PubMed使用指南.ppt

医学文献资源检索与利用,PubMed数据库检索,中山大学医学文献检索教研室朱伟丽zhuweili020-873304452011年5月,Outline,数据库概况数据库检索检索结果处理yNCBI,1、PubMed-概况,纸质版（IndexMedicus,IM美国医学索引）-光盘版（MEDLARSonLine,MEDLINE）-网络版(PubMed)，收录时间范围：1947-，部分期刊回溯至创刊年。数据每日更新(TuesdaySaturday)世界上权威性的生物医学书目型数据库，收录全世界范围内70多个国家和地区近5000种生物医学相关期刊论文，主要收录英语语种期刊，少部分其他语种期刊。-学科范围涵盖基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、营养卫生、药理和药剂学、预防医学、卫生管理、医疗保健和情报科学领域，2000年起新增生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学领域-全球免费使用，部分文献免费获取全文-集成在NCBI平台，访问网址(/pubmed),1PubMed-概况,记录组成-OldMEDLINEPubMed-OLDMEDLINE：1947-1965年间的MEDLINE数据，正在做回溯加工，补充主题词及部分全文链接-MEDLINEPubMed-indexedforMEDLINE：标引了主题词被MEDLINE正式收录的文献数据。-PreMEDLINEPubMed-inprocess：已被MEDLINE录用，正处于加工标引状态的文献数据。-EpubaheadofprintPubMed-assuppliedbypublisher：由出版商提供的纸质版尚未正式出版的文献，大部分最终会转入PubMed-inprocess，再正式转入MEDLINE，部分不在MEDLINE收录学科范围内的数据，最终会转化为PubMed-assuppliedbypublisher/PubMed状态。-Publisher-SuppliedPubMed-assuppliedbypublisher/PubMed：由出版商提供但因其学科不在MEDLINE收录学科范围内，而最终未进入MEDLINE但保留在PubMed中的文献数据。,OLDMEDLINE,MEDLINE,PreMEDLINE,Epubaheadofprintsuppliedbypublisher,PubMed/suppliedbypublisher,未入选数据,PubMed,标引主题词,入选数据,PubMED形成示意图,检索区,2PubMed-检索,-基本检索-Limit限定检索-MeSH词检索（主题检索）-检索史组配检索-ClinicalQueries（临床咨询模块）-SingleCitationMatcher（单篇引文匹配）,PubMed基本检索,-支持布尔逻辑运算AND,OR,NOT支持截词检索*支持字段检索：如livercancerti-支持短语检索“”自动词语匹配(字段限定、词组、截词检索时该功能失效),案例1(自动词语匹配）,请利用PubMed检索有关结肠造口术后患者的护理的相关文献。检索词：结肠造口术-colostomy护理-nursing,colostomynursing,自动词语匹配:,PubMed对检索用户输入的检索词,如果不限定检索字段,系统依次到MeSH转换表、刊名转换表、作者全名转换表、作者索引表、合作者全名转换表、合作者转换表进行词语的核对、转换和检索，如果在上述六个表中都找不到匹配的短语，系统将短语拆开，继续到这六个表中搜索，短语断开部分为AND关系。如果拆到的单词在上述五个表中还是找不到匹配词，将到所有字段中去搜索这些单词，单词之间的逻辑关系也是AND。,案例2（截词检索）,请利用PubMed检索有关肝移植患者术后生活质量的相关文献。检索词：肝移植-livertransplant*生活质量-qualityoflife,livertransplant*qualityoflife,案例3（精确检索）,利用PubMed检索有关胎儿染色体异常的产前诊断研究。产前诊断：PrenatalDiagnosis胎儿染色体异常：FetalChromosomalAbnormalities,“PrenatalDiagnosis”“FetalChromosomalAbnormalities”,案例4（字段检索）,检索cell杂志上发表的有关干细胞移植方面的文献检索词：stemcelltransplant*cellta常用字段：ti(题名）、tiab（题名或摘要）、au（作者）、1au(第一作者）、lastau(最后一位作者）、ta（刊名）、ad(地址）、all（所有字段）、majr(主要主题词）、mh（主题词),PubMed限定检索,功能：a字段限定b时间限定c文献类型限定d语种限定e年龄性别限定f全文获取限定g检索子集限定,案例1作者与文献语种限定,检索2002年以来PubMed收录的葛坚教授发表的青光眼的中文文献。检索词：作者：gejian2002年以后的作者检索可以用全称主题概念：glaucomaLimits：2002-2010出版年限Chinese语种限定,作者检索tips,作者输入格式:姓前名后,姓用全称,名字用首字母,姓与名之间不加标点符号。如MichaelR,Nash-NashMR自动转换作者名检索:输入Smithjau将检索出Smithja,Smithjb,Smithjr等作者精确检索:“”将作者名引起来,再加au如输入“smithj”au则仅检索出姓为Smith,名首字母为j的作者的文献.,gejianglaucoma,案例2文献时间与类型限定,利用PubMed检索近十年来干扰素治疗多发性硬化症的综述文献干扰素interferonbeta多发性硬化症multiplesclerosis限定：last10yearsReview,检索肝移植患者术后生活质量的研究，要求检索词出现在篇名中，检索结果可以获取全文。检索词：livertransplantation、qualityoflife检索字段：篇名限定：linktofulltext,案例3全文获取限定,Livertransplantationqualityoflife,案例4文献子集限定,护理类杂志上发表的有关循证护理研究的文献检索词：evidencebasednursing检索字段：MeSH限定：subset-nursingjournals,PubMed-主题词检索,PubMed依据MeSH词表（医学主题词表）对所收录数据进行主题标引利用主题词检索可以提高文献检索效率MeSH网络版本集成在PubMed数据库中,案例,检索有关结肠造口(colostomy)患者的护理（nursing)的文献,colostomy,主题词注释,可组配的副主题词,主题词加权与扩展,入口词,主题词树,主要主题词限定检索(加权检索),检索近十年以来PubMed收录的甘精胰岛素治疗2型糖尿病的临床研究文献。检索词：甘精胰岛素：insulinglargine2型糖尿病：type2diabetesmellitus,PubMed-检索史组配检索,同义词,如2型糖尿病noninsulindependentdiabetesmellitusNIDDMType2Diabetes（Mellitus）Adult-OnsetDiabetesMellitusMaturity-OnsetDiabetesMellitusStableDiabetesMellitusSlow-OnsetDiabetesMellitusKetosisresistantdiabetes,.PubMed-ClinicalQueries,为帮助临床医生更有效地获取PubMed数据库中一般疾病的病因学、预后、诊断、治疗及预防等方面的信息，PubMed设置了ClinicalQueries功能。该功能具备特殊的过滤器装置能将上述主题文献集中提供检索。,.PubMed-SingleCitationMatcher,功能:输入题录信息，查找特定文献，参考文献补缺。注意:刊名要准确，缩写要标准作者字段第一作者与最后一名作者需用简写Example:查找：smithiesoliver发表在blood第12期上关Hematopoieticstemcells的文献的篇名、其他作者、页码等信息。,3PubMed-检索结果处理,检索结果显示检索输出、保存全文链接：Linkout,Summary：默认格式，包括作者、篇名、出处、相关文献链接Summary(text)：summary的文本形式Abstract：篇名、作者、摘要、出处、主题词、全文链接标记等Abstract（text）：篇名，作者，摘要，出处MEDLINE：所有记录字段XML格式、PMIDlist可通过Display下拉菜单选择其它显示方式,七种检索结果显示格式,检索结果显示,检索结果输出、保存,剪贴板:Clipboard(临时保存）,注意:Clipboard(剪贴板)最多只能保存500条最多可以保存8小时长期保存,应存到myNCBI的collection中,全文链接-LinkOut,4、PubMed-MyNCBI,永久保存检索结果保存检索策略，追课题发展个性化设置,永久保存检索结果,注册登录,检