【蛋白质组学技术研究的文献综述2900字】

致谢蛋白质组学技术研究的文献综述1.1蛋白质组学概述蛋白质组这个概念起初是由MarcWikins[21]于1994年在一次会议中提出的，蛋白质组学主要围绕着蛋白质组进行研究，研究内容为蛋白质的组成及其在整体水平上的变化规律[22]。蛋白质组学技术已经成为了蛋白质水平上大规模研究中强有力的工具，得到国内外科学家们的热切关注。蛋白质组学迅速发展技术日渐成熟，蛋白质组学现如今已经广泛的应用到了药物开发、遗传病学、微生物学、疾病研究、植物研究、食品科学等领域[23-26]。1.2蛋白质组学研究方法概述（1）常用分离技术双向凝胶电泳（2-DE）是拥有较长发展历史的比较经典的一项分离方法，这项技术主要根据样品中蛋白质的等电点以及分子量的不同，达到了将蛋白质按照梯度的方式逐级分离的目的[27][28]，虽然这项技术具有很好的发展历史，但是仍存在一些缺点，比如对蛋白质具有偏好性，一些低丰度蛋白、碱性蛋白、难溶蛋白质则很难使用这项技术将其分离，并且还存在例如电泳图谱具有较低的重复性和分辨率等一些亟待解决的问题[29]。色谱技术，是液相色谱以及气相色谱为主的分离技术。日常中大多使用的是高效液相色谱（HPLC）。它既可以独立进行分离，又可以串联质谱仪（HPLC-MSM），是现如今最常用且占据主流地位一种方法。HPLC和传统的2-DE技术相比，操作相对简便，拥有较高的灵敏度及较好的重复性，并且十分容易实现自动化等优点[30]。（2）常用鉴定技术质谱技术作为一项在当今社会发展迅速且适用范围极为广阔的蛋白质鉴定技术，深受科研工作者的喜爱[31]。质谱技术的主要原理是轰击进入离子源的待测样品并使其分子离子化，然后根据其质荷比（M/E）的不同将其分离和进行成分结构分析。而常用的手段是将待测样品使用电泳进行分离得到目标胶段进行酶解成胶段，或者直接将样品进行酶解工作得肽段，然后对分离得到的肽段经由质谱进行鉴定分析[32]。质谱仪器通常由离子源、质量分析器和检测器组成。这些质量分析器不仅可以单独使用或也可以根据不同的需求来进行串联使用，常见的有MALDI-TOF-MS、QQQ-MS、MS-MS、Q-TOF等[33]。蛋白质组学的样品可以是细胞裂解物，也可以是组织的提取物。它不仅能够确定蛋白质的结构，而且可以进行更进一步的翻译后修饰的鉴定，研究蛋白质与底物之间，或研究与其它蛋白质之间的相互作用，并且定量的评估蛋白质的表达水平。基于质谱的蛋白质和多肽分析方法已成为研究生物系统的主要技术[34][35]。（3）生物信息学技术生物信息学技术是伴随着现代化社会中计算机信息技术的蓬勃发展以及互联网信息技术的广泛使用，伴随着人类基因组计划的实施进而产生出来的，已经成为了蛋白质组学重要的信息技术平台。生物信息学主要由计算机科学、数学统计学以及生物医学等工具组成，从而进行数量庞大且极为复杂的生物信息数据分析，探讨数据背后所隐藏着的生物学意义。他的两个最为主要的应用：一是通过已知测序的全基因组序列预测对应全蛋白质序列、建库；二是通过与现有并已知的蛋白数据库进行比较，解析由LC-MS/MS系统采集的海量谱图数字[36]。此外，生物信息学在蛋白质功能、相互作用以及蛋白质结构的预测中起着极为关键的作用。瑞士的UNIPROT数据库是蛋白质组学中最权威且最常用到的数据库，当然还有NCBI（美国国立生物技术信息中心）、PDB（结构蛋白质组数据库）等也被广泛使用。1.3在胶类真伪鉴别中的应用程显隆等[34]为建立不同胶类药材掺杂杂皮的真伪辨别方法。将酶解后的胶类样品进行序列比对分析，成功得到了龟甲胶、鹿角胶、阿胶的特征性肽段，合成分析得到的肽段，使用多反应检测（MRM）建立具有专属性的鉴别方法并对其准确性进行了验证。唐敏[37]为建立巴西龟以及中华草龟为来源的龟甲胶中掺杂着牛皮源成分的鉴别方法，使用药监局出台规定中的的牛皮特征肽作为检测的主要对象，建立了从巴西龟中鉴定是否掺杂牛皮的专属性方法。石峰[38]等通过生物信息技术对待测样品进行模拟酶切，获得理论结果的特征肽段，并使用液质联用技术对理论结果进行了进一步的验证，最终成功的建立了属于阿胶的专属鉴别分析方法。巩丽萍[39]等筛选得到了马皮胶的特征肽段，并对市面上贩卖的阿胶商品进行真伪鉴别，其中部分商品中能够检测到马皮特征肽，为市面上贩卖的阿胶中掺杂马皮的真伪鉴别提供了方法。杭宝建[40]等对驴、马、羊、猪、鹿皮、牛、骆驼源的胶原蛋白进行序列比对，模拟酶切，对筛选到的各种特征肽进行了进一步的验证实验，建立质谱方法，并对市面上的15批阿胶产品进行检测，在部分样品中检出了杂皮源成分。王芳[41]等通过对比驴、牛、猪皮的I型胶原蛋白中α1链氨基酸序列，进而使用UPLC-QTOF/MS进行检测鉴定与验证。其中12个理论性特异性肽中验证得到了1条专属驴皮特征性肽段，并对10批阿胶的样品进行了特征性肽段的鉴定。刘宇文[42]将胶原蛋白进行酶解,利用MASCOT搜库结合二级质谱图分析，找到巴西龟胶特征肽段,使用多反应监测的手段成功的建立了龟甲胶（浙龟甲）区分巴西龟来源的专属性鉴别方法。并对市面上贩卖的的20批样品进行了真伪鉴别,其中有11批样品中能够检测出巴西龟的成分。RuiLiu[43]等采用非靶向和靶向质谱方法分析胰蛋白酶消化动物皮胶类的混合多肽。使用数学集合理论的方法来筛查不同样本和目标物种集合中肽之间的关系，验证得到了2个鹿皮胶区别于猪马牛羊皮胶的特征肽段，建立了专属的检测方法，并进行了不同比例混合的各种胶类中鹿皮胶特征肽的检出。参考文献董万超,张宝香.鹿皮胶的制作[J].特种经济动植物,1998(03):3-5.北京市卫生局.北京市中药炮制规范[M].北京市卫生局,1986：351.董洪霜,张静娴,胡青,孙健,冯睿,张甦,于泓,季申.胶类中药质量控制研究进展[J].中草药,2018，49(13):3166-3173.周芳妍,刘力.胶类中药质量控制方法研究进展[J].中国药业,2013,22(01):1-3.李光玉.疫情下中国梅花鹿产业的机遇与挑战[J].畜牧产业,2020(07):52-54.宋胜利,宋文辉,史文清,刘国世,赵广华.中国药用鹿科动物简述[A].中国畜牧业协会、辽宁省外经贸厅、辽宁省服务业委员会、铁岭市政府.第六届(2015)中国鹿业发展大会论文汇编[C].中国畜牧业协会、辽宁省外经贸厅、辽宁省服务业委员会、铁岭市政府:中国畜牧业协会,2015:8.杨镒峰,陈秀敏,赵伟刚,古革军,魏海军.我国驯鹿养殖现状与发展策略的研究[A].中国农业科学技术出版社.“十二五”鹿科学研究进展[C].:中国畜牧业协会,2016:4.王建辉,李琦,刘在群等.鹿皮胶原的提取与性质[J].吉林大学自然科学学报,2001,1:106-108.张磊,王燕华,刘畅,宫瑞泽,李珊珊,孙印石.驴皮胶及鹿皮胶的化学品质分析与评价[J/OL].食品科学：1-9+11-15[2018-11-23].朱连连,窦德强.阿胶、鹿皮胶中蛋白质及氨基酸含量测定[J].亚太传统医药,2018（6）都帅.鹿皮胶熬制工艺优化及免疫调节机制研究[D].吉林农业大学,2019.张宝香,姜英,邵建新.鹿皮胶软胶囊免疫调节作用研究[J].特产研究,2008(01):19-21.郭骏骐,黄晓巍,张永和.鹿皮胶对血虚模型小鼠造血功能及免疫功能的影响[J].中国老年学杂志,2010，30(01):67-68.曲绍春,曲极冰,刘洁,马秀俐,张景文,孙允秀.鹿胶原对环磷酰胺所致小鼠白细胞减少的影响[J].长春中医学院学报,1996(01):57.杨丽,黄晓巍,张永和.鹿皮胶对失血性血虚动物模型的影响[J].吉林中医药,2008(11):841-842.李冬,李宏宇,黄晓巍,张永和.鹿皮胶对环磷酰胺所致血虚动物模型影响的实验研究[J].长春中医药大学学报,2010,26(05):652-653.谭晓虹.鹿皮胶的制备及功能研究[D].山东师范大学,2012.董万超,张宝香.鹿皮胶的制作[J].特种经济动植物,1998(03):23.张宝香.鹿皮膏的加工[J].农村实用科技信息,2002(04):32.齐越.超声波辅助法酶解鹿皮胶原蛋白及其产品研发[D].吉林大学,2014.WasingerVC,CordwellSJ,Cerpa-PoljakAetal.Progresswithgene-productmappingoftheMollicutes:Mycoplasmagenitalium.[J].Electrophoresis,1995,16:1090-4.PandeyA,MannM,Proteomicstostudygenesandgenomes.[J].Nature,2000,