PubMed数据库.ppt

1、PubMed数据库,人民医院 图书馆 2007年6月,PubMed登录方法,登录北京大学医学部图书馆网站 点击“电子资源”下的“文摘索引数据库” 点击“PubMed世界医学文献数据库” 或者直接登录网站，地址：/entrez/query.fcgi?DB=pubmed,PubMed介绍,PubMed检索系统由隶属于美国国立图书馆（NIL）的国家生物信息中心（NCBI）开发 通过PubMed检索系统，能检索到比MEDILNE收录范围更大的生物医学文献信息，并且具有以下优点：能上网即可获取该系统的相关信息，检索功能强，结果新，可免费检索MEDLIN

2、E、PREMEDLINE，部分记录还可链接到全文 PubMed检索循证医学的研究和实践,PubMed 与MEDLINE的区别,PubMed收录范围广：MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊（物理、天文、化学等） PubMed收录记录新：在MEDLINE数据标引前的最新题录 PubMed文献类型全：提供电子原文链接（部分可免费获取全文）,PubMed的收录范围,MEDLINE PbuMed-index for MEDLINE PREMEDLINE PubMed-in process 每日更新 版面商直接提供的记录PubMed-as supplied by publisher 另

3、外：PubMed链接了与NLM有联系的杂志的网址，可得到更多杂志信息，其中部分网址提供免费的全文,PubMed主页,1、检索提问框 2、特征栏(Feature Bar) 3、PubMed Service,提问框,特征栏,注册个人帐户,可注册个人帐号，存储个人的检索策略,点击新帐户注册,填写相关注册信息,点击注册,您会在邮箱中收到确认信息,再次登陆个人帐户，可查看保存过 的内容,检索方法和 检索结果显示/输出,开始检索之前，选择需要查询的数据库，点击后可见下拉菜单,检索提问框,位于“Search”下拉菜单右侧“for”之后的条形框，该框右侧的“GO”按钮用于执行检索功能，“Clear”用于清除检

4、索提问框中的已有的内容。 由于检索提问框处于活动状态，进行检索时在每屏中均可见到检索提问框。,PubMed基本检索功能,在检索栏中输入: 一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)如： hypertension therapy 著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab 刊名，可输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式如： clin exp immunol 布尔逻辑运算式： (运算符须大写）如：Stem ti AND neuroscience,截词检索：在单词末尾加上 * ，可作截词检索。例如 bacter* 可以查到bacteria,bacterium,bacteriophage等。最

5、多限150个单词。 词组检索： heart failure 特指要加上“heart failure”,自动转换功能和自动扩展检索功能 PbuMde设有自动转换提问词功能 当检索词输入到检索提问框执行检索功能时，系统自动将检索词逐一与主题词转换表（MeSH Translation table）,杂志名转换表（Joumals Translation table）,短语列表（Phrase Iist）和作者索引（Author Index）中的词进行核对，并转换、匹配为相对应的词。 给短语加上双引号，则不执行自动转换提问词的功能。,具有对主题词和副主题词进行自动扩展检索的功能 如：hypertensio

6、n therapy,系统自动对高血压的药物治疗、饮食疗法等检索,字段检索,字段标记符（tag ）使用规则： 只能在词后加字段标记符，如：hypertention mh，cancerti mh 为主题词缩写，必须用封闭的方括弧 ，大小写和空格会被忽略，如: liver mh = LiverMH。,在检索框内输入检索词， 然后点击“Go”。 检索结果列在下面,可看到该检索词下查到的综述文章,这种图标代表提供全文,用“Clear”清除前面的检索词后，输入另外一个检索词，在检索词尾不确定如何书写时，可用“ * ”替代,可选择检索结果显示的格式,显示字段选择（Display),Abstract repo

7、rt:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 Citation Report: 显示除上述内容外，加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。 MEDLINE Report: (最完整，有标识符）,选择”AbstractPlus”显示方式时，可看到是否有全文链接,可选择每屏显示结果的数量,可选择检索结果排序的方式,可选择检索结果输出的方式,特征栏的功能,Feature Bar,该栏位于检索提问框下方，包括：“Limits”, “Preview/Index”, “History”，“Clipboard”, “Details” 5个重要的、各具特

8、色的辅助检索功能按钮，前3个按钮在辅助检索功能方面更为突出，后2个按钮的功能比较偏重检索之后的显示。,三.PubMed的辅助检索功能,Limits（检索限制选择） 字段限制：著者、刊名、篇名、滤过（filter原文收藏处）等 数据输入时间：默认检索可回溯到1966年，限制选择30天-10年 7种文献类型限制： 7种语种： 12种子文档：(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics ）,可使用限制功能,将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围,设定只搜索包含全文的文献,设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库,设定检索时间限制,将搜索范围

9、设定在一个特定的域,点击“Go”,将搜索限定在某一特定的文献类型,使用限制功能后，大大减少了文摘数量,Previw/index（检索策略预览）,浏览检索式 改变检索式 （可用检索式编号#1 OR #2） 浏览索引（index）,点击“预览/索引”，浏览检索式,对检索式进行管理，或者编写二次检索式,3号和6号检索式组合后得到的检索结果,(3) History功能键,历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果 History显示：查询方案、查询时间、查询到的文献数量 使用History可以看到最近100次的查询结果,点击“历史”，浏览检索史,(4) Details功能键,显示检索词转换匹配运算详

10、细过程 用途： 转换、确定规范词 如：liver cancer liver neoplasms 修改检索策略,点击“细节”，查看细节信息，然后决定是否保存,保存前的提示信息，如果您需要更新的检索结果，请选择“是”,(5) Clipboard功能键,您可查看剪贴板上最近500条记录 这些记录在休止状态8个小时后自动消失 如果想保存剪贴板上的信息，保存到My CNBI collections,将检索结果发送至剪贴板,最多保存500条，可发送到My NCBI Collections,再次登录,检索前首先登录个人帐户,输入用户名和密码,查看保存过的检索式，可以重新运行检索或者在此基础上编写新的检索式,

11、例如：做一个“Insulin”和1号检索式的组合检索,检索结果,全文链接和保存,举例：选择“AbstractPlus”，显示方式,有全文链接的文章，有类似的图标，可直接点击,这是网页版全文，可点击左侧各功能项,续上页,续上页,续上页,续上页,续上页，可点击图使之变大,续上页，对于参考文献，有免费全文的可点击链接,可点击PDF格式,点击保存副本,选择保存路径,相关文献的全文链接,PubMed Service,位于主页左侧，列中有“PubMed Service”栏目，有以下内容： Jornal Database(杂志数据库) MeSH Database(主题词浏览器) Single Citatio

12、n Matcher(单篇引文匹配器) Batch Citation Matcher(多篇引文匹配器) Clinical Queries(临床提问) Link Out(与链接有关的功能) Cubby(与存储有关的功能),PubMed Service,MeSH Database（医学主题词浏览器）在“MeSH Database”检索提问框内输入检索词后系统将自动主题词表进行匹配检索，有的非主题词将转换为主题词，可浏览主题词的定义、浏览树状结构并进行选择，并能提供可供组配的副主题词进行检索，还提供是否只针对主要主题词检索及是否进行扩展检索等功能,2. Journal Browser (期刊浏览器) 刊名全称、MEDLINE 的期刊缩写或国际标准期刊号（ISSN)。 通过journals with links to full-text websites,便可链接入所有与PubMed建立链接的生物医学期刊列表。目前约有两千六百多种期刊。 3. Citation Matcher（引文匹配器）,Clinical Queries（临床提问）： 1、列有临床医生常用的类目，如therapy(治疗)、 Diagnosis(诊断)、etiology(病因)和prognosis(预后) 2、检索质量侧重点过滤器