细菌的分类与命名.ppt

v 第七章 细菌的分类与命名 第七章 细菌的分类与命名 l l 动植物林奈分类体系动植物林奈分类体系 l l 细菌细胞不同于动植物细胞细菌细胞不同于动植物细胞 前 言 第七章 细菌的分类与命名 第一节 细菌分类地位 一、分类地位一、分类地位 l l 细菌过去归属植物界，自细菌过去归属植物界，自19741974年以来，划为原核生物。细菌作为年以来，划为原核生物。细菌作为 另一个系统进行类别的原核生物，包括对动物和人具有致病作用的另一个系统进行类别的原核生物，包括对动物和人具有致病作用的 衣原体、立克次体、霉形体、螺旋体、放线菌等，此外还涉及蓝细衣原体、立克次体、霉形体、螺旋体、放线菌等，此外还涉及蓝细 菌、紫色光合细菌等。菌、紫色光合细菌等。 第七章 细菌的分类与命名 第一节 细菌分类地位 二、分类单元二、分类单元 l l 属属 l l l l 种种 l l l l 菌株菌株 具有共性的若干种的组合，应与其他属有具有共性的若干种的组合，应与其他属有 明显的差异。不同属之间的明显的差异。不同属之间的16SrRnA16SrRnA序列有较大序列有较大 的差异，但尚未提出差异的量化标准。的差异，但尚未提出差异的量化标准。 是微生物学分类的最基本单元，种可认为是是微生物学分类的最基本单元，种可认为是 一群性质相似的菌株，它与其他菌株群体有明显差一群性质相似的菌株，它与其他菌株群体有明显差 异。凡是异。凡是16SrRNA16SrRNA序列同源性大于序列同源性大于97%97%的两株细菌即的两株细菌即 可确定为同一种。可确定为同一种。 是不同来源的某一种细菌的纯培养物。是不同来源的某一种细菌的纯培养物。 同一种细菌可以有许多菌株，其主要性状应同一种细菌可以有许多菌株，其主要性状应 完全相同，其次要性状可稍有差异。完全相同，其次要性状可稍有差异。 第七章 细菌的分类与命名 第二节 细菌的命名 一、俗名法一、俗名法 二、学名法二、学名法 约定俗成的名字约定俗成的名字 细菌的命名依据细菌的命名依据“国际细菌命名法规国际细菌命名法规”的规定，学名用拉丁的规定，学名用拉丁 文，遵循文，遵循“双名法双名法”。所谓。所谓“双名法双名法”就是每一种细菌的拉丁文就是每一种细菌的拉丁文 名称由属名和种名两部分构成，属名第一个字母必须大写，其余名称由属名和种名两部分构成，属名第一个字母必须大写，其余 均应小写，即使科名是以人名或地名命名的，种名头一个字母也均应小写，即使科名是以人名或地名命名的，种名头一个字母也 用小写。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。用小写。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。 第七章 细菌的分类与命名 第三节 细菌分类鉴定的标准 一、表型特征鉴定一、表型特征鉴定 二、种系发生关系鉴定二、种系发生关系鉴定 l l 测定测定DNADNA中中G+CmolG+Cmol% % l l 核酸杂交法核酸杂交法 l l 16sRNA16sRNA寡聚核苷酸序列寡聚核苷酸序列 l l 长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征，即形态、染色、培养、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征，即形态、染色、培养、 细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。 第七章 细菌的分类与命名 第四节 细菌分类的方法 一、条目分类法一、条目分类法 l l 长期以来，细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。此法首选要在细菌长期以来，细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。此法首选要在细菌 的各种性状中，选择一项或数项被认为是最主要的基本性质，作为分类指的各种性状中，选择一项或数项被认为是最主要的基本性质，作为分类指 征，在最高一级的分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中选征，在最高一级的分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中选 择数项次要性状为指征，将细菌作次一等阶分类，依此类推，一直划分到择数项次要性状为指征，将细菌作次一等阶分类，依此类推，一直划分到 种。种。 第七章 细菌的分类与命名 第四节 细菌分类的方法 二、数值分类法二、数值分类法 原理是根据数值分析，借助电子计算原理是根据数值分析，借助电子计算 机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定 位。位。 第七章 细菌的分类与命名 第五节 细菌的分类体系 一、伯吉氏系统学手册一、伯吉氏系统学手册 二、原核生物二、原核生物 三、国际系统与进化微生物学杂志三、国际系统与进化微生物学杂志 四、国际著名的菌种保藏机构四、国际著名的菌种保藏机构 第七章 细菌的分类与命名 第六节 细菌的鉴定 一、分类培养一、分类培养 l l 一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。 第七章 细菌的分类与命名 第六节 细菌的鉴定 二、鉴定方法二、鉴定方法 除按表型特征、除按表型特征、DNADNA同源性或同源性或rRNArRNA序列比较等方法鉴定细菌外，还有序列比较等方法鉴定细菌外，还有 用其他方法，如测定细菌的脂肪酸组成，用气相液相质谱分析细菌用其他方法，如测定细菌的脂肪酸组成，用气相液相质谱分析细菌 的脂肪酸谱，每一种细菌的脂肪酸谱是恒定的，可重复性好，因此此法的脂肪酸谱，每一种细菌的脂肪酸谱是恒定的，可重复性好，因此此法 可用于细菌的鉴定或分类，往往结合常规方法参照应用。在有条件 的可用于细菌的鉴定或分类，往往结合常规方法参照应用。在有条件 的 单位可用单位可用PCRPCR技术检测鉴定细菌。技术检测鉴定细菌。 第七章 细菌的分类与命名 第六节 细菌的鉴定 三、鉴定程序三、鉴定程序 革兰氏阳性细菌革兰氏阳性细菌 球菌球菌 杆菌杆菌 丝状及树枝状丝状及树枝状 产生芽孢革兰产生芽孢革兰 氏阳性大杆菌氏阳性大杆菌 无芽孢无芽孢 抗酸染色阳性抗酸染色阳性抗酸染色阴性抗酸染色阴性 革兰氏阴性细菌革兰氏阴性细菌 球菌球菌/ /球杆菌球杆菌 杆菌杆菌 MZNMZN染色阳性染色阳性MZNMZN染色阴性染色阴性 弧状杆菌弧状杆菌丝状菌 丝状菌 中等大小杆菌中等大小杆菌螺旋状菌 螺旋状菌 第七章 细菌的分类与命名 本 章 小 节 1.1.细菌的分类基本单元是种，属和菌株也是动物微生物学中常用的单元，细菌的分类基本单元是种，属和菌株也是动物微生物学中常用的单元， 细菌种命名遵循双名法。细菌种命名遵循双名法。 2.2.细菌分类标准长期以来以细菌的表型特征为依据的。细菌分类标准长期以来以细菌的表型特征为依据的。 3. 3.近年来人们采用核酸分类方法逐渐得到认识，特别是根据近年来人们采用核酸分类方法逐渐得到认识，特别是根据16SRNA16SRNA基因序列基因序列 进行分类显示出极大的优越性。进行分类显示出极大的优