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文档简介

1、Gw-analysis : an introduction，Yong-Xiang Lin，Gw基本流程，1。获得相同基因家族的序列2。保守域3。利用数据库构建和获得的报酬域进行动员性搜索4。根据搜索结果提取相应的序列5。使用pfam和smart删除未验证和删除的序列6。消除重复序列7。通过相似性比较构建演化树，Osi BCD 003925 mmgsgmphmyfasshgtgahyqspgapitmavpdmgflvagigmapsfvmpegalaasysamatvpvgvpqsrfgngnpgsfkgawtrqedevlkqmvies确认网站，例如网站列表列出水稻或拟南芥相应的家族序列，下

2、载和使用，如何获得保守域序列？pfam确认(http:/pfam.sanger.ac.uk/)，保守域序列复制，保守域名，搜索结果，如何构建数据库？dnatools软件应用节目，构建蛋白质数据库，构建核酸数据库，粘贴pfam获得的保守domain序列，格式化，格式化，动员性比较搜索方法？设置参数，获取比较结果，保存比较结果，3。如果所有得到的基因数都是80，保守的多曼，删除牙齿80个基因，重新搜索所有可能的基因，2。提取相应的基因序列，使用UltraEdit软件，使用UltraEdit打开库档案，使用搜索功能和复制基因名称，将结果每个序列分别存储在文本文档中，如何确定搜索到的基因是否有保守的域

3、牙齿？searchp fam database(http:/pfam . Sanger . AC . uk/)，2 .search smart database(http:/smart . embl-huh，染色体，开始位置，结束位置，使用位置映射软件MapInspect，文件格式，染色体长度(Mb)，染色体上的基因位置，重复序列位于基因组中的相同位置，序列动员性高，这些基因的开始和结束位置可以相同(10bp以下)，使用同源性比较软件(Mega、ClusterX等)比较所有序列，保留长domain保守序列，剔除短序列。、如何创建进化树？使用mega 4.0软件，首先是序列比对，ClusterW动员性比较，NJ方法进化树构建，动员性差异如果不能制造mega软件进化树怎么办？使用ClusterX软

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