甲基化芯片与数据分析ppt课件.ppt_第1页
甲基化芯片与数据分析ppt课件.ppt_第2页
甲基化芯片与数据分析ppt课件.ppt_第3页
甲基化芯片与数据分析ppt课件.ppt_第4页
甲基化芯片与数据分析ppt课件.ppt_第5页
已阅读5页，还剩30页未读， 继续免费阅读

下载本文档

版权说明：本文档由用户提供并上传，收益归属内容提供方，若内容存在侵权，请进行举报或认领

文档简介

甲基化芯片数据分析应用 1 DNA甲基化 2 研究DNA甲基化的意义 3 DNA甲基化与肿瘤发生 4 高效液相色谱重亚硫酸盐测序甲基化特异性PCR焦磷酸测序甲基化DNA免疫共沉淀 常用的检测手段 5 Affymetrix甲基化芯片实验 HumanPromoter1 0RHumanTiling1 0R 2 0R 6 甲基化实验流程 7 利用甲醛对样品进行固定 使蛋白与染色质进行交联 样品交联 8 超声波打断染色质 染色质片段化 9 特异性MBD2抗体结合 免疫共沉淀 CHIP 10 对CHIP染色体进行进行纯化 并对DNA进行琼脂糖凝胶电泳检测CHIP效率 洗涤纯化 11 利用随机引物扩增CHIP和对照组DNA片段 PCR扩增 12 使用DNA末端标记试剂盒将PCR扩增产物打断成碎片DNA 并进行标记 片段化 标记 13 杂交洗脱扫描 14 甲基化芯片数据分析及应用 15 甲基化芯片数据类型 16 单通道甲基化芯片数据分析 17 数据解析 18 数据质控 信号分布 19 数据质控 MA图 20 散点图 21 GC含量及ATCG位置信号分布 22 标准化 23 标准化 24 标准化 25 双通道甲基化芯片数据分析 26 每个样本的信号值和Input信号值的比值 原始数据 27 AMS 绝对甲基化水平 染色体区域范围内探针所代表的甲基化水平RMS 相对甲基化水平 探针所代表的相同数量CpG的甲基化水平 RMS AMS计算 MEDME MEDME对smoothedlog Ratio进行处理 使用全甲基化数据构建出log Ratio对AMS的模型 再代入待测样本的log Ratio数据计算出RMS 28 探针filter完全相同值的探针Peakfilter没有peak的区域 FILTER 29 差异甲基化探针筛选 30 差异甲基化基因注释 31 全基因组展示 32 差异甲基化聚类 33 ThankYouForYourAttention 施沫全国统一服务电话 40030 40060公司电话 8011手机 Email
人人文库> 全部分类> 教育资料 > 课件下载

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明，都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等，如果需要附件，请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸，网页内容里面会有图纸预览，若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间，仅对用户上传内容的表现方式做保护处理，对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑，并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容，请与我们联系，我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论