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文档简介

蛋白质免疫印迹技术及 常见问题分析,张绍进,Western Blot简介 Western Blot一般流程 Western Blot常见问题分析,Western Blot 简介:,印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。 1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNARNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为Southern印迹法。 而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后蛋白质分子的印迹分析称为Eastern印迹法。,Western Blot 基本原理,Western Blot 优点,高分辨率的电泳技术 特异敏感的抗原-抗体反应 1-5ng中等大小的靶蛋白,Western Blot应用,目的蛋白的表达特性分析 目的蛋白与其它蛋白的互作 目的蛋白的组织定位 目的蛋白的表达量分析,Western Blot 流程,蛋白样品的制备 SDS-PAGE 转膜 封闭 一抗杂交 二抗杂交 底物显色,通过有机溶剂或水溶法制备总蛋白 水溶液提取法 针对水、稀盐、稀酸或碱溶液中的蛋白质。稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂 。 有机溶剂提取法 对于分子中非极性侧链较多的蛋白质可用有机溶剂提取,包括乙醇、丙酮和丁醇等。 通过层析或电洗脱法制备目的蛋白,蛋白样品的提取,蛋白样品的定量,目前常用比色法测定样品蛋白的含量:Bradford法(考马斯亮蓝法)、Lowry法(Folin-酚试剂法)、 BCA法等。但各有优缺点,大家可以根据具体情况选取。按相应蛋白质定量试剂盒操作说明操作,测定样品浓度。 蛋白质浓度测定的各种方法汇总: /thread-23639-1-1.html,蛋白样品的变性,2SDS-PAGE上样缓冲液: DTT可临用前以1:4比例混合加入,亦可全部配好分装,-20冻存。 按1:1比例与蛋白质样品混合,95100加热515min,冰上冷却后再上样,上样量一般为20-25l,总蛋白量2050g。,SDS:,阴离子去污剂 变性剂 氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束。 蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电荷量,消除了不 同分子之间原有的电荷差异。 与强还原剂一起使蛋白分子氢键、疏水键打开,使蛋白质分子线性化。,蛋白质-SDS胶束的特点:,(1)具有相同的形状,形状像一个长椭圆棒 (2)平均1g 蛋白质结合1.4g SDS (3)短轴对不同的蛋白质亚基-SDS胶束基本上是相同的 (4)长轴的长度则与亚基分子量的大小成正比,不连续的电泳缓冲体系。 SDS蛋白质复合物在凝胶电泳时,不再受蛋白质电荷与形状的影响,而只取决于蛋白质分子量的大小。,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳,SDS-PAGE 是在蛋白质样品中加入SDS和含有巯基乙醇的样品处理液,SDS是一种很强的阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级和三级结构。 强还原剂巯基乙醇(或二硫苏糖醇,DTT)可以断开二硫键破坏蛋白质的四级结构。使蛋白质分子被解聚成肽链形成单链分子。解聚后的侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物。 蛋白质分子结合SDS阴离子后,所带负电荷的量远远超 过了它原有的净电荷,从而消除了不同种蛋白质之间所 带净电荷的差异。蛋白质的电泳迁移率主要决定于亚基 的相对分子质量,而与其所带电荷的性质无关。,【SDS-PAGE基本原理】,凝胶成分,丙烯酰胺和N,N-亚甲双丙烯酰胺 SDS 配胶的Tris缓冲液 TEMED 过硫酸铵 Tris-甘氨酸电泳缓冲液,PAGE:聚丙烯酰胺凝胶,聚丙烯酰胺凝胶(polyacrylamide gel)是由单体丙烯酰 胺(acrylamide,简称Acr)和交联剂(crosslinker) N,N-亚甲基双丙烯酰胺(N,N-methylenebisacylamide, 简称Bis)在催化剂和加速剂作用下聚合交联而成的三维网 状结构的凝胶。化学惰性强,具有一定的机械强度和透明 度。是良好的电泳介质。,聚丙烯酰胺凝胶的聚合方式:,单体:丙烯酰胺(Acr); 交联剂:甲叉双丙烯酰胺(Bis); 催化剂:过硫酸胺或核黄素(AP); 加速剂:四甲基乙二胺(TEMED); 产物:三维网状结构凝胶,聚丙烯酰胺凝胶聚合机理是通过提供氧游离基(free radicals)的催化,使体系发生氧化还原作用(catalyst-redox systems)来完成的。催化体系主要有化学催化(APTEMED)和光化学催化(核黄素TMTED)体系。,凝胶浓度与蛋白分离范围,SDS-PAGE浓缩胶(5% Acrylamide)及分离胶配方表:/thread-20726-1-1.html,不连续电泳:,电泳缓冲液:pH8.3 Tris-甘氨酸系统。,灌制分离胶 隔绝空气,ddH2O 0.1%SDS:8%,灌制积层胶 插入梳子,转膜,要将电泳后分离的蛋白质从凝胶中转移到固相载体(例如NC膜)上,通常有两种方法:毛细管印迹法和电泳印迹法。 常用的电泳转移方法有湿转和半干转。两者的原理完全相同,只是用于固定胶/膜叠层和施加电场的机械装置不同。,转移膜的选择,最常用于Western Blot的转移膜主要是硝酸纤维素(Nitrocellulose,NC)膜和聚偏二氟乙烯 (Polyvinylidene Fluoride, PVDF)膜,此外也有用尼龙膜、DEAE纤维素膜做蛋白印迹。尼龙膜和NC膜的特点相似,主要用于核酸杂交。 各种膜的详细特点介绍: /bio101/2008/21461_2.htm,湿转系统,半干转移系统,丽春红染色 蛋白带出现后,于室温用去离子水漂洗硝酸纤 维素滤膜,换水几次。 印度墨汁染色 只用于放射性标记抗体或放射性标记A蛋白探 针的Western印迹过程。,转膜后检测(此步可以省略),封闭,为避免作为检测试剂的特异性第一抗体与膜发生非特异性结合,使非特异性背景提高,需对膜上的潜在结合位点进行封闭处理。 5%脱脂奶粉或BSA(室温孵育1h) Western Blot 膜封闭液(生物试剂公司) Tween-20的作用:减少非特异性吸附,不影响抗体与抗原的结合。,一抗、二抗孵育,把NC膜放在密闭塑料袋或者培养皿中,根据膜面积以0.1mL/cm2的量加入一抗溶液,摇床上平缓摇动,于室温孵育1-2小时或4过夜。 回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。 加入用封闭液配制的二抗,摇床上缓慢摇动,于室温孵育1-2小时或4过夜。 回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。 最后用TBS漂洗膜2次,每次10min。,二抗与底物反应显色,辣根过氧化物酶法(HRP) 碱性磷酸酶法(AP) 化学发光显色法(HRP),膜解吸方法(膜的重复利用),通过加热和去污剂进行解吸 原理:组合使用去污剂和加热使抗体解离,适用于任何化学发光底物系统。 酸解吸 原理:使用低pH改变抗体结构从而使结合位点失活,从而将抗体与抗原分离,适用于任何化学发光底物系统。,Western Blot结果分析,目的蛋白的灰度值除以内参的灰度值以校正误差,所得结果代表某样品的目的蛋白相对含量。 Western Blot结果分析软件Gel-Pro Analyzer 4 绿色版(附动画演示教程)/thread-44929-1-1.html,Western Blot常见问题分析,SDS-PAGE电泳,胶不平? 凝胶漏液?,胶板洗刷干净 加入AP和TEMED的量要合适 加入试剂后摇匀,使其充分混合,防止部分胶块聚合不均匀 温度合适,受热不均匀导致胶聚合不均匀 两块玻璃板底部要对齐,条带比正常的窄? “微笑”或“倒微笑”条带?,凝胶聚合不均匀,灌胶时候尽量混合均匀,动作轻缓 拔梳子要迅速,清洗加样孔要小心,以免把上样带扭曲 样品盐浓度过高会挤压其他条带导致宽窄不一,纯化样品,调整盐浓度 胶板底部有气泡会影响电泳效果,应赶走气泡。同时注意电泳槽装置是否合适,SDS-PAGE电泳,转膜及抗体检测,凝胶肿胀或卷曲? 条带歪斜或漂移? 单个或多个白点? 转膜缓冲液过热?,可将凝胶在转膜之前放到转膜缓冲液中浸泡5-10min 电转仪长期使用导致海绵变薄,“三明治”结构不紧凑导致。可在两块海绵之间垫上少许普通的草纸 确保膜和胶块之间没有气泡 缓冲液中离子浓度太低,电流或电压太高。转膜过程注意降温,转移到膜上的蛋白很少,背景太高,杂交信号很弱,出现非特异带,Further Readings,生物秀Western Blotting专题 /special/experiment/WesternBlotting.ht

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