第九章 微生物的进化、系统发育.ppt

1、第九章了解微生物的进化、系统发育和分类鉴定，了解微生物的分类鉴定方法类型，作为进化表的测量指标，熟悉rRNA序列测量和分析方法的常用分类群术语熟悉微生物的快速鉴定和自动化分析技术。1最早的生命形态，地球已经存在了约46亿年，微生物生命的化石证据存在于36亿年历史和不到36亿年的岩石中。早期的地球没有氧气，比现在的地球热得多。最初的生化化合物是通过无氧合成生产的，提供了生命起源的可能性。最古老的微生物可能是厌氧光阳微生物。2进化的测量指标，进化：生物与生存环境相互作用的过程中，随着时间的推移，发生了一系列不可逆转的遗传信息变化，导致了表型变化和对生存环境的相对适应。2.1进化表可用于测量进化变化

2、的细胞大分子。两个物种之间的进化距离可以通过两个茄子同源大分子的核苷酸或氨基酸的序列差异来测定。1)作为进化时钟大分子的条件，1)牙齿分子广泛分布在用于研究的分类群中。2)必须在各生物中功能动员(功能不相关的分子没有序列相似性)。3)分子序列可以线性排列，有利于分析比较。4)序列变化率与测量的进化距离一致，2)进化时钟核糖体RNA是最适合揭示各种生物亲缘关系的rRNA，特别是16SrRNA。优点：功能稳定，分布广，适当保守性及相对分子质量适中。您可以在互联网上获得10，000多种rRNA序列(3358RDP WWW./)、2.2 RRNA的顺序和演变。1)rRNA序列

3、测定和分析方法(1)寡核苷酸列表分析方法水解传记电泳辐射现象16S rRNA片段分离小片段分子序列测定相似系数SAB=2NAB/(NA NB)核苷酸列表比较序列印迹序列：2.3系统发育树(phylogenetic tree)，2) rRNA排序所提出的系统发育树通过RNA序列分析，表明一般祖先开始的进化最初是通过两个茄子方向：细菌系谱和古生菌-真核生物系谱，以及古生菌和真核生物分化，产生了两个茄子主要系谱。形成生命的三个茄子区域：Archaea，Bacteria and Eukaryotes。1)概念系统树分子系统树：由比较生物大分子序列差异的数字组成的系统树。细菌，学名Archaea，Euk

4、arya，宇宙生物进化树，3细菌分类，命名，蜂鸣器手册，3.1细菌分类常用的分类群术语1)非正式分类单位培养物和纯培养物菌株常用的数字，以及eg 3360 Bacillus subtilis ASI . 398人口(population):表示特定空间中同一个人的组合。格式(type or form):亚种以下的单位。同种或亚种不同菌株之间的性质不能分为新亚种时的表达方法。2)物种(species)微生物没有严格意义上的性交，在微生物之间通过传导、转换、结合等途径，可以用作盆景的参考。根据基因序列资料，DNA杂交动员性为60%-70%以上或16SrRNA序列动员性为97%以上的菌株可以定为一个

5、品种。，3.2命名1) 2) 3命名法属物种名称gar(subsp或var)亚种或变体gar 3)为特定(或未定宗名)EG 3360 Streptomyces IJSB。()新名称公布时，应添加所属新分类等级的缩写ord.nov。Gen.novSp.nov .3.3蜂鸣器系统细菌学手册是有关细菌和古生菌的主要分类学著作。“bergeys manual of systematic bactereiology(系统手册)”第二个板块5卷的一般内容。P340，4微生物分类识别的特征和技术，4.1形态特征4.2生理生化特征4.3血清学实验和噬菌体分型血清学实验：一般用于种内(及个别属)不同菌株血清型分类。使用已知抗体鉴定未知抗原(微生物)。噬菌体分型：根据噬菌体的宿主范围，将细菌分为不同的波均衡，利用噬菌体分解作用的特异性进行细菌识别。4.4氨基酸顺序和蛋白质分析传记电泳模式比较；瞳孔酶的传记游泳迁移率4.5(G C)%与核酸分子杂交的G C含量相同，只是表示亲缘关系可能相似，无法说明是否是动员。4.6发生基因重组的细菌之间应该有广泛的染色体动员性。5微生物的快速鉴定及自动化分析技术，微量多