如何撰写sc i医学论文之个人体会

-精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 1 如何撰写 SCI 医学论文之个人体会 如何撰写 SCI 医学论文之个人体会 作者简介：程博士、肿瘤细胞生 物学、生物化学专业；美国芝加哥大学 Ben May 癌症研究所高级研究科学家； “SCIE 高级 SCI 英文主任编辑 自 2005 年开始 撰写自己第一篇 英文学术论文开始，特别是自 2006 年 赴美研究四年多里，各种 SCI 英文研究 性论文、国际会议论文及国际学术会议 的摘要等已撰写过十余篇。初期文章写 作总是漫长而痛苦的的过程，不但字句 要反复斟酌，经历反复修改，可最后成 稿的文章可能因为 reviewer 评审中存在 language and structure issue 而从头来过。 其中甘苦非亲身经历别人难以体会。然 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 2 而，在写过最初的三、四篇文章之后， 亦能从磨难的经历中总结出英文文章写 作中的一般规律和审稿人的常见要求。 最近因为担任“SCIEDIT ”高级英文编辑 的缘故，使得自己有机会去评审一些来 自国内的英文学术论文的手稿，在此结 合自己评审经历中遇到的现象，谈一下 一般性 的 SCI 论文写作的常见问题， 旨在抛砖引玉。 从根本上说，一项研究成果到底 否发表成一篇 SCI 论文是由研究本身的 水平决定的，这也是我们在评审过程中 坚持的最高原则，如果初步判定研究存 在着严重的缺陷，则写作再出色仍不能 起到起死回生的作用。然而，但研究达 到一定水准，具备冲击 SCI 期刊的可能 时，则专业的英文写作和出色的文章组 织结构将能锦上添花、有效提升文章档 次的作用。下面按 SCI 文章写作的主要 方面谈谈这方面的问题。 标题：在我们评审的文章中， “SCIEDIT”的很多客户稿件因为标题不 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 3 够精炼或表达不准确而使得审稿人一开 始就对文章的印象打了折扣。常见的是 用平实的陈述语句总结实验的初始目的， 不能显示出研究的意义所在，如： “Integrated expression of the -amylase, dextranase and glutathione gene in an industrial brewers yeast strain”。实际 上，本文探讨的是通过将三个不同的基 因共整合并表达至啤酒酿造工业常用的 TYRL21 酵母中而提高了啤酒的多种品 质，因此本文的出彩之处并非在于分子 生物学中常见的质粒构建和基因表达方 面，而在于对于提供啤酒品质方面的意 义。显然上述标题完全没有体现这一点。 而如果我们简单地改成“Integrative expression of the -amylase, dextranase and glutathione in TYR21 facilitates beer quality improvement”则可显著提高审稿 人对文章的认同，因为该标题简练而清 晰地表明了研究手段“Integrative expression”和研究意义“facilitates beer -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 4 quality improvement”。简单地说，一个 好的标题应做到简练而准确地体现出研 究内容和 研究意义所在。此外，因为 有的时候实验结果较多，而有的作者又 想在标题中将研究内容一网打尽，往往 将标题起的很长，不但读起来拗口，也 可能有语法错误。对这种情况的正确的 做法是，标题只需体现研究的主要内容 及研究意义就可以了。如发表在 Molecular Cel l 上的“Tip60-dependent acetylation of p53 modulates the decision between cell-cycle arrest and apoptosis”一 文，大大小小的实验有几十个之多，但 标题只是点睛般的提出 Tip60-dependent acetylation of p53 对细胞周期及细胞凋 亡上的调节，至于如何调节则不需在标 题中反应出来，因为有研究的意义 “decision between cell-cycle arrest and apoptosis”就可以了。 摘要：如果说标题是一项研究的 初始感觉，则摘要就是真正深入实质的 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 5 第一印象。摘要不但能基本反映出研究 的水平是否达到了 SCI 的标准，作者的 英文写作水平基本也能反映出来。单就 写作角度来说，很多“SCIEDIT ”编辑评 审文章的摘要不具备标准的摘要写作的 三层次的逻辑结构：即 a）通过简单的 背景描述显示当前研究某方面不足； b）由此引申出本研究的目的和研究结 果概要；c）通过对上述不足的解决显 示本研究的意义所在。下面以我发表在 国际知名肿瘤学期刊 Oncogene 上的一 篇文章的摘要为例： The histone acetyltransferase TIP60 regulates the DNA damage response following genotoxic stress by acetylating histone and remodeling chromatin . However, the molecular mechanisms underlying the TIP60- dependent response to UV-induced DNA damage remain poorly understood . To systematically analyze proteins that regulate TIP60 activity in response to UV -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 6 irradiation , we performed a proteomic analysis of proteins selectively bound to TIP60 in response to UV irradiation using mass spectrometry and identified a novel regulatory mechanism by which TIP60 orchestrates transcriptional activation of p53-dependent checkpoint response in UV-irradiated cells. The initial step of this pathway involves UV-induced association of TIP60 with SUMO-conjugation enzymes and site-specific sumoylation of TIP60 at lysines 430 and 451 via Ubc9. This sumoylation initiates the relocation of TIP60 from nucleoplasm to the promyelocytic leukemia body, which is essential for the UV-irradiated DNA damage repair response via a p53- dependent pathway. Significantly, inhibition of TIP60 sumoylation by overexpression of non-sumoylatable mutant abrogates the p53-dependent DNA damage response, demonstrating the -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 7 importance of TIP60 sumoylation in response to UV irradiation. Furthermore, our biochemical characterization demonstrated that the sumoylation of TIP60 augments its acetyltransferase activity in vitro and in vivo 。. Thus, this study shed new light on the function and regulation of TIP60 activity in UV- irradiated DNA damage response 。 引言：没有人会否认在整个英文 文章撰写过程中，引言和讨论是最为困 难的两个写作部分。引言写作的困难在 于如何对大量的与自身研究相关的文献 进行分析，一方面为本研究提供必要的 研究背景，一方面从分析中获得以往研 究的不足，即批判性分析，为自身研究 的科学意义奠定基调。在“SCIEDIT ” 编辑评审文章的过程中，常见的引言写 作缺陷包括文献分析不足、无关文献的 引用、引用文献的逻辑关系的建立等。 在我们评审的很多文章中，引言部分读 完了不知道作者想表达什么样的中心思 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 8 想，似乎只是把与他研究有关文献的结 论简单地复述一遍，看不出别人的研究 和自己的 研究有什么必然的联系。这 实际是引言部分写作的致命缺陷。 一般性的引言写作模式是： 1）引用分析：对与自身研究紧 密相关的文献做一简单但突出核心的综 述，突出当前研究的进展； 2) 批判分析：对于 SCI 层次的文 章来说，重复别人的研究显然不可能发 表。因此在引用分析的基础上必需要有 正确的批判性分析，即当前的研究有那 些不足或有那些自相矛盾的地方，从而 为自己的研究奠定逻辑上的必要性； 3）自身研究意义分析：在上述 两种分析的基础上，下面就可以水到渠 成地提出进一步研究的必要性。首先在 简单描述主要实验结论后，需要突出阐 明出自身研究的意义所在，如解决了上 述讨论中存在的那些问题或厘清了那些 模糊的认识等。 以发表的 “Functional -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 9 characterization of TIP60 sumoylation in UV-irradiated DNA damage response”为 例，引言部分的写作需要包括对 TIP60 蛋白、sumoylation 修饰现象和 DNA damage 的研究背景进行综合分析，但 这种分析不是简单而孤立地描述以上三 种研究领域的进展，必需寻找三者之间 的结合点。如 TIP60 有很多功能，作者 不可能也不需要面面俱到，只需突出 TIP60 在 Protein post-tranlational modification 及 DNA damage 中的研究 结合点；同理，对 sumoylation 的分析 也只需放在对如 TIP60 这样的 acetyltransferase 和 DNA damage 上面。 一言以蔽之，引言分析中必需体现三者 必要的逻辑联系，并明确指出其间存在 的研究空白，即“Whether TIP60 is a potenital SUMOylated substrate in UV- induced DNA damage response”，而对上 述问题的阐明将“Deepen our understanding to DNA damage-reduced tumorigenesis”，从而顺理成章提出本研 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 10 究的科学意义所在。而很多国内的作者 往往不能认真分析与自身研究相关的文 献，不但文献引用粗糙，而且分析不足 导致审稿人看不清你的研究的意义在什 么地方，并且由于写作逻 辑层次混乱得不出自己研究的必 要性和重要性。因为 SCI 文章需要强调 研究的新颖性 和重要性，则如果引言 部分的写作不能让审稿人明确感觉到上 述两点，那么对下面研究结果的审阅就 少了很多兴趣。 研究结果 ：我们发现研究结果 的写作在很多作者的眼里只是简单地、 孤立地描述某项实验的过程和发现，完 全忽视了对结果的分析和结果之间逻辑 关系的建立。如一开始提笔就是“In Figure 1, we found that knock-down of xxx protein inhibit the cancer cell proliferation”，或稍微好一点的是： To examine where xxx protein funtion in cancer cell proliferation, we performed siRNA- mediate approach to inhibit the -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 11 xxx protein expression”。在这种情况下， 逻辑上，作者需要说明该实验为什么要 做的必要性，即在简单的背景介绍下提 出实验执行的合理性。其次，当作者解 释完 Figure 1 再引入对 Figure 2 的说明 前，需要解释为什么要做针对 Figure 2 的实验，即两者之间有着什么样的必要 关系。从写作角度来说，逻辑衔接是其 中最重要的一项任务，通俗地说就是要 体现出为什么要做某项实验，为什么做 了实验 A，还要做实验 B，接着还要做 实验 C 等等。最糟糕的写作方式莫非提 笔就描述某个实验现象和结论，既不解 释做这个实验的目的，然后又毫无征兆 地跳到下一个实验的描述上。严密的逻 辑性是科学研究的内在属性，因此在实 验结果的写作是必须要体现出来。实际 上，逻辑衔接的建立在该部分的写作上 模式可循。例如，a) 你为什么要做这个 实验：Previous studies showed that ., However, it is still not clear whether Thus, to investigate -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 12 ., we performed .b) 为什么要 做下一个实验：As shown in Figure A, we demonstrated that . To further explore , we next carried out Experiment B to addressc) 实验结 果之间有什么关系，得出什么结论： Collectively, all these results revealed that , we therefore conclude that . 在研究结果部分存在的另一种常 见缺陷是，对一种实验现象证明的严谨 性和完备性不足，以及实验结果之间的 无序安排。这既是研究自身的问题，也 是写作上各个结果之间逻辑关系排列的 问题。如 “By FACS analysis, we demonstrated that A inhibitor can arrest cancer cells in G1/S phase and effectively induce apoptosis, we then conclude that this inhibitor may be used a drug in cancer therapy”。显然从研究的完备性来说， 证明 cell cycle arrest 和 apoptosis 固然可 以用细胞流式的方法，但是对于 SCI 层 次的文章来说，仅有该一种分析证明是 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 13 不足的，还需要有其他的生化分析的证 明，即 cross-check。另一方面，仅凭这 点实验证据，姑且认为实验是 100%正 确的，就得出“this inhibitor may be used a drug in cancer therapy”是一种极不严谨 的描述，让人反感。 讨论 ：毫无疑问，讨论部分可 能是最难写的部分了，因为不知道要讨 论些什么。讨论部分写作存在这三种常 见的不足：1）讨论写的像综述，与自 身研究没有关联。既花上大段的篇幅对 所研究的背景描述一番，而这种描述完 全是总结前人的研究成果，与当前的研 究没有瓜葛。2）讨论写的像引言，常 常是把引言部分的研究背景再描述一遍， 然后说明自己为什么要做自己的实验。 3）讨论写的像实验结果的再次综合性 描述，即重复性地依次地把把各部分的 实验结果叙述一遍。后两种情况是讨论 写作中最常碰见的缺陷，并且也正是讨 论部分写作的大忌。讨论部分当然需要 再次介绍研究背景，但此时背景介绍的 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 14 侧重点已和引言部分不同，即转换为和 本研究结论相关的背景的介绍，以突出 自身研究的 novelty 和 significance。 换句话说，讨论部分需要你提出解释 。你的研究结果如何和别人的研究结果 相似，那么你需要解释你的不同之出； 或者你的研究结果出乎意料，那么你更 需要分析其中原因，提出合理的解释。 特别对于实验结果的主要部分，需要分 析实验现象，合理地提出解释原因。大 体上，在写作上，讨论部分常需要涉及： a）在背景分析基础上的研究对比；b） 对实验结果作出解释；c ）总结性描述 本研究的 novelty 和 significance，并提 出研究的 prospective。 封面信 ：如果说文章的标题是 给人的第一印象，而第一印象有可能是 不准确的，那么 cover letter 基本上就能 对文章定调了，尤其是对于编辑而言。 通俗地说，cover letter 的写作更需要像 文章的自我介绍，自信之中务必突出自 己的不同之处。cover letter 的写作实际 -精选财经经济类资料- -最新财经经济资料-感谢阅读- 15 上更有规律可言，第一句话往往是 “We would like to submit the enclosed mauscript entitled “xxxxxxxxxxxxxxxxx”， which we wish to be considered for publication in xxxxx”。接下来就需要对 本研究的背景做高度的概括性描述并显 示出该领域的研究是重要的，如“As we know, xxx protein palys crucial roles the breast cancer metastasis by regualting xxxx pathway”，下面需要突出在该领域 还有什么没解决的， “However, it is still unclear whether the protein xxxxxxxx, hindering the deep understanding to tumorigenesis in breast cancer”。然