CN119475257A 多模态数据融合的idh野生型胶质母细胞瘤分型方法及系统 （中国科学院深圳先进技术研究院）

多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分的MOFS亚型进行验证。本申请通过整合来自MRI智能方法，确定并验证了IDH野生型成人胶质瘤2基于所述影像组学特征，并采用基于弹性反向传播的神经网络算法，构2.根据权利要求1所述的多模态数据融合的ID对所述MRI图像进行标准化处理，并从标准化处理后的MRI图像中提取成像特3.根据权利要求1所述的多模态数据融合的I4.根据权利要求1所述的多模态数据融合的IDH野生型胶对所述数据集中的肿瘤样本分别进行全外显子测序、转录组测序，得5.根据权利要求1所述的多模态数据融合的I6.根据权利要求1所述的多模态数据融合的IDH转录组测序数据和蛋白质组学特征进行多模态数据7.根据权利要求6所述的多模态数据融合的I学中每个模态层变量的中位绝对偏差，从每一层中选出前n名变量，组合成2640个变量组38.根据权利要求1所述的多模态数据融合的IDH9.根据权利要求8所述的多模态数据融合的IDH野所述数据集模块用于获取GBM患者的数据集；所述GBM患者包括IDH野生型胶质母细胞所述模型验证模块用于根据所述影像组学特征，并采用基于弹4[0001]本申请涉及影像分析技术领域，特别涉及一种多模态数据融合的IDH野生型胶质[0002]成人弥漫性胶质瘤是最常见的原发性恶性中枢神经系统（CentralNervous影响力的分子标记物，可将弥漫性神经胶质瘤患者分为预后、遗传特征和潜在治疗选择不同的两组。最近发布的世界卫生组织中枢神经系统肿瘤分类将IDH突变型胶质瘤和ID型胶质瘤归类为成人患者的不同肿瘤实体。值得注意的是，IDH野生型成胶质细胞瘤显著的肿瘤间和肿瘤内异质性，基因组、转录组、蛋白质组和表观基因组水平存在显著差进一步研究。[0005]本申请提供一种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分型方法及系统，通5[0015]第二方面，本申请实施例还提供了一种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞6[0017]本申请实施例提供一种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分型方法及系[0018]本申请提供的多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分型方法，整合了来自确定并验证了IDH野生型成人胶质瘤中的三种不同亚型。当前队列不仅包括组织学上的的精确治疗方案。本申请通过识别与特定亚型相关的预后生物标志物和潜在治疗靶点[0020]图1为本申请一实施例提供的一种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分[0025]图3为本申请一实施例提供的一种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分7数据的依赖可能限制了GBM完整分子复杂性的捕获。虽然影像组学分类模型显示了较高的可以通过前沿技术提取与风险独立相关的组织病理特征来识别复杂的模式和生物学特征，[0029]为了解决上述技术问题，本申请实施例提供了一种多模态数据融合的IDH野生型8[0036]在步骤S1中数据集的获取过程：本申请收集了在某医院接受根治性切除的IDH野GBM和低级别弥漫性胶质瘤的综合诊断根据2021年世卫组织分类重新分类；入院前无既往9型在逐个体素的基础上生成所有成像平面的经影像学副主任医师使用ITK_SNAP软件在rFLAIR、rT2WI和rCE_T1WI图像的轴面上手动勾估重测数据集的评分者内可靠性分析和多描述数据集的评分者间可靠性分析，保留了ICC小波图像和高斯拉普拉斯图像三类图像中提取成像特征。最终，从5个MRI序列中提取了倍物镜放大率(0.5m/像素)分割成大量1024×1024的面片，然后使用CellProfiler进行特用量子位3.0荧光计和量子位dsDNAHS分析试剂盒评估DNA片段的纯度和浓度。使用DNA1000试剂盒在4200生物分析仪上测量片段长度。使用IlluminaNovaseq6000系统对末端质量分数重新校准，然后使用GetPileupSummaries和CalculateContamination模块评使用0.3log2比值阈值定义CNV扩[0056]在转录组测序(RNA‑seq)和分析过程中，使用TRIzol试剂盒从组织样本中提取总阳离子在NEBNext第一链合成反应缓冲液(5X)中裂解RNA。使用NEBNextUltraRNA文库制片段，选择长度为150‑200bp的cDNA片段。库质量采用Agilent生物分析仪进行评估。在万个作图片段的外显子模型每千个碱基的片段)和TPM(每百万个作图阅读的外显子模型每成粉末。向每份样本中加入4倍粉末体积的裂解缓冲液(1%TritonX_100，1%蛋白酶抑制[0060]使用Agilent300ExtendC18色谱柱(4.6×250mm)分离样本，检测波长为214数据采用OrbitrapExploris480质谱仪[0061]液相色谱(LC)参数与构建库时使用的参数一致。使用超高效液相色谱系统分离本申请使用limma软件包中的normalizeBetweenArrays函数对微阵列数据进行分位数归一自赵等人上传的序列读取档案(SRA)数据库(SRA登录:PRJNA482620)[26]。该队列包括7名[0064]GBM细胞系的表达概况和药物应答数据:35个GBM细胞系的转录组和药物应答数据[0069]本申请通过集成基于不同原理的11种算法，进行了多模态数据的中间融合[0075]（4）、聚类分析的聚类用于从基于Jaccard距离矩阵的11种算法中获得一致的结MOFS3亚型为预后中等、免疫和基质成分丰富、对抗PD_1免疫治疗敏感的肿瘤微环境富集条途径进行差异分析，认为FDR<0.001且NES差异>1的途径显著富集。ORA分析是使用率大于5%的基因。广义和局灶性CNV负荷定义为分别出现在染色体臂和局灶节段的CNV之[0084]鉴于公共数据库中有丰富的高质量GBM转录组数据，本申请基于转录组表达谱开SD代表评分的标准偏差，则每个患者的最终评分计算为3+1.5×(Score_M)/SD。从[0093]免疫组织化学染色，免疫组化(IHC)实验使用抗_strip(Cat编号18277_1_AP，阳性染色细胞的百分比与核染色强度评分相乘来计算最[0094]特定药物鉴别，本申请从CCLE和GDSC数据库中检索了35个GBM细胞系的药物应答IC50值表示较高的药物敏感性。本申请在基因表达谱数据中保留了在GBM细胞中特异性表下:[0103]与现有技术相比，本申请提供的模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分型方和基于MS的蛋白质组学的多模态数据，确定并验证了IDH野生型成人胶质瘤中的三种不同的预后生物标志物和潜在治疗靶点。MOFS3亚型具有丰富的肿瘤免疫浸润且对免疫治疗敏[0105]由以上技术方案，本申请实施例提供一种多模态数据融合的IDH野生型胶质母细[0106]本申请提供的多模态数据融合的IDH野生型胶质母细胞瘤分型方法，整合了来自确定并验证了IDH野生型成人胶质瘤中的三种不同亚型。当前队列不仅包括组织学上的的精确