克氏原螯虾遗传多样性.ppt

1、克氏原螯虾8个野生群体遗传多样性及遗传分化的SSR分析,答辩人: 邓 伟 专 业: 水族科学与技术 导 师: 高泽霞,Outline,前 言 材料与方法 结果与分析 讨 论 致 谢,1,2,3,4,5,一、前言,克氏原螯虾(Procambarus clarkia)，味道鲜美， 营养丰富，近年来已成为池塘养殖的特种经济水产品之一。随着分布地域及养殖规模的逐步扩大，在基因水平上研究克氏原螯虾野生群体的遗传变异及群体间的遗传关系对防止群体退化，保持高效、 稳定生产十分必要。,一、前言,本研究使用微卫星标记对洞庭湖(DT)、鄱阳湖(PY)、嘉兴(JX)、无锡(WX)、简阳(JY)、宁乡(NX)、忠县(

2、ZX)和沅江(YJ)这8个克氏原螯虾野生群体的遗传多样性状况及遗传结构进行研究分析，为有效开展克氏原螯虾种质资源的调查和遗传育种研究提供一定的理论依据。 。,二、材料与方法,技术路线,样品采集,DNA提取,引物优化,GenBank,引物筛选,聚丙烯酰胺凝胶电泳,群体遗传多样性和遗传结构分析,二、材料与方法,使用POPGENE32软件对有效等位基因数、 杂合度、遗传相似度、遗传距离等指标进 行计算与分析。 LittleProgram软件计算多态信息含量(PIC)，利用公式计算基因流(Nm)。 使用MEGA 4.0软件用非加权配对算术平均法对8个克氏原螯虾群体进行聚类分析。,三、结果与分析,引物P

3、CLG-15位点在嘉兴群体个体中的基因型检测,引物PCLG-29位点在嘉兴群体个体中的基因型检测,三、结果与分析,8个克氏原螯虾野生群体在12个微卫星位点基本信息,三、结果与分析,平均期望杂合度值为0.7391，平均多态信息含量为0.6949，说明这8个野生群体具有较高遗传多样性，8个群体的遗传多样性从高到低依次为：洞庭湖群体，无锡群体，嘉兴群体，沅江群体，宁乡群体，鄱阳湖群体，简阳群体，忠县群体。,三、结果与分析,8个克氏原鳌虾群体间遗传相似度和遗传距离,遗传相似度(对角线上)和遗传距离(对角线下),三、结果与分析,群体间遗传相似度在0.4804-0.7822，遗传距离在0.2457-0.7

4、332，鄱阳湖群体与简阳群体的遗传相似度最小，遗传距离最大，说明这两个群体间遗传变异程度最高，亲缘关系较远；宁乡群体与沅江群体的遗传相似度最大，遗传距离最小，说明这两个群体间遗传变异程度最低，亲缘关系较近。,三、结果与分析,8个克氏原鳌虾群体Neis聚类图,三、结果与分析,8个群体聚类后可分为3组： 洞庭湖群体、鄱阳湖群体、宁乡群体和沅 江群体聚类为一组 嘉兴群体和无锡群体聚类为一组 简阳群体和忠县群体聚类为一组,三、结果与分析,8个克氏原鳌虾群体间基因流与种群分化指数,基因流值(Nm)(对角线上)与种群分化指数Fst(对角线下),三、结果与分析,各群体间基因流值在1.1241-4.1850，

5、种群分化指数在0.0564-0.1819 8个群体间的基因流值Nm 1，基因流水平较高 各个群体间的种群分化指数Fst 0.05，群体之间都存在中度分化 洞庭湖群体和宁乡群体间的Nm 4，存在广泛的基因流，群体间是随机交配的群体 简阳群体和鄱阳湖群体间的种群分化指数Fst 0.15，两群体间为高度分化,四、讨论,洞庭湖群体的遗传多样性最高，可能与当地种质资源丰富，自然群体越大，基因流的机会越多，基因丢失的速率越慢，遗传多样性就越高。 忠县群体的遗传多样性最低。可能由于忠县群体与其它群体缺乏交流，有效群体较小及瓶颈效应等因素的存在使得该群体遗传多样性水平最低。,四、讨论,洞庭湖群体与鄱阳湖群体，宁乡群体与 沅江群体亲缘关系分别较近，可能与两地 频繁引进克氏原螯虾开展养殖有关 鄱阳湖群体和简阳群体之间的亲缘关系 较远，两地相隔的地理距离较远，群体之间的基因交流较少,四、讨论,克氏原鳌虾被引入中国南京后，便开始向周边地区迁移和扩散， 无锡群体和嘉兴群体都受到人为引种的影响，2个群体间的亲缘关系较近。简阳群体和忠县群体的地理距离不远，人为因素的介入使这2个群体之间存在频繁的遗传物质交流，两群体有着较近的亲缘关系。,