浅谈如何阅读文献.ppt

浅谈如何阅读文献 -书山有路,徐 辉 2009-3-5,2,内容提要,阅读文献入门方法 带着问题阅读文献 Idea如何产生 小结,3,1. 文献的意义,为什么要阅读文献？,文献是知识库（科学知识结晶） 文献是“巨人的肩膀”（前辈研究成果）,科学研究是知识不断积累的过程 任何理论都不是凭空想象出来的,4,2. 阅读文献的方法,分阶段，不同阶段重点不同 带着问题看文献（目的性） 善于记录总结 善于提问、善于思考,5,初级阶段：入门 中级阶段：开题 高级阶段：课题开展、论文撰写,文献阅读者可分为三个阶段：,分阶段,6,入门：掌握某领域的起源、重要里程碑， 了解最新进展。 开题：由面到点，深入到你感兴趣的问题。 课题开展、论文撰写：针对某一问题，做到 如数家珍。,所处不同阶段重点不同：,分阶段,7,入门阶段,泛读某个大领域的三五篇综述 选择你所感兴趣的小领域 精读十篇经典文献 掌握某领域的研究历史和成果 泛读十篇近两年内NCS上的相关文章 了解某领域的最新进展,总体阅读方法：泛读精读泛读,分阶段,8,结构 功能 调控,rRNA tRNA mRNA snoRNA miRNA ,DNA RNA Protein,分子生物学,1. 泛读某个大领域的三五篇综述 选择你所感兴趣的小领域,分阶段,Example：,9,2. 精读几篇经典文献,秘笈1：求精不求多 秘笈2：忌喜新厌旧,精读23篇经典Review，逐字逐句吃透它，大致了解整个领域。 精读58篇里程碑级Article，掌握这个领域涉及的主要方面、研究内容、研究方法、结果和意义。,经典文献哪里找？ NPG和Cell Press 的Review和Article； 经典Review里引用的文献。,分阶段,10,3. 泛读，全面了解,泛读10篇两年内最新Article，了解目前进展。 当你了解了一个领域的历史后，必须了解它的现在和未来。 开题阶段,分阶段,11,开题阶段,开题：好的idea如何产生？,任何理论都不是凭空想象出来的 Idea来源于读文献时产生的灵感,分阶段,12,带着问题看文献-最高秘笈,没有目的不要看文献 （今天我想知道什么？） 有的放矢-就像做英语阅读理解题， 不要浪费时间在无关的信息上。 得到满意的答案才是完成工作。,目的性,13,我想知道：“microRNA是什么？” 把问题拆分，由大化小，由少化多。,目的性,Example：,microRNA是RNA，那么它是什么样的RNA？有很多吗？分子大小如何？分布广泛吗？有什么结构特点？为什么命名为这个名字？有什么功能？,14,带着这些问题，看几篇综述，然后作答：,目的性,microRNA是一类高等真核生物体内普遍表达的长度在22个核苷酸左右的单链小分子RNA，它以碱基互补的原则作用于mRNA的3UTR，在转录后水平调节基因的表达。 以上定义中包含我找出的12个必要信息。,15,Article 本身也是由问题和其相对的答案组成（发现了某种现象，提出什么问题，如何解决，得到了什么结果，结果如何，有何意义）。 针对某一篇文献，按照科学研究的内在逻辑顺序去逐层解读文献，更易于理解和掌握。 “现象提出问题 解决问题” Cell中的paper堪称科研论文的典范。它的表述顺序和格式是最标准的逻辑语言。,目的性,带着问题看文献的另一层含义,16,某种现象,提出问题,采取方法,结果与分析,Cell，2005,17,此处包含四层意思： 好记性不如烂笔头，写一遍胜过读十遍 灵感往往瞬息而逝 总结是一种认识的升华 温故而知新,善于记录总结,18,如何总结？记录什么？,记录暂时不能得到答案的问题。 标记文章中你认为重要的信息。 标记文章中的作者的推测和假想。 记录灵感的火花。 记录你的读后感。 自己写摘要（以你的角度评述文章）。 时常整理你的备忘录。,善于记录总结,19,开题阶段,开题：好的idea如何产生？,任何理论都不是凭空想象出来的 Idea来源于读文献时产生的灵感,善于思考,20,idea源于对问题的思考,在文献阅读时，只要你勤于思考，斟字酌句时便会产生很多问题，这些问题自然地帮助你产生许多idea.,善于思考,microRNA是一类高等真核生物体内普遍表达的长度在22个核苷酸左右的单链小分子RNA，它以碱基互补的原则作用于mRNA的3UTR，在转录后水平调节基因的表达。,Example：,21,一类：如何归类，分类标准是什么？到底有多少个？占基因组多少比例？这么多有什么意义？目前全部发现了吗？ 高等真核生物：最原始的具有miRNA的生物是什么？ miRNA的进化始于什么年代？为什么原核生物没有？ 普遍表达：每时每刻都表达，还是有时序性？有没有特异表达的？种属特异，组织特异，细胞特异，时期特异？ 22个核苷酸左右：这个长度是如何产生的？这个长度有什么意义？必需在这个长度吗？ 单链：单链的有没有二级结构？单链RNA稳定性不高，这是否与miRNA发挥其功能的方式有关？单链的RNA都有蛋白保护，miRNA的保护蛋白是什么？,善于思考,22,一篇文献为什么能发nature？它的闪亮点是什么？作者如何想到这个idea？他的工作无懈可击吗？将来他们会沿着这条思路做下去吗？有什么他们尚未涉足的领域吗？,善于思考,思考才能提高自己,认识水平的提高 视觉角度的提高 科学问题出发点的提高 走在世界最前沿,23,小结,巨人就站在大家面前