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文档简介

1、生物信息学，第7章基因组分析，人类基因组计划，基因组，转录组和蛋白质组，基因组，转录组，蛋白质组，化学生物学，本章摘要，1。基因组结构和内容2。基因组注释3。比较基因组学4。基因/蛋白质功能预测，1。基因组结构和内容，(1)基因结构(2)基因：可变剪切(3)蛋白质：翻译后修饰(4)相互作用网络：基因、蛋白质和小分子之间的相互作用(5)非编码区a .功能元件：转录因子结合位点；启动子非编码核糖核酸：微核糖核酸转座子重复片段假基因，(1)基因结构，基因组大小介导其他核糖核酸分子的化学修饰，如甲基化，微核糖核酸/微核糖核酸，1。长度21-23bp 2。调节基因的表达。前mirna: 70bp，转座子

2、：能够在基因组2中移动位置的DNA序列。基因组注释，(1)基因组序列组装，(2)基因预测，(3)可变切割的预测，(4)非编码功能元件的预测，(1)基因组测序：鸟枪法，基因组组装，由重复序列引起的干扰，(2)基因预测，直接，在相同或相关物种中高度匹配的序列，与EST，cDNA，蛋白质和其他序列的完全或接近完全匹配，间接，基于统计的序列比对(同源性)从头预测，上述两种方法的组合，真核生物的基因结构， 外显子(CDs en rightaj等人，自然，1999，402:86-90，基因组a，基因组b，基因顺序/双向对的保守性，基因顺序对，双向转录基因对，丹德卡尔等人，TIBS，1998，23:324-328； 奥弗贝克等人，PNAS，1999，96:2896-2901；科贝尔乔等人，NBT，2004，22:911-917，系统发育谱，佩莱格里尼等人，PNAS，1999，9633604285-4288；胡宁等，PNAS，1998，95:5849-5856，相关序列签名，甲，乙，该模型计算速度更快，更方便，PID模型，PIDC模型，PID模型：最大似然法，P(Imn=1):训练，保守共表达，不是生产者价格指数，但功能链接，斯图亚特JM等，科学，2003，3023360249-255；Vo

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