核磁处理软件使用说明PPT课件.ppt

Mestre CWINNMR 核磁处理软件 1 核磁数据处理软件有 NUTS MestRe C Gifa等 NUTS可以处理一维及二维核磁数据 其功能包括付立叶变换 相位校正 差谱 模拟谱 匀场练习等几乎所有核磁仪器操作软件的功能 其演示版在下载 2 MestRe C为处理一维二维核磁数据的免费软件 功能完善 其最新版本为2 3 有兴趣可在http qobrue usc es jsgroup MestRe C MestRe C html处查看有关信息即下载 或所内网站上下载 Gifa可以处理一至三维核磁数据 为运行在LINUX操作系统中X Window上的免费软件 有关信息可查看http www cbs univ montp1 fr GIFA 3 核磁处理软件 Mestre C 4 软件安装 从ftp上下载软件 安装完毕后 将crack软件解压缩后将其拷贝到安装程序所在文件夹 覆盖原文件即可 获取核磁数据 软件本身带有一个ftp客户端软件可以从网络下载数据 5 打开已经下载的数据 软件可以自动识别核磁数据的格式 不同仪器产生的数据格式不同 对于所有的仪器 原始的核磁数据文件名为fid对于bruker仪器产生的数据 因其可以保存处理好的数据 可由Mestre C软件直接打开 文件名1D为1r 2D为2rr 6 核磁数据的目录结构 Bruker仪器 文件名 编号 原始数据存储在这个文件夹中File open 文件所存盘 文件名 样品编号 pdata 处理编号 文件类型 allfiles 文件名1D为1r 2D为2rr 处理过的数据存储在这个文件夹中 7 一维数据处理的步骤 打开原始数据文件fid文件 是一个递减的波形文件进行傅立叶变换 设置参数 最重要的是setfunctions中的第一个参数 窗函数 调整相位基线校正积分 定标 标记化学位移等 8 谱图处理 设置窗函数 单击ft按钮 在对话框中点击setfunction s 在打开的对话框中 修改exponentia的值缺省是0 5Hz 增加此项数值将会是峰型变宽 但可消除裂分 9 相位校正 可选择自动相位校正如果效果不好 可使用手动校正点击手动相位校正按钮在对话框中点击biggest按钮在对话框中间部分按住鼠标左键 调整最高峰附近的峰的相位在对话框中间部分按住鼠标右键 调整远离最高峰的其他峰的相位调到峰行对称 10 基线校正 点击工具按钮上基线校正按钮 在菜单中选择fullauto即可 11 核磁画图 可以不做以上操作直接进入图谱按以下操作进行图谱处理 处理标记峰定标积分谱图显示 处理 12 标记峰 找出变换好的图谱路径如下 File open 文件所存盘 文件名 样品编号 pdata 文件类型 所有文件allfiles 文件名1D为1r 2D为2rr1D点击PeakPicking按钮 使用鼠标在谱图中进行标记 13 点击PeakPicking按钮 使用鼠标选中 框住 在谱图中进行标记 14 化学位移保留小数点后 位 options properties peakpick decimal 15 定标 如果化学位移出现偏差 可使用工具条上标有TMS的按钮进行定标 单击TMS按钮 鼠标指针变为十字型在标准峰上单击鼠标在弹出的对话框中输入化学位移值 16 积分 点击积分按钮 使用鼠标进行积分可使用自动积分积分值可以到出到文件 17 点击积分按钮 按住鼠标左键拉动进行积分 18 用鼠标双击某一积分面积跳出对话框把它定为1对积分面积进行调整 后copy到word 19 鼠标拉倒边框处 点右键对边框进行调整 20 谱图显示 可使用工具按钮上有关谱图显示的按钮进行谱图放大 缩小等操作 21 Mestre C有关参数的设置 窗口背景 options seting谱图参数 options properties找出变换好的图谱路径如下 File open 文件所存盘 文件名 样品编号 pdata 文件类型 所有文件allfiles 文件名1D为1r 2D为2rr 2D处理 22 2D粘贴1D 从上面图标上点击setup1DTraces再从跳出的对话框中点击leadfromdisk选择1D查找范围 样品所在 样品名 图谱编号pdat 1r双击 23 调整1d 如图按左边对话进行调整 24 2D校正 advance shiftspectrumvector pointsto增减 添加方框线 options setting gride 选为黑色 25 画图 选择从上面图标上点击红色方框 再从跳出的对话框中点击红色方框图旁边的第二个圆圈图 26 2020 1 9 27 2D去边框 粘贴好1D后 选中1D上边 或左边 点击鼠标右键 properties set none ok apply ok 28 NOESY QC需要照以下路径操作 界面左边lev negative调为 2D去边框 粘贴好1D后 选中1D上边 或左边 点击鼠标右键 properties set none ok apply ok 29 C和DEPT 依次打开C和DEPT 将C谱取峰 校正 确定C谱范围 将DEPT打开 并确定成与C谱相同范围将C谱复制edit copyspectrum在打开的DEPT中将复制的C谱粘贴在工具栏stack随后通过工具栏 左右居 中将两张谱对齐以下操作类推即可 此时需用edit selectallspectrum工具选择所用图谱 然后再copy 30 核磁处理软件 WINNMR 31 网络版WINNMR软件 从ftp上下载该软件在安装界面中选择安装 WINNMR1D 1DPostprocessingWINNMR2D 2DPostprocessingWIBukey2 52asoftwareprotection安装完后在c windows d2nmr init中加入 settings Network 1Nethasp 1 32 网络版WINNMR软件 此软件对1D谱放大及DEPT画图较好 找出变换好的图谱路径如下 File open 文件所存盘 文件名 样品编号 1D为1r 2D为2rr点开1D点击PeakPicking按钮 使用鼠标在谱图中进行标记添加图谱参数output acpu从里面选择所需参数 showselect ok 33 标记峰图谱路径如下analysis peapking pc ok 点击 对图谱调整添加图谱参数output acpu从里面选择所需参数 34 analysis peakpicking pc ok mousepp框出所需的峰 returnanalysis Calibration calibraic returnanalysis integration 点击积分按钮 使用鼠标左键右键把光标放到最小的峰上进行积分 return yes打印output printersetup setup 布局 横向 确定 ok 此设置好后即可 标峰 校准及积分路径如下 35 调整图谱 点击左边preview鼠标左键选中图谱 向左拉动右边边框 再用鼠标左键选中参数栏 将其拖到图谱右边 鼠标左键选中图谱 向上下 左右拉动边框 用鼠标点击 2 2调整图谱峰高 36 打印 点击preview yes选中参数把参数拖到适当位置printoredit copy到word 点击界面左上角nmrzoom进行放大 37 C和DEPT 按照氢谱做法打开碳谱 进行校准标峰后点击preview双击鼠标左键跳出对话框把xstar和Xstop化学位移固定 把颜色改为黑色点击ok 再file savemetafile 确定 yes储存 return 照上述操作打开dept preview 调整图谱放在中间 删除参数 双击取消axis fram 选定star stop ok 在file openmetafile 确定调整13C savemetafile 确定 yes 38 File open 文件所存盘 文件名 碳谱编号 1ranalysis peakpicking pc ok mousepp框出所需的峰 39 点击preview双击鼠标左键跳出对话框把xstar和xstop化学位移固定 固定谱宽化学位移 40 鼠标左键选中图谱 向左拉动右边边框 再用鼠标左键选中参数栏 将其拖到图谱右边 鼠标左键选中图谱 向下拉动上边边框 缩小到页面1 3处 用鼠标点击 2 2调整图谱峰高 鼠标 41 照上述操作打开dept preview 调整图谱放在中间 删除参数 双击取消axis fram 选定star stop固定化学位移 ok 在file openmetafile 确定调整dept savemetafile 确定 yes 2 2调整谱峰度 拉大 缩小边框 选中取消 42 照上述操作打开dept135 preview重复上述操作 openmetafile 确定调整13C printorcopy到 43 2D处理 找出变换好的图谱路径如下 File open 文件所存盘 文件名 样品编号 2rr粘贴1r图谱路径如下 Utilities f1 axisext 文件所存盘 文件名 样品编号 pdata处理编号 文件类型 allfiles 1r acceptUtilities f2 axisext 文件所存盘 文件名 样品编号 pdata处理编号 文件类型 allfiles 1r accept 44 45 可以拉大边框对图谱大小调整 拉后要选中上边和左边的1d调整 点击右面automaticfactor改为2调整画面 46 放大图谱只要用鼠标框中2d在点击鼠标左右键 然后分别用鼠标点击上边和左边的1d调整 通过点击一边把一边变为灰色 另一边变为蓝色进行调整 灰色不变 蓝色变 47 打印要把右面colors设置为黑色 48 对于2d hsqc roesy 需要点击左上角 对正负面选择恰当的一面进行处理 下图为点击 前 49 处理前图谱不理想 处理后较好图谱 下图为点击 后 50 打印设置