。第三节 资料的收集常规数据资料收集包括死亡和发病统计资料以及其他背景资料。一、死亡和发病统计资料对法定应报告传染病造成的死亡和发病数字都

可从各级政府兽医机构的疫情统计报表中得知。每个具体畜群，尤其是集约化饲养的畜群，都有完整的死亡记录。暴发调查和其他来源也可提供死亡资料。死亡统计资料都不够完全、不够准确和不够及时的缺点。所以，常规死亡统计资料并不都适用于流行病学研究。发病统计资料的收集。在我国，畜禽、发病资料的收集主要限于法定应报告的传染病，如畜禽疫情报表都记录有发病资料。各畜禽生产单位都有发病的日常记录；在执行消灭或控制某些疾病的规划过程中，对特定疾病的发病资料记录，如猪瘟、新城疫、布鲁氏菌病和结核病的发病记录；在进行特定研究作的发病记录，如流产记录、肢蹄病记录、牛乳房炎记录等。对特定病原体感染情况的统计资料，也属于发病统计资料的范畴。如屠宰场对畜禽寄生虫感染情况、沙门氏菌污染情况以及血清学检查的资料。国际重要畜禽疾病的死亡和发病的常规资料如FAO/OIE/WHO。二、其他背景资料死亡和发病以外的其他背景资料：（一）自然地理资料

地形、地貌、水文、地质、气候、土壤、植被、野生动物和自然灾害等常规资料，有关政府部门均有详细记录。（二）经济地理资料行政区划分、人口分布、工农业发展状况、畜群结构、畜牧制度、饲养管理等背景资料也可从有关政府部门或其他机构获得。（三）兽医机构及运作资料兽医行业的组织结构、行政管理、技术力量、教育和研究、兽医药品的生产和管理、畜禽卫生保健制度等。三、资料的整理（一）检查收集的资料资料完整性

检查原始记录是否有遗漏和重复，各项目有关资料是否齐全。资料的准确性

检查所有项目是否准确。资料的修正、剔除和补充。（二）设计分组所谓分组，是根据各项目的特征，将同质的资料归并在一起，使资料系统化，以显示内部的规律性。质量分组按事物的性质或类型分组，如疾病分类、死

因分类、种和品种分类、性别和年龄分类等。数量分组在质量分组的基础上，再按变量值的大小来分。如抗体滴度高低等。数量分组的多少决定于资料的性质和资料的多少。数量分组便于进行资料内对比。（三）拟整理表原始资料整理归组后通常用表或图表示，在资料整理中最常用。分组决定后可按研究目的和要求拟定整理表。应注意各项目之间的相互关系，把关系密切的项目放在一个表内，便于进行比较分析（表5.9)。有时整理表需设“不详”栏目，以便把所有结果都列入整理表，保持总计数一致。（四）归组划记法适用于调查资料不多，内容简单的分组归纳。即把原始资料中标志相同的用划记法记数后列入整理表内，一般用“正”字划记，如一丁下正正。分卡法把原始记录卡按项目分为若干组，清点后把原始资料中有价值的内容或项目过录到“过录卡片”，然后再分卡归组。输入电脑把归组资料按一定程序输入电脑。第四节 资料的贮存和调出流行病学资料是疾病的历史档案，需长期保存。本节将介绍兽医资料贮存和调出的方法和兽医资料库。一、非电脑记录法（一）普通书写记录技术一种以普通书写记录资料的方法，目前国内大多数兽医机构、各级兽医站和畜禽场多采用此法。1．日记簿 通常是一种叙事性描述。这种记录在流行病学研究中很难利用。记录卡将病例卡片贮存在抽屉或盒子中。每张卡片一个动物，通常按畜主的名字依字母顺序存放。一个动物的不同卡片按时间顺序排列，可提供病畜完整的历史。记录卡一般有打印的固定栏目，如品种、性别、出生日期等——“封闭”部分；记录卡还有对病畜其他详细情况作记录的空白区——“开放”部分。先形表（profornlas）是一种封闭记录部分项目较多的记录卡，可产生很详细的观察性和解释性资料记录。缺点是栏目繁多，有些临床兽医不愿逐一填写，而且有些栏目的资料价值不大。（二）打孔卡片记录技术打孔卡片可分为项目卡片（边缘缺刻）和特征卡片（中央打孔）两种。项目卡片（item

cards）每一张项目卡片表示一个动物、卡片边缘按一定距离打孔（通常孔距为6-7mm），每孔代表动物的一个特征（属性），当患者具有某项特征时，将相对应的孔剪为缺口。如一只牛是公的，则该牛项目卡片上对应于公牛的孔是缺刻，要寻找所有的公牛项目卡片，只需要将卡片置于盒中，用针穿入相对应的孔并提起，所有的公牛卡片因有缺刻都留在盒内。优点是简便、费用低、省时；缺点是代表的特征项目数受到孔数的限制，卡片孔易于破损，且每次操作的卡片数一般在500张之内。图5.2为寻找有发热症状病畜的例子。2．特征卡片一个特征一张卡片，每张卡片上均有代表具体动物的数字构成的方阵，如某动物具有某卡片规定的特征，则在该卡片与该动物对应的数字位置上打孔。在寻找同时具有几种特征的动物时，可将相应特征卡片叠放在光屏上。试系统卡片上打的孔必须对得很准。打孔机价格昂贵。已用于兽医资料的贮存和调出。二、电脑记录法已广泛用于资料贮存、分析和调出，动物生产、科学研究和行政管理等部门都有使用。国内大

中型的动物生产企业和各级兽医行政管理部门

都已用电脑贮存、分析和调出兽医资料。近年来已出现不少对流行病学研究中数据贮存和分析有用的软件包，如EPI

INFO

(

USDIncorporated

)

, EPI

PAK

(Ep-idemiologyMonitor

)

,

EPIDEMO (

M

.

Beiboer）等。此外还有一些用于动物生产和兽医服务的专用软件，如DHMD (

Dairy

Herd

ManagementSystem

)

,

SUIS (

Swine

User

Infor-orationService）等。三、兽医资料库（一）资料库的类型

资料含有几类，例如动物（项目）的品种、性别、年龄和症状等属性（特征）。有些属性是永久的，是病例特异的，如

动物的品种和出生日期；有些属性各次

记录有变异，是记录特异的，如诊断和

症状。根据资料贮存的方法不同，一个记录各组分之间的联系可以用几种方法分析，产生四种资料库模型。1．记录型资料库是构建资料库的传统方法，中心组分是包含病例特异和记录特异资料的个案记录。临床医生常用这种资料库。由于难于分析记录之间各属性的相关，因

此在流行病学研究中此类资料库用处不大。2．层次型资料库它与下面的网络型资料库和关系型资料库都是用来解释如何在电脑系统中贮存和处理资料的。

在层次型资料库中，资料组分被贮存在呈树状

结构的叉点上。层次的最高水平只有一个叉点，称之为根。根以外的叉点都有一个在更高水平上的叉点与它有关。对于高一层次的叉点，低一层次的叉点称子体，对于低一层次的叉点，高一层次的叉点称母体；在树枝末端的组分称为叶（图5.3)。3．网络型资料库在上述层次型资料库中，如果一子体有一个以上母体，这时就不是严格的层次结构而是网络结构。网络型包括并延伸了层次型。网络型资料库很多资料组分可以相关，有重要的流行病学价值。如果病因因素和疾病作为组分贮存于网络中，则可以分析它们之间的联系（图5．4）。关系型资料库所有的资料都用二维表来表示的一种资料库。二维表有下列特征：表项是单值的，不允许重复组群和数组存在；在一列中的所有项目都是同一类；每一列都有独特名称，列的次序不重要；每一行都是独特的，行的次序不重要。关系型资料库与层次型和网络型资料库不同，主要区别在于层次型和网络型资料库中组分之间的关系是明确表达的，并是预先确定的，在关系型资料中基本资料结构是预先确定的。但记录关系在使用之前是不确定的。由于关系型资料库具有动态反映关系的能力，而且简单，所以有广泛应用价值。（二）资料库的规模小规模资料库收集在农场或研究机关分开的动物群体内部的疾病问题，例如很多畜群的保健和生产计划是

典型的小规模资料库，记录个体和畜群的性能

和生产力以及疾病，找出生产力和疾病的关系。中规模资料库涉及较广范围的疾病问题，例如畜禽屠宰场、诊断实验室和兽医诊疗所的资料收集。资料从其来源传送到负责分析的机构。大规模资料库涉及到全国范围的疾病问题，以此为目的收集资料。全国性或国际性的疾病监测规划是典型的大规模资料库。（三）兽医资料库和信息系统举例ANADIS是澳大利亚全国动物疾病信息系统（theAustralian

National

Animal

DiseaseInformation

System)的缩写。它包括遍布于整个澳大利亚贮存区域性兽医资料的电脑网络。原来是为消灭结核和布鲁氏菌病的规划而建立的，现在还包括记录诊断实验室资料，与外来病暴发有关的资料、国家血清库及保健和生产计划。

OIE

是国际兽疫局（OfficeInternational

des

Epizooties）的简称。

1924年建立，记录全世界主要动物传染性流行性疾病的资料。丹麦猪屠宰检验资料库含有在屠宰时收集的猪剖检资料。丹麦

大多数肥育猪的资料都记录于该库，所

以它不仅是中规模的资料收集项目，而

且也行使全国性大规模监测系统的职能。4．爱丁堡小动物诊疗教学单位临床记录系统（

Edinburgh

SAP

TIJ

clinicalrecording

sys-tem）记录从爱丁堡兽医学院小动物诊疗教学单位来的临床病例摘要，因此是中规模资料库。资料以相继的数字密码输入。该资料库使用网络型资料库管理系统，便于提供病例记录组分的相关。5.

VIDA

II

是兽医调查研究诊断分析系统（Veterinary

Investigation

DiagnosisAnalysis)的缩写，为中规模资料库，由送到英国各兽医调查研究实验室的样品

记录构成。这些样品是志愿寄送的，仅

是所有死后剖检和实验室样品的一部分。原来用打孔卡作贮存媒介，现在已改用

大容量电脑贮存资料。6

.COSREEL

是记录经济上重要家畜有关事件电脑系统（Computer

system

for

RecordingEvents

affecting

Economically

importantLivestock)，为英国的保健和生产资料库。有些奶牛场及其地方兽医机构使用该系统。资料库保存于大容量电脑。资料依字母顺序编码，通过邮寄或通过外周输入和输出终端存入。这是一个小规模资料库，因为它产生畜群管理核对单；但它也是中规模资料库，因为从几个农场来的资料可以用作流行病学研究。数据来源显示有选择偏倚，但提供了对流行病学研究有用的很多资料。7.

VMDB

是兽医数据库（Veterinary

Medical

DataBase）的缩写，以前称为兽医数据程序（VMOP)，由北美几个兽医学院参加的合作性中规模数据库。数据用

SNVDO密码编码。