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文档简介

1 首先将 JPG 格式转换为 TIF 格式 根据自己的情况选择软件 2 将 TIF 格式图片导入 Quantity One 用打开命令即可 3 点击 Lane 命令 出现下拉菜单 点击 Frame Lanes 如果命令键为灰色 请下载补丁 安装 在出现的对框中填入泳道数 点击 OK 进行调整 使红色线条尽量在泳道的中间部位 整体拉动 lane 框架 还可以进行单独的调整 在 lane 命令下的 single lane adjust lane 4 调整好 lane 后 点击 band 下的 detect bands 出现下图 在软件右方位置 有如下对话框 可根据需要设置红色框区域的属性 包括密度 宽度等 调整好了 再根据实际情况 手动添加删除调动条带 采用褐色框的命令 需要耐心 5 调整好后 如下图 仅仅是假设图 点击 match 下的 match 命令 会出现下图 根据实际情况 采用 match 与 unmatch 调节自己的条带的迁移率的匹配度 这一步最关键 最需要耐心 匹配有问题 就用 unmatch 取消再进行 match 命令 心静就行 5 match 完成后 假如上图 即可导出一系列 reports Repots 很多 但计算多样性指数的为 lane report 如下图选择一些指标 点击 report 依次点击红色框命令 保存 txt 到指定文件夹下 将 txt 文件里的数据复制粘贴到 excel 中 如下图 将第一条泳道的 average int 进行求和 上图 A 列 用 average int 值比上 A 列计算的求和 得出 B 列数值 对 B 列数值求自然对数相反数值 得到 C 列 再将 B 与 C 列数值相乘 得到 D 列数值 最后将每一条泳道的 D 列值求和 即得到该条泳道的多样指数 通常用 H 表示 丰富度 E 的计算很简单 即是数每条泳道有多少条带 如上表中 泳道一就有 13 条带 数 所以丰度度为

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