hday质粒的提取和电泳.ppt

上次实验小结 1、观察自己组的实验结 果：转化平板 *培养板在37C 培养12-16h 卫星菌：培养时间过长 2、实验中的难点 *制备效率高的感受态细胞 o 目的 DNA片段 质粒 TA载体 连接 重组质粒 目的 DNA 转化 无质粒的E.Coli 死亡 有质粒的E.Coli 存活 含抗生素培养基中生长 重组质粒 的鉴定 PCR 开始上课时介绍2-3min 平板筛选 小量制备质粒和电泳分析小量制备质粒和电泳分析 实验四 开始实验操作前：本次实验介绍10-15min 质粒 质粒载体 是存在于细菌染色体外的小型闭 合环状双链DNA分子，在宿主细 胞内可独立自主复制并赋予宿主 细胞一定的遗传性状 筛选标记 MCS（多克隆位点） 复制原点 质粒 1)培养细菌使质粒扩增； 2)收集裂解细菌； 3)分离纯化质粒DNA。 质粒提取原理： 质粒提取有多种方法，但 都包含有3个基本步骤： 去除蛋白质 去除基因组DNA 去除RNA *酚-氯仿抽提法*RNase消化 ？ 质粒质粒DNADNA与基因组与基因组DNADNA的区别的区别 大肠杆菌遗传物质 1、部位不同： 2、大小不同： 质粒分子量较小，大小只 有普通细菌染色体DNA的百分 之一。 基因组DNA分子量较大， 细菌基因组约含3000个基因， 5106 bp。 基因组DNA容易断裂线性化 碱裂解法提取质粒的原理 原理： 1、强碱和SDS裂解细菌，细菌中的质粒或基因组DNA在碱 性条件下发生变性。 2、怎样去除基因组DNA？ 当加入酸性物质进行中和时，质粒DNA很快复性， 染色体DNA则和变性蛋白质等缠绕在一起难以复性而形 成沉淀，经离心随细胞碎片一起去除； 3、怎样去除蛋白质？ （已经学过） 留有质粒DNA的上清，经酚和氯仿去除蛋白质后, 用乙醇沉淀质粒DNA，即得到质粒DNA. 1) 细胞悬浮液（溶液I）-悬浮菌体 50 mmol/L 葡萄糖 25 mmol/L Tris.Hcl PH 8.0 10 mmol/L EDTA.Na2 PH 8.0 2) 细菌裂解液（溶液II） -裂解菌体 0.2mol/L NaOH 1% SDS 碱裂解法提取质粒试剂： 3）中和液（溶液III） -中和NaOH 60 ml 5mol/L 醋酸钾 11.5ml 冰醋酸 28.5ml 水 4）20mg/ml RNase-降解细菌RNA 工作浓度3050 g/ml 其他试剂作用和成分同实验一。 质粒DNA的制备 录像5分钟：（8：208：25） （1）（细菌的收获：） 取1.5 ml 工程菌液6,000转/分，离心2min， 弃上清。 （2）（细菌的裂解：） 加入200l预冷的细胞悬浮液（溶液I）悬浮细菌 加入200l细菌裂解液（溶液II）， 颠倒混合离心管内容物，待溶液变粘稠为止。 注： 粘稠 ：开盖后出现拉丝现象，证明DNA已经游出。 （3）（中和：）加入150l中和液，上下颠倒混合后置 冰上 5min， 12,000转/分， 4离心 5min。 碱裂解法提取质粒操作步骤碱裂解法提取质粒操作步骤 开始操作： （去除蛋白质） （4） 将上清移至另一离心管中(注意不要混入白色 沉淀物)，加入等体积的TE饱和的酚/氯仿/异戊醇(25 ：24:1)混和液，振荡混匀1min，12,000转/分离心 5min。 （5）将上层水相移至另一离心管中，加入等体积的 氯仿/异戊醇(24:1)溶液，振荡混匀1min， 12,000转/ 分 离心 5min 。 （沉淀DNA） （6）将上层水相移至另一离心管中，加入2.5倍体积 的无水乙醇， 置-20沉淀1015 min。 继续提取质粒： 获取及溶解沉淀的质粒DNA 2 质粒DNA电泳分析： （7） 12,000 转/分离心8min。 弃上清，室温干燥质粒DNA 5-10min。 （去除RNA） （8）用20l含RNase的水溶解质粒DNA， 轻轻吹打混合。 37 保温10min 20 l质粒 DNA溶液 取出10 l放于另一个离心管中备用 剩余10 l用于下一步酶切 继续实验操作 取10 l 的质粒DNA 加2 l 上样液混匀。 加到0.8%琼脂糖凝胶的加样孔内。 电泳条件：100V 40min。 电泳结束后照像保存，结果分析。 质粒质粒DNADNA的琼脂糖凝胶电泳的琼脂糖凝胶电泳 质粒提取方法 质粒的量 质粒的纯度要求决定使用不同的方法 质粒的大小 质粒过大：温和裂解 质粒大小适中：碱裂解，煮沸法 如： 如： 大量提取质粒：二次扩增细菌，纯化方法要复杂 小量提取质粒：单克隆培养，普通碱裂解法 质粒纯度：要求高纯度、无内毒素等等 （满足各种转基因实验的要求） 要求不同的纯化方法 电泳时讲授10-20min 方法举例： 经典的方法：CsCl-溴化乙锭梯度密度离心 特点：纯度最高（可获得 高质量的超螺旋质 粒DNA）、最贵、 最麻烦 应用：大量制备质粒；基 因注射，基因转染 等对质粒质量要求 高的实验 缺口环状或 线状DNA 闭环质粒DNA 原理：不同结构和大小的DNA参入的溴化乙锭的量不一 样从而在CsCl梯度密度离心中处于不同的位置 特点：小量质粒制备、最简便、快捷 应用：质粒酶切鉴定、克隆（粗提） 测序、转染（细提） 质粒提取试剂盒 常用方法：小量碱裂解法 满足不同需要的试剂盒 纯化原理：离子交换柱层析等 小量制备质粒kit 大量制备质粒kit 去除内毒素制备质粒kit 可用于大部分分生实验 质粒的电泳 质粒DNA的3种形式泳动速度:超螺旋线性开环 质粒DNA的存在形式有3种: 1、共价闭环DNA:常以超螺旋 形式存在 2、开环DNA:质粒DNA两条链 中有一条发生一处或多处断裂 ，因此可以自由旋转从而消除 张力,形成松弛的环状分子 3、线性DNA:因质粒DNA的两 条链在同一处断裂而造成. 开环 超螺旋 线性 重组质粒的鉴定 平板筛选：大多数情况下，平板筛选只能区分含有 或未含有质粒的细胞，