利用不同的方法筛选和鉴定转化子.docx

利用不同的方法筛选和鉴定转化子摘 要: 通过使用不同的方法，从大肠杆菌中筛选和鉴定出转入了GFP基因并表达出GFP的菌株。实验先用蓝白斑筛选得到含有载体的转化子，之后用菌落PCR对其中的重组子进行进一步鉴定，最终通过对表达的产物的检测确证是否能表达出GFP。实验结果表明挑选出来的菌株并没有表达出GFP，需要挑选其他菌落继续实验。关键词: 蓝白斑筛选、菌落PCR、GFP、蛋白质检测前 言我们采用的是目前应用最广泛、技术最成熟、同时也是最经典的微生物基因重组，作为载体的质粒，我们需要选择或者构建带有多克隆位点和带有抗性基因的质粒，前者有利于基因顺利导入到受体细胞，后者方便我们对转化产物进行筛选；对于受体细胞，我们所选择使用的大肠杆菌，具有遗传背景清楚，结构简单，表达效率高，容易获取等优点，已经建立起一套完善成熟的表达系统，是目前转基因领域最受欢迎、使用最普遍的系统之一。GFP自从发现以来，已经获得了广泛充足的应用，是生物领域的重要材料绿。绿色荧光蛋白本身无毒，且不需要其他辅酶或者反应底物，在紫外或者蓝光激发下就可以自主发光，而且有较好的稳定性，当其基因与其他蛋白质表达基因相融合时，该蛋白质既能保持原有活性，发光能力也不受影响，这意味着我们可以将GFP与我们想要了解的蛋白质相接合在一起，将GFP作为荧光标签，对蛋白质的位置、运动、活性以及相互作用等机理进行追踪和观察，因为这种特性，绿色荧光蛋白具有其他报告蛋白无法比拟的优点，已经在生物研究中获得广泛的应用。我们已经通过一系列的实验操作，获取GFP基因，用PCR技术将其扩增并连接到载体质粒pMD19-T Vector上，用CaCl2法将其转入到大肠杆菌中，经过本次实验的筛选和鉴定，构成了完整的转基因操作流程，将我们的课堂学习和实际操作结合起来，从而对转基因技术有一个最直接的认识。尽管在当下中国，转基因技术备受争议，但是每一名生物专业的学生，都应学习了解国际科学社会在转基因领域上所取得的巨大成就，并看到其广泛的应用前景和巨大的市场潜力，同时将所学习到的关于转基因知识科普出去，让每一个公民都能科学、正确地认识转基因，理性、客观地参与到关于转基因的有益讨论中去，推进我国生物科学技术的发展。一、材料、试剂和器具1.材料转化菌液：经过转化操作的E. coli DH5菌株(R-，M-，Amp-或者含pMD19-T Vector)2.试剂 含氨苄青霉素(Amp, 100mg/L)的LB固体培养基、LB液体培养基、X-gal（200mg/ml）储存液、IPTG储存液（20mg/ml）、10PCR buffer 、rTaq 酶、dNTP mixtures（dATP，dTTP，dGTP，dCTP）、无菌蒸馏水、1.5% 琼脂糖凝胶、矿物油、DNA maker、110 Loading Buffer引物溶液(P1、P2各10M)P1:GFP-F: 5-TAGTCGACTATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG-3 (Tm=65.5) (Sal I)P2:GFP-R: 5-GCGTCTAGATTACTTGTACAGCTCGTCCATG-3 (Tm=61.5) (Xba I)3.器具超净工作台、涂布器、无菌牙签、PCR管、移液枪、移液管、离心机、PCR仪、天秤；灭菌锅；琼脂凝胶电泳系统；紫外照射摄像系统；恒温振荡培养箱；蓝光手电筒二、实验步骤1.蓝白斑筛选1.1 筛选培养基的准备在制备好的含100 mg/L Amp的LB平板表面中央位置分别加入40l X-gal储存液和4l IPTG储存液，用无菌玻棒将溶液涂布均匀，置于超净工作台上，使培养基表面的液体完全被吸收。1.2 菌落筛选培养取500 l复壮后的转化菌液涂布于筛选培养基表面，待菌液完全被培养基吸收后，用封口膜封住培养皿边缘，倒置培养皿，37培养过夜。1.3结果观察观察平板，是否有蓝色和白色菌落，分别计数，白色菌落即为重组子。2.菌落PCR2.1 挑菌选择大小合适，最好周围有蓝斑的白色菌落5个，编好号码之后，小心地刮取一半，分别涂抹于对应的1.5mLPCR管底部。2.2 配制PCR反应体系先按下列试剂于PCR管中配制50L的PCR反应体系总液10 PCR buffer 5LdNTP mixture 4L前向引物 (P1) 2L反向引物 (P2) 2LrTaq酶 0.5L灭菌蒸馏水 36.5L所有试剂按量仔细添加后，轻轻混匀，稍离心后即可，然后取10L分别分装到涂抹有菌落的PCR管中，稍离心后，加入10L矿物油，2.3 PCR反应PCR仪设置参数如下：94 2 min94 30sec61 30sec 40 cycles72 45sec72 5 min2.4 琼脂糖凝胶电泳检测反应结束后，取10L的PCR产品，加入1L的110 Loading Buffer，混匀后点样，121V电泳15min，紫外照射摄像观察结果，在750bp-1000bp区间有条带产生即为阳性结果。3. 产物表达观察选择在凝胶电泳中为阳性结果的菌落，将其在蓝白筛选培养基上的剩余部分刮取到LB液体培养基中，37，180 r/min恒温振荡培养过夜，在蓝光照射下观察，培养液有绿色荧光的即为阳性结果。三、实验注意事项1、注意无菌操作，接菌的时候应该在超净工作台中进行，培养基需要高压蒸汽灭菌后方可使用，防止杂菌污染；2、X-gal和IPEG应分别涂抹于LB固体培养基上，由于IPEG存储于有机溶液中，挥发快，应当快速操作，保证分布均匀；3、配制PCR反应体系时，rTaq酶应该最后加入，减少引物二聚体的形成；4、加入矿物油是为了防止PCR反应液的挥发，点样时只需抽取下层的PCR反应液，不要吸取到油层。四、结果和分析1、蓝白斑筛选结果图一 蓝白斑抗性筛选结果 结果：如图一所示，培养基上有21个白色菌落，2个蓝色菌落结果分析：使用的E. coli DH5菌株（Amp-）在含有氨苄青霉素（Amp）的培养基上无法生长，而我们使用的载体pMD19-T Vector 上含有氨苄青霉素抗性（Ampr）基因，当载体成功导入到DH5 菌株上形成转化子后，DH5就能在培养基上正常生长，即长出的菌落的就是含有载体的转化子。pMD19-T Vector上有具备一个多克隆位点的lacZ基因，能与大肠杆菌发生-互补，在IPEG诱导下，产生-半乳糖苷酶，将X-gal分解成蓝色物质，在培养基上生成蓝色菌落；而当我们的GFP基因插入到多克隆位点上时，lacZ基因会被破坏，无法形成-互补，在培养基上生成正常的白色菌落；即白色菌落就是带有GFP基因的重组子。X-gal涂抹不均、两个载体连接、lacZ基因的丢失、破坏或者突变都可能导致假阳性结果的产生，因而需要更进一步的鉴定。从中挑选5个白色菌落进行标号，进行菌落PCR。2、菌落PCR结果图二 菌落PCR的琼脂糖凝胶电泳结果 结果：1号泳道在750bp-1000bp之前有清晰的条带，2-4号泳道均无条带产生，但有较严重的拖尾。结果分析：标号1-5的泳道是我的PCR结果，根据资料，GFP基因大致在800-1000个碱基对左右，可以看到，1号泳道在750bp-1000bp之前出现清晰的条带，同其他组大多数结果一致，说明确实含有GFP基因，对应的1号菌落确实是含有GFP基因的重组子。其他泳道没有出现条带，说明其对应菌落在蓝白斑筛选上是假阳性，但是同时不排除是PCR反应体系的配制或者操作等的失误导致没有条带出现，因此除了1号菌落外，再任意挑选一个菌落进行摇瓶培养。拖尾说明存在杂质或者PCR体系存在问题导致DNA降解或者非特异性配对。3、产物表达的观察图三 GFP表达产物观察结果：培养基在蓝光照射下无绿色荧光。结果分析： 因为我们使用的TA克隆是不定向克隆，GFP基因可能反向插入，或者基因、启动子被破坏等等其他种种因素导致基因无法正常表达，因此我们需要对最终产物的进行检测，验证基因确实正常、完整地转入到受体细胞，并能正常表达。导入的GFP基因表达产物是绿色荧光蛋白（Green Fluorescent Protein )，在紫外光（395nm）或者蓝光（470nm）的激发下，能产生绿色的荧光（509nm）。两个摇瓶在蓝光照射下均无绿色荧光产生，说明1号菌落中GFP基因是反向插入，或者其他因素导致基因无法正常表达。四、讨论/小结由于实验条件、时间等各方面的限制，我并没有从转化子中筛选到能表达绿色荧光蛋白的大肠杆菌，最大可能是菌落PCR得到的结果是一个反向插入的基因，这是一个随机事，并不意味着实验的失败，在实际应用中，我们通常是需要更多的重复实验操作来验证结果。由于我们的目的产物GFP有明显可见的特征，