canreg的使用

肿瘤登记软件CanRge4使用介绍,全国肿瘤登记中心 张思维 2010年03月 重庆,主要内容,CanReg4的获得、授权使用和安装CanReg4主要模块使用介绍,CanReg概述,CanReg是由国际肿瘤研究中心描述流行病学室的编写开发的并推荐使用肿瘤登记软件，目前已经是第5版2002年全国肿瘤登记中心与IARC合作，将CanReg4汉化，以适用于中国的肿瘤登记工作,CanReg4特点,CanReg4用于基于人群肿瘤登记的软件全世界已经有75个国家超过150个肿瘤登记处在使用CanReg4软件我国目前使用CanReg4的登记处约50余个,全球使用CanReg的肿瘤登记处分布,CanReg特点,CanReg4 使用国际疾病分类肿瘤学专辑第三版（ICD-O-3）和ICD-10编码CanReg4内置于数据录入中的检查程序（Check），可以很方便的检查出不合格的、罕见的，以及重卡和多原发肿瘤病例记录频数分析、导出/导出、发病率表等模块简单易用CanReg4目前已有：英语、法语、西班牙语、意大利语，阿拉伯语、泰国语和简体中文版。,CanReg4主要模块,数据录入数据分析数据管理,数据录入,浏览/编辑记录字典导入,数据分析,频数分布（按年）发病率表导出/报告频数/表格Epi-Info 6,数据管理,查看工作文件备份名字/性别检查 （中文版不适用）重卡搜寻用户/密码选项,CanReg4的获得、授权使用和安装,软件的获得与使用授权,CanReg4可以免费下载，IACR不定期的对软件进行更新，可从以下网址获得最新的版本:.fr/canreg4.htm使用CanReg4必须得到授权，需要有由IACR/IARC统一定义的、带有三位字符编码的系统备份文件，且每个登记处使用唯一的编码,软件的获得与使用授权,肿瘤登记处为国际肿瘤登记协会（IACR）成为会员,才可以获得免费CanReg4使用的授权全国肿瘤登记中心负责定义中国肿瘤登记处三位编码，并授权使用CanReg4全国肿瘤登记中心以团体会员的形式，加入了IACR，因此各登记处可以得到授权使用CanReg4,在桌面建立CanReg4启动快捷方式,在“我的电脑”或“资源管理器”中找到主程序：.CR4ShareCanReg4CR4-ExecCR4-Init.exe点击按右键，选择“创建快捷方式”；将“快捷方式”改名为 “CanReg4” ，并拖到桌面按右键，进入属性：将“起始位置”改为：CR4ShareCanReg4 按确定。现在你可以点击这个图标进入程序。,恢复系统备份,授权备份文件一共有三个：Cr4-XXX.db (字典备份)Cr4-XXX.mb0 (主要数据库,若数据量大，则会有多个文件)Cr4-XXX.ob (登记处定义等文件)这里的“XXX”为三位肿瘤登记处编，各登记处使用的编码会不同,点击“从备份中恢复”按钮,键入三位肿瘤登记处编码“XXX”选择备份文件所在的位置：CanReg4的默认文件夹为：CR4ShareCanReg4CR4-Back或软盘，或其它驱动器数据库将在一段时间后建立,CanReg4的数据录入,CanReg4启动,CanReg4起动屏幕中有两个选项:使用现有的系统从备份中恢复(?)这个按钮可以查看帮助,CanReg4启动,使用现有的系统如果CanReg4登记处定义文件已经安装在电脑中，则点击这个选项转到 登录/密码面板。从备份中恢复用于CanReg4程序初次安装，可加载详细的肿瘤登记处定义、字典代码和数据。这个选项也可以从备份文件中恢复数据，以便接续以前的工作。,进入CanReg4,输入用户名： andy输入密码： cooke,数据录入模块,浏览/编辑记录字典导入,浏览与编辑记录,CanReg4 的这个页面用于浏览和编辑数据库记录浏览记录：可利用筛选、排序和范围等工具，对已有记录进行查看。编辑记录：可建立新记录，或对原有记录进行编辑、修改。,浏览记录,浏览记录,可使用如下工具找到你所需要的记录筛选工具快速筛选工具排序工具排序+范围工具快速导航按钮,使用筛选工具,性别=1（男性）年龄=60性别=2 和年龄=60Sex=2 and Age 值 - 键入 60 完成,排序,CanReg4一共有7条索引： Registry No. : 登记号 / Update date : 更新日期 / Multiple Primary : 多原发肿瘤 / 发病日期 / Incidence date : 发病日期 / ICD-10 : ICD-10 / 性别 / Names : 姓名 / Pinyin : 姓名拼音 /,使用排序/范围,先将记录根据选定索引进行排序然后为已排序变量指定开始和结束范围例如: 按发病日期排序, 仅显示1991年和1992的记录: 索引 =发病日期（Incidence Date） 开始 =1991 结束 =19929999,使用导航按钮,可快速移动记录指针,下页,上页,第一个记录,最后一个记录,显示变量,点击变量“单选按钮”可以选择显示如下变量: 全部变量(All variables) 指定(强制性)变量(Mandatory variables)登记处定义为必须填写的项目 关键变量(Key variables)姓名,年龄,发病日期,肿瘤部位等不可空缺的项目,编辑记录,使用右侧3个按钮可以编辑记录:建立新记录: 使用这个选项可建立一个新的空白记录表，当保存这个记录的时候，会自动赋予一个登记号编辑表中记录: 这个选项可编辑在数据表中的被蓝色条标记的当前记录编辑记录号: 在按这个按钮之前，先填写你想编辑的记录的登记号。如果记录已经存在，将打开这个记录进行编辑；如果不存在，则打开一个空白记录且将登记号赋予这个空白记录使用这个选项可为你的第一条记录设置登记号。,刷新表格,如果数据库中的记录数改变了，使用这个按钮可以刷新显示的列表,录入、编辑记录,编辑页面组成,“系统变量”面板,数据录入表,“多原发肿瘤”面板,数据录入表,数据录入表由4部分组成：病人信息肿瘤信息医院信息随访信息,肿瘤病例报告卡,病人信息,肿瘤信息,医院信息、随访信息,变量名称,对于每个变量，有三个变量名：中文变量名 Long Variable names短的变量名 Short Variable names英文变量名 English Variable names例如：出生日期 Birthda Birth Date,病人信息变量11个：,肿瘤信息变量11个,the International Classification of Childhood Cancer (ICCC). 国际儿童肿瘤分类,医院信息变量4个,随访信息变量6个,新病例控制变量8个,数据库共计变量40个,新病例控制变量8个,病人信息变量11个,肿瘤信息变量11个,医院信息变量4个,随访信息变量6个,数据录入,在数据录入过程中使用下列方法移动光标: - 向上或向下键可移动到下一个或上一个变量; - 回车键可到下个变量; - PgDown, PgUp 键可移动到下一个,上一个组; - Home, End 键可移动到第一个, 最后一个变量。 - 键入 “?” 可看见字典弹出。使用鼠标，可以直接点击想编辑的变量，并可在弹出的字典框中去选择正确的编码。,当数据录入或修改之后，你必须完成以下步骤：,录入检查 当数据录入完成后执行各种的一致性检查。重卡检查 搜寻任何的可能属于同一个病例的记录。记录状态 改变记录状态是确认、挂起、或删除。保存/退出如果更改过记录内容，将出现一个红色的星号在”保存”按钮旁边 。 如果不保存，这些改动将遗失。,“系统变量”面板,检查状态：是否做过，结果是什么。 重卡检查：是否做过，结果是什么。 记录状态：在成功的完成“检查” 和 “重卡搜寻” 程序以前，所有新的记录都被设置成 “未确定的”。只有被确认的病例才可用于分析。 保存/退出：保存或不保存退出。 更新日期：方框显示的是这条记录最后的编辑日期,检查内容,编辑检查地方检查（Local Checks）各登记处自定义项目的检查强制性变量检查（Mandatory Variables）登记处规定必须填写的变量检查名和性别（中文版不适用）交叉检查（Cross-Checks）,检查项目,发病日期检查出生日期检查年龄检查死亡日期检查性别检查部位检查形态学检查行为检查分期检查诊断级别检查,发病日期/出生日期年龄 = 发病 - 出生发病日期/死亡日期部位/形态形态/行为性别/部位性别/形态年龄/部位年龄/形态年龄/部位/形态部位/行为,重卡检查,搜寻可能属于同一个病例的记录，既查重在查重过程中使用如下有关的变量：日期出生、居住地址、身份证号码、姓名、拼音等，每个变量的权重不同如果没有发现匹配的记录,系统将会出一个提示信息。,IARC有关多原发肿瘤的定义,识别存在着两个或两个以上的原发肿瘤不取决于时间。一个原发肿瘤是一个起源于一个原发部位或组织的肿瘤。因此既不是扩散也不是复发和转移。某一发生在一个或多个器官或组织（由ICD-O解剖学所限定的）肿瘤，除组织学不同外应认识是单一肿瘤。,IARC多部位原发肿瘤的确定标准,“多原发肿瘤”面板,左边的两个数字表示的是多原发肿瘤的主要序号和总数例如：2/3 这是指这位病人的三个多原发肿瘤，当前的是第二个；0/1 意思是没有多原发肿瘤 “同一病人新的肿瘤”按钮(仅超级用户)如果确定这位病人除了当前这个肿瘤之外，确有另外的一个肿瘤，点击这个按钮可建立一个新的记录表，并且这个病人的基本信息已经复制在新的记录表中,如果是多原发肿瘤记录,以下内容可见,多原发肿瘤码“AAA”表示是同一病人，“AAB”表示另一病人 “查看其他肿瘤”按钮依照顺序，显示这个病人的全部多原发肿瘤的详细资料“复制随访变量”如果改变了 “最后的接触日期 ” 或 “死亡原因” 等这样的变量，则这个选项将复制新的改变的信息到其它的多原发肿瘤记录中,字典,CanReg4允许登记处编辑字典内容，并可添加或删除代码；编辑字典代码注意事项及步骤：确定没有用户在使用输出字典到文本文件根据需要对文本文件进行编辑输入文本文件到字典,CanReg4中文版共有字典18个,Record status记录状态Check status检查状态Person search人工搜索Topography解剖学部位Morphology形态Behaviour行为Sex 性别Basis Diagnosis 诊断依据Hospital医院,10. Grade 分级11. Tribe 民族12. Marital status婚姻状况13. Status最后接触状态14. Cause Death死亡原因15. Address地址代码16. Doctors医师17. Place of Death死亡地点18. Occupation职业,新病例控制部分字典3个,Record status记录状态Check status 检查状态Person search人工搜索,病人信息部分字典5个,Sex 性别Tribe 民族Marital status婚姻状况Occupation职业Address 地址代码,肿瘤信息部分字典5个,Topography解剖学部位Morphology形态学Behavior行为Grade 分级Basis Diagnosis诊断依据,医院信息部分字典2个,Hospital 医院Doctors 医师,随访信息部分字典3个,Status 最后接触状态Cause Death死亡原因Place of Death死亡地点,导入,外部数据文件中的记录可通过导入添加到 CanReg4 数据库中外部数据文件必须是文本格式，并以下列格式分隔字段：Tab 键、逗号 或竖线 |数据文件每栏（列）的顶端最好有变量名，并且与CanReg4定义的变量名一致,导入步骤,主要有以下4步：选择文件识别变量选择不同选项 导入文件,导入时的不同选项,有差异时最大行数CanReg4数据,有差异时,差异是指当导入时发现在同一个数据库中相同的登记号的记录有差异当一些数据有差异时，选择: 拒绝 ：数据将不会被输入 更新 ：所有新的数据将会覆盖数据库记录 重写 ：所有变量将会被覆盖, 包括空项,最大行数 / 仅测试,为了能成功导入数据，可先进行导入测试，“最大行数”可用于指定先导入的记录数当“仅测试”被勾定时，数据实际上没有被导入到数据库中；只生成一个报告去展现将要发生的导入结果。（需要真正导入时，要把这个勾去掉）,CanReg 数据,运行检查如果导入的数据不是由CanReg4建立的，或者是一个未确定的病例, 则必须运行检查程序如果新导入病例已经通过检查, 则可去除这个选项的勾定，检查程序将不会运行运行重卡搜索在导入 CanReg4 数据时，即使已经做过重卡搜索，查重仍需要运行如果这个选择项不被勾定，则查重不会运行有疑问的名字（中文版不适用）,数据分析,数据分析模块,频数分布(按年)发病率表导出/报 告频数/表 格Epi-Info 6,频数分布(按年),建立文本文件，显示按年各选定变量的病例频数分布建立的文本文件自动保存在下列文件夹中：CR4SHARECANREG4CR4-WORK 使用“数据管理”中的“查看工作文件”选项，可查看文件,频数分布(按年),默认产生以下3个文件： - 性别 / 记录状况 - 月 - ICD-10 组其他变量的频数分布，可从“选择变量”的滚动条中选择。对具有复合字典的变量，可选择是对其分类还是对全部字典编码进行病例计数,发病率表,计算发病率，需要知道人口数（分母）。因此需要建立“人口数据集” （P.D.S.)“人口数据集” 由以下部分组成：人口数据，按性别和年龄分组数据来源 ( 例如：人口普查或人口估算)该人口数据所对应的时间“筛选器”或选择标准，选择对应于该人口的发病记录(分子）,发病率表,“人口数据集”P.D.S.有两个选项：使用一个已经存在的人口数据集 P.D.S. 建立一个新的人口数据集 P.D.S.计算发病率时，须定义一个计算发病率的时间段“年龄标化率”用于比较不同地区人群的发病率，通常使用“世界标准人口”，也可改为“中国标准人口”（如2000年普查人口）等,导出/报告,导出全部或部分CanReg4数据库记录到一个外部文件有两个主要的作用：将数据文件转入到另一个程序如“EXCEL”或 “ACCESS” ，以便做进一步分析。产生一个报告或一个病例清单，以便能在“WORD”等文件中浏览并打印。,导出/报告,导出/报告的步骤：选择想导出的记录：可使用筛选、排序/范围工具选择想导出的变量：选择标题或变量名：标题、变量名选项选择需要的文件格式：导出文件格式导出,导出/报告,导出文件的格式：一般都生成文本文件，默认扩展名为“.TXT”，若指定为“逗号”的文件其扩展名为：“.CSV”“Tab键” - 将每个变量以TAB符（制表符）分割“逗号” - “逗号分割变量”将每个变量用引号括起来，后用逗号分开“固定的宽度 ，无空格” - 根据变量的最大宽度，在其结尾填补空格“固定的宽度 +1空格” - 与上同, 但各栏间有一个空格，更易于浏览“固定的宽度 +2空格” - 如上, 但各栏间有两个空格“Epi Info 6” - 可将文件存成扩展名为“.REC”的Epi-Info 6的文件格式,频数/表格 - 频数,从 Excel（或一个文本文件）中剪切一列数据，然后粘贴到A栏点击“频数A”产生这列数据的频数分布选择“从最多的开始”把从原先以字母排序的显示转为以频数由多到少排序用相同的方法可对B栏也产生频数分布,频数/表格 - 表格,剪切并粘贴数据到A栏把数据库中相同的记录的第二栏数据粘贴到B栏点击“表格 AxB” 产生以A为行、B为列的交叉表格点击“表格 BxA” 产生以B为行、A为列的交叉表格点击“短标题”按钮截取列的标题,频数/表格 - 一般情况,如果列的第一行包含了标量名称，选择“变量名在第一行”可将结果剪切并粘贴回Excel对数据进行作图点击“清除” 按钮清除所有格子中的数据通过调整视窗的大小改变格子的大小,Epi-info 6,略,CanReg4数据管理,数据管理模块,查看工作文件备份名字/性别检查 （中文版不适用）重卡搜寻用户/密码选项,查看工作文件,工作文件存放的默认文件夹：CR4SHARECANREG4CR4-WORK可以打开的最大文件个数：10,备份,备份程序将压缩并加密所有的数据, 且复制字典、人口数据以及登记处CanReg4系统定义等。可复制备份到软盘、光盘、移动磁盘等计算机以外的地方。默认的备份文件存放的文件夹：CR4SHARECANREG4CR4-BACK,备份文件,备份文件至少有三个：Cr4-xxx.db (字典等)Cr4-xxx.mb0, Cr4-xxx.mb1. (记录数据库)Cr4-xxx.ob(登记处定义等)以上数据文件全部为加密后的文件。注：“xxx”为登记处编码,重卡搜寻,本选项可以查找数据库记录中可能的重卡和多原发肿瘤卡。用于查重的变量及所占权重： 姓名