（动物遗传育种与繁殖专业论文）鸡HFABP基因PCRSSCP分析及其与脂肪性状的相关研究.pdf

1 j 畸： j 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 摘要 目前家禽育种工作已经取得了很大进展，然而这种高强度选择又带来了许多负面 影响。其中控制脂肪在鸡体内的过多蓄积，提高肉鸡的胴体质量和适口性是中国养禽 业急需解决的问题。利用基于分子遗传学的标记辅助选择进行脂肪与风味相关性状选 择，将是解决这类问题的主要手段之一。 本实验将h - f a b p 基因作为影响脂肪代谢和肌内脂肪含量的候选基因，采用单链 构象多态性( p c r - s s c p ) 技术，以封开杏花鸡( t 0 4 ) 、惠阳三黄胡须鸡( h ) 、清远麻鸡 ( q ) 、广西霞烟鸡( s 1 ) 等4 个地方品种，岭南黄鸡矮小型麻羽专门化品系( e 4 ) ， 岭南黄鸡i i 号配套系商品代( d c ) 、m 白羽肉鸡商品代( 从) 等2 个培育品种为试 验材料，对h - f a b p 基因进行s n p s ( 单核苷酸多态性) 检测和基因类型判别。对h 队b p 基因的多态性、基因频率和基因型频率的研究显示：在1 2 对引物位点中，只有引物 8 位点和引物l o 位点不存在多态，而在其它的引物位点中，七个鸡品种都存在变异。 通过不同品种鸡脂肪性状的比较分析发现，品种效应对于腹脂率、肌内脂肪含量 和肌苷酸含量三个性状影响很大，达到了极显著的水平( p o 0 1 ) ，其中e 4 鸡和从 鸡对应的腹脂率和肌内脂肪含量最高，分别为5 8 3 4 和3 8 2 5 。 在分品种进行h f a b p 基因与脂肪性状的相关性分析中，在p 1 - 8 9 2 9 5 位点，除 d c 鸡b b 基因型与a a 基因型之间的肌苷酸含量的最d - - 乘均值之间的差异达到显 著水平( p 0 0 5 ) 。在p 2 1 1 0 2 8 0 位点，d c 鸡和t 0 4 鸡中b b 和a a 基因型对i m f 影响达到显著水平( p 0 0 5 ) 。在p 4 5 2 8 7 9 2 位点，除a a 鸡b b 基因型与a b 、b b 基因型之间的i m f 和肌苷酸含量的最小二乘 均值之间的差异达到显著水平( p 0 0 5 ) 。在p 5 7 7 5 1 0 4 9 位点， 从鸡b b 基因型对肌苷酸含量影响显著( p o 0 5 ) 。在p 6 9 6 0 - 1 1 6 8 位点，a a 鸡的 从基因型，h 鸡的a b 基因型和s 1 鸡的c c 基因型均对肌苷酸含量的影响显著 ( p 0 0 5 ) 。在p 9 1 6 4 4 - 1 9 0 9 位点，t 0 4 鸡中b b 基因型和胡须鸡的从基因型均对 腹脂重影响显著( p o 0 5 ) 。p 1 2 2 8 9 3 3 0 5 2 位点中，h 鸡a b 基因型和s 1 鸡a b 基 因型分别对肌苷酸含量和腹脂重影响显著( p 0 0 5 ) 。 在整个群体中进行h f a b p 基因与i m f 含量的相关性分析发现，p 2 - 11 0 2 8 0 位 点和p 7 1 1 0 6 1 2 8 3 位点中都是基因型a a 对应的肌内脂肪含量最小二乘均值显著高于 基因型a b 、b b ( p 0 0 5 ) ；在 p 3 4 3 0 6 6 1 位点中基因型b b 对应的肌内脂肪含量最4 , - 乘均值显著高于基因型a b 和从( p 0 0 5 ) ；在p 4 - 5 2 8 - 7 9 2 位点中基因型b b 对应的肌内脂肪含量最高，它极显著高于基因型从和a b ，而从和 a b 两种基因型之自j 的差异也显著( p 0 0 5 ) 关键词：鸡h - f a b p 基因单链构象( s s c p ) 肌内脂肪含量 一，j l-r - r 、 j f 4 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 a b s t r a c t p r e s e n t l y , t h ei m p r o v e m e n ti np o u l t r yb r e e d i n gh a sb e e nm a d e h o w e v e r , n e g a t i v ee f f e c t sh a v ea p p e a r e da c c o m p a n i e dw i t hh i g hi n t e n s i t ys e l e c t i o n p r o b l e m s n e e d e dr e s o l v e db yp o u l t r yi n d u s t r yi nc h i n a , e x i s ti nc o n t r o l l i n ge x c e s s i v ef a t n e s s a c c u m u l a t i o nt h a ta f f e c t sc h i c k e nc a r c a s sq u a l i t y t or e s o l v et h e s ep r o b l e m s ，o n e m a i nm e t h o dt os e l e c tf a ta n df l a v o u rt r a i t s i su s i n gm a r k e r - a s s i s t e d se l e c t i o n ( m a s ) b a s e do nm o l e c u l a rg e n e t i c s t h i ss t u d yw a sd e s i g n e dt oi n v e s t i g a t et h ee f f e c to fh - f a b pg e n eo nc h i c k e n i m pc o n c e n t r a t i o i na n df a tm e t a b o l i z e t h ef o u r t h g e n e r a t i o np o p u l a t i o no f p a r o c h i a l b r e e do ff e n g k a i x i n g h u ac h i k e n ( t 0 4 ) ，h u i y a n gh u x ue h i k e n ( h ) ， q i n g y u a nm ac h i c k e n ( q ) a n dg u a n g x ix i a y a nc h i k e n ( s 1 ) ，t h eo t h e rb r e e do f a i x i a oc h i c k e n ( e 4 ) ，a ae h i k e n ( a a ) a n dl i n g n a nh u a n gc h i k e n ( d c ) w e r eu s e d i nt h e r e s e a r c h p o l y m o r p h i s m s w e r ed e t e c t e d b yp c r - s s c p a n dd n a s e q u e n c e i n g w ei n v e s t i g a t e d t h e p o l y m o r p h i s m s o fh - f a b pg e n ea n dt h e f r e q u e n c i e so fg e n ea n dg e n o t y p e a m o n g1 2p a i r sp r i m e r s ，e x c e p t8a n d1 0p r i m e r h a v en op o l y m o r p h i s m a , o t h e r sw e r ep o l y r n o r p h i s m ai nt h e s es e v e nb r e e d s t h r o u g ht h ea n a l y s i so ff a tt r a i t si nd i f f e r e n tb r e e d s ，w ef i n db r e e d sh a d s i g n i f i c a n t e f f e c to na b d o m i n a lf a t p e r c e n t ，i m fa n di m p( p 0 0 1 ) ，t h e a b d o m i n a lf a t p e r c e n ta n di m fc o n t e n t i na ac h i c k e nw e r e5 8 3 4 3 8 2 5 r e s p e c t i v e l y i nt h ea n a l y s i so ft h ec o r r e l a t i o nb e t w e e nh - f a b pg e n ea n dt h ef a tt r a i tb y u s i n gt h ed a t ao ft h e s es e v e nb r e e d sr e s p e c t i v e l y , a tl o c u sp i 一8 9 2 9 5 ，t h el e a s t s q u a r em e a n 8o fi m ph a ds i g n i f i c a n td i f f e r e n c eb e t w e e nb ba n da ag e n o t y p e ( p 0 0 5 ) f o rp 2 1 1 0 - 2 8 0 t h el e a s ts q u a r em e a n 8o fi m fh a ds i g n i f i c a n td i f f e r e n c e b e t w e e nb ba n da a g e n o t y p e ( p 0 0 5 ) f o rp 4 - 5 2 8 7 9 2 i l i 、一hj t ： j 1 、 j 1 j 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 t h el e a s ts q u a r em e a n so fi m fa n di m ph a ds i g n i f i c a n td i f f e r e n c eb e t w e e nb ba n d a a ，a bg e n o t y p e ( p 0 0 5 ) f o rp 5 - 7 7 5 - 1 0 4 9 t h es i g n i f i c a n te f f e c to f b b g e n o t y p eo ni m pi na ac h i c k e n f o rp 6 9 6 - 1 1 6 8 ，a ag e n o t y p ei n 从c h i c k e n ，a b g e n o t y p ei nh u x uc h i c k e na n dc cg e n o t y p ei ng u a n g x ic h i c k e na l lh a v es i g n i f i c a n t e f f e c t o n i m p ( p 0 0 5 ) f o r p 9 1 6 4 4 1 9 0 9 ，b bg e n o t y p e i n x i n g h u a c h i c k e n a n d a a g e n o t y p e i nh u x uc h i c k e nh a v e s i g n i f i c a n t e f f e c to na b d o m i n a lf a t w e i g h t ( p 0 0 5 ) i nt h ea n a l y s i so ft h ec o r r e l a t i o nb e t w e e nh f a b pg e n ea n dt h ei m fc o n t e n t b yu s i n gt h ed a t ao f t h e s ef o u rb r e e d st o t a l l y , f o rp 2 1 1 0 - 2 8 0a n dp 7 - 1 1 0 6 1 2 8 3 ，t h e r e s u l t ss h o w e dt h a ti l v l fc o n t e n th a d s i g n i f i c a n td i f f e r e n c eb e t w e e na a a n da b 、 b bg e n o t y p e ( p 0 0 5 ) f o rp 3 - 4 3 0 - 6 6 1 t h e r ew e l es i g n i f i c a n td i f f e r e n c eb e t w e e n b ba n da b 、a ag e n o t y p e ( p 0 0 5 ) f o rp 4 - 5 2 8 - 7 9 2 t h er e s u l t ss h o w e dt h a t i m fc o n t e n th a dh i g hs i g n i f i c a n td i f f e r e n c eb w e e nb ba n da b 、从，w h il et h e r e w e r es i g n i f i c a n td i f f e r e n c eb e t w e e na ba n da bg e n o t y p e ( p o 5 为高度多态；0 2 5 p i c o 5 为中 度多态；p i c o 2 5 为低度多态。 h”一l“ p i c = l 一( 只2 ) 一( 2 只2 群) 扛ij = lj = i + l 其中i ，j 为第i ，j 个等位基因；p 。和p j 分别为第i 和第j 个等位基因的频 率；n 为等位基因数。 2 3 3h a r d y - w e in b e r g 平衡状态的检验 h a r d y w e i n b e r g 平衡是指在一个无穷大或足够大规模的、封闭的、随机交 配的孟德尔群体中，基因型频率在世代交替过程中保持稳定不变，这种稳定状 态称为h a r d y w e i n b e r g 平衡。 检验公式； 对于一个处于h a r d y w e i n b e r g 平衡状态的群体，在一个基因座位具有两 个等位基因的情况下有如下公式： p = p 2h = 2 p qq ：q 2 n n ，= ( n m + n 柚+ n 哺) hn m ，= ( n “+ n 柚+ n 瞳) p n 雎，= ( n m 十n 聃+ n ) q 其中：p = ( 2 n m + n n ) 2 ( + n 柚+ n ) ，q = ( 2 n 日+ n | ) 2 ( n m + n 。+ n 8 日) 其中：p 为等位基因a 的基因频率，q 为等位基因b 的基因频率。n 。、n 。 和n n 分别为群体中基因型为从、a b 、b b 型的个体数。，、，、n 。，为n 。、 n n 、n 蚰的理论值。 平衡状态的判定用x2 适合性检验进行l 艟, 6 9 , 7 0 。 2 l 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 z 2 ，( o i - 甄e i ) 2 ( d f 2 ) 矫正公式为： zz：主幽。=1 e e t ：理论值，0 。：实际观察值，n 为等位基因数 2 3 4 基因型与鸡的生产性能的相关分析 在分析h - f a b p 基因与各品种( 系) 鸡脂肪性状的相关分析时，根据固定效 应模型，利用s a s 6 1 2 软件包，采用的最小二乘的方差分析数学模型为： y i j = s i + m j + e l j 其中y 。，为个体生产记录；肛为群体平均值；s 。为性别效应；m j 为基因型效应； e 。j 为随机误差。 在分析总群体h f a b p 基因不同位点中各基因型对脂肪性状的相关分析中， 则采用的数学模型为： y l j f 。s l + m j + & + e i 业 其中y 小为个体生产记录；p 为群体平均值； s 。为性别效应；m j 为基因型效应； b k 品种效应；e i j k 为随机误差。 2 3 5 核苷酸序列分析 ( 1 ) 对得到的序列运用b i o e d i t 软件进行核苷酸序列的校对，以确保序列 的准确性；用d n a s t a r 软件包( d n a s t a ri n c ，1 9 9 6 ) 的e d i t s e q 、s e q m a n 软 件进行序列编辑和比对，同时构建系统发育关系树。 ( 2 ) 用d n a s p 4 1 0 ( d n as e q u e n c i n gp o l y m o r p h i s m ) ( r o z a se ta 1 ，1 9 9 9 ) 统计核苷酸多态性，群体内和群体间d n a 序列的变异情况( k i m u r a ，1 9 8 0 ； t a j i m aa n dn e i ，1 9 8 4 ：j i na n dn e i ，1 9 9 0 ) 。 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 3 试验结果 3 1 基因组d n a 抽提结果 用1 琼脂糖凝胶电泳，e b 染色，经紫外透射仪检测。结果能够用于p c r 图3 i 鸡基因组d h 财由提结果 f i 9 3 1t h er e s u l t0 5t h eg e n o m i cd g a 3 2p c r 扩增结果 用1 2 对引物分别对鸡基因组d n a 进行扩增，经过摸索条件得到所需的扩增 产物，各扩增产物的琼脂糖电泳检测结果如下( 所有m a r k e r 都是d l 0 0 2 ) ： 3 2 1 引物1p c r 产物的扩增结果 _1234567 图3 2 引物i 的2 0 7 b pp c r 产物i o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 2a g a r o s eg e l ( i i m a g ea b o u t2 0 7 b pp c rp r o d u c to fp r i m e rl 3 2 2 引物2p c r 产物的扩增结果 1234567m 图3 3 引物2 的1 8 8 b pp c r 产物i 0 9 6 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 3a g a r o s eg e l ( 1 o ) i m a g ea b o u t1 8 8 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r2 3 2 3 引物3p c r 产物的扩增结果 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 l 2 3 4 5 6h 图3 4 引物3 的2 3 2 b pp c r 产物1 o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 4a g a r o s eg e l ( 1 0 ) i m a g ea b o u t2 3 2 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r3 3 2 4 引物4p c r 产物的扩增结果 m 1 23 4 5 图3 5 引物4 的2 6 5 b pp c r 产物1 o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 5a g a r o s eg e l ( 1 i m a g ea b o u t2 6 5 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r4 3 2 5 引物5p c r 产物的扩增结果 ml 2 34 图3 6 引物5 的2 7 5 b pp c r 产物i o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 6a g a r o s eg e l ( 1 0 9 6 ) i m a g ea b o u t2 7 5 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r5 3 2 6 引物6p c r 产物的扩增结果 hl234567 图3 7 引物6 的2 0 9 b pp c r 产物i o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 7a g a r o s eg e l ( 1 o ) i m a g ea b o u t2 0 9 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r6 3 2 7 引物7p c r 产物的扩增结果 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 ml234567 图3 8 引物7 的1 7 8 b pp c i l 产物i o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 8a g a r o s eg e l ( 1 - o ) i m a g ea b o u t1 7 8 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r 3 2 8 引物8p o r 产物的扩增结果 mlz3456 图3 9 引物8 的2 7 1 b pp c r 产物1 0 9 6 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 9a g a r o s eg e l ( 1 o ) i m a g ea b o u t2 7 1 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r8 3 2 9 引物9p o r 产物的扩增结果 ml234567 图3 1 0 引物9 的2 6 6 b pp c r 产物i 伽琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 1 0a g a r o s eg e l ( 1 o ) i m a g ea b o u t2 6 6 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r9 3 2 1 0 引物1 0p c r 产物的扩增结果 l2345 图3 i i 引物1 0 的1 1 3 b pp c r 产物 67 m 1 o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 i ia g a r o s eg e l ( 1 0 ) i m a g ea b o u t1 1 3 b pp c rp r o d u c to fp r i m e r 3 2 ”引物1 ip c r 产物的扩增结果 四川农业太学2 0 0 6 届硕士学位论文 ml234567 图3 1 2 引物1 1 的2 9 8 b pp c r 产物i o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 1 2a g a r o s eg e l ( 1 0 ) i m a g oa b o u t2 9 8 b pp c i cp r o d u c to fp r i m e r1 1 3 2 1 2 引物1 2p c r 产物的扩增结果 mlz34 567 图3 1 3 引物1 2 的1 6 0 b pp c r 产物1 o 琼脂糖凝胶电泳检测结果 f i 9 3 1 3a g a r o s eg e l ( 1 0 9 6 ) i m a g ea b o u t 1 6 0 b pf c rp r o d u c to fp r i m e r1 2 从上面的琼脂糖凝胶电泳检测结果可以看出：所设计的引物经适宜的p c r 条件，都有较好的扩增效果，片段大小也与鸡的相应片段大小基本相同，而且 扩增片段没有非特异扩增带，可以直接进行s s c p 电泳分析。 3 3p c r - s s c p 多态性检测结果 各扩增片段进行s s c p 银染后，在凝胶成像系统中检测，结果如下： 3 3 1 引物1p o r - s s c p 检测结果 a ba b 从 明从从 图3 1 4 引物ip c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 1 45 s c pa n a l y s i so nt h ep c i p r o d u c to fp r i m e r1 3 3 2 引物2p c r - s s c p 检测结果 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 a a 从 bb b 从 髓 图3 1 5 引物2p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 1 5s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r2 3 3 3 引物3p c r - s s c p 检测结果 从阴髓从从 图3 1 6 引物3p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 1 6s s c pa n a l y s i so rt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r3 3 3 4 引物4p c r - s s c p 检测结果 从a bb b髓从髓 图3 1 7 引物4p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 1 7s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r4 3 3 5 引物5p c r - s s c p 检测结果 从从踮a a b b 图3 1 8 引物5p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 1 8s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r5 3 3 6 引物6p c r - s s c p 检测结果 c c从a bb bb ba b 图3 1 9 引物6p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 1 9s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r6 四j 农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 3 3 7 引物7p c r - s s c p 检测结果 a a阴 b b 从a a 图3 2 0 引物7p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 2 0s s c pa n a l y s i so i lt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r7 3 3 8 引物8p c r - s s c p 检测结果 从ma 从从从 图3 2 1 引物8p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 2 1s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r8 3 3 9 引物9p c r - s s c p 检测结果 a bm髓髓 b 图3 2 2 引物9p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 2 2s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r9 3 3 1 0 引物1 0p c r - s s c p 检测结果 图3 2 3 引物1 0p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 2 3s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r1 0 3 3 1 1 引物1 1p c r - s s c p 检测结果 从从a ab bb b 图3 2 4 引物i tp c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 2 5s s c pa n a l y s i so i lt h ep c rp r o d u c to fp r i m e ri i 2 8 四川农业大学2 0 0 6 届硕十学位论空 3 3 1 2 引物1 2p c r - s s c p 检测结果 从 ba b 从 b 图3 2 5 引物1 2p c r 扩增产物的s s c p 检测 f i 9 3 2 5s s c pa n a l y s i so nt h ep c rp r o d u c to fp r i m e r1 2 从上面p c r - s s c p 结果可以看出：除引物8 和1 0 的扩增片段没有多态，其 余的引物的扩增片段均有多态。 3 4s s c p 检测结果基因型命名 本研究根据鸡心脏型脂肪酸结合蛋白基因( h f a b p ) 的序列( g e n b a n k 登 录号a y 6 4 8 5 6 2 ) 设计了1 2 对鸡h - f a b p 基因引物，经s s c p 检测结果发现第8 和第l o 对引物扩增片段没有多态，第1 、2 、3 、4 、5 、6 、7 ，9 、i i 和1 2 对 引物扩增片段均具有多态。引物1 、2 、4 、5 、7 、9 、1 2 扩增的片段有3 种基 因型，分别定义为从、a b 和b b ；引物3 、1 l 扩增的片段有2 种基因型，分别 定义为从和b b ；引物6 扩增的片段有4 种基因型，分别定义为从、a b 、b b 和c c 。 3 5 突变位点的群体遗传学研究结果 3 5 1 各品种鸡的h - f a b p 基因频率和基因型频率分析 表3 i7 个鸡品种中h - f a b p 基因有多态性引物的基因频率和基因犁频率 t a b l e3 1g a n e 缸q u e n c ya n dg c n o t y p c 脚e n c yo f t h ep o l y m o r p h i cp i m e 坪o f h f a b p g e n ei ns e v e nc h i k e n b r e e d s 四川农业大学2 0 0 6 届硕 学位论文 p r i n l e t 2 引物3 p r i m e r 3 引物4 p r i m e r 4 引物5 p r i m e r 5 引物6 p r i t n e r 6 引物7 p r i m e r 7 引物9 p r i m e r 9 引物“ p r i m e r l l 引物1 2 p r i m e r l 2 a b0 8 7 5 00 5 0 0 0 0 7 0 5 90 7 6 4 80 6 6 6 60 7 2 2 20 6 1 儿 050000 4 7 2 20 5 8 8 20 5 0 0 00 5 0 0 0 0 6 3 8 90 6 3 8 8 b 0 5 0 0 00 5 2 7 80 4 1 1 80 5 0 0 00 5 0 0 00 3 6 1 1 0 3 6 1 2 从 1 0 0 0 01 0 0 0 00 6 4 7 10 8 2 3 50 5 5 5 60 8 8 2 40 7 2 2 2 b b0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 3 5 2 90 1 7 6 50 4 4 4 40 1 1 7 60 2 7 7 8 a b 0 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 0 0 o 0 0 00 0 0 0 0 a1 0 0 0 0i 0 0 0 00 6 4 7 1 0 8 2 3 5 0 5 5 5 60 8 8 2 40 7 2 2 2 b0 0 0 0 00 0 0 0 00 3 5 2 9 0 1 7 6 50 4 4 4 40 1 1 7 60 2 7 7 8 从0 3 7 5 00 1 8 7 5 0 5 8 8 20 4 7 0 60 2 7 7 80 2 7 7 80 2 2 2 2 1 3 b0 3 1 2 50 3 7 5 00 4 1 1 8 0 1 7 6 50 4 4 4 4 0 3 8 8 90 4 4 4 5 a b 0 3 1 2 50 4 3 7 50 0 0 0 00 3 5 2 90 2 7 7 80 3 3 3 3 0 3 3 3 3 a0 5 3 1 ：20 4 0 6 20 5 8 8 20 6 4 7 00 4 1 6 70 4 4 4 40 3 8 8 8 b 0 4 6 8 80 5 9 3 80 4 1 1 80 3 5 3 00 5 8 3 30 5 5 5 60 6 1 1 2 从0 5 0 0 00 3 7 5 00 6 4 7 10 6 2 5 00 6 6 6 70 1 1 7 60 4 1 1 8 b b0 5 0 0 00 5 0 0 0 0 2 3 5 30 3 7 5 0 0 2 7 7 80 8 8 2 40 5 2 9 4 a b0 0 0 0 00 1 2 5 0 1 1 7 60 0 0 0 00 0 5 5 50 0 0 0 00 0 5 8 8 a0 5 0 0 00 4 3 7 50 7 0 5 9 0 6 2 5 00 6 9 4 50 1 1 7 60 4 4 1 2 1 3 0 5 0 0 00 5 6 2 50 2 9 4 10 3 7 5 00 3 0 5 50 8 8 2 4 0 5 5 8 8 a a 0 0 6 2 50 1 7 6 50 0 6 2 50 1 3 3 30 0 5 5 60 0 0 0 0 0 1 1 7 6 1 3 1 0 0 6 2 50 0 5 8 80 4 3 7 50 4 6 6 70 2 7 7 80 3 5 2 9 0 2 3 5 3 a b 0 5 6 2 50 2 3 5 30 5 0 0 00 1 3 3 3 0 3 8 8 90 2 3 5 30 3 5 2 9 c c 0 3 1 2 50 5 2 9 40 0 0 0 00 2 6 6 70 2 7 7 80 4 1 1 80 2 9 4 1 a 0 3 4 3 80 2 9 4 20 3 1 2 50 2 0 0 00 2 5 0 0 0 1 1 7 60 2 9 4 2 1 30 3 4 3 7 0 1 7 6 40 6 8 7 50 5 3 3 30 4 7 2 20 4 7 0 60 4 1 1 7 c 0 3 1 2 50 5 2 9 40 0 0 0 00 2 6 6 70 2 7 7 80 4 1 1 80 2 9 4 1 a a 0 0 6 2 50 0 0 0 00 1 7 6 50 2 3 5 30 0 0 0 00 0 0 0 00 1 1 1 1 髓0 0 6 2 50 0 5 5 6 0 2 3 5 30 1 1 1 60 1 6 6 70 1 6 6 70 0 0 0 0 a b0 8 7 5 00 9 4 4 40 5 8 8 20 6 4 7 10 8 3 3 30 8 3 3 3 0 8 8 8 9 a0 5 0 0 00 4 7 2 2 0 4 7 0 60 5 5 8 80 4 1 6 70 4 1 6 70 5 5 5 5 1 3 0 5 0 0 00 5 2 7 80 5 2 9 40 4 4 1 20 5 8 3 30 5 8 3 3 0 4 4 4 5 a a 0 0 6 2 50 0 5 8 80 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 0 b b 0 6 2 5 00 5 8 8 20 5 8 8 20 5 6 2 50 5 0 0 00 6 4 7 10 7 2 2 2 a b 0 3 1 2 50 3 5 2 90 4 1 1 80 4 3 7 50 5 0 0 00 3 5 2 90 2 7 7 8 a0 2 1 8 7 0 2 3 5 30 2 0 5 90 2 1 8 8 0 2 5 0 00 1 7 6 40 1 3 8 9 b 0 7 8 1 30 7 6 4 70 7 9 4 10 7 8 1 20 7 5 0 00 8 2 3 60 8 6 1 1 从0 3 3 3 30 3 7 5 0 0 2 9 4 10 3 1 2 50 0 5 8 80 3 8 8 90 3 3 3 3 即0 6 6 6 70 6 2 5 0 0 7 0 5 90 6 8 7 50 9 4 1 20 6 1 1 10 6 6 6 7 b0 0 0 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 0 0 a0 3 3 3 30 3 7 5 00 2 9 4 10 3 1 2 50 0 5 8 80 3 8 8 9 0 3 3 3 3 b 0 6 6 6 70 6 2 5 00 7 0 5 90 6 8 7 50 9 4 1 2o 6 1 1 1 0 6 6 6 7 从0 3 1 2 50 1 6 6 70 2 9 4 10 5 2 9 40 6 6 6 70 3 3 3 30 4 4 4 4 踮0 3 7 5 00 4 4 4 4 0 6 4 7 l0 2 9 4 10 3 3 3 30 5 0 0 00 4 4 4 4 b 0 3 1 2 50 3 8 8 90 0 5 8 80 1 7 6 50 0 0 0 00 1 6 6 70 1 1 1 2 11 ：! 塑：! ：型! ! ：! ! 塑! ：! ! ：! ! ：! ! ! ! ! ：! ! 堑! ：! ! ! ! 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 0 3 8 2 40 3 3 3 30 5 8 3 40 5 0 0 0 根据计算基因频率和基因型频率的公式，对7 个不同品种鸡的h - f a b p 基因有多态的1 0 对引物扩增多态性进行统计分析( 表3 1 ) 。 从表3 i 可以看出：对于引物l ，7 个鸡品种都有从、a b 、b b 三种基因型， 其中d c 鸡、t 0 4 鸡、从鸡、q 鸡、h 鸡、s l 鸡群体中主要是从纯合基因型个 体；e 4 鸡群体中主要是a b 基因型，7 个鸡品种中优势等位基因都是a 基因。 对于引物2 ，7 个鸡品种中只有h 鸡群体中是从和a b 两个基因型，主要是a b 基因型个体，a 是优势等位基因；而在o c 鸡、t 0 4 鸡、a a 鸡、q 鸡、e 4 鸡、s l 鸡群体中都有从、a b 和髓三种基因型，主要是a b 基因型个体，但e 4 鸡和s l 鸡中a 是优势等位基因。对于引物3 ，7 个鸡品种中都只有从和a b 基因型， 主要是a a 基因型个体，优势等位基因都是a 。对于引物4 ，7 个鸡品种都有a a 、 a b 、b b 三种基因型，其中d c 鸡、e 4 鸡、从鸡群体中主要是从纯合基因型个 体，a 是优势等位基因；t 0 4 鸡、q 鸡、s 1 鸡和h 鸡群体中主要是b b 纯合基因 型个体，b 是优势等位基因。对于引物5 ，7 个鸡品种中胡须鸡只有从和b b 两 种基因型个体，大多数足盼基因型个体，优势等位基因是b ；而在d c 鸡、t 0 4 鸡、从鸡、q 鸡、e 4 鸡、s 1 鸡群体中都有从、a b 和b b 三种基因型，其中从 鸡、e 4 鸡和o c 鸡群体中主要是从基因型个体，a 是优势等位基因；t 0 4 鸡、q 鸡和s 1 鸡中b 是优势等位基因。对于引物6 ，7 个鸡品种中e 4 鸡只有从、a b 和b b 三个基因型，主要是a b 基因型个体，优势等位基因是b ；而在d c 鸡、t 0 4 鸡、从鸡、q 鸡、h 鸡、s l 鸡中有从、a b 、b b 和c c 四种基因型，其中a a 鸡、 d c 鸡、q 鸡和s 1 鸡群体中主要是a b 基因型个体，b 是优势等位基因：t 0 4 鸡 和h 鸡群体中主要是c c 基因型个体。对于引物7 ，7 个鸡品种中，t 0 4 鸡、q 鸡和h 鸡只有b b 和a b 两种基因型，主要是a b 基因型个体，优势等位基因是b ； s l 鸡群体中只有从和a b 两种基因型，大多数是a b 基因型个体，a 是优势等 位基因；而d c 鸡、e 4 鸡和从鸡群体中是三种基因型，主要是a b 基因型个体。 对于引物9 ，7 个鸡品种中只有d c 鸡和t 0 4 鸡是从、a b 、b b 三种基因型，e 4 鸡、a a 鸡、q 鸡、h 鸡和s 1 鸡只有b b 和a b 两种基因型，7 个品种中主要是b b 基因型个体，b 是优势等位基因。对于引物l l ，7 个鸡品种中都只有从和b b 两种基因型，且主要都是b b 基因型个体，优势等位基因为b 。对于引物1 2 ，7 个鸡品种中，q 鸡群体中只有从和b b 两种基因型，主要是从基因型个体，a 是优势等位基因；而在其他品种中都是从、a b 和明三种基因型，其中从群 体中从基因型个体数量最多，a 是优势等位基因；d c 鸡、t 0 4 鸡、e 4 鸡、h 鸡 四川农业大学2 0 0 6 届硕士学位论文 群体中主要是b b 基因型个体。优势等位基因是b 。 3 5 2 各品种在不同引物中的遗传特性分析 本研究中有多态性的1 0 对引物在7 个鸡群体的遗传特性分析见表2 。 表3 2 多态位点在七个鸡群体中的遗传特性 t a b l e3 2g e n e t i cc h a r a c t