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文档简介

13 基因突变与DNA损伤修复 要点: 1.基因突变的相关概念、类型 2.基因突变的机制 3.基因突变的修复机制 4.基因突变的检测 基因突变(gene mutation):基因的核苷酸顺序 或数目发生改变。仅涉及DNA分子中单个碱基的 改变称点突变(point mutation)。涉及多个碱 基的还有缺失、重复和插入。 突变体(mutant):具有突变表型的细胞或个体。 13.1 基因突变的概念、类别及性质 (1)概念 从突变的表型: 1)形态突变:突变影响生物的形态结构。 2)生化突变:突变影响生物的代谢过程,导致 一个特定生化功能的改变或丧失。 3)致死突变:突变影响生物个体的生活力。分 为显性致死和隐性致死。 4)条件致死突变:在某一些条件下致死,而在 另一些条件下成活的突变。 (2)突变类型 从对遗传信息的改变: 1)同义突变:碱基序列的改变没有引起产物氨基 酸序列的改变,与密码子的简并性有关。 2)无义突变:某个碱基的改变使代表某种氨基酸 的密码子变成了终止密码子,使蛋白质合成提前 终止,因而蛋白质产物一般是没有活性的。 3)错义突变: 碱基序列的改变引起了产物氨基酸序 列的改变。 有些错义突变严重影响蛋白质活性甚至完全无 活性,从而影响了表现型。如果该基因是必须基因 ,则称为致死突变。 有些错义突变的产物仍有部分活性,使表型介于 野生型与突变型之间的中间类型,称为渗漏突变。 有些错义突变不影响或基本上不影响蛋白质的 活性,不表现明显的性状变化,称为中性突变。 按其发生的原因: 1)自发突变(spontaneous mutation):在自然 情况下发生的突变。 2)诱发突变(induced mutation):人们有意识 地利用物理、化学诱变因素引起的突变 。 随机性:可发生在体细胞和生殖细胞中。 生殖细胞的突变频率高于体细胞。体细胞突变 在显性或纯合状态才能表现,出现嵌合体。 稀有性 :突变率是很低的。 高等动植物10-510-8,细菌10-410-10,反应 了物种的基因的相对稳定性。 (3)突变的性质 可逆性 1) 野生型基因 突变型。 2) 回复突变率一般低于正突变率。 3) 真正的回复突变很少发生。常被第二个位点的 突变所抑制,抑制因子突变(suppressor mutation)。 4)回复突变的有无是区别基因突变与染色体缺失 或重复的标志。 正突变 回复突变 突变的多方向性和复等位基因 同一基因可突变为多个等位基因。突变的 基因可以再突变。这一系列的等位基因就叫做 复等位基因。这是由于同一座位内的不同位点 上的结构发生变化产生的。 突变的有害性和有利性。 一般,有害突变多,有利突变少。 eg. 5-BU是胸腺嘧啶(T)的结构类似物,酮式 结构易与A配对;烯醇式结构易与G配对。 13.2.1 碱基类似物 13.2 点突变的诱变机制 A.TA. 5-BU(酮式)G. 5-BU (烯醇式 ) G.C A. 5-BU G.CA.T 2-AP是腺嘌呤的类似物,既可与T配对,也 可与C配对。 A.T 2-AP.T2-AP.CG.C G.C2-AP.C 2-AP.T A.T (1)烷化剂: 甲磺酸乙酯(EMS)、亚硝基胍(NG)等 。通过改变碱基结构使碱基错配。当G烷基化后可 与T配对,导致碱基转换。 G.CA.T。 或:烷化剂使嘌呤脱落,造成转换、颠换; DNA链的断裂或交联。 13.2.2 碱基改变 (2)嵌入剂 eg. 吖啶橙、吖啶黄素、原黄素等碱基对的 类似物,易造成移码突变。 (1)紫外线: 产生环丁烷嘧啶二聚体和6-4光产物。 双链间形成,阻碍DNA的复制。 同一链上相邻T间形成,阻碍碱基的正常配对和 腺嘌呤的正常掺入,使复制在这个点上停止或错 误进行,产生碱基顺序改变了的新链。 13.2.3 碱基损伤 (2)黄曲霉(B1)的作用 使鸟嘌呤G脱落,SOS修复引入A, 造成G.CA.T 。 13.2.4 基因的定点突变 1)寡核苷酸诱导的基因定点突变 将某基因克隆到载体上人工合成含有突变 位点的一对引物(突变位点位于引物中心附近, 两端有足够的序列足以互补配对)PCR扩增 Dpn酶切将突变DNA转入受体筛选重组子 。 2)双引物法 将某基因克隆到载体上人工合成一对互 补的含有突变碱基的引物在基因的上游和下游 各设计一个引物,分别与突变位置处的一个引 物进行PCR扩增两个PCR产物混合延伸后就可 获得有特定位点突变的基因。 13.3 自发突变的机制 1 DNA复制错误(errors of DNA replication) a 转换 b 颠换 A T G C C 移码突变:增加或减少一个或几个碱基对的 突变,引起密码编组的移动。 eg:Hb Wayne是138位UCC失去一个C,使链 的合成不在原来应该终止的地方停止,一直到 146位合成精氨酸后才终止,从而使链延长。 d 缺失和重复突变 e 插入突变 (转座子) 自发损伤 a 脱嘌呤:碱基和脱氧核糖间的糖苷键受到破 坏,从而引起一个鸟嘌呤或腺嘌呤从DNA分子上 脱落下来。 b 脱氨基:如胞嘧啶脱氨基后变成尿嘧啶 。U=A,结果G-CA-T。 3 氧化损伤:O2-,OH-,H2O2可对DNA造成损伤。 如:8-oxo dG与A配对,导致G.CdG.AT.A 13.4 动态突变 在基因的编码区、3或5-UTR、启动子区 、内含子区出现的三核苷酸重复,及其他长短不 等的小卫星、微卫星序列的重复拷贝数,在减数 分裂或体细胞有丝分裂过程中发生扩增而造成遗 传物质的不稳定。亦称为基因组的不稳定性,可 造成基因功能丧失或获得异常改变的产物。 13.5 DNA损伤修复机制 13.5.1 光复活(photoreactivation)(原核) 概念:可见光存在的条件下,在光复活酶作用 下将UV引起嘧啶二聚体分解为单体的过程。 过程 光复活酶与T=T结合形成复合物; 复合物吸收可见光切断T=T之间的C-C共价键, 使二聚体变成单体; 光复活酶从DNA链解离。 13.5.2 切除修复(核苷酸外切修复、暗修复) (1)切除修复 在DNA内切酶、DNA聚合酶、外切酶、DNA连接 酶等共同作用下,将DNA受损部位部分切除,并以 其中一条链为模板,合成修复。 消除由UV引起的损伤,也能消除由电离辐射 和化学诱变剂引起的其他损伤。切除的片段可由 几十到上万bp,分别称短补丁修复、长补丁修复 。 (2)DNA糖苷酶修复及AP核酸酶修复途径 E.coli 不明显的损伤,需要特异性修复。 DNA糖苷酶修复:如果碱基被共价修饰,糖基化 酶可作用于C-N糖苷键,使碱基释放,产生无碱 基(AP)位点, 再由AP内切酶修复系统修复。 AP内切酶修复系统修复:由内切酶、外切酶、 聚合酶和连接酶活性来完成,以修复AP位点。 13.5.3 错配修复系统 修复杂种DNA错配碱基及基因转变。 13.5.4 重组修复 (1)复制:以损伤单链为模板复制时,越过损伤 部位,对应位点留下缺口;未损伤单链复制成完 整双链。 (2)重组:缺口单链与完整同源单链重组,缺口 转移到完整链,使损伤单链的互补链完整,损伤 单链仍然保留。 (3)再合成:转移后的缺口以新的互补链为模板 聚合补齐。 13.5.5 SOS修复 a 通过式修复:损伤较大时(如产生很多的T=T), 正常的DNA多聚酶复制到损伤位点时,其活性受到 抑制,短暂抑制后产生一种新的DNA多聚酶,由于 其修复校正功能较低,新合成的DNA碱基错配频率 较高,易引起突变。 b 切除式修复:DNA双链均有损伤且距离较近时 的一种可能的修复机制。 13.6 基因突变的检测 13.6.1 病毒和细菌基因突变的检测 利用寄主范围、生长速度、噬菌斑大小、形 态等性状可检测病毒突变。 通过在培养基中添加抗生素或噬菌体即可筛 选细菌抗性突变体。 细菌营养缺陷型的检测:利用在完全培养基上 能正常生长,在基本培养基上不能生长的影印 培养实验。首先采用青霉素富集法浓缩大量突 变体,再进行负选择。 13.6.2真菌营养缺陷型的检出菌丝过滤法 分生孢子诱变处理基本培养基 未萌发孢子 萌发菌丝 培养 去除(过滤) 少数 死亡 营养 野生型 孢子 缺陷型 (去除) 营养培养基 13.6.3 果蝇突变体的检测 (1) 果蝇X连锁隐性突变的检出 ClB法 ClB品系:l隐性致死基因;B棒眼 C交换抑制因子(Bl倒位); Muller-5法 Muller-5品系:B(棒眼)-Wa(杏眼)-sc(小盾片少 刚毛)并

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