BD FACSCalibur中文操作手册FACStation 数据管理系统.doc

bd facscalibur 中文培训手册 第四章 facstation 数据管理系统本章要点1. facstation主要组成。2. 文件类型、管理文件 。3. macintosh的基本用法。4.1facstation 数据管理系统组成facstation系统基本配置1 苹果macintosh计算机2 17或20彩显3 键盘4 鼠标5 彩色或黑白打印机6 加密锁为了确保您的celluest软件能够运行，必须将加密锁与计算机连接。 facstation系统标准软件1 苹果7.1或更高版本的操作系统软件2 cellquest软件通用数据获取分析软件3 facscomp软件机器质控软件4 modfit ltdna分析软件可选软件1 multiset软件全自动单色、双色、三色或四色样本获取分析2 hla-b27软件全自动双色血样获取分析3 simulset软件全自动双色淋巴细胞亚群获取分析4 reti-coumt软件全自动网织红细胞获取分析5 procount软件全自动获取分析人类样本中cd34+细胞6 paint-a-gate用于多色样本的多维分析7 attractor多色样本的自动分析10. quanticalc用于分析用quantibrite pe beads 定标，cellquest获取的定量数据11. worklistmanager和loadermanager与bd软件和facsloder共同使用，实现全自动上样，获取及分析4 2 facstation文件组成这个部分的目的在于帮助你建立自己的文档系统，首先，必须理解几个基本原则。这是一个文件夹。文件夹是用来放置资料的地方，通过文件夹来管理文件。你可以将facstation中的文件夹想象成文件箱里的一个夹层。你还可以将文件夹放进另一个文件夹内以便将相关的研究内容合理分组。4.2.1 如何建立文件夹如想在桌面建立文件夹，只须在file菜单下选择new folder，并对新生成的文件夹进行命名；如想在硬盘下建立文件夹，首先打开硬盘，然后选择file 下的new folder，并命名即可。以此类推，你可在任何一个文件夹下建立新的文件夹，方法是打开上一级文件夹，然后在file菜单下选择new folder。4.2.2 facstation文件的类型1.点阵排列的数据文件（list-mode data file）-为未经处理的原始数据，包含了样本中每一个颗粒被检测的所有参数。通常以fcs2.0形式生成。大多数facstation软件只能分析fcs2.0的数据。2. 统计输出文件（export stats files）-为文本形式的文件（数字及字母），可用于将分析得到的结果传输到表格程序或数据库程序。3. 报告文件（report files）-以一种排列有序的文件形式，包括一个测试或一组测试的结果。通常，一个测试的报告形式为图象文件（曲线和图象），而一组测试的报告则为文本文件。4. document files包括使用软件过程中涉及的所有信息，比如图形形式，页面设计，统计划分，获取设置等。一旦保存，可以重复打开使用，为使用者节省了时间。5. 仪器设置文件（instrument settings files）-包括针对任何一项应用有关仪器条件的各种信息，一旦保存，可以再次打开并输送到仪器。4.2.3 如何管理文件为了帮助你建立适合你们实验室的文件管理模式，下面是一些典型的例子，以供参考。（例1） 这种模式比较适合科研机构。在最高的一级，每一个操作者都以自己的名字建立一个文件夹（如joes, donnas, debs），并在每一个操作者的文件夹下根据使用的软件建立相应的应用文件夹，而在应用文件夹下，再建立实验室文件、数据文件、仪器设置、统计输出等不同的文件夹。（例2） 这种型式既适合于临床也适合于科研机构。以不同科研或临床应用建立相应文件夹作为最高一级，比如血小板检测、小鼠研究、移植实验等，其下建立实验室文件、仪器设置及日期（以月为例）文件夹，在日期文件夹下，再建立每天的文件夹，里面包括数据文件及统计输出文件夹。（例3） 这种型式也能同时适合临床及科研。在最高一级建立实验室文件，仪器设置及数据文件夹，在数据文件夹下再以操作者的名字建立文件夹，在每一个人名下在分别建立数据及报告文件的文件夹。（例4） 这种型式适用于临床。在最高一级建立实验室文件，仪器设置及数据文件夹，在数据文件夹下再以英文字母建立不同的文件夹。保存样本时根据病人的姓名建立文件夹，并将其放入合适的字母文件夹中。4.3 实用macintosh的功能下面列举的是macintosh一些基本特点，可能对你的操作有所帮助：1.当你发现屏幕上的图标被高亮显示（黑线环绕），你可直接敲击return键或用鼠标点击该图标2.双击软件或文件夹的图标可以运行该软件或打开文件夹3.chooser是一个应用程序，让你选择硬件如打印机及网络共享等。chooser可从苹果菜单下进入4.control panels是一个允许你更改macintosh一些特征的程序，比如说声音，鼠标的移动，显示器，键盘，节能装置以及时钟，同样从苹果菜单下进去5.find命令可以帮助你寻找你不能定位的文件。当你同时按住ctrl+f键或从file菜单下选择find时，将出现一个对话窗，在对话窗中键入你需要查找的文件名或文件名的一部分，系统就会查找出相应的文件。如果你不记得文件名，可点击more chioces键，用其它的标准来查询。如果系统找到的文件不是你需要的，可按住ctrl+g键重新启动find命令。一旦找到，系统会显示文件所在的文件夹。6. finder是你与系统软件之间的一个应用程序，用于显示桌面。它之所以叫做finder是因为如同照相机中的viewfinder一样，它可以为你显示电脑工作空间内（即桌面）的所有内容，包括程序，文挡，磁盘等。7. macintosh在操作系统中装有help菜单，称为balloon help，位于菜单栏的右上方。balloon help可对鼠标指向的任何一个macintosh项目作出简单的描述。8. 在balloon help 菜单中也有一个选项为finder shortcuts。选择这一命令可以显示好几页有用的快捷键方式。所谓快捷键是几个按键的组合，用于快速激活命令或设置选项。快捷键同样显示与菜单项的旁边。4.4 如何设置模版通常模版文件可以在任何facstation软件中生成并在例常的工作中被重复使用。一个文挡可以被保存为或转化为固定形式，即为模版形式。一旦文挡被保存为固定形式，则模版将维持原有的形式和内容不再变化。1.单击选择你所需要设为模版的文挡2.在file菜单下选择get info3.在窗口的右下角点击stationery pad4.关闭窗口这时文挡的图标已转换为stationery pad形式。当你打开这种形式的文挡时，它将以新的未命名的文件形式出现，内容与你原来保存的一样，当你关闭或保存这个文件时，系统会请你对这个新的文件命名，这样能保证原有的文件不会被改变。4.5 实验练习：如何将modfit lt的别名添加到苹果菜单下在这里，所谓别名是指代任何一个文件夹中某个程序或文档的方式，且无须备份。一个别名能直接指向它最开始代表的文件，因此，当你打开别名，你实际上是打开了它所指代的文件。在这个小结中，你将学习怎样建立modfit lt这个程序的别名，并将它保存在苹果菜单的文件夹下，这样，你可直接从苹果菜单下进入这个软件。1.找到并双击打开modfit lt文件夹2.激活modfit lt文件的图标，从file菜单栏中选择make alias，这时将生成一个modfit lt alias图标3.在硬盘中找到并打开系统文件夹4.在系统文件夹下打开苹果菜单项目文件夹5.用鼠标拖住modfit lt alias图标，将其放入苹果菜单项目文件夹中这时，你可以直接从苹果菜单下运行modfit lt了。4.6 可选性存储装置光盘驱动器及zip、mo是能够为我们提供额外的文件存储空间的外置驱动器，它们是一种在存储容量、使用寿命、速度等方面优于软盘的一种可移动性媒介。可以根据需要选配。4.6.1 可选性存储装置的基本工作原则当一个可选性存储装置与电脑连接，同时磁盘也放入驱动器后，电脑桌面上将出现一个图标，你可象进入其它存储器一样进入。下面列出了一些基本操作原则：1.参考生产商提供的使用指南，清楚开始与关闭的程序2.在打开电脑之前打开存储装置，以便电脑识别3.新的储存媒介在使用前要先格式化4.在关闭系统电源之前，将磁盘从驱动器中取出，否则可能丢失数据5.参考使用指南中的安装步骤及故障排除6.不要在电脑电源或其它配件电源接通的情况下连接或脱连接外接存储装置，这样可能会对电脑或配件造成损害7.如果电源突然断电，而磁盘还在驱动器中，请不要在电力恢复前试图将磁盘取出8.不要直接获取数据到可选性磁盘中，可能出现连接问题导致数据丢失。facstation在直接获取数据到硬盘时效率最高，然后再拷贝一份到可选性存储器中4.6.2 光驱的维护驱动器如不够洁净会引起系统操作错误，例如若在光盘和驱动头之间存在灰尘粒子，你会发现电脑找不到你需要的文件，即便你能肯定这个文件一定存在。随后再试，你又会发现电脑能毫无问题地找到这个文件。所以说，即使是一个微粒也可能在任何一个时候干扰驱动器阅读文件，并可能损坏光盘或驱动头。定期清洗驱动器能有效地防止这类问题。如何清洗读/写头对于光驱，在一般性的工作环境中需要每三个月清洗一次驱动器镜头。你可用专门的光驱镜头清洗试剂盒和媒介清洗试剂盒做日常维护。4.6.3光盘或软盘的维护1.不要让磁铁或带磁性的物体接近光盘或软盘，可能导致数据的丢失，也不要将它们放在电脑显示器、打印机或激光的上面2.不要在驱动器运行的时候撞击或移动它3.不要在磁盘或光盘处于工作状态时移动它们，这将导致数据的丢失4.不要在磁盘没有取出的情况下关闭驱动器的电源，这不仅会导致数据损毁，还让驱动器门处于敞开的状态，使其暴露于灰尘和其它污染物之下，可能引起数据的丢失5.不要在驱动器电源未接同的情况下插入光盘