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文档简介
1、实验报告的实验总结模板学生实验实习报告册学年学期:2019-2020学年o春o秋学期课程名称:课程设计(小型软件系统)学生学院:理学院专业班级:11921701学生学号:2017213260学生姓名:联系电话:指点教师:总评成绩:*邮电大学教务处制课程设计(小型软件系统)要求通过本课程设计,了解当代计算材料学之材料设计和计算及摹拟的理论基础、发展历程。初步掌握LINUX系统的基本操作、脚本编写。熟习经常使用的材料计算软件的使用,并能够通过摹拟计算,取得常见的简单晶体结构的几何和电子性质。具体要求:1.通过前期的课程学习和网络调研,了解第1性原理计算的理论基础;2.通过课程学习和实践操作,初步掌
2、握LINUX系统的基本操作;3.学会根据实验测试数据(如XRD、TEM等),利用FINDIT软件取得已知材料体系的晶体结构;4.学会利用VESTA、MATERIALSSTUDIO、UEDIT等软件对晶体结构进行查看、结构调理,终究准确取得初始计算模型;5.学会利用VIENNAAB-INITIOSIMULATIONPACKAGE(简称VASP)软件,取得晶体结构稳定构型、电荷密度散布、电子态密度、能带结构、声子谱、结合能等;6.学会利用P4VASP、ORIGIN等软件进行数据转换和作图;7.能够利用所学的量子力学、固体物理、半导体物理学知识,分析晶体结构、电荷密度散布、电子态密度和能带结构。实验
3、名称系统建模与仿真实验课程编号A2110260实验地点SL110实验时间6.15.191、课程设计目的:目的:通过本课程设计,了解当代计算材料学之材料设计和计算及摹拟的理论基础、发展历程。初步掌握LINUX系统的基本操作、脚本编写。熟习经常使用的材料计算软件的使用,并能够通过摹拟计算,取得常见的简单晶体结构的几何和电子性质。2、课程设计使用的仪器、软件:仪器:计算机。软件:FINDIT、VESTA、MATERIALSSTUDIO、UEDIT、VIENNAAB-INITIOSIMULATIONPACKAGE、P4VASP、ORIGIN。3、课程设计要求:1.通过前期的课程学习和网络调研,了解第1
4、性原理计算的理论基础;2.通过课程学习和实践操作,初步掌握LINUX系统的基本操作;3.学会根据实验测试数据(如XRD、TEM等),利用FINDIT软件取得已知材料体系的晶体结构;4.学会利用VESTA、MATERIALSSTUDIO、UEDIT等软件对晶体结构进行查看、结构调理,终究准确取得初始计算模型;5.学会利用VIENNAAB-INITIOSIMULATIONPACKAGE(简称VASP)软件,取得晶体结构稳定构型、电荷密度散布、电子态密度、能带结构、声子谱、结合能等;6.学会利用P4VASP、ORIGIN等软件进行数据转换和作图;7.能够利用所学的量子力学、固体物理、半导体物理学知识
5、,分析晶体结构、电荷密度散布、电子态密度和能带结构。4、课程设计原理:研究体系的复杂性表现在多个方面,从低自由度体系转变到多维自由度体系,从标量体系扩大到矢量、张量系统,从线性系统到非线性系统的研究都使解析方法失去了原本的威力。因此,借助于计算机进行计算与摹拟恰恰成为唯1可能的途径。复杂性是科学发展的必定结果,计算材料科学的产生和发展也是必定趋势,它对1些重要科学问题的美满解决,充分辩明了计算材料科学的重要作用和现实意义。采取了基于密度泛函理论的第1性原理计算方法。使用目前经常使用的商业软件包,VIENNAABINITIOSIMULATIONPACKAGE(VASP),进行摹拟。离籽实与价电子
6、层的相互作用采取投影缀加平面波赝势(PROJECTORAUGMEN=TEDWAVE,PAW)来描写。交换相干能采取广义梯度近似(GGA)中的PBE泛函描写。为了更好地描写层间作用,在计算时,用OPTPBE-VDW方法进行范德华尔斯修正。平面波基组截断能设置为400eV。结构优化和静态计算时的布里渊区K点采样网格分别为333和444。原子完全弛豫,直至各原子之间的力小于0.01eV,结构弛豫结束。5、课程设计思路、步骤:1、打开FINDIT软件,查找MoS2,选择晶胞参数为3.16,以下图图1查找MoS2数据导出MoS2数据,注意保存格式为.cif。2、将保存好的文件(icsd.cif)直接拖入
7、MATERIALSSTUDIO软件,便可以看到MoS2的单个晶胞结构,点击鼠标右键选择Displaystyle中的CPK选项,调剂原子为适合大小,点击viewacross查看模型的正面图(图2),以后点击viewonto查看模型的俯视图(图3),最后,保存文件到指定文件夹,文件命名为MoS2-BULK.Cif。图2.MoS2重视图3.MoS2俯视图3、将保存好的文件(MoS2-BULK.cif)直接拖入VESTA软件,转动1下便可以看到MoS2的单个晶胞结构,再点击左下角的Properties-icsd.cif进入参数设置,第1选择General里的Singleunitcell便可以看见1个更
8、规整的晶胞结构;第2点击Atoms,在里面可以选择Mo、S两个原子的色彩;第3点击edit中的Bonds,点击new后把A2改成S,将Maxlength改成3。调剂完后可得到下图(图4),最后保存文件,命名为icsd.vasp。图44、将icsd.vasp文件用Uedit32打开,可以得到MoS2晶胞的坐标数据。5、计算部份:采取了基于密度泛函理论的第1性原理计算方法。使用目前经常使用的商业软件包VIENNAABINITIOSIMULATIONPACKAGE(VASP),进行摹拟。离籽实与价电子层的相互作用采取投影缀加平面波赝势(PROJECTORAUGMEN=TEDWAVE,PAW)来描写。
9、交换相干能采取广义梯度近似(GA)中的PBE泛函描写。为了更好地描写层间作用,在计算时,用TPBE-DW方法进行范德华尔斯修正。平面波基组截断能设置为400eV。结构优化和静态计算时的布果渊区K点采样网格分别为333和444。原子完全弛豫,直至各原子之间的力小于0.01eVA,结构弛豫结束。(1)打开Xshell软件,建立会话并进入自己的分组,拷贝4个文件INCAR、KPOINTS、POSCAR、vdw_kernel.bindat。在POSCAR中拷入刚得到的MoS2晶胞的坐标数据,修改INCAR中的数据,通过1系列操作,最后输入运行代码nohupmpirun-np8vasp_std&1.ou
10、t&进行结构优化计算。通过结构优化后可以得到CONTCAR并导出。(2)接下来进行静态计算。创建新的文件夹static,进入该文件夹后导入结构优化后的CONTCAR、POSCAR,注意还要考入没有结构优化之前的INCAR、KPOINTS并修改KPOINTS为444。一样输入运行代码nohupmpirun-np8vasp_std&1.out&进行静态计算。得到CHGCAR、vasprun.xml并导出。6、将CHGCAR拖入VESTA中进行参数更改。第1选择General里的Singleunitcell便可以看见1个更规整的晶胞结构;第2点击Atoms,在里面可以选择Mo、S两个原子的色彩;第3
11、选择Isosurfaces里的New,将Isosurfacelevel改成0.05便可得到下图5图5MoS2晶胞7、通过1个脚本文件vaspkit的计算,可以得到TDOS.dat并导出,再由脚本文件的另外1个计算可导出PDOS_Mo.dat、PDOS_S.dat,接着新建1个excel文档导入TDOS.dat、PDOS_Mo.dat、PDOS_S.dat中的数据并进行处理,将处理的数据导入Origin中再处理,便可得到下图6图68、再创建文件夹bands,将CHGCAR、POSCAR、POTCAR、vdw_kernel.bindat拷贝进该文件夹,再将前面的INCAR、KPOINTS拷入。在Matstudi软件中点击ToolsBrillouinzonepath可得到下图7图7最后在bands中用脚本文件计算,可以得到REFORMATTED_BAND.Dat并导出。相同的方法在Excel中处理数据再导入Origin中
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