PubMed-图书馆秋冬系列数据库培训.ppt

1、PubMed是图书馆秋冬季系列的第七次数据库培训，它介绍了如何使用数据库以及如何处理检索结果。从字面上看，PubMed这个名字来自英语单词“Public”和“Medline”，意思是为公众提供免费的医学信息检索服务。Pubmed是NLM国家医学图书馆下属的国家生物技术信息中心(NCBI)建立的生物医学文献检索系统，它使用NCBI的Entrez检索平台。它是搜索全世界生物医学期刊的重要工具。基于互联网，它提供免费的检索服务，一些文件(约5%)可以免费下载全文。1.MEDLINE(Medline是PubMed的核心内容)2。3号线前。出版商提供了引文。MEDLINE是美国国家医学图书馆开发的生物医

2、学摘要光盘数据库。它于1983年推出，已经被广泛使用了20多年。它包含自20世纪60年代以来在70多个国家和地区出版的5，300多种重要生物医学期刊的书目和摘要(截至2006年10月的统计数据)，涉及广泛的生物医学和相关学科(如农业、化学等)。)。数据库中大约80%的记录提供摘要。Medline数据库中的文献主要是英文(约85%)，但也包括世界上其他几十种重要的语言。对于原始文本不是英语的文档，当包含Medline时，原始文档的标题信息被翻译成英语并适当标记(非英语文档的标题用方括号括起来)。该记录被标记为“Medline PubMed索引”。Pre-MEDLINE是MEDLINE的预处理数据

3、库，主要包含未被索引的书目信息，只提供基本的书目线索，如标题、作者、摘要、来源等。医学预科班属于medline的最新内容，检索Medline光盘时找不到。只能在下一次更新Medline光盘后才能检索。由于没有主题索引，自由词检索记录被用来标记“PubMed-in process”。“出版商提供的引文”是数据库的检索界面，对于未包含在由出版商直接提供给PubMed的Medline中的电子期刊记录，该界面标记为“PubMed-由出版商提供”。PubMed有两个独立的互联网域名。/sites/entrez/,NCBI,其他资源简单搜索、辅助搜索、特

4、殊搜索、数据库使用、简单搜索、辅助搜索、特殊搜索、数据库使用-简单搜索，在pubmed初始搜索界面的唯一搜索框中输入任意搜索词或搜索公式，然后点击“Go”按钮，系统将显示搜索结果。输入的搜索词不区分大小写，可以是任何具有实际意义的词或短语，如自由词(疾病名称、药物名称)、主题词、人名、地名、期刊名称、期刊ISSN号等。搜索公式是指通过使用布尔逻辑运算符和分词字符(通配符)来组合搜索词。PubMed可以使用布尔逻辑运算符“与”、“或”和“非”。具有多个布尔逻辑运算符的搜索表达式是按照从左到右的自然顺序进行操作的，并且没有运算符的偏好，但是可以使用半角括号来指定搜索表达式的优先操作顺序，例如“辅助

5、和(中国或韩国)”。布尔逻辑运算符必须大写才有效。支持“*”截断运算符，用于匹配多个字符。Entrez PubMed具有自动术语映射功能。通过该功能，系统将在搜索框中依次搜索用户输入的不合格搜索词，如MeSH词转换表、期刊翻译表、短语列表和作者索引。作者搜索格式：姓氏首字母的全名(最多两个字母)搜索2006年诺贝尔医学奖获得者安德鲁兹费尔发表的论文，可以直接在搜索框中输入“火a”或“火az”。例如：检索钟南山院士发表的论文，输入“钟NS”或“钟N”，期刊检索：标题检索或序号检索：全称或简称序号检索：ISSN(国际标准序号)注：我国PubMed发表的期刊名称均为中文拼音，不含英文翻译。输入检索词

6、后，PubMed的自动词匹配功能将优先将这些词转换成医学主题词(同时作为自由词)进行检索，而不是自动检索期刊和作者姓名。搜索作者姓名时，很容易检索到姓名格式相同但实际上不同的其他作者。对策使用受限字段检索，格式：搜索项的字段名称，例如，钟nsau使用半角双引号调出搜索项，迫使PubMed进行精确的短语检索。例如，如果您在搜索框中输入“基因治疗”，系统将直接在数据库的所有字段中搜索该短语，而不是执行自动单词匹配功能。使用布尔逻辑运算符添加约束。例如，搜索广州医学院钟南山的论文：钟nsau和广州med*ad、数据库字段、常用字段：ad(作者)、au(作者)、TI(标题)、LA(语言)、MH(主题)

7、、PT(文档类型)、(标题/)国家或地区)、RN(酶代码和化学文摘登记号)、TA(期刊名称)以及数据库辅助检索的使用方法，限制预览/索引历史剪贴板细节，限制、限制和修改搜索项或搜索策略以缩小搜索范围，获得更准确的搜索结果并改进一旦“限制”被设置或修改，它将对后续搜索保持有效，直到它被再次设置。作者搜索(按作者搜索，可输入多个作者姓名)、期刊搜索(按期刊搜索，可输入多个期刊名称)、仅全文、自由全文和摘要；日期(出版日期和加入PubMed数据库的日期)；受试者(湖南人或动物)；性别(性别)；语言)；文件；子集。和：物品类型；受试者的年龄组；指定标签术语。预览/索引、预览/索引包括预览和索引功能。预

8、览预览最后三个搜索的结果，对每个搜索进行编号(#加数字)，列出搜索公式、搜索时间和命中文档的数量。用户可以根据命中文档的数量来判断是否需要进一步修改搜索公式来缩小或扩大搜索范围，从而避免每次传输大量数据而浪费时间。在此栏中，您可以直接进行新的匹配。用鼠标单击预览中的索引号链接，将出现一个“选项”菜单，供用户执行相关操作，如逻辑组合(与、或、否)、删除、搜索(执行)、查看搜索详细信息、保存在我的NCBI等。用鼠标单击命中记录的数量，查看检索到的文档。索引是从索引中查看和选择关键字。例如，要搜索与结核病相关的网格词，请在输入框中输入结核病，在前面的下拉菜单中选择网格术语，然后单击索引按钮。所有与结

9、核病和点击记录相关的关键词将显示在以下滚动索引窗口中。选择“结核病/药物治疗(19012)”并点击“与”、“或”或“否”按钮，结核病/药物治疗网格术语将自动出现在检索问题框中。历史记录、历史记录的功能与预览类似，但历史记录可以保存用户的所有检索请求和结果。该窗口显示检索序列号、检索公式、检索时间和命中文档数。单击“清除历史记录”按钮清除所有检索历史记录。用鼠标点击历史中的检索类型号，还会出现一个“选项”菜单，供用户逻辑组合(与或否)、删除、搜索(执行)、查看检索详细信息、保存在我的NCBI等。点击热门文献编号，查看检索到的文献。搜索记录在系统中保存8小时。剪贴板，剪贴板主要用于临时存储一个或多

10、个检索结果中的选定记录(“发送到剪贴板”包含在PubMed检索结果处理方法中)。用户可以对剪贴板中的文档进行排序和发送，也可以对剪贴板中的文档进行进一步的搜索：例如，要查找剪贴板中的英文文档，可以在搜索框中输入“#0和英文LA”，这不会影响剪贴板中的内容。#0表示剪贴板中的现有文档。剪贴板可以容纳多达500个文档；如果PubMed停止8小时或更长时间，剪贴板的内容将被清除；详细信息、详细信息的功能主要用于查看和编辑每次检索，并可以添加或删除搜索词。例如，在简单搜索框中输入搜索词“肝癌肝炎”并搜索，您可以在详细信息中看到相应的转换过程。“查询翻译”项列出了该搜索词的自动匹配；用户可以修改该检索公

11、式，并点击“搜索”按钮再次检索。点击“网址”按钮，进入显示本次搜索结果的页面，使用浏览器的书签(或收藏夹)菜单，将当前搜索项以书签的形式保存为网址，以便下次再次搜索；“结果”项表示该搜索中命中文档的数量；“翻译”项描述了用户输入的每个搜索词的转换；数据库描述了这次检索的数据库对象；“用户查询”列出了用户在该搜索中输入的搜索词。特殊搜索、期刊数据库、MeSH数据库、单次引用匹配器、临床查询、期刊数据库、PubMed期刊的查询相关信息：您可以在期刊名称(全名或缩写)、ISSN号和期刊名称中输入任意一个或多个词来查找期刊的详细信息。包括标题、ISSN编号、标题缩写、国际标准化组织缩写、出版起始年份、

12、出版商、延续注释、语言、出版国家、主题术语、NLM标识等。并选择“发送到搜索框或”命令来搜索在此期刊上发表的文献。MeSH数据库，供用户查询医学主题词并构建相关检索策略：输入自由词，系统将提供相似主题词供用户选择。例如，点击“MeSH Database”，界面将进入关键字检索状态。在搜索框中输入“艾滋病”，系统会在页面中列出相关的医学关键词，并逐一进行简要评论。点击其中一个关键字，系统将显示该关键字的详细信息。包括：词义标注包含在医学主题词表中的年数，所有可以与主题短语表匹配的子主题词(可以检查)，主题词的树形结构表是否将主题词限定为主主题词(仅限于对主主题标题的搜索)，是否进行扩展搜索(不要

13、分解该术语)，输入“辅助”进行搜索， 系统列出相关关键词：点击所需关键词，输入关键词的详细信息，选择子关键词“饮食疗法”、语义标注、收录时间、搭配子关键词(允许多选)、是否仅限于主关键词、是否扩展。，获得搜索结果，使用搜索公式，虽然通过主题词数据库搜索主题词很麻烦，但其搜索结果准确度高且不易遗漏，因此可以说是最好的搜索方法之一。一旦掌握了，就能事半功倍。单次引用匹配器(Single引文匹配器)，单次引用匹配器可以通过输入论文的相关信息，如论文名称、卷、期、页码、出版日期、作者和论文标题的关键词，快速检索论文。例如，我们知道一位名叫哈钦斯的作者在1979年发表了一篇论文。这篇论文在杂志上的最初页码是745，但我们不知道这份文件的其他相关信息。我们可以通过单引用匹配器(未知为空)输入有限的已知信息，快速找到这篇论文。单次引用匹配器的功能也可以通过上述PubMed有限域搜索来实现。在上例中，您可以在搜索框中输入搜索公式“HutchinsA