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文档简介
1、SWISS-MODEL同源建模的方法,SWISS-MODEL同源建模简介,SWISS-MODEL 是一个自动化的蛋白质比较建模服务器，该服务器提供用户三种模式可选择： Automatic mode（简捷模式）: 用于建模的氨基酸序列或是Swiss-Prot/TrEMBL (/sprot )编目号（accession）可以直接通过web界面提交。服务器会完全自动地为目标序列建立模型。 用户可以选择指定模板结构，模板可以来自由PDB数据库（ ）抽取得到的内建模板库，也可以上传PDB格式的坐标文件。 Alignment mo
2、de（联配模式）: 这个模式需要多序列联配的结果，序列中至少包括目标序列和模板（最多可输入5条序列）。服务器会基于比对结果建模。用户需要指明哪一条序列作为目标序列，哪一条又作为模板。 Project mode(项目模式): 这种模式允许用户提交经过手工优化的请求给服务器。DeepView被用来建立一个项目文件，它包含了模板结构，以及目标序列与模板的联配结果。这个结果也要上传到服务器。这种方式提供对建模过程中细,SWISS-MODEL网页界面,我们选择简捷模式,填写正确的邮箱，会有邮件,输入蛋白质序列,提交以后会出现,在线显示的有的时候速度有点慢，耐心等待,Ps:珍惜劳动成果。这可是等了一个小时的成果,反馈的结果也可以在myWorkspace中查看，自己的邮箱是用户名，邮件里边有password,可以把结果保存下来,预测的三维结构,SWISS-MODEL网页界面,我们再选择联配模式,接着会出现下面的界面,出
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