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实验室信息管理系统 金同玲山东省疾控中心0531 82679638jintongL2004 实验室信息管理系统 laboratoryinformationmanagementsystem LIMS 目的自动化运行信息化管理无纸化办公作用提高实验室工作效率 科研水平 降低运行成本保证实验室的质量管理在严格控制下运行 从而能使实验室的最终产品即所有的检测或管理数据 信息均符合相关的质量标准或规范 概述 主要内容 第一节 LIMS的基本概念和发展历史第二节 LIMS的系统结构第三节 LIMS的设计开发原则第四节 LIMS的功能简介第五节 LIMS在实验室质量管理中的作用第六节 电子签名第七节 LIMS的应用和未来 第一节LIMS的基本概念和发展历史 一 基本概念1 LIMS的分类2 LIMS的研究对象3 LIMS的基本特征4 LIMS与管理软件的区别二 发展历史1 雏形期2 商品化时期3 功能完善时期4 网络化产品的兴起 实验室信息管理系统 LIMS 的基本概念 简单地讲 实验室信息管理系统 LIMS 就是指通过计算机网络技术对实验室的各种信息进行管理的计算机软 硬件系统 也就是将计算机网络技术与现代的管理思想有机结合 利用数据处理技术 海量数据存储技术 宽带传输网络技术 自动化仪器分析技术 来对实验室的信息管理和质量控制等进行全方位管理的计算机软 硬件系统 以满足实验室管理上的各种目标 计划 控制 执行 LIMS的应用对象 可大可小 可多可少 LIMS的分类 按功能 LIMS一般可以分为两大类 第一类是纯粹数据管理型这类的LIMS软件主要功能一般包括 数据采集 传输 存贮 处理 数理统计分析 数据合格与否的自动判定 输出与发布 报表管理 网络管理等模块 特点 功能单一 容易实现 LIMS的分类 第二类是实验室全面管理型除了具有第一类的功能外 还增加了以下管理职能 样品管理 资源 材料 设备 备品备件 固定资产管理等 管理 事务 如工作量统计与工资奖金管理 文件资料和档案管理 管理等模块 组成了一套完整的实验室综合管理体系和检验工作质量监控体系 特点 1 功能比较全面 除了能够实现对检验数据严格管理和控制外 还能够满足实验室的日常管理要求 2 网络结构相应要复杂一些 实现起来要困难一些 投资比较大 而且往往需要专业单位与实验室合作开发设计 LIMS的研究对象 主要研究对象是实验室管理活动中信息的规律以及用计算机和网络技术实现辅助管理的方法 主要研究内容是如何利用计算机和网络技术来实现信息处理的全过程 LIMS的研究对象 具体来说 包括四方面内容 1 信息需求的研究2 信息流动过程与信息量的研究3 LIMS的结构研究4 主要设计工具的研究 3 LIMS的基本特征 1 LIMS是围绕实验室管理目标而设计的2 LIMS的结构化决策支持3 数据集中统一管理4 分析预测和控制功能5 系统观点 LIMS与管理软件的共性 LIMS作为一个信息管理系统 它有着和ERP MIS之类管理软件的共性 如它是通过现代管理模式与计算机管理信息系统支持企业或单位合理 系统地管理经营与生产 最大限度地发挥现有设备 资源 人 技术的作用 最大限度地产生经济效益 LIMS与管理软件的不同性 首先 LIMS作为实验室的管理软件 它是有标准可以遵循的 它的系统方案设计必须严格遵循国际和国家关于实验室的要求 而ERP MIS之类的企业管理软件则没有相应的标准可以执行 这就使得不同用户的ERP MIS之间可以存在巨大的差异 其次LIMS不仅仅能为实验室提供一个管理的平台 还能为提升整个实验室的运行效率 学术水平等等提供更多帮助 现代的仪器是智能的 高度自动化的 这就使得实验室人员能通过LIMS来操纵仪器 极大的提高工作效率 LIMS发展历史 LIMS发展至今大体可分为以下几个阶段 1 雏形期60年代末期 70年代初期为雏形期 是LIMS设计思想的产生时期 实验室的数据管理仍然停留在手工记录阶段 2 商品化时期这个时代的计算机语言和网络技术还不够发达 计算机的价格比较昂贵 需要专业的技术人员编写与维护程序 3 功能完善时期4 网络化产品的兴起 第二节 LIMS的系统结构 一 体系结构二 基本运行环境三 系统的网络结构 体系结构 以Web服务器为中心 采用三层架构来实现 即 界面 业务和数据三个功能层次 三层架构模式来实现LIMS的优点 1 系统的界面层与业务层相互分离 无论是界面层的改变还是业务层的改变 都可以做到互不影响 因而 有利于系统的维护和功能扩充 增强了系统的灵活性 2 业务逻辑在应用服务器实现 而不是在每一台客户机上实现 同时 对数据的访问也可以做到只能通过应用服务器进行 从而增强了系统的安全性 并实现了 瘦客户端 3 客户端需要的数据可以在应用服务器中进行预先处理或全部处理 然后将处理结果传给客户端 降低网络通信量 基本运行环境 1 软件环境 服务器操作系统 WindowsNTServer UNIX LINUX等 数据库 MSSQLServer SYSBASE ORACLE等 工作站Windows98 Windows2000 WindowsXP等 2 硬件环境 服务器 PC 打印机以及不间断电源等设备 可根据单位实验室的规模进行相应配置 系统的网络结构 实验室及其内部所有仪器设备都分布在一个单位内各个建筑物内 网络的拓扑结构一般采用星型以太网式 以100Mbps速率以太网卡组网 以目前技术发展水平 单位内部完全可以实现100M以上的连接带宽 因此实验室的各种设备都可通过网线连接到各层次的网络设备上 然后与服务器相连 在网络设备与实验室仪器设备之间 也需要布置相关的分析仪器数据接口 如图 第三节 LIMS的设计开发原则 一 总体系统观念二 系统适应性三 联合开发四 系统设计与工作程序配套五 运用计算机功能优势六 自顶向下 第四节 LIMS的功能简介 一 LIMS应具备的基本特点二 LIMS的功能简介 一 LIMS应具备的基本特点 1 技术上具有先进性 高效性 实用性 安全性 2 数据管理功能完善 数据的采集 处理 发布过程中不会出现数据丢失 改变的问题 3 界面友好 操作简便 使用Web数据库技术和统一的浏览器界面 4 自动化程度高 网络结构设计简单 5 模块化设计 易于扩充功能 6 符合ISO IEC导则25的规范要求 符合实验室管理特点 7 产品设计灵活 客户化周期短 二 LIMS的功能简介 1 标准库管理系统主要是完成相关标准的录入 更新 修改和审核等功能 一套完整的标准库是使整个业务能够流畅运转的根本保障 标准库的内容应该包括标准代码 标准名称 标准类别 项目代码 项目名称 项目标准值 项目标准单位 检验方法 检验科室等必要字段 为了保证标准的准确性 标准库应由资深的专家审核后方可正式使用 2 样品管理系统该系统是实验室日常运行最为频繁的模块 它为样品分析评价提供了支持 包括样品分析 样品登录 样品管理 样品测试 审核系统 结果输出 QA QC等方面 3 争议处理系统当用户对分析结果产生质疑时 可以通过争议模块处理争端 LIMS应完整记录样品分析相关信息并具备可追踪性 用户只需通过书面 电话 传真 电子邮件 网上发布等形式提出争议请求 争议处理负责人员将及时响应用户需求 4 查询统计系统 1 信息查询 2 信息统计 1 信息查询 包括分析进度 综合信息查询 用户可根据授权级别查询相关信息 为了迅速从系统中找到所需信息 避免多余信息的出现 用户可进行特定的 自定义查找 所有查询结果都可以进行排序 分类 统计 信息查询可快速反映从原始数据到加工处理数据的每一步历史数据 也能查询人员情况 项目进行情况 客户 标准资料 实验室各种文件规定 各种报表 及各种技术资料等等 2 信息统计 灵活方便的反映不同用户要求的各类统计图表信息模块 根据需要还可提供与各类专用统计软件的无缝连接 5 实验室事务管理系统包括实验室杂务 内部通告 人员去向 计划 工作安排 文档处理 公共信息 人事管理和经费管理等方面 主要从事日常事物处理工作 提供汇总实验室人员 设备 项目以及实验数据 完成各种日常报表编制和实现网上信息采集 整理 检索和数据统计工作 6 检测收费管理系统受检样品收费功能 样品受理完成后形成缴费单据 进行过欠费处理的除外 财务科的工作人员根据样品受理时产生的唯一编号进行收费操作 财务收费应包括申请 被采样 单位 缴款方式 现金 支票 电汇 打折情况 应缴款 实际缴款等字段 财务管理功能包括会计核算 总帐模块 应收帐模块 应付帐模块 现金管理模块 固定资产核算模块 多币制模块 工资核算模块 成本模块 和财务管理 财务计划 财务分析 财务决策 等模块 系统自动完成凭证记帐 根据定义好的报表格式和公式自动生成报表 而且保证了数据的准确性和一致性 减轻了手工劳动 大大提高了工作效率和工作质量 7 科研管理及资料查询系统包括科研立项 过程监控 文档 阶段试验 报告 科研档案管理和项目结题等方面 该系统将与单位内部的文献资料信息库集成 方便科研人员的资料查询 提高科研的水平和质量 8 资源管理系统资源管理包括人力资源 物力资源 标准物质管理 其它物资管理以及无形资产如知识产权等的管理模块 9 客户关系管理系统由于消费者的消费者意识逐渐加强 顾客已由过去的被动接受 转变为主动寻求自我需求 因此注重满足个性差异的顾客需求将是企业间的竞争趋势 在客户导向的时代 只有积极的个性化服务 才能提高消費者的忠诚度 抓住客户的心 客户关系管理关注的就是如何通过不断的沟通了解并影响顾客的行为 通过分析对顾客有效并可供参考的信息 增加新客户 留住老客户 根据客户的个性化需求提供专为客户量身订做的服务以提高客户的满意度并改善客户的利润贡献度 10 系统管理系统系统管理模块是对系统用户进行管理 包括用户设置与编辑 数据查询用户 部门设置与编辑和部门管理等 同时进行资源配置管理和日志管理 系统管理包括系统初始化 设定用户权限 系统设定 日志管理 论坛管理和数据维护 数据维护是系统维护工作量最大的部分 因为系统每天运行都要产生大量数据 这些数据的有效存储 备份都是很重要的 11 内部论坛和公告栏可以按业务种类设置专题论坛 每一论坛有本实验室的这类业务负责人负责 内容涉及该类业务的发展动态 员工的技术交流 专业问题的讨论等 公告栏主要是针对实验室的当前的研究重点 工作活动的安排 主攻的难点 科研计划等进行公告 让员工随时了解本实验室的工作动态 有利于调动员工的工作主动性 12 帮助系统有独立运行帮助系统 有紧跟具体模块的在线帮助 更有智能化帮助信息 系统自动根据鼠标所处的位置给出相应的帮助信息 全方位的提供帮助信息 第五节LIMS在实验室质量管理中的作用 一 样品管理二 数据管理三 仪器管理四 报告管理五 安全管理六 资源管理 一 样品管理在质量管理中 样品登录 分析检验 数据复核直至最终分析报告组成了样品管理流程 根据不同组织结构 各组织成员所担负的不同职责以及不同的样品类型 LIMS通过用户配置将这一流程组织成为能以最规范和最有效方式运行的样品管理流程 并在运行中对整个流程及其各个环节进行精确的控制 从而提高样品的管理效率 质量管理人员可以通过LIMS快捷地获得所有样品的信息 当出现质量问题时能在第一时间作出反应并采取措施 此外 LIMS还可以与业务办公系统等系统连接 让领导和相关部门共享检验信息 及时对出现的问题作出调整 二 数据管理LIMS能对这些数据进行统一管理 将所有数据的输入 贮存 处理和分发全部在一个数据库中进行 避免了数据丢失和多次复制 数据集中管理还为迅速查询和形成报告提供了最快捷方便的手段 并通过相关的统计手段及趋势图来加强产品质量控制 具有纸张保存方式无法比拟的优势 LIMS的安全机制保证了只有经授权的人员才能输入 读取 处理和分发数据 杜绝了非法复制 修改数据的现象 对于正常的数据更正 系统也会要求输入更改理由 并自动记录更改人的姓名及时间等 三 仪器管理LIMS可以连接分析仪器 如液相色谱仪 气相色谱仪 天平等 通过对仪器分析数据的自动采集 可以减少手工录入错误 加快数据传送速度 从而节约了分析员的大量时间 在采集分析数据的同时 LIMS还能采集相关的环境数据 使对数据的分析更加全面 可靠 LIMS还可以进行仪器维护 允许为仪器创建定期的校正计划表 跟踪 记录校正情况 LIMS还可以统计仪器的使用率 最大限度地利用仪器 网络的发展使LIMS远程控制分析仪器成为可能 使实验室人员可以最大范围地使用自动化仪器 随时对样品分析全过程进行动态跟踪监控 四 报告管理LIMS具有强大的报告功能 LIMS带有一个专门用于报告设计的模块 可以让用户设计出符合自己要求的报告 报告的种类可以是常规的检验报告 分析报告 也可以是质量报告 管理报告等 这些报告不仅能简单地反映出系统内部数据 而且还能对数据进行加工处理 例如质量趋势报告 质量波动图等 LIMS可以设定在流程的某个环节自动打印报告 或以电子邮件和网页形式公布报告 及时 准确地反映质量情况 上述这些报告也都有一定的权限设定 只有经授权的人员才能阅读 打印 从而保证了数据的安全性 五 安全管理LIMS采用先进的网络技术 可用多层次 逻辑处理 数据存储分层的分离技术 确保数据完整 防范病毒的破坏和人为修改 通过给用户分配权限 只允许观察和操作某些指定的数据 在LIMS中每一种操作都应能够规定操作权限 如果没有给使用者某些权限 那么在他工作期间 相应的操作无法执行 实验室的测试结果在发送前要经过主管部门负责人的审核 合理的审核机制也是一个优秀LIMS系统所应该具有的 六 资源管理LIMS可以对人员 对照品 试剂等进行管理 并可对工作量进行统计 核算成本等 第六节电子签名 一 电子签名的概念二 电子签名的功能三 电子签名的模式四 电子签名和加密技术五 电子签名的应用 一 电子签名的概念FDA的定义 电子记录是指任何由计算机系统产生 修改 维护 归档 提取和分发的文字 图形 资料 声音 图像或其它以数字形式存在的信息集合 而电子签名则是指经计算机编辑的由某人使用 承认或授权 与其手写签名在法律上具有同等地位的任何符号或符号串 电子记录和电子签名适用于所有与人类健康相关的行业 中国电子签名法 给出的定义 电子签名是指数据电文中以电子形式所含 所附用于识别签名人身份并表明签名人认可其中内容的数据 通俗点说 电子签名就是通过密码技术对电子文档的电子形式的签名 并非是书面签名的数字图像化 它类似于手写签名或印章 也可以说它就是电子印章 可靠的电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力 数据电文 是指以电子 光学 磁或者类似手段生成 发送 接收或者储存的信息 数据电文应能够有形地表现所载内容 并可以随时调取查用的数据电文 视为符合法律 法规要求的书面形式 二 电子签名的功能1 身份认证2 保密3 完整性4 不可抵赖 三 电子签名的模式目前 美国使用的电子签名主要有三种模式 1 智慧卡式2 密码式3 生物测定式 四 电子签名和加密技术基于数字证书的电子认证技术已经可以成功解决用户身份识别 数据安全 数据完整和历史行为不可抵赖等安全问题 电子认证采用PKI 公开密钥基础设施 技术 为用户收发电子邮件 访问Web站点的访问 网上公文传递等应用简单提供了安全保障 利用基于数字证书的用户身份认证技术对日常管理工作中的文档数据进行数字签名 可以确保文档数据信息的完整性 确认文档数据的真实来源 防止出现抵赖行为或他人冒充伪造篡改数据 利用基于数字证书的数据加密技术对在网络上传输的机密文档进行加密 可以防止商业机密或其他敏感信息泄漏 电子签名技术的实现需要使用到非对称加密 RSA算法 和报文摘要 HASH算法 非对称加密 RSA算法 是指用户拥有两个密钥 一个是公钥 一个是私钥 公钥是公开的 任何人可以使用 私钥是保密的 只有用户自己可以使用 该用户可以用私钥加密信息 并传送给对方 对方可以用该用户的公钥将密文解开 对方应答时可以用该用户的公钥加密 该用户收到后可以用自己的私钥解密 公私钥是互相解密的 而且绝对不会有第三者能插进来 报文摘要利用HASH算法对任何要传输的信息进行运算 生成128位的报文摘要 而不同内容的信息一定会生成不同的报文摘要 因此报文摘要就成了电子信息的 指纹 电子签名的软件应该做到 1 实现电子盖章 文档加密 签名者身份验证等多项功能 这对于签名者的身份确认 文档内容的完整性和签名不可抵赖性等问题的解决具有重要作用 2 软件还应支持多人多次签名 每个签名可以在文档中的任意位置生成 完全由签名者控制 3 软件避免采用宏技术4 电子签名使用的数字证书可以存储在智能卡和USB电子令牌之类的硬件设备中 五 电子签名的应用 第七节LIMS的应用和未来 一 LIMS在各行业实验室的应用二 LIMS的未来1 专用分析方法2 宽带网络3 电子商务4 仪器远程控制 一 LIMS在各行业实验室的应用1 在实验室中使用LIMS技术 将会给实验室管理和工作质量控制产生较大的效益 是实验室必然的发展趋势 2 各类检测实验室的改造 提升离不开LIMS 它对于提高效率 降低成本 提高产品质量起到重要作用 3 目前 LIMS已经在化工行业 医疗 医药 环境保护 科研 教学 食品 酿酒 烟草 进出口检验检疫 冶金 矿山 机械制造 计量等行业实验室得到了广泛的应用 二 LIMS的未来LIMS应用发展非常迅速 从实验室管理的角度来看 随着实验室的需求的变化对该系统要不断的更新和完善 未来实验室的LIMS应当是高度专业化 智能化 系统化 自动化 空间跨距大以及多学科交叉的 LIMS的发展与应用要紧跟技术的最前沿 满足数字化时代的要求 目前比较热门的GIS 地理信息系统 宽带网络 电子商务等都可以引入到LIMS中来 仪器远程控制也是相当重要的一个方面 1 专用分析方法专用分析方法的多少 技术水平的高低 在某种程度上也代表了LIMS的专业技术水平 简单的数据处理是对仪器输出的数据作诸如四则运算之类的计算 运算的公式等都可由用户自行设定 任何一套LIMS都有这个功能 以谱库为基础的专业方法涉及质谱 核磁 红外等 目前有多家公司正积极开展这项工作 图象分析系统 图象处理涉及实验室所属专业知识 计算机图象处理理论等等 典型的交叉学科 难度比较大 专家系统运行一段时间后都会积累大量的数据 在此之上完善和升级 对实验室具有非同寻常的意义 地理信息系统 Geographicalinformationsystem GIS 是计算机科学 地理学 测量学 地图学等多门学科综合的技术 如土地信息系统 城市信息系统 规划信息系统 空间决策支持系统等 GIS是一组用来采集 存储 查询 变换和显示空间数据的工具集合 提供了处理地理数据的工具 这类数据库系统 其数据有空间次序 提供一个对数据进行操作的集合 以回答对数据库中空间实体的查询 地理信息系统是管理地理参考数据的系统 功能一般包括 数据管理 获取 存储和维护 分析 统计和空间建模 数据表达 地图和其他图象 GIS的根本特点是能从外部数字资料或直接扫描地图输入地图数据 直接扫描输入地图数据既耗时又难以奏效 目前许多数据来源