《生物信息学示例》PPT课件.ppt_第1页
已阅读1页，还剩29页未读， 继续免费阅读

下载本文档

版权说明：本文档由用户提供并上传，收益归属内容提供方，若内容存在侵权，请进行举报或认领

文档简介

1、Gw-analysis : an introduction，Yong-Xiang Lin，Gw基本流程，1。获得相同基因家族的序列2。保守域3。利用数据库构建和获得的报酬域进行动员性搜索4。根据搜索结果提取相应的序列5。使用pfam和smart删除未验证和删除的序列6。消除重复序列7。通过相似性比较构建演化树，Osi BCD 003925 mmgsgmphmyfasshgtgahyqspgapitmavpdmgflvagigmapsfvmpegalaasysamatvpvgvpqsrfgngnpgsfkgawtrqedevlkqmvies确认网站，例如网站列表列出水稻或拟南芥相应的家族序列，下

2、载和使用，如何获得保守域序列？pfam确认(http:/pfam.sanger.ac.uk/)，保守域序列复制，保守域名，搜索结果，如何构建数据库？dnatools软件应用节目，构建蛋白质数据库，构建核酸数据库，粘贴pfam获得的保守domain序列，格式化，格式化，动员性比较搜索方法？设置参数，获取比较结果，保存比较结果，3。如果所有得到的基因数都是80，保守的多曼，删除牙齿80个基因，重新搜索所有可能的基因，2。提取相应的基因序列，使用UltraEdit软件，使用UltraEdit打开库档案，使用搜索功能和复制基因名称，将结果每个序列分别存储在文本文档中，如何确定搜索到的基因是否有保守的域

3、牙齿？searchp fam database(http:/pfam . Sanger . AC . uk/)，2 .search smart database(http:/smart . embl-huh，染色体，开始位置，结束位置，使用位置映射软件MapInspect，文件格式，染色体长度(Mb)，染色体上的基因位置，重复序列位于基因组中的相同位置，序列动员性高，这些基因的开始和结束位置可以相同(10bp以下)，使用同源性比较软件(Mega、ClusterX等)比较所有序列，保留长domain保守序列，剔除短序列。、如何创建进化树？使用mega 4.0软件，首先是序列比对，ClusterW动员性比较，NJ方法进化树构建，动员性差异如果不能制造mega软件进化树怎么办？使用ClusterX软

人人文库> 全部分类> 教育资料 > 课件下载

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明，都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等，如果需要附件，请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸，网页内容里面会有图纸预览，若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间，仅对用户上传内容的表现方式做保护处理，对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑，并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容，请与我们联系，我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论