真菌分类学习笔记

病原真菌的分类Classification of pathogenic fungi,Fundamental Concepts,真菌：有细胞壁的异养真核生物Mycoses真菌病：病原真菌引起的人或动物的感染Medical mycology医学真菌学：研究mycoses的学科,亲缘关系：植物动物细菌？,亲缘关系：动物植物细菌！,Qs,真菌和植物有什么区别？获取营养的方式不同真菌和人有什么区别？有胞壁 vs 无胞壁真菌和细菌有什么区别？细胞壁成分不同(葡聚糖/乳糖/chitin vs 肽聚糖)细胞膜成分不同(麦角固醇 vs 无固醇)能量转导方式不同(线粒体 vs 细胞膜)细胞质成分不同(蛋白/糖蛋白/细胞器 vs 蛋白)基因结构不同(有内含子 vs 无内含子)细胞核结构不同(多染色体/有核膜 vs 单染色体/无核膜)核糖体不同(40S+60S=80S vs 30S+50S=70S)Capsular polysaccharide (Cn vs Several agents of meningitis),三大分类体系,系统分类学临床分类实验室分类,Clinically relevant,Biologically relevant,系统分类学,主要基于有性型的繁殖方式其次考虑形态学、生理生化特性借用植物分类体系,有性型 vs. 无性型,无性型 anamorph/asexual有丝分裂临床相关有性型 teleomorph/sexual减数分裂传统分类学依据,When the sexual state of a fungus is identified, the genus and species of the teleomorph form takes priority and should be used thereafter. The asexual or anamorph name is subsidiary to the sexual state.,系统分类学,传统系统分类学的问题双重命名系统：有性型、无性型同种异名现象极普遍约100,000个种约400,000个命名,Examples of sexual vs. asexual state,Aspergillus nidulans 构巢曲霉Candida guilliermondii 季也蒙念珠菌Candida kefyr 乳酒念珠菌Candida krusei 克柔念珠菌Cryptococcus gattii 格特隐球菌,Emericella nidulans 构巢裸孢壳Pichia guilliermondii 季也蒙毕赤酵母Kluyveromyces marxianus产乳糖酶马克斯克鲁维酵母Issatchenkia orientalis东方伊萨酵母Filobasidiella bacillispora杆孢线黑粉菌,命名系统演变,旧命名系统：the International Code of Botanical Nomenclature 2007新命名系统：the International Code of Nomenclature for Algae, Fungi, and Plants 2011主要变化：废除双命名系统，废除拉丁文拼写，重视基因亲缘性One fungus, one name,新命名系统一些悬而未决的问题,同种异名的取舍：One fungus, which name?新菌种命名规范如何命名只有DNA序列的环境菌株以往熟知种属分类变更带来的混乱 e.g.毛霉目毛霉亚门新分类系统的推广,在这个新旧交替的动荡时代,三大分类体系,系统分类学临床分类实验室分类,Clinically relevant,Biologically relevant,感染部位/致病性/流行性分类,非致病 Mushroom, Free living浅表感染 皮肤癣菌系统感染/皮下感染原发性致病 primary pathogenic球孢子菌，组织胞浆菌，皮炎芽生菌，孢子丝菌特点：地方流行性 endemic mycoses， 双相性条件性致病 opportunistically pathogenic多为全球性分布少数为地方流行性： 马尔尼菲青霉Any fungus capable of growing at 37 is a potential pathogen in a debilitated or immunocompromised host.,按无性型镜下形态分类,酵母yeasts芽生分生孢子 blastoconidia 是最常见的分裂形式关节孢子 arthroconidia 在Trichosporon中可见假菌丝pseudophyphae 为blastoconidia成串排列形成的链样结构假菌丝团pseudomycelium (a mass of pseudohyphae),丝状真菌(霉菌)molds菌丝 hyphae, 菌丝团 mycelium无分隔/少分隔菌丝：Mucoromycotina有分隔菌丝：除Mucormycotina之外的丝状真菌,双相真菌dimorphism Mold Yeast (或其他形态)一般环境中为菌丝相，感染组织中为酵母相Coccidioides: Moldspherules(小球体)Melanized molds :moldsmuriform cells,Dimorphism,双相生长是真菌适应宿主环境的表现所有原发性致病真菌都是双相真菌组织胞浆菌球孢子菌孢子丝菌皮炎芽生菌双相真菌不一定是原发致病菌马尔尼菲青霉（条件致病）,Summary,Take Home Massage,真菌乃人类之近亲Its easy to kill the fungi. The difficult thing is, to kill the fungi, and kee