CN119399401A 囊胚的三维拟合重建方法、装置、电子设备和存储介质 （广州市华粤行医疗科技有限公司）

本申请提供了一种囊胚的三维拟合重建方取囊胚的多个焦平面图像，基于多个焦平面图掩膜，根据滋养层细胞的掩膜和内细胞团的掩2根据所述滋养层细胞的掩膜和内细胞团的掩膜，分别构建滋养层细胞根据所述滋养层细胞网格模型、所述内细胞团网格模型以及所述内部三维点云模型，从所述多个焦平面图像对应的多个焦平面中，确定所述各像素点的清对所述多个第一焦平面图像进行插帧处理，得到所述囊胚若所述多个焦平面图像中存在目标焦平面图像，则将所述目标根据所述多个焦平面图像对应的预设标记图形，分别在所述多个焦对位于所述滋养层细胞区域内部的内细胞团区域进行识别，得到所述内细胞团的掩确定所述多个焦平面图像对应的多个焦平面中的预设焦平面为所述滋养层细胞的最根据所述多个焦平面图像中所述内细胞团的掩膜的面积，从所述多3根据所述滋养层细胞的最佳焦平面，确定所述滋养层细胞网格模型的三维位置所述根据所述滋养层细胞网格模型、所述内细胞团网格模型以及所述内根据所述滋养层细胞网格模型的三维位置，对所述滋养层细胞网格根据所述多个焦平面图像中所述内细胞团的掩膜的面积，从所述将所述目标焦平面图像中的所述内细胞团的掩膜作为分割掩膜，对根据所述多个分割焦平面图像的清晰度，从所述多个焦平面中确定识别模块，用于基于所述多个焦平面图像，识别所述囊胚中滋养构建模块，用于根据所述滋养层细胞的掩膜和内细胞映射模块，用于根据所述纹理图像和所述深度图进行平面映射所述构建模块，还用于根据所述滋养层细胞网格模型、所述内细胞团所述映射模块，还用于将所述纹理图像映射到所述三维几何模型4[0007]基于所述多个焦平面图像，识别所述囊胚中滋养层细胞的掩膜和内细胞团的掩[0020]对所述多个第一焦平面图像进行插帧处理，得到所述囊胚的多个第二焦平面图5[0029]确定所述多个焦平面图像对应的多个焦平面中的预设焦平面为所述滋养层细胞[0031]根据所述滋养层细胞的最佳焦平面，确定所述滋养层细6[0053]对所述多个第一焦平面图像进行插帧处理，得到所述囊胚的多个第二焦平面图[0063]所述确定模块，还用于根据所述多个焦平面图像中所述从所述多个焦平面中确定所述内细胞团的最佳7[0077]图3为本申请实施例提供的滋养层网格模型和内细胞团网格模型的构建过程示意8[0095]随着人工授精(ArtificialInsemination，ART)和人工智能(Artificial创三维拟合重建成为可能，而现阶段大多数的胚胎学家愿意选择时差(Timelapse)所获取像的方式获取Z_stack(基于Z轴的堆栈图像集)的序列荧光切片数据进行三维模型的重建，9[0100]图1为本申请实施例提供的囊胚的三维拟合重建方法的流程示意图一，本实施例曼调制对比显微镜成像的特殊性，使得焦平面图像具有浮雕感(细胞边缘有强烈的对比得到立体的滋养层细胞的三维模型和内细胞团后根据法线计算和曲面重构算法将滋养层细胞的点云拟合模型和内细胞团的点云拟合模[0112]图3为本申请实施例提供的滋养层网格模型和内细胞团网格模型的构建过程示意[0115]其中，深度估计法可以为基于传统对焦测距算法(DeepFlowFieldFusion，DFF)，该方法是通过同一视野范围内通过调整不同Z轴位置获取到不同离焦程度的图像数中，图像融合方法有以下几种方案Densefuse_net、FusionNet、U2FusionNet：优选为：[0127]由于HMC是一种基于明场成像的方式，囊胚表面组成主要是由透明带和TE细胞构面平行于球体模型的半球面的赤道面，并与半球面相切于正极点A而将投影中心置于球面[0134]图6为本申请实施例提供的囊胚的三维拟合重建方法的流程示意图二，如图6所[0136]对焦平面图像中各像素点进行清晰度提取，得到焦平面图像中各像素点的清晰(x,y)，选择一个由其近邻的若干像素点组成的模板，求模板中所有像素的深度值的平均[0144]图7为本申请实施例提供的囊胚的三维拟合重建方法的流程示意图三，如图7所[0150]图8为本申请实施例提供的囊胚的三维拟合重建方法的流程示意图四，如图8所[0164]在本实施例中，由于HMC明场成像的特殊性，为了消除相邻层之间伪影图像的干[0170]获取多个焦平面图像中内细胞团的掩膜的面积，并根据从多个焦平面中确定内细胞团的掩膜最清晰的最佳[0174]根据多个分割焦平面图像的清晰度，从多个焦平面中确定内细胞团的最佳焦平掩膜面积最大的目标焦平面，然后将目标焦平面图像中的内细胞团的面积作为分割掩膜，多个分割焦平面图像中清晰度最大的焦平面图像对应的[0177]值得说明的是，滋养层细胞的最佳焦平面可以理解为滋养层细胞的掩膜的赤道格模型的平面位置即X值Y值将内细胞团的最佳焦平面的Z[0211]确定模块708，用于确定多个焦平面图像对应的多个焦平面中的预设焦平面为滋[0219]根据多个分割焦平面图像的清晰度，从多个焦平面中确定内细胞团的最佳焦平[0223]在本申请实施例中，该计算机程序被处理器运行时还可以执行其它机器可读指算机软件产品存储在一个存储介质中，包括若干