如何进行医学信息检索

2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 1 美国医学文献数据库MEDLINE 2008 9 22 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 2 一 数据库概况 一 主办单位 美国国立医学图书馆 NLM 编制 二 收录学科内容 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献 包括行为科学 健康专业所需要的化学 生物工艺学 基础研究和临床 护理 公共卫生 卫生政策发展或相关教育活动的内容 2000年起增加了生物 环境科学 海洋生物 植物和动物学 生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 3 三 文献来源 收录全球70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊 大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee LSTRC 评估挑选 由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐 近年数据涉及37种语种 回溯至1950年的数据涉及60种语种 数据库47 为美国本土出版文献 90 为英文文献 79 的文献有著者撰写的英文文摘 以上数据根据2007年11月数据库提供 一 数据库概况 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 4 四 收录数据类型已处理完毕的数据 Indexed 1950 1965回溯数据1966topresent近年数据处理中的数据 Inprocess 最新的 尚未经规范处理的数据 只有简单的篇名 作者 出处等书目信息和文摘 没有标引规范化医学主题词 物质名称 文献类型等信息 该库中数据在所有标引工作完成后 每周一次转入MEDLINE Indexed数据库中 一 数据库概况 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 5 收录图示 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 6 五 MEDLINE的检索系统NCBI PubMedOvidSPWebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch 一 数据库概况 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 9 一 NCBI网站简介www ncbi nlm nih gov 1988年 美国的参议员ClaudePepper发起 1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心 NCBI NCBI的任务 建立基于计算机信息处理的分子生物学 生物化学 遗传学知识的自动存储和分析系统 并进行先进方法的研究 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 10 NCBI主页 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 11 NCBI生物信息整合系统Alldatabase 检索大分子生物学数据获取GenBank EMBL等数据库的核酸序列 获取Swiss port PIR PRF PDB等蛋白质序列 从核酸序列翻译到蛋白质的序列 获取基因和染色体图谱 蛋白质三维结构数据及大分子模式 MMDB 等其他生物信息数据库检索 PubMed书目文献数据 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 12 二 PubMed简介 特点 1 免费提供题录和文摘2 提供与原文的网址链接 部分免费获取 3 提供检索词自动转换匹配4 操作简便 快捷 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 13 PubMed收录数据 MDENLINEIndexed1966toprensent的MEDLINE已标引数据 有MeSH字段和摘要 每条记录标有 PubMed indexedforMEDNLINE OldMDENLINE1950 1965年间的MEDLINE数据 没有MeSH字段和摘要 每条记录标有 PubMed OLDMDENLINEforPre1966 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 14 PubMed收录数据 MDENLINEInprocess最新的MDENLINE尚未标引的处理中数据 每条记录标有 PubMed inprocess NotMDENLINE是出版商提供的电子文献 PubMed收录 而MDENLINE不收录的数据 每条记录标有 PubMed 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 15 基本检索输入框 特征栏提供辅助检索功能 侧栏提供其他检索如期刊数据库检索 规范词数据库检索 特定文献检索等 执行检索 PubMed主页 高级检索 个性化服务 检索帮助手册 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 16 可以在检索栏中输入一个或多个检索词 系统默认空格为AND检索 如 placentagrowthoxygen可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式 运算符必须大写 如 asthmaAND therapyORtreatment 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 17 输入多个检索词 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 18 字段限定符 如 Stem ti ANDneuroscience截词符 treat 强迫短语匹配符 brca1 严格按输入形式匹配 不再自动转换匹配和扩展检索 常用于词组和专有名词检索 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 19 含字段限定的检索式 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 20 自动转换匹配检索词 对常用医学名词进行自动在规范词索引 文本词及所有记录字段中转换匹配 如 renalfailurekidneyfailure MESH ORkidney AllField ORrenalfailure AllField 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 21 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 22 自动扩展检索 系统自动对主题词 副主题词进行扩展检索 如 输入hypertensiontherapy 系统自动检索高血压的药物治疗 饮食疗法 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 23 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 24 著者检索 authors 姓全称在前 名首字母在后 加字段限定符如 genbacevo au mooream au 2002年以后的文章可以查著者全名如 joshualederberg 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 25 著者检索mooream au 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 26 期刊检索 journals 刊名全称检索如 newenglandjournalofmedicine so MEDLINE认可的标准刊名缩写检索如 clinexpimmunol so 国际标准期刊号检索如 1059 1524 三 PubMed基本检索规则 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 27 刊名的检索 字段限定来源SO 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 28 PubMed记录字段说明 文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 29 电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 30 最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 31 作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式 纸张或电子 参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 32 四 PubMed的辅助检索 1 Limits 检索限制选择 字段限制 著者 刊名 篇名 出版日期 滤过 filter原文收藏处 等限制 数据输入时间 默认检索可回溯到1950年 限制选择30天 10年 各种文献类型限制各种语种限制期刊类别与学科文档限制 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 33 作者限定 添加作者姓名输入框 清除限定 期刊限定 作者姓名索引选词 多作者逻辑匹配选项 全文 免费全文 摘要限定 日期限定 Limits 检索限制 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 34 出版日期限定 入库日期限定 研究对象人 动物限定 研究对象性别限定 语种限定 子文档限定 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 35 检索字段限定 执行检索 清除所有限定 文献类型限定 研究对象年龄限定 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 36 2 Previw index 检索策略预览 索引 浏览检索式 预览检出文献数量修改检索式组配检索式如 可用检索式编号 1OR 2浏览索引 index 选词检索 四 PubMed的辅助检索 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 37 检索预览 检索历史 索引加词检索 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 38 PubMed Index索引检索例 johnshopkinsasthma 选择著者地址字段 输入地址起始单词 点击显示索引词表 选择相关词条 选择词条间的逻辑关系 添加到检索框 执行检索 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 39 3 History 检索史 历次检索式回顾编辑检索式如 5ANDgenbacevo au 四 PubMed的辅助检索 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 40 检索历史回顾 检索式 检索时间 检出篇数 检索式编号可替代检索式进行输入检索如 6ANDgenbacevo au 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 41 4 Details 检索的详细匹配过程 显示检索词转换匹配运算详细过程用途 转换 确定规范词如 livercancerliverneoplasms修改检索策略 四 PubMed的辅助检索 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 42 检索明细 数据库匹配过程 检索词转换 显示用户输入的检索式 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 43 检索策略 检索式 的修改 以下途径均能实现检索策略的修改 基本检索框中随时修改 Limit Preview index History Details 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 44 五 PubMed的高级检索 在一个网页中集检索史 检索字段选择 检索词输入 词表查询 逻辑算符选择 检索限定于一体 选择检索字段后 检索框内只能输入检索词 不能输入检索式 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 45 多栏复合检索 词表查询 栏间逻辑组配 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 46 六 PubMed其他检索服务 1 MeshDatabase 规范化主题词表 确定规范化主题词查看主题词词义注释 树状结构表选择副主题词 扩展主题词 主要主题词例1 欲查植物 plant 生长素 growthfactor 研究的相关文献 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 47 PubMed基本检索 输入检索式 plant ANDgrow ANDfactor 默认在全部字段中检索 结果太多 相关度低 植物SynadeniumumbellatumPax的抗肿瘤和抗血管生成活性 血管内皮生长因子的水平并非植物生长素 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 48 PubMed基本检索 输入检索式 plant TI ANDgrow TI ANDfactor TI 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 49 MeSH规范化主题词表选词检索 送至检索框 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 50 输入自由词检索ANDgrowthfactor 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 51 MeSH查找植物生长素结果 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 52 详细结果 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 53 检索分析 一般检索逻辑关系粗浅 修饰概念匹配不特定 检索词涵盖不全面规范检索逻辑关系紧密 修饰概念匹配特定 下位词检索全面 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 54 例2 欲查肾衰竭 renalfailure 饮食疗法 diettherapy 疗效观察 treatmentoutcome 的相关文献 基本检索肾衰竭的饮食疗法 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 55 结果中有些主要内容并非肾衰竭 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 56 MeSHDatabase规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题 1 输入检索词 3 点按规范词可获详细注解 2 执行浏览 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 57 主题词注释 可选副主题词 限定作为主要主题词匹配 不进行下位词扩检 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 58 该主题词所替代的非规范词形式 主题词树形结构表 显示该词的学科隶属关系 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 59 检出结果更为专指 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 60 进一步用主题词表检索综合疗效观察 treatmentoutcome 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 61 2 Journaldatabase 期刊数据库 通过输入刊名全称或缩写等浏览特定期刊上发表的文献 提供电子原文的超链按钮 六 PubMed其他检索服务 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 62 期刊数据库检索 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 63 输入待检期刊名 得出期刊详细信息 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 64 3 引文匹配器 CitationMatcher 输入题录信息 查找特定文献进行补缺 刊名要准确 缩写要标准著者姓名大小写不敏感如查找 TaiwanIHsuehHuiChih由ChangPY taiwanyixuehuizazhi 撰写 1975发表文献的其他著者 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 65 输入待检刊名 年份 输入待检第一著者 特定文献查找 已知文献第一著者 欲查其他信息如其他著者等 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 66 得出其他著者 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 67 4 临床问题 ClinicalQueries 专门检索临床研究方法学 循证医学 文献 主要涉及治疗 诊断 病因 和预后四个分类 并提供强调选择 即敏感度 强调查全 或专指度 强调查准 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 68 5 临床警示 ClinicalAlert 1991年开始 NIH美国卫生健康研究所不定期公布能引起死亡率和致病率升高的临床试验项目重要新闻稿 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 69 七 PubMed检索结果输出 显示检索结果保存检索结果保存检索策略打印检索结果 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 70 显示字段选择 Display Abstract 来源期刊 标题 著者 著者地址 记录性质 文献类型 勘误 评论 PMID或UI 摘要 Citation 显示除上述内容外 加MeSH叙词 化学物质名称 资助项目号等字段 MEDLINE 最完整 有标识符 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 71 显示格式选择 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 72 排序 输出方式选择 排序方式 输出方式 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 73 显示记录选择 单一记录显示 著者姓名所有记录显示 选display旁的格式 及每页显示记录数选定记录显示 方框内打钩 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 74 点击作者链接显示文摘增强格式 文摘增强格式 电子期刊全文链接 2020 2 23 复旦大学图书馆文献检索教研室 75 输出格式选择 sendto 选中题录 或文摘 后Text当前网页文本格式 用浏览器文件保存File所有记录纯文本格式保存 用对话框保存Clipboa