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文档简介
DNA顺式作用元件 制作人:李静 2012110205 作物栽培学与耕作学 内容简介 顺式作用元件概述 顺式作用元件结构 顺式作用元件与反式作用因子关系 同一DNA分子中具有转录调节功能的特异DNA序列 。 定义 化学本质 存在于DNA分子中的较短的DNA序列 顺式作用元件概述 顺式作用元件在分子遗传学领域,相对同一染色体或DNA分子而言为“ 顺式” ;对不同染色体或DNA分子而言为“反式”。 顺式作用元件结构 顺式作用元件结构 (一)启动子 启动子一般位于真核基因转录起始点上游200bp以内。包括 至少一个转录起始点以及一个以上的机能组件。 1.TATA盒 TATA盒共有序列是TATAAAA,通常位于转录起始点上游- 25-30bp,决定转录的方向和精确的转录起始点。TATA盒 是基本转录因子TFIID结合位点。 2.起始子 在一些真核基因的上游没有典型的TATA盒,但在某些无 TATA盒的基因转录起始点附近发现了起始子元件INR,一般 将位于转录起始点下游的调控序列称为下游起始子。 3.上游启动子元件 除TATA盒外,GC盒(GGGCGG)和CAAT盒(GCCAAT)也 是很多基因常见的,它们通常位于转录起始点上游-30- 110bp区域。 顺式作用元件结构 (二)调节元件 一般位于基因转录起始点上游-200bp以上区域的顺式作用元件 ,包括增强子和沉寂子 1.增强子 起正调控作用的顺式元件,位于真核基因中远离转录起始点, 能明显增强启动子转录效率的顺式作用元件,它对方向和定位 无依赖性。一般具有组织特异性和细胞特异性。序列长度一般 在70200bp之间,基本核心组件常为812bp,部分序列有回 文结构特征,可以单拷贝或多拷贝串联形式存在。 2.沉寂子 和起正调控作用的增强子相对应的是起负调控作用的沉寂子。 它的功能不受定位和方向的限制。与相应的反式作用因子结合 后,可降低或封闭某些基因的表达。 增强子和沉寂子协调可决定基因表达的时空顺序 3.转座元件 一些DNA序列在染色体上的座位可以在一系列的靶位点之间插 入或移出,此系列称为转座元件。 顺式作用元件与反式作用因子关系 反式作用因子:与顺式作用元件结合的可扩散性蛋白,包括基础因 子,上游因子,诱导因子。 真核生物的转录调控是调控的最重要的途经,大多是通过顺式作用 元件和反式作用因子复杂的相互作用而实现的。 顺式作用元件与反式作用因子关系 1.顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅 提供一个作用位点,只有与反式作用因子相互 作用才起作用。 2.反式作用因子通过不同的途经发挥调控作用 ,它们与特异的靶基因的顺式元件相结合起作 用。 反式作用因子一般具有两大类结构域:一 类是识别和结合特异DNA顺式作用元件所必需 的,一类是调节转录基因效率所必需的。两类 结构域具有不同的特征,但同一类结构域具有 一些共同的结构特点。 反式作用因子结构域类型 1.螺旋-转折-螺旋 有2个螺旋,螺旋2是识别和DNA结合,一般结合于大沟;螺旋1 和其它蛋白质结合。两个螺旋由一个转角链接 2.锌指 锌指这个名称来源于它的结构,它由一小组保守 的氨基酸和锌离 子结合,在蛋白质中形成了相对独立的功能域,像一根根手指伸 向DNA的大沟。 3、亮氨酸拉链 两个蛋白质分子对应的螺旋区之间的两行亮氨酸通过疏水性相互 作用形成1个类似拉链的结构,称为亮氨酸拉链。对形成稳定的蛋 白二聚体十分重要。 4、螺旋一环一螺旋 有2个螺旋,螺旋中有些疏水氨基酸,分布在螺旋一侧。螺旋间 被长短不同的肽断分隔而形成的结构。 反式作用因子结构域类型 反式作用因子结构域类型 反式作用因子通过不同的结构域与不同DNA 顺式作用元件互作用来实
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