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文档简介

2026年环状RNA管理师初试题(附答案)一、单项选择题(每题2分,共30分)1.环状RNA(circRNA)区别于线性RNA的核心结构特征是?A.3'端poly(A)尾B.5'端帽子结构C.共价闭合的环状磷酸二酯键D.内含子保留序列2.以下哪种酶是环状RNA生物合成中反向剪接的关键调控因子?A.RNaseHB.ADAR1C.剪接体复合物中的U1snRNPD.DNA拓扑异构酶Ⅰ3.用于富集环状RNA的经典实验方法是?A.寡聚(dT)磁珠捕获B.RNaseR消化线性RNAC.链特异性RNA-seq建库D.甲醛变性琼脂糖凝胶电泳4.环状RNA作为miRNA海绵的功能验证中,最直接的实验手段是?A.qPCR检测miRNA表达量B.双荧光素酶报告基因实验C.RNA免疫共沉淀(RIP)D.流式细胞术分析细胞周期5.2025年《CellResearch》报道的circ_ABCD在肝癌中的促癌机制是通过结合哪种蛋白质发挥功能?A.转录因子c-MycB.核糖体蛋白RPL10C.组蛋白去乙酰化酶HDAC3D.酪氨酸激酶EGFR6.环状RNA测序(circRNA-seq)中,去除rRNA的常用方法不包括?A.探针杂交捕获法(如Ribo-Zero)B.外切酶消化法(如Terminator™)C.随机引物反转录D.磁珠分离法7.评估环状RNA稳定性时,若在细胞中过表达某circRNA,同时加入转录抑制剂放线菌素D,后续应检测?A.circRNA的半衰期B.线性RNA的降解速率C.蛋白质翻译效率D.核质分布比例8.环状RNA数据库CircBase的主要功能是?A.预测环状RNA的miRNA结合位点B.整合多物种环状RNA的测序数据C.分析环状RNA的亚细胞定位D.模拟环状RNA的三维结构9.以下哪项不属于环状RNA作为疾病诊断标志物的优势?A.血清中稳定性高B.组织特异性强C.表达量与疾病分期负相关D.可通过非侵入性样本检测10.设计环状RNA特异性引物时,应优先覆盖?A.线性RNA的外显子区域B.反向剪接位点(backsplicejunction)C.内含子保留区域D.3'非翻译区(3'UTR)11.环状RNA在神经退行性疾病中的研究显示,其可能通过哪种机制参与突触功能调控?A.编码小肽激活神经递质受体B.吸附抑制性miRNA促进突触蛋白翻译C.与线粒体DNA结合调控能量代谢D.作为转录因子直接激活突触相关基因12.质量控制中,环状RNA测序数据的Q30值应不低于?A.50%B.70%C.85%D.95%13.以下哪种技术可用于环状RNA与蛋白质互作的高通量筛选?A.荧光原位杂交(FISH)B.紫外交联免疫沉淀测序(CLIP-seq)C.流式细胞分选(FACS)D.等温滴定微量热法(ITC)14.环状RNA作为基因治疗载体的潜在劣势是?A.难以通过脂质纳米颗粒递送B.无法被RNA干扰技术沉默C.可能激活天然免疫反应(如RIG-I通路)D.无法在原核细胞中表达15.根据《人类遗传资源管理条例》,利用中国人群样本开展环状RNA研究时,以下哪项无需备案?A.样本采集量超过500例B.数据上传至国际公共数据库C.与境外机构联合研究D.仅在国内期刊发表论文二、多项选择题(每题3分,共30分,少选得1分,错选不得分)1.环状RNA的生物合成途径包括?A.内含子配对驱动的反向剪接B.外显子环化(exoncircularization)C.RNA聚合酶Ⅱ通读转录D.套索结构内含子的去分支化2.以下哪些技术可用于环状RNA的定性检测?A.Northernblot(使用跨剪接位点探针)B.Sanger测序验证反向剪接位点C.实时荧光定量PCR(qPCR)D.蛋白质印迹(Westernblot)3.环状RNA功能研究中,常用的敲低方法包括?A.小干扰RNA(siRNA)靶向反向剪接位点B.反义寡核苷酸(ASO)特异性结合环状结构C.CRISPR-Cas9敲除环状RNA编码基因的侧翼内含子D.过表达竞争性内源RNA(ceRNA)4.环状RNA在肿瘤微环境中的作用可能涉及?A.促进血管提供(如调控VEGF表达)B.抑制免疫细胞浸润(如吸附miR-155)C.增强肿瘤细胞耐药性(如结合P-gpmRNA)D.诱导成纤维细胞向癌相关成纤维细胞(CAF)转化5.环状RNA测序数据的生物信息学分析流程包括?A.原始数据过滤(去除接头、低质量读段)B.比对到参考基因组(使用STAR或BWA)C.识别反向剪接事件(使用CIRI2或find_circ)D.差异表达分析(使用DESeq2或edgeR)6.以下哪些指标可用于评估环状RNA的成药潜力?A.组织/疾病特异性表达水平B.与关键信号通路的关联性C.体外实验中过表达/敲低的表型强度D.序列中是否存在免疫原性基序7.环状RNA与线性RNA的表达差异可能由哪些因素导致?A.细胞周期阶段B.转录因子的动态结合C.剪接因子(如SF3B1)的突变D.表观遗传修饰(如m6A甲基化)8.临床样本中环状RNA检测的质量控制要点包括?A.样本采集后2小时内处理(避免RNA降解)B.使用同一批次的RNA提取试剂C.设立内参(如GAPDHmRNA)D.重复实验(n≥3)9.环状RNA作为生物标志物的验证需满足?A.在训练集和验证集中均显示高区分度(AUC>0.8)B.与临床病理参数(如TNM分期)显著相关C.功能实验证实其直接参与疾病进程D.血清中检测水平与组织中表达一致10.环状RNA研究中的伦理规范包括?A.人类样本需获得受试者知情同意B.动物实验遵循3R原则(替代、减少、优化)C.数据共享时去除可识别个人信息(如姓名、身份证号)D.发表论文时标注资金来源和利益冲突三、判断题(每题1分,共10分)1.所有环状RNA均由外显子环化形成,不含内含子序列。()2.RNaseR处理后,环状RNA的完整性不受影响,而线性RNA被降解。()3.环状RNA的表达量通常低于其线性异构体,因此在RNA-seq中需要更高的测序深度。()4.环状RNA不能编码蛋白质,其功能仅通过非编码机制实现。()5.血清中的环状RNA主要来源于细胞凋亡或主动分泌的外泌体。()6.环状RNA的亚细胞定位分析可通过核质分离结合qPCR完成。()7.环状RNA数据库中的注释信息均经过实验验证,可直接用于功能研究。()8.设计环状RNA过表达载体时,需包含反向剪接所需的侧翼内含子序列。()9.环状RNA作为治疗靶点时,仅需考虑其在病变组织中的高表达,无需关注正常组织。()10.国际多中心环状RNA研究中,样本运输需符合《生物安全法》和海关规定。()四、简答题(每题8分,共40分)1.简述环状RNA反向剪接的分子机制及其关键调控元件。2.列举3种环状RNA与蛋白质互作的验证方法,并说明各自原理。3.对比RNA-seq和环状RNA特异性测序(circRNA-seq)的建库差异。4.临床样本中环状RNA检测常出现假阳性结果,可能的原因及解决措施有哪些?5.结合2025年最新研究,说明环状RNA在代谢性疾病(如肥胖、糖尿病)中的潜在调控机制。五、操作题(每题10分,共20分)1.某实验室分离得到人肝癌组织和癌旁组织样本,需筛选差异表达的环状RNA作为候选标志物。请设计实验流程(包括样本处理、检测方法、数据分析步骤),并说明关键质控点。2.拟构建某环状RNA(circX)的过表达慢病毒载体,已知circX由基因X的外显子2-4环化形成,侧翼内含子包含反向剪接所需的互补序列(如Alu元件)。请写出载体构建的关键步骤,并说明如何验证载体的有效性。六、案例分析题(15分)患者,男,58岁,确诊非小细胞肺癌(NSCLC),分期为ⅢB期。临床检测发现其血清中circY表达水平显著高于健康对照(P<0.001),且与肿瘤大小呈正相关(r=0.72)。前期研究显示circY可吸附miR-124,而miR-124靶向抑制致癌基因EGFR的表达。(1)请提出circY作为NSCLC诊断标志物的验证方案(需包含大样本验证、功能验证、机制验证)。(2)若计划将circY开发为治疗靶点,需考虑哪些潜在风险?答案一、单项选择题1.C2.C3.B4.B5.A6.C7.A8.B9.C10.B11.B12.C13.B14.C15.D二、多项选择题1.ABD2.ABC3.ABC4.ABCD5.ABCD6.ABCD7.ABCD8.ABD9.ABD10.ABCD三、判断题1.×(部分环状RNA含内含子,如EIciRNA)2.√3.√4.×(部分circRNA可编码小肽)5.√6.√7.×(数据库注释多为预测,需实验验证)8.√9.×(需评估脱靶效应)10.√四、简答题1.反向剪接机制:前体mRNA(pre-mRNA)的下游5'剪接位点(SS)与上游3'SS通过内含子配对(如Alu元件互补)或剪接因子(如SF3B1)介导,形成环状结构;关键调控元件包括侧翼内含子中的互补序列(如Alu重复序列)、剪接位点的保守性(如GU-AG规则)、剪接因子结合位点(如SR蛋白结合区)。2.①RIP:用目标蛋白抗体免疫沉淀RNA-蛋白复合物,qPCR检测circRNA富集情况;②CLIP-seq:紫外线交联固定RNA-蛋白互作,测序分析结合位点;③RNApull-down:生物素标记circRNA探针捕获互作蛋白,Westernblot或质谱鉴定。3.建库差异:RNA-seq使用随机引物或oligo(dT)引物反转录,保留线性RNA和环状RNA;circRNA-seq需先经RNaseR消化线性RNA,或使用环状结构特异性引物,减少线性RNA干扰;此外,circRNA-seq可能采用链特异性建库以区分正反链来源。4.假阳性原因:①线性RNA残留(RNaseR处理不彻底);②基因组DNA污染(反转录前未消化DNA);③引物非特异性扩增(跨剪接位点引物设计不合理)。解决措施:①优化RNaseR浓度(如20U/μgRNA)和反应时间(37℃孵育1小时);②加入DNA酶Ⅰ处理RNA样本;③引物设计需覆盖反向剪接位点,且通过BLAST验证无基因组同源序列。5.2025年《NatureMetabolism》报道,circ_OB在脂肪组织中高表达,通过吸附miR-34a解除其对PPARγ的抑制,促进脂肪细胞分化和脂质积累;另一项研究显示,胰岛β细胞中的circ_Ins2可结合RNA结合蛋白HNRNPA2B1,稳定胰岛素mRNA,改善2型糖尿病小鼠的血糖控制。五、操作题1.实验流程:①样本处理:组织匀浆后用Trizol提取总RNA,RNaseR消化(37℃,1小时,20U/μgRNA)富集circRNA;②检测方法:circRNA-seq(测序深度≥30Mreads)联合qPCR验证差异circRNA;③数据分析:使用CIRI2识别反向剪接事件,DESeq2进行差异表达分析(|log2FC|>1,FDR<0.05)。质控点:RNA完整性(RIN>7)、RNaseR处理效果(线性RNA内参GAPDH显著降低)、测序数据Q30>85%。2.载体构建步骤:①PCR扩增基因X的外显子2-4及侧翼内含子(含Alu元件);②将片段克隆至慢病毒载体(如pLVX)的多克隆位点;③转染293T细胞,提取RNA后qPCR检测circX表达(跨剪接位点引物),RT-PCR产物测序验证环化;④包装病毒并感染靶细胞,流式分选稳定过表达株。有效性验证:qPCR检测circX表达量(需显著高于空载组),RNaseR处理后仍可检测到circX(线性RNA对照降解)。六、案例分析题(1)验证方案:①大样本验证:收集300例NSCLC患者(训练集150例,验证集150例)和200例健康对照,检测血清circY水平,计算ROC曲线(AUC需>0.8);②功能验证:在NSCLC细胞系(如A549)中敲低circY,检测细胞增殖(CCK-8)

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