第四节化能异养型微生物代谢中的能量形式转换（ppt x页）课件

第四节 化能异养型微生物代 谢中的能量形式转换 Date1张星元：发酵原理 化能异养型微生物利用化 学能源，并以有机化合物为主 要碳源和能源进行生命活动。 化学能源物质作为能源化合物 参与生物氧化，从而获得可以 直接支持生命活动（支撑生命 ）的代谢能。 Date2张星元：发酵原理 2.4.1 氧化还原对及其氧化还原电位 2.4.2 电子载体与高能（磷酸）键载体 2.4.3 生物学体系中的能量耦合 2.4.4 与呼吸、发酵对应的代谢能转换 机制 Date3张星元：发酵原理 2.4.1 氧化还原对及其 氧化还原电位 Date4张星元：发酵原理 2.4.1.1 2.4.1.1 溶质标准状况的规定溶质标准状况的规定 2.4.1.2 2.4.1.2 生化反应前后自由能的变化生化反应前后自由能的变化 2.4.1.3 2.4.1.3 氧化还原电位的测定及标准氧化还原电位的测定及标准 状况的规定状况的规定 Date5张星元：发酵原理 氧化还原系统中成对的氧化物 和还原物被称为氧化还原对（redox couple），又称为电极对，其通式为 ：氧化型 / 还原型。 例如： NAD+NADH+H+ Fe3+Fe2+。 Date6张星元：发酵原理 在氧化还原电极对之间有电子转移的 趋势，它们的还原电位（或称电极电位） 就是衡量这种电子转移（获得电子）的趋 势的物理量，记作“E ”。在物理化学标准 状况下电极对的还原电位，叫标准还原电 位，记作E0。在生物化学标准状态下电极 对的还原电位记作E0，叫生化标准还原电 位。所谓标准还原电位，是根据下述溶质 的标准状况的参考标准来定义的。 Date7张星元：发酵原理 2.4.1.1 溶质标准状况的规定 Date8张星元：发酵原理 在生物系统中，溶质标准状 况有它的特殊性，因为生化反应 通常在接近中性 pH 的稀水溶液 中进行。已对生物系统的标准状 况作如下参考规定： Date9张星元：发酵原理 水的标准状况规定为纯液体 的标准状况。因而，水的浓度（或 活度）取作 1 ，尽管实际上水的摩 尔浓度为55.5 mol/L。 氢离子的活度规定为对应于 在生理 pH 条件（ pH 7 ）的活度 ，而不是化学标准状态规定的 pH 0（ 氢离子活度为 1 ）的活度。 Date10张星元：发酵原理 能经历酸碱反应的化合物的标能经历酸碱反应的化合物的标 准状况规定为其天然存在的离子混合准状况规定为其天然存在的离子混合 物在物在 pH 7 pH 7 的条件下的总浓度。这样的条件下的总浓度。这样 做的好处在于，通常测量一个化合物做的好处在于，通常测量一个化合物 的总浓度比测量其一种离子的浓度要的总浓度比测量其一种离子的浓度要 更容易些。然而，因为酸或碱的离子更容易些。然而，因为酸或碱的离子 组成随组成随 pH pH 值而变化，用总浓度计算值而变化，用总浓度计算 标准自由能时，只能采用标准自由能时，只能采用 pH 7 pH 7 时的时的 浓度。浓度。 Date11张星元：发酵原理 使用上述参考规定时， 标准自 由能变化一般用符号G 0（生化标 准状况下自由能的变化） 来表示， 这里加上撇号“ ”，以区别于物理化 学标准状况下自由能的变化G 0。由 于 自由能变化与所规定的参考状况 无关， 所以参考状况是可以人为选 择的。 Date12张星元：发酵原理 然而，在用公式表示水和质子对 自由能变化的影响时，规定这参考状 况是很重要的，如果用生化标准状况 作参照，水的浓度可以从公式中省去 。类似地，如果反应在 pH7条件下进 行，则质子浓度不必包括在公式中（ 如果反应在 pH 值不等于 7 的情况下 进行， 质子浓度应当取与 10-7 有关的 值，即应当以 “ H+ /10-7 ” 的方式出 现）。 Date13张星元：发酵原理 2.4.1.2 生化反应前后自由能的变化 Date14张星元：发酵原理 在活细胞内的反应条件是恒温、恒压 的条件。在恒温、恒压条件下，各类化学 反应能否自发进行，取决于自由能的变化 “G ” 的值（反应的G与变化的途径无 关）。 当 G0 时，反应能自发进行，并 能放出自由能量； 当 G0 时，反应已达到平衡； 当 G0 时，反应不能自发进行， 必须 “注入” 代谢能才能进行。 Date15张星元：发酵原理 生物体内的反应在恒温、恒压下 进行，反应的自由能变化是： G = G终态 G始态 如果反应系统处于平衡状态，上 式可进一步化为： G = G 0 + RT ln Keq Date16张星元：发酵原理 当系统达到热力学平衡（G= 0），则 有： G 0= - RT ln Keq R 是摩尔气体常数8.314 J（molK ）-1 ， 平衡常数Keq可以测得的，因此可以从该反应 的Keq值及绝对温度T ，来推算G 0。当然 G 0的值也可以通过查表获得。 Date17张星元：发酵原理 2.4.1.3 氧化还原电位的测定 及标准状况的规定 Date18张星元：发酵原理 在测量电极对的还原电位时，常用 氢电极作为标准电极，并要求样品半电 池的氧化物、还原物对子的溶质的浓度 均为 l molL-1； 对参比半电池为氢电极 的情况来说，H+ 浓度为 l molL-1（ pH 值为 0）；H2为l atm。指定氢电极的标 准还原电位E0为零，因此，两个半电池 的电位差即为样品对子的标准还原电位 。 Date19张星元：发酵原理 为了使电极对的还原电位数据 有可比性，必须对溶质的标准状况 作上述严格的规定。下表列出了若 干在生物学上比较重要的氧化还原 对子的 E0 值。 E0 是在 pH 7.0 和 25条件下，相对于标准氢半电池 的生化标准还原电位的测定值。 Date20张星元：发酵原理 Date21张星元：发酵原理 可以预见，在生化标准状况可以预见，在生化标准状况 下，表中任何指定的氧化还原对下，表中任何指定的氧化还原对 ，倾向于还原任何列在它下面的，倾向于还原任何列在它下面的 氧化还原对，其相对位置是它们氧化还原对，其相对位置是它们 之间之间氧化还原热力学自发性氧化还原热力学自发性的度的度 量。量。 Date22张星元：发酵原理 在生物体中，氧化还原反应的标准自由 能变化（ G 0 ） 实际上是与两个氧化还原 对之间的标准还原电位之差 （ E0） 成线 性关系的。两者的关系可用下式表示： G 0= - nFE0 式中，n 为电子传递数目，F 为法拉第 常数（9.6485104Cmo1）， E0 为电子 受体的E0减去电子供体的E0所得之差值。 Date23张星元：发酵原理 2.4.2 电子载体与高能 （磷酸）键载体 Date24张星元：发酵原理 2.4.2.1 电子载体与氢载体 2.4.2.2 高能（磷酸）键载体及能量偶联 Date25张星元：发酵原理 2.4.2.1 电子载体与氢载体 电子载体广义地包括脱氢酶的 辅酶和电子传递链的全体成员。广 义的电子载体又可以分为氢载体和 电子载体。 Date26张星元：发酵原理 脱氢酶的辅酶 NAD+ 实际上是氢负 离子（ hydride ion，即一个质子和一对 电子 ） 的载体； 黄素蛋白和CoQ 实际 上是氢原子（一个质子和一个电子 ）的 载体，它们均可称为氢载体。 铁硫蛋白（ Fe-S-P ）和细胞色素是 狭义的电子载体。 Date27张星元：发酵原理 这些载体的氧化型和各自的还这些载体的氧化型和各自的还 原型配对，组成各自的氧化还原电原型配对，组成各自的氧化还原电 极对。例如：极对。例如： NADNAD + + NADH+HNADH+H + + 、FAD/FADHFAD/FADH 2 2 、CoQ / CoQHCoQ / CoQH 2 2 和和 FeFe3+ 3+ FeFe2+ 2+ 等。 等。 Date28张星元：发酵原理 2.4.2.2 高能（磷酸）键载体 及能量偶联 Date29张星元：发酵原理 根据热力学第二定律，当反应体系 的G 0 时反应不能自发进行，若要 进行，必须提供足够的、可以被反应体 系利用的能量。在细胞中，这种可以利 用的能量只能来源于放能反应所释放的 自由能，而且只有当放能反应提供的自 由能大于该需能反应所需的自由能时， 反应才能进行。 Date30张星元：发酵原理 生物学中定义：由放能 反应提供自由能，用以驱动 需能反应的过程，被称为放 能反应与需能反应之间能量 的偶联。 Date31张星元：发酵原理 然而，在生物体内，放能反应不 能与需能反应直接发生偶联，必须借 助能量载体才能将放能反应所释放的 自由能的一部分（生物可直接利用的 能量）提供给需能反应，从而驱动需 能反应。大自然已选择5-三磷酸腺嘌 呤核苷（ATP）作为生物可直接利用 的能量的载体。我们把这种细胞可直 接利用的能量叫做代谢能。 Date32张星元：发酵原理 高能磷酸 酯键 普通磷酸 酯键 Date33张星元：发酵原理 在生命活动过程中，生 物体不断地消耗ATP，同时 也不断再生ATP，因此ATP 的转运、使用和再生是生物 最重要的生理过程。 Date34张星元：发酵原理 2.4.3 生物学体系中 的能量耦合 Date35张星元：发酵原理 在化能异养型微生物中，能 源化合物被氧化时放出的化学能 主要通过以下 3 种机制转换成生 物可以直接利用的能量代谢 能。 Date36张星元：发酵原理 2.4.3.1 2.4.3.1 直接化学耦合直接化学耦合 2.4.3.2 2.4.3.2 电耦合电耦合 2.4.3.3 2.4.3.3 还原当量耦合还原当量耦合 Date37张星元：发酵原理 2.4.3.1 直接化学耦合 Date38张星元：发酵原理 直接化学耦合指的是代谢中间化合 物参与的底物水平磷酸化的过程。也就 是代谢中间化合物 （ 如 1,3-2P-GA 、 PEP、ScCoA和乙酰磷酸等高能磷酸化 合物）的高能磷酸键的水解反应与ADP 或 GDP 的磷酸化反应直接耦合。 借助 于对应的酶的催化作用，在酶的底物的 水平上发生磷酸化作用，形成特殊的高 能化合物（ATP、GTP）的过程。 Date39张星元：发酵原理 这类代谢中间化合物，也就是前面所 谓酶的底物，包括酵解途径中由脱氢酶催 化的反应生成的 1,3-2P-GA， 由烯醇化酶 催化生成的PEP，TCA环中由- KG脱氢酶 催化生成的 ScCoA，以及 PK 途径中的由 磷酸酮解酶（phosphoketolase）裂解酮糖 生成的乙酰磷酸等高能化合物。这些高能 （ 磷酸 ） 化合物在对应的酶（ 1,3-2P-GA 对应于3-P-GA 激酶，PEP对应于PYR激酶 ）的催化下将ADP 磷酸化成 ATP。 Date40张星元：发酵原理 2.4.3.2 电耦合 Date41张星元：发酵原理 电耦合是指以质子运动势p为媒 介，借助电子传递链和 ATP 酶， 将 ATP的使用（ATPADP）与 ATP 的 再生（ADPATP）耦合起来。 详见 本章 2.4.4。 Date42张星元：发酵原理 2.4.3.3 还原当量耦合 还原当量，还原当量耦合 Date43张星元：发酵原理 还原当量 讨论还原当量耦合问题，首先必须 弄清什么叫还原当量。 生物化学将相当于一个电子或一个 氢原子的还原力的量叫做一个还原当量 。本课程为了说明问题的方便，将相当 于一对电子或一个氢负离子（hydride ion） 的还原力的量叫做一个还原当量。 Date44张星元：发酵原理 所谓氢负离子是指所谓氢负离子是指 HH - - ， 即即 HH + + + + 2e2e - - - - ，也就是一个质子也就是一个质子 和一对电子。和一对电子。 NADNADHH是是NADNAD + + HH - - 的简的简 写。写。 Date45张星元：发酵原理 因此，NAD+ 是氢负离子的载体，也 就是一对电子和一个质子的载体，当然也 是一对电子的载体。脱氢酶的辅酶 NAD+ 作为一对电子 （ 即还原当量 ） 的载体， 其氧化型是空载的，其还原型携带了还原 当量的，所以也有人把还原型辅酶当作还 原当量，或把它称为还原力。就像我们把 ATP称为代谢能，而实际上ATP是代谢能 的载体一样。 Date46张星元：发酵原理 发生生物氧化时，还原性化合物（还 原剂）脱氢（氧化）而释放出“氢”（有些 书上标写为“2H” ），这个 “氢” 实际上是1 对电子和2个质子，这2个质子有时结合在 辅酶或辅基上，有时其中一个质子存在于 溶液中，因此有： NAD+ + 2H NADH + H+ （ 其中一个质子和一对电子结合在辅酶分 子上，一个质子存在于溶液中）； FAD + 2H FADH2 （两个质子和一对电子都结合在辅基上） 。 Date47张星元：发酵原理 AMP FMN FADH FADH 2 FAD 图4-23 FAD + 2H FADH2（这两个质子结合在辅基分子上） Date48张星元：发酵原理 图4-24 NAD+ + 2H NADH + H+ （其中一个质子和一对电子结合在辅酶分子上，一个质子存在于溶液中） H 来自水相 NAD(P) NAD(P) + + NAD(P)HNAD(P)H Date49张星元：发酵原理 还原当量耦合 还原当量耦合一般是指：直接 接受还原性化合物（还原剂）脱下 的电子而形成的还原型辅酶或辅基 ，直接与细胞内不同的氧化还原反 应相耦合。 Date50张星元：发酵原理 在生物氧化过程中，还原性化 合物的降解通常涉及它们自身被氧 化，这就要求氧化型辅酶或辅基作 为直接的电子受体参与反应；另一 方面，微生物细胞内存在着许多需 还原的过程，要求有还原型的辅酶 或辅基作为直接的电子供体参与反 应。 Date51张星元：发酵原理 一些重要的辅酶，如烟酰胺腺嘌呤二 核苷酸（NAD），其氧化型 NAD+可作为 直接的电子受体，其还原型NADH可作为 直接的电子供体，因此能将这些氧化反应 和还原反应偶联起来。如 GA-3-P 脱氢时 生成的 NADH 与乙醇脱氢酶催化的反应 相耦合，将乙醛还原成乙醇；另一个重要 的辅酶 NADP（烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷 酸），其还原形式 NADPH 主要与还原性 合成反应相耦合。 Date52张星元：发酵原理 NAD+是一些常见的脱氢酶的 辅酶， 如乳酸脱氢酶， 丙酮酸脱 氢酶、- 酮戊二酸脱氢酶、 苹果 酸脱氢酶； NADP+ 是另一些常见 的脱氢酶的辅酶 G-6-P脱氢酶，6- P-GA 脱氢酶、 异柠檬酸脱氢酶 、 - 磷酸甘油脱氢酶等。 Date53张星元：发酵原理 FAD 和 FMN 是一些氧化还原酶（ 脱 氢酶 ）的辅基， 这些酶因为有 FAD 或 FMN 作辅基而称黄素蛋白。以 FAD 为辅 基的酶有琥珀酸脱氢酶，脂酰 CoA脱氢酶 等；以 FMN（或FAD ）为辅基的酶有 L- 氨基酸氧化酶， 电子传递链的成员中也有 以FMN（ 或FAD ）为辅基的蛋白质， 如 NADH 脱氢酶。 Date54张星元：发酵原理 尽管大多数脱氢酶（氧化酶）所 催化的反应是有专一性的，但这种共 同的氧化还原耦合机制，允许不同的 酶催化的脱氢（氧化）反应为同一个 还原反应提供还原当量，允许同一个 脱氢（氧化）反应为许多其他还原反 应提供还原当量。 Date55张星元：发酵原理 2.4.4 与呼吸、发酵对应的 代谢能转换机制 Date56张星元：发酵原理 为了说明问题方便，以微生 物对葡萄糖的降解代谢为例，来 说明与呼吸、发酵对应的代谢能 转换机制。葡萄糖的降解可分成 3 个阶段。 Date57张星元：发酵原理 第一阶段是指葡萄糖进入细胞，在胞 内以葡萄糖、葡萄糖磷酸酯或葡萄糖酸的 磷酸酯的形式出现。 第二阶段是微生物细胞经酵解途径， 将葡萄糖或磷酸葡萄糖降解到处于 3C 水 平的丙酮酸。这个阶段不但通过底物水平 磷酸化生成ATP，而且向细胞质释放还原 当量。 第三阶段是丙酮酸继续代谢和代谢产 物的分泌。这是区分葡萄糖的氧化性代谢 与发酵性代谢的关键性阶段。 Date58张星元：发酵原理 如果丙酮酸或由丙酮酸继续代 谢而生成的可用作还原当量吸收剂 的化合物（如乙醛）吸收第二阶段 释放的还原当量，生成相应的还原 产物（如乙醇）。这时微生物细胞 进行发酵性代谢。这个过程因这些 还原产物的分泌而得以进行。 Date59张星元：发酵原理 如果遗传与环境条件许可，丙 酮酸相对容易地经TCA环降解，最 终可被氧化降解成二氧化碳；第二 阶段（酵解）及第三阶段所释放的 还原当量则被电子传递链吸收并传 递给外源的最终电子受体。这时微 生物细胞进行氧化性代谢。 Date60张星元：发酵原理 葡萄糖的氧化性降解代谢与发酵 性降解代谢两者最基本的区别在于： 氧化性降解代谢除了可以与发酵性降 解代谢一样通过底物水平磷酸化形成 ATP外，还经电子传递磷酸化产生更 多的ATP，从而允许微生物有更高的 生物合成速率及更高的细胞得率 ( 细 胞对葡萄糖的转化率 ) 。 Date61张星元：发酵原理 2.4.4.1 与呼吸相对应的代谢能转换机