技术在临床中的应用

1、FISH技术在临床上的应用，基因科技(上海)有限公司，一、正确选择探针的方法，正确使用探针的方法，临床上应用胃癌的方法，一、正确选择探针的方法，FISH探针的种类，染色体计数探针(CEP )部位特异性标记分子(LSI )泰hicks DG tubebsrr.assessmentoftheher2stattussinbrestcancerbyfluorescenceinsituhybridization : atechnicalreviewwithinterpret 36(3):250-61 .ratoofher 2第二代copynumberratio 2； her-2 geneamplicat

2、ionnotobservedratio 2； HER-2geneamplificationobserved、PathVysionDNAProbes、LSIHER-2/neu352:987-996 .形态学上，小细胞型胶质母细胞瘤和间变性少胶质细胞瘤均为中细胞密度，形态单一的胶质细胞瘤细胞质透明且明显活跃的核分裂、微血管增殖或显着的坏死，表明肿瘤小细胞型胶质母细胞瘤和间变性少胶质母细胞瘤的鉴别很重要。 这两种肿瘤的临床表现和治疗意义极为不同的分子特征可用于小细胞型胶质母细胞瘤和间变性少胶质母细胞瘤的鉴别：胶质母细胞瘤小细胞型几乎普遍为10号染色体短臂的60p%的小细胞型胶质母细胞瘤EGFR基因扩

3、增相反，间变性少胶质母细胞瘤几乎为10q缺失和EGFR基因约60%间变性少的胶质细胞瘤有1p/19q杂质性缺损，VysisEGFR/CEP7FISHProbeKit，hunanmdtmeting 26 aug 2014，39，CompanyConfidential2014Abbott 10号染色体短臂缺损10qLoss 10号染色体短臂缺损是源发和继发性多形性胶质母细胞瘤中的重要特征之一，10号染色体短臂缺损在间变性星形细胞瘤和多形性胶质母细胞瘤中显示不良预后，生存期短的PTEN基因位于10号染色体短臂上(10q23 )， 其多肽对脂质和蛋白质具有磷酸酶活性，其中一个是与10号染色体短臂缺损和

4、多形胶质母细胞瘤相关的候选基因在儿童多形性胶质母细胞瘤中10号染色体短臂缺损是唯一与患者的不良预后相关的EGFR基因扩增，1p/19q的杂质缺失和p16基因缺失不能提示儿童患者的预后，成年患者不提供独立的预后信息，hunanmdtmeting 26 aug 2014，40，CompanyConfidential2014Abbott，fallotal . 6:6314322.horbinskietal.brain pathology 2011； 213336473niiforova135:58568、EGFR扩增和EGFR基因扩增仅适用于神经胶质瘤的鉴别诊断。 这个基因的变化不是独立的预后标志。

5、 EGFR基因扩增是与多形性胶质母细胞瘤发病相关的主要基因。 EGFR扩增基本上是一种GBM的特殊疾病，虽然微观标签很容易识别，但来自GBM浸润边缘的组织可能显示出肿瘤的本质，有时组织学标准并未指定为WHOIV级。 hunanmdtmeting 26 aug 2014，41，companycodential2014abott，falonetal.jneuropatholexpneurol 2004； 6:6314322.horbinskietal.brain pathology 2011； 21336605773 niiforova 135:58568、CDKN2A、p16、CDKN2A基因位

6、于9号染色体的手臂上，9p21、抑瘤基因CDKN2A的纯合性缺失为11%II级、47%III级、and60%IV级肿瘤1 18%原发性脑胶质瘤和43%复发性脑胶质瘤中p16缺失的发现进一步证实了与肿瘤进展的关联性1，hunanmdtmeting 26 aug 2014，42，CompanyConfidential2014Abbott，falonetal.jneu 6:6314322.horbinskietal.brain pathology 2011； 21336505773 niiforova 135336058568，新的目标治疗？ ROS1基因重排阳性肿瘤对康唑置换尼crizotinib

7、 (精工XALKORI )有显着的治疗活性ROS1是否成为胶质母细胞肿瘤的新目标治疗目标？ hunanmdtmeting 26 aug 2014，43，CompanyConfidential2014Abbott，肉瘤、肉瘤概述，骨和软组织肉瘤是一种罕见的异质肿瘤。成人占所有肿瘤的不到5%，儿童约占10%。 由于肿瘤细胞的由来，这些肿瘤是骨肉瘤Osteosarcoma (形成于硬骨部分)软骨肉瘤Chondrosarcoma (形成于软骨中)尤因肉瘤Ewingssarcoma (形成于骨髓组织中) 原发于其他组织I软组织肉瘤纤维肉瘤Fibrosarcomas和恶性纤维组织细胞瘤(由纤维组织形成)脂

8、肪肉瘤Liposarcomas平滑肌瘤Leiomyomas和横纹肌肉肉瘤rhabdomyosarcomas (原发于肌肉) 滑膜肉瘤通常形成于膝关节周围的组织中)、hunanmdtmeeting26aug2014、45、companycodential2014abott、OSuna483363-21 .肉瘤的遗传异常、肉瘤被诊断但是，正确的诊断在评价预后和选择适当的治疗方法上非常重要的组织切片镜检查形态学诊断是肉瘤诊断的金标准辅助技术，对形态学诊断非常有用，特别是采用FISH和PCR法的分子检查。 所有肉瘤约有1/3具有特定的复发性染色体易位的特征，引起高特异性基因融合，采用上述分子检测方法就

9、容易检测。 这些易位通常是唯一的细胞遗传学异常现象，而且可能具有最致病的重要性，hunanmdtmeeting 26 aug 2014，46，CompanyConfidential2014Abbott，antonescu.his 483363013-21.nccnclinicalpracticeguidelinesinoncology.softtissuesarcomas，版本2.2014.OS una 433363012-26 .肉瘤的分子诊断以下的情况下， 分子诊断：的免疫组织化和超微结构的研究结果不一定是良性和恶性肿瘤时的鉴别诊断，如FUS易位检查，是低水平纤维粘液样肉瘤和神经束膜瘤或其

10、他良性纤维性和神经性细胞增殖恶性类型的鉴别诊断，如， DDIT3易位可以用于区分儿童粘液样脂肪肉瘤和脂肪母细胞瘤的验证异常的临床表现(例如异常年龄组或肿瘤部位)或非典型的免疫组化结果，例如，具有典型的尹肉瘤表型的肿瘤发生于老年人，或存在于内脏部位时可能需要分子确认的hunanmdtmeting26aug2014、47、CompanyConfidential2014Abbott、Antonescu.Histopathology2006； 483363013-21.nccnclinicalpracticeguidelinesinoncology.softtissuesarcomas，版本2.201

11、4.OS una 4:12-26 .hunanmdtmeting 2 由于FOXO1、EWSR1、ALK、SS18、FUS/DDIT3、黏液样肿瘤的鉴别诊断、粘液样软组织肿瘤的鉴别诊断通常很困难，具有多种肿瘤重复的组织学特征，特别是在根据小的活检标本进行评价时，这些肿瘤有复发和转移的潜在正确分类很重要的术前诊断可能影响手术和新辅助疗法不同的复发性遗传变异和粘液样肿瘤，即：骨外粘液样软骨肉瘤和粘液样脂肪肉瘤中的EWSR1基因重排低水平纤维粘液样肉瘤和粘液样脂肪肉瘤中的FUS基因重排； 粘液样脂肪肉瘤中的DDIT3 (以前称为CHOP )基因重排，FUS成为伙伴基因。 hunanmdtmeting

12、 26 aug 2014，49，companycodential2014abott，downs-Kelly et al.amjsurgpathol 2008； 32335313.wange tal.modern pathology 2008； 213336301031310.jclinexppathol 2010； 3(4):416-429 .粘液样肿瘤的鉴别，FUS-DDIT3重排为粘液样脂肪肉瘤的高灵敏度和特异性特征。 形态相似的肿瘤(例如，大量粘液样变化分化良好的脂肪肉瘤或粘液样纤维肉瘤)中，即使FUS-DDIT3重排基因少的粘液样脂肪肉瘤也没有检测出其他重排，

13、t(12； 22)(q13； q12 )中，EWSR1-DDIT3转位的多数骨外粘液样软骨肉瘤病例为t(9； 22)(q31； q12)EWSR1-NR4A3融合基因。其他NR4A3基因的突变体可在包含t(9)之前鉴定为17)(q31； q12)TAF15-NR4A3融合基因和t(9； 15)(q31； q21)TCF12-NR4A3融合基因，hunanmdtmeting 26 aug 2014，50，CompanyConfidential2014Abbott，downs-Kelly et al.amjsurgpathol 2008； 32愚人节13，vysisewsr1breakapartf

14、ishprobekit，hunanmdtmeting 26 aug 2014，51，companycodential2014abott，正常的EWSR1基因， ewsr1基因重排vysisddit3breakapartfishprobekit，hunanmdtmeting 26 aug 2014，52，companycodential2014abott，ddit3基因重排， vysisFUSbreakapartfishprobekit hunanmdtmeting 26 aug 2014，53，companycodential2014abott，fus基因重排，downs-Kelly et a

15、l.amjsurgpatho 32愚人节13，透明细胞肉瘤和恶性黑色素瘤鉴别诊断，透明细胞肉瘤是一种罕见的独特肿瘤，好发于青少年和青年四肢远端肌腱和腱膜。 透明细胞肉瘤在儿童群中少见发生，报告的病例中只有2%发生在未满10岁的儿童。 透明细胞肉瘤也称为软组织黑色素瘤，该肿瘤表现的表型特征与恶性黑色素瘤相似，包括存在黑色素并表达黑色素体的超微结构、S-100蛋白质和黑色肿瘤相关标志的免疫表型。 透明细胞肉瘤的鉴别诊断包括发生于成人和儿童的上皮肿瘤和间质肿瘤。 鉴别诊断包括原发性和转移性黑色素瘤、细胞型青痣、恶性周围神经鞘肿瘤(MPNST )、滑膜肉瘤(SS )、纤维肉瘤、横纹肌肉肉瘤(RMS )

16、 (特别是腺胞状RMS )、平滑肉瘤、颗粒细胞瘤、腺胞状软组织肉瘤(ASPS )等。 在很多透明细胞肉瘤病例中检测出了特定的复发性染色体易位t (12 ) 22 ) (q 13； q12 )或发生的22q12上的EWSR1基因和12q13上的ATF1基因的融合基因。 hunanmdtmeeting 26 aug 2014，54、CompanyConfidential2014Abbott、jclinexppathol 2010； 3 (4) :16-429.Patel al.modern pathology 2005； 183353525385590.songe tal

17、.pathologydinternational 2010； 6060630608613 .横纹肌肉瘤的分子诊断横纹肌肉瘤是儿童和未满15岁青少年最常见的软部组织肉瘤，以肌肉块的形式与四肢、鼻窦或腹膜后腔横纹肌肉瘤不同的组织学亚型包含腺胞状(alveolarrhabdomyosarcoma )，胚胎性(emb 胚胎性横纹肌肉瘤是最常见的横纹肌肉瘤，约占70%，最常出现在头部和颈部的区域和泌尿生殖器官中的腺房状横纹肌肉瘤约占21%，最常出现在四肢胚胎性和腺房状横纹肌肉瘤中的临床表现极为不同。 胚胎性肿瘤具有较好预后的特异性遗传变异可用于鉴别腺泡状横纹肌肉瘤，与FOXO1基因的重排有关： t(2；

18、 13 ) (q 353360 q 14 ) Pax3/foxo 1a (70 %关系式) t (1； 13)(p36； q14)PAX7/FOXO1A(10%ofARMS )或其他变异，hunanmdtmeting 26 aug 2014，55，companycodential2014abott，downs-Kelly et al.diagnmololol 183363018143.jclinexppathol 2010； 3 (4) :6016-429.wexler 28愚人节01532126-2128 .moleculardiagnosisofrhabdomysarcomas、PAX/FOXO1阳性ARM