CN119410778A 胶质瘤患者分层预后生存风险率的评估方法和系统 （浙江大学）

胶质瘤患者分层预后生存风险率的评估方本发明提供胶质瘤患者分层预后生存风险待测胶质瘤患者肿瘤标本转录组测序中13种量数据获得待测胶质瘤患者预后生存风险率评本发明提供的胶质瘤患者分层预后生存风险率的评估方法，有助于对胶质瘤患者进行分层预治疗效率，为胶质瘤精准医疗提供一种解决思2获取待测胶质瘤患者肿瘤样本转录组测序结果中13种LncRNA的表达将所述13种LncRNA的表达量数据输入至胶质瘤患者步骤2、通过Kaplan_Meier生存分析从TCGA数据库中胶质瘤患者分层预后生存风险评分=(Coef1*AC004067.1的表达量)+(Coef2*AC012213.1的表达量)+(Coef3*AC012213.1的表达量)+(Coef4*AC015922.3的表达量)+(Coef5*AC020915.3的表达量)+(Coef6*AC020916.1的表达量)+(Coef7*AC025171.1的表达量)+(Coef8*AC025171.5的表达量)+(Coef9*AC026401.3的表达量)+(Coef10*AC064875.1的表达量)+(Coef11*AC093673.1的表达量)+(Coef12*AC120036.4的表达量)+(Coef13*数据获取模块，用于：获取待测胶质瘤患者肿瘤样本转录组测序结果数据处理模块，用于：将所述13种LncRNA的表达量数据3获取待测胶质瘤患者肿瘤样本转录组测序结果中13种LncRNA的表达将所述13种LncRNA的表达量数据输入至权利要求1_4任一项所述的胶质瘤患者分层预根据所述待测胶质瘤患者预后生存风险率评分，筛选对待测9.一种电子设备，包括存储器、处理器及存储在的待测胶质瘤患者分层预后生存风险率的评估方法或者权利要求7_8任一项所述的胶质瘤机程序被处理器执行时实现如权利要求1_4任一项所述的待测胶质瘤患者分层预后生存风险率的评估方法或者权利要求7_8任一项所述的胶质瘤患者治疗药物的辅413种LncRNA对应的基因分别为AC004067.1、AC012213.1、AC012213.1、AC015922.3、将所述13种LncRNA的表达量数据输入至胶质瘤患者分层预后生存风险率评估模[0009]上述评估方法中，13种LncRNA对应的转录基因根据人参考基因组GRCh38/hg38版5胶质瘤患者预后生存风险率评分=(Coef1*AC004067.1的表达量)+(Coef2*AC012213.1的表达量)+(Coef3*AC012213.1的表达量)+(Coef4*AC015922.3的表达量)+(Coef5*AC020915.3的表达量)+(Coef6*AC020916.1的表达量)+(Coef7*AC025171.1的表达量)+(Coef8*AC025171.5的表达量)+(Coef9*AC026401.3的表达量)+(Coef10*AC064875.1的表达量)+(Coef11*AC093673.1的表达量)+(Coef12*AC120036.4的表达量)+(Coef13*6数据获取模块，用于：获取待测胶质瘤患者肿瘤样本转录组测序结果中13种LncRNA的表达量数据，所述13种LncRNA对应的基因分别为AC004067.1、AC012213.1、瘤患者分层预后生存风险率评分小于预设阈值时，则判定所述待测胶质瘤患者的预后较713种LncRNA对应的基因分别为AC004067.1、AC012213.1、AC012213.1、AC015922.3、将所述13种LncRNA的表达量数据输入至上述任一所述的待测胶质瘤患者分层预患者分层预后生存风险率的评估方法或者上述胶质瘤患者治疗方式的临床决策辅助方法所述计算机程序被处理器执行时实现上述待测胶质瘤患者分层预后生存风险率的评估方法或者上述胶质瘤患者治疗方式的临床决策辅助方法或者上述胶质瘤患者治疗药物的辅[0025]图1为胶质瘤患者的预后生存风险率评分和生存时间的统计结果和13种LncRNA的图2为13种LncRNA在不同胶质瘤亚型中的表达量分析结果；其中,A为经典型胶质like共7种胶质瘤甲基化亚型中13种LncRNA的表达量分析结果；D为IDH突变1p/19q共缺失（glioblastoma）、少突星形细胞瘤（Oligoastrocytoma）、少突神经胶质瘤8亚型患者中TAMSig和生存时间的相关性分析结果，B为C2亚型患者中TAMSig和生存时间的图4为胶质瘤患者接受不同治疗方式治疗后TAMSig和生存时间的相关性分析结接受化疗后TAMSig和生存时间的相关性分析结果；C为胶质瘤患者接受靶向治疗后TAMSig关性分析结果，C为不同胶质瘤亚型和TAMSig的相关性分析结果，D为不同胶质瘤亚型和罗可维汀对CD8+T细胞和CD4+T细胞的流式细胞仪检测结果，I为罗可维汀对CD8+T细胞9[0030]步骤3、利用L1惩罚法从候选基因中筛选出L1惩罚法回归系数不为零的多种间质型胶质瘤（Mesenchymal，ME）、神经型胶质瘤（Neural，NE）、前神经元型胶质瘤示。示。[0039]根据胶质瘤的串通病理分型，对星形细胞瘤（astrocytoma）、胶质母细胞瘤（glioblastoma）、少突星形细胞瘤（Oligoastrocytoma）、少突神经胶质瘤[0040]根据RoelVerhaak在2010年的研究中提出的，将胶质母细胞瘤分为四种亚型C1_根据胶质瘤母细胞瘤C1_C4亚型患者的TAMSig中位数，将每种亚型患者分为高TAMSig反映胶质瘤患者对不同治疗方法预[0045]采用相同的分析方法，根据患者TAMSig的中位数，将患者分为高TAMSig组和低TAMSig，并根据高TAMSig组和低TAMSig组患者在接受肿瘤切除手术后是否进行化疗治疗，将患者分为三组，分别为高TAMSig化疗胶质瘤患者、低TAMSig化疗胶质瘤患者以及高[0046]采用相同的分析方法，根据患者TAMSig的中位数，将患者分为高TAMSig组和低TAMSig，并根据高TAMSig组和低TAMSig组患者在接受肿瘤切除手术后是否进行靶向治疗，1p19q_codetion（发生1p和19q染色体臂共缺失）、MGMT_状态(MGMT_status)、ATRX状态 聚类(Methylation_Cluster)作为参数分别进行单因素和多因素回归分析，得到风险比G_CIMP_low/LGm6_GBM/Mesenchymal_like/PA_like）以及胶质瘤类型（星形细胞瘤Astrocytoma/胶质母细胞瘤Glioblastoma/少突星形细胞瘤Oligoastrocytoma/少突胶质[0063]IL_6是TAMs自我维持的重要组成部分和代表性标记。通过对小鼠脾脏细胞上清以对前述各实施例所记载的技术方