ChemDraw 教程－2.doc

ChemDraw 教程2Written by Anan WuXiamen University Chapter 4 Atomic Label and Text在ChemDraw中有两种文本：说明文字和原子标记文本。说明文本用来建立化学品的名字，化学方程式，页标题和在表中的信息。原子标记文本用来确定原子和由化学符号及分子式确定的详细结构。在图4-1中表示了海胆霉菌素原子的标记和说明都是用文本工具来编辑的。4.1 说明文本建立一个说明文本的方法：l 在工具板上选择文本工具。l 在文件窗口任意合适出单击鼠标，此时会出现含有光标的说明文本。l 输入文本说明，见图4-2，文本框的宽度随文本的输入而变化。l 另起一行，按回车键l 在文本框的外面单击鼠标即可关闭工作文本框而建立另外的一个文本框。4.2 编辑说明文本的内容编辑现有说明文本的方法：l 在工具板上选择文本工具l 将鼠标移动至说明文本处，当出现黑框时单击鼠标即可编辑现有文本。用选择工具编辑现有说明文本：l 在工具板上选择选择工具，并将鼠标移动至现有说明文本，当出现黑框时单击鼠标选择现有文本。l 按Ctrl+Alt+Tab或选择文本工具即可编辑现有文本。4.3 说明文本的字体，字号和字形ChewDraw 使用系统默认的字体，字号和字形，改变格式有两种方法：l 选择文本说明。l 利用Text菜单(见图4-2)中的Font(字体)，Size(字号)，Style(字形)子菜单。l 利用格式对话框来改变格式。图4-2 Text 菜单注意：字形的改变可以利用字形子菜单中右键给出的组合键来完成，而改变字号可以利用Rezize handle 或者Scale多话框中的选择项来完成。同时也可利用工具栏中的字体，字形，字号工具来改变格式。4.4 输入非罗马字体ChemDraw 用标准的方法设置了所有类型的字体，包括希腊字母和其他常见的化学符号。建立希腊字母的方法：l 用文本工具单击建立文本框。l 在Text菜单或工具栏中对应的Font子菜单中选择Symbol命令。l 输入文本，例如要建立a，可以输入a；要建立p，可以输入p。l 如希望在希腊字母文本框中输入非希腊字母，可在Font子菜单中选择相应的字体。建立度数符号的方法：l 用文本工具建立文本框。l 按下右面的数字小键盘中的Num lock 键。l 按住Alt 键。l 在数字键盘中连续键入0176。l 放开Alt键。4.5 原子符号的标记4.5.1 原子符号的标记l 选择文本工具。l 将鼠标移动至原子处，当出现一蓝色亮斑后单击鼠标，将弹出原子标记框。l 输入原子符号。l 按回车键关闭原子标记框。也可使用键或者环工具在原子上定位，然后双击来标记原子。见图4-3，4-4图4-3 定位图4-4 单击在一个原子标记框中建立一新行的标准方法是按下Alt+Enter。4.5.2标记同位素，电荷l 打开一原子标记框。l 输入一个同位素或电荷，如: 15N，O-l 用文本工具，选择同位素质量15。l 从Text菜单中的Style子菜单选择Superscript命令，图4-5图4-5 建立同位素标记4.5.3 重复标记原子符号标记许多相同原子符号的方法：l 标记一个原子。l 双击其他原子可重复标记已标记的原子符号。编辑原子标记可参考编辑文本说明(见4-2节)。4.5.4 原子标记的调整为把原子标记在准确位置上，把标记分成各符号段，先把第一个符号与原子相连，然后再放置剩余的符号。例如建立N-甲基哌啶分子，首先要确定在环己烷的某个原子处建立一个标记NCH3。如果标记在C3原子处，标记符号就从左至右标记。如果在C5原子标记，标记符号就从右至左。在C1原子上标记，第二和第三个符号就要放置在第一个原子上面。如果在C4原子处，第二和第三个符号就要放置在第一个的下面。见图4-6。图4-6 建立N-甲基哌啶分子上标记的调整：l 选择要标记的原子。l 在Text菜单中选择Stacked Above命令。l 按下Alt+Enter键来建立新一行。l 输入第二行字母。（见图4-7）图4-7 上标记的调整对齐调整l 选择要标记的原子。l 在Text菜单中选择对齐命令(左，右，中间对齐)。l 从左至右输入字母Chapter 5 Drawing Orbital and Chemical Symbol 轨道工具用于化学结构作图中的轨道绘制。首先绘制单个轨道，每种类型的轨道都有三种颜色填充模式：白色，灰色和黑色。 选择Objects 菜单中的Fixed Lengths 命令可以限定轨道的长度，也可以通过选择Fixed Angles命令来限定所有轨道相对于X轴的角度。 注意：在ChemDraw里面轨道不属于邻近结构的一部分，可以用Objects菜单中的Group命令将轨道和结构组合成一体。5.1 s-轨道l 在工具板上选择轨道工具，在弹出的子菜单中选择第一行的前三种工具中的任一。l 将鼠标移动至已绘制的结构中的原子位置处。l 向外拖动鼠标即可绘制出一s-轨道。当选择了Objects里面的Fixed lengths，可以通过按住Alt键来调节轨道的大小。其它轨道的绘制可以通过选择相应的轨道工具，进而参照s-轨道的绘制。5.2 化学符号化学符号工具用于在绘制的化学结构中加入各类化学符号。所有的化学符号都会自动与最近的结构结合成一体。另外这些符号都包括在所执行的任何Check Structure命令中（见Structure菜单）。5.2.1 H-点和H-划表示一个沿Z轴向平面外伸出的H，可以使用H-点符号。表示一个沿Z轴向平面里进入的氢可以使用H-划符号。绘制一个H-点和H-划的方法：l 从化学符号栏中选择第一行的第五个子工具或者第二行第五个工具。l 定位要操作的原子。l 单击该原子即可。5.2.2 孤对电子，自由基，阳离子，阴离子和电荷可以参照H-点和H-划的绘制方法绘制。Chapter 6 Drawing Arrow，Arc and Other Figures.6.1 箭头工具箭头工具用于表示电荷的转移，键间的角度以及显示反应物向产物的转化及配位键(见图6-1)图6-1 用箭头表示电荷转移，键角6.1.1 绘制箭头l 在箭头工具中选择普通箭头（箭头工具的第一行前三）。l 将鼠标移动至工作窗口的任意适合位置。l 按住鼠标左键拖动鼠标即可绘制出箭头。6.1.2编辑箭头延长，缩短和旋转箭头的方法：l 在工具栏选择选择工具。l 选择整个箭头区域(见图6-2)l 在亮斑处拖动鼠标即可对箭头进行延长，缩短或者旋转。图6-2 选择箭头区域注意：箭头的延长，缩短和旋转都是相对于其端点。6.2基元工具基元工具提供了各种结构图形中的基本图形元素。一些基本图形元素有不同的填充模式：空心，灰色和黑色。6.2.1方框工具绘制基本方框图形的方法：l 从基元工具的子工具中选择方框工具。l 在工作窗口定位方框的左上角。l 从定位点沿对角线拖动鼠标即可绘制所需方框（见图6-3）。图6-3 绘制方框图形其它的基元图形如圆，椭圆，弧等可参照方框的绘制。编辑结构基元可参照上节编辑箭头的操作。6.3画笔工具在ChemDraw里面，画笔工具具有强大的功能，可用于绘制箭头，轨道或者基元工具箱中所未提供的图形。其最大的作用是用以绘制化学反应势能曲线(见图6-4)。图6-4 化学反应势能曲线6.3.1单击绘制用画笔工具绘制的最简便方法是图形轮廓上反复的单击：l 在工具板上选择画笔工具。l 在绘制窗口定位曲线的起点，并单击鼠标左键。l 移动鼠标，再次定位并单击得到第二点，此时两点被直线连接，继续单击可以得到所需图形（见6-5）。图6-5 用画笔工具单击建立图形6.3.2 拖动绘制曲线用画笔工具绘制曲线的第二种方法是拖动鼠标绘制曲线。l 在工具板上选择画笔工具。l 在工作窗口定位曲线的起点，并拖动鼠标，出现两端点。l 移动鼠标至另一位置，再次定位后拖动鼠标即得到一曲线。在此端点出现三个灰点用于控制曲线的曲率及位置。用鼠标调节灰点的位置可以改变曲线。l 继续以上操作可以得到第二段曲线，以此类推。l 绘制结束后，可按Esc或者单击另一工具退出曲线绘制。（见图6-6）图6-6 用画笔工具绘制曲线6.3.3 编辑改变曲线编辑已绘制的曲线的方法：l 选择画笔工具。l 将鼠标移动至曲线的任意位置，单击鼠标左键即可进入编辑状态。l 此时原来绘制时用以调节曲线的灰点都会重现。l 选择任意灰点可以对曲线进行编辑改变。6.3.4 添加一条线段添加一条线段的方法：l 选择画笔工具，单击曲线进入编辑状态。l 将鼠标移动至曲线的一端点，直至光标变为手型。l 按住Alt键，当手心中出现一+号后，单击鼠标为端点添加一控制点后，可将鼠标移动至窗口任意点添加曲线。l 按Esc或者单击其它工具，或