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DNA甲基化的特征 ChenYan20160829 一 DNA甲基化与羟甲基化 1 胞嘧啶2 第五个C原子上3 甲基或羟甲基的修饰 二 DNA甲基化分布 DNA甲基化发生在CpGdinucleotides低频率 在人基因组中的频率为1 而含有42 GC 理论值上为 0 21 0 21 4 41 2 CpGislandI 不被甲基化II 长度为500 2000bpIII 常分布在看家基因和特异性基因启动子区域 二 DNA甲基化的分布 1基因内甲基化抑制转录延伸 但与基因表达为正相关 2CpGisland不被甲基化可能与使得基因维持可以转录状态有关 二 DNA甲基化分布的特殊情况 1 在非CpG环境下的低水平甲基化 功能未知 EScells oocytes andbrain 不发生DNA复制 2 启动子中CpGisland发生甲基化imprintedandpluripotency relatedgenes 长期转录沉默 三 DNA羟甲基化的分布 cell EScells 0 03 Purkinjeneurons 0 59 Gene CpGtranscriptionstartsites TSS cis regulatoryelements 四 DNMTs 功能 四 DNMTs 结构 五 TET家族蛋白 功能 5mC5hmC 五 TET蛋白 结构 六 ReprogrammingofDNAmethylationduringpreimplantationdevelopment 第一次卵裂前 几次卵裂后 不发生ReprogrammingofDNAmethylation 1 imprintedloci2 repeatsintracisternalAparticles IAPs L1Md Aelements LTRERV1elements3 CpGislands 七 ReprogrammingofDNAmethylationingametes Demethylation imprintingloci genebodies intergenicregions mobileelements CpGislandpromoters 八 Globaldemethylationinerythropoiesis Purkinj
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