CN119494848A 基于显微镜图像的根结线虫会阴区分割方法及系统 （陕西省生物农业研究所）

基于显微镜图像的根结线虫会阴区分割方对花纹双侧线条中的重叠花纹线条依据各非重叠花纹线条对于重叠花纹线条的轮廓参考性进镜图像放大下存在不同层重叠导致依据会阴花2通过边缘检测对显微镜图像中会阴区的若干花纹线条进行提取；依据花纹双侧线条中花纹线条的重叠关系，基于其内部分布系数构建花纹分布特征；对花纹双侧线条中的重叠花纹线条依据各非重叠花纹线条对于重叠花纹线条的轮廓对于任意一条花纹线条，对该花纹线条上每个边缘像素点获取其对于存在重叠部分的花纹线条，多层存在重叠部分的单条花纹线条构成一组花纹线元素之间的切向角差值绝对值的正弦三角函数，作为元素之间的距离构建匹配距离矩阵，对任意两条非重叠花纹线条计算轮廓差异度，从所有轮廓差异度的对同组花纹线条中的重叠花纹线条，依据其走向相似关系及空间分3对任意一组花纹线条中任意两条重叠花纹线条的轮廓走向序列进行DTW匹配，其中若中重叠边缘像素点构成的匹配边缘像素点之间的欧式距离为0，对所有匹配边缘像素点对中欧式距离不为0的匹配边缘像素点对的欧式距离计算均值，并作为该两条重叠花纹线条对于该组花纹线条中任意一条重叠花纹线条，获取与其空间距离其中，o(dn)表示任意一组花纹双侧线条中所有匹配边缘像素点对的欧式距离的标准两个边缘像素点的切向角，cos()表示余弦三角函数，softmax()表示权重归一化函数，对于所有由非重叠花纹线条构建的花纹双侧线条，将其记为非重叠双对所有组非重叠双侧线条的轮廓相似度进行归一化，得到的结果作为线条的分布权重，通过分布权重对所有组非重叠双侧线条的内部分布系数进行加权求均，对于任意一组由重叠花纹线条构成的花纹双侧线条，将其中4依据目标重叠花纹线条与其参考非重叠花纹线条的轮廓走向序列，对目标重叠花纹线条与其任意一条参考非重叠花纹线条，基于其轮廓走向序列进行获取目标重叠花纹线条与其每条参考非重叠花纹线条的轮述对花纹双侧线条中的重叠花纹线条依据各非重叠花纹线条对于重叠花纹线条的轮廓参将重叠花纹线条构成的花纹双侧线条记为重叠双侧线条，按照重叠从内部分布系数最小的重叠双侧线条开始，依据其中重叠花纹线条对应的对包括修正花纹线条的重叠双侧线条重新计算内部分布系数，结程序时实现如权利要求1_9任意一项所述基于显微镜图像的根结线虫会阴区分割方法的步5结线虫会阴花纹在显微镜图像放大下存在不同层重叠导致依据会阴花纹鉴定根结线虫种本发明提出了基于显微镜图像的根结线虫会阴区分割方法，该方法包括以下步间的走向相似关系及其空间分布，获取重叠及非重叠花纹线条并构建若干组花纹双侧线对花纹双侧线条中的重叠花纹线条依据各非重叠花纹线条对于重叠花纹线条的连接相邻的边缘像素点得到若干边缘，将所有闭合的边缘作为会阴区的花纹线6纹线条的轮廓走向序列；对任意一组花纹线条中任意两条重叠花纹线条的轮廓走向序列进行DTW匹配，其构成匹配边缘像素点对；得到该两条重叠花纹线条的走向相似度及若干匹配边缘像素点点对中欧式距离不为0的匹配边缘像素点对的欧式距离计算均值，并作为该两条重叠花纹7其中，o(dn)表示任意一组花纹双侧线条中所有匹配边缘像素点对的欧式距离的对中两个边缘像素点的切向角，cos()表示余弦三角函数，softmax()表示权重归一化函[0010]可选的，所述对一组花纹双侧线条中的重叠花纹线条分别与两侧非重叠花纹线为目标重叠花纹线条，除目标重叠花纹线条外另一条重叠花纹线条记为参考重叠花纹线8叠花纹线条对其的轮廓参考性，以及重叠花纹线条与各非重叠花纹线条的轮廓走向序列，[0013]本发明还提出了基于显微镜图像的根结线虫会阴区分割系统，该系统包括存储重叠花纹线条的修正，确保其能够对重叠部分进行分割且保证轮廓形态不会发生较大改[0016]图1为本发明一个实施例所提供的基于显微镜图像的根结线虫会阴区分割方法流9[0018]请参阅图1，其示出了本发明一个实施例所提供的基于显微镜图像的根结线虫会[0025]需要说明的是，不存在重叠部分的花纹线条由于距离越条通常为相邻但不重叠的花纹线条，需要以其为标准对存在重叠部分的花纹线条进行分述方法对该组花纹线条中任意两条重叠花纹线条的轮廓走向序列进行DTW匹配，其中若两线条本身并不重叠；则得到该两条重叠花纹线条的走向相似度及若干匹配边缘像素点对；其中重叠边缘像素点构成的匹配边缘像素点之间的欧式距离为0，对所有匹配边缘像素点对中欧式距离不为0的匹配边缘像素点对的欧式距离计算均值，并作为该两条重叠花纹线其中，o(d,)表示该组花纹双侧线条中所有匹配边缘像素点对的欧式距离的标准[0036]所需说明的是，以匹配边缘像素点对之间的切向角的差异来进行走向差异的量重叠部分构成的匹配边缘像素点对，由于其在内部分布系数分析过程中不具备参考意义，间分布的基础上量化走向相似关系，得到非重叠花纹线条对于重叠花纹线条的轮廓参考组花纹双侧线条需分别参考两侧的非重叠花纹线条的轮廓形态走向序列进行DTW匹配，得到若干匹配边缘像素点对，按照非重叠花纹线条之间走向差异纹线条与其每条参考非重叠花纹线条的轮廓相似度，对所有轮廓相似度进行softmax归一走向上的整体相似性同样需要作为参考条件，即重叠并未破坏重叠花纹线条的整体轮廓，