RNA的生物合成动物生化.ppt

第十章RNA的生物合成,第一节转录的概念和转录模板,转录,一、转录(transcription)以DNA为模板，在RNA聚合酶（RNApolymerase）的作用下合成mRNA，将遗传信息从DNA分子上转移到mRNA分子上，这一过程称为转录。生物体以DNA为模板合成RNA的过程。,参与转录的物质,原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol)其他蛋白质因子,5GCAGTACATGTC3,3cgtgatgtacag5,5GCAGUACAUGUC3,NAlaValHisValC,编码链(+),模板链(-),mRNA,蛋白质,转录,翻译,二、转录模板,不对称转录(asymmetrictranscription),在DNA分子双链上某一区段，一股链用作模板指引转录，另一股链不转录；模板链并非永远在同一条单链上。,53,35,模板链,编码链,编码链,模板链,结构基因,核心酶(coreenzyme),全酶(holoenzyme),第二节原核生物基因的转录,一、原核生物的RNA聚合酶,RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合,酶的连接和装配,亚基,分子量,每分子酶中所含数目,功能,365122,1506181,与底物NTP结合，延长多核苷酸链,1556131,结合DNA模板,702631,辨认起始位点,原核生物的RNA聚合酶,利福平作用部位,100001,未知,原核生物一个转录区段可视为一个转录单位，称为操纵子(operon)，包括若干个结构基因及其上游(upstream)的调控序列。,模板DNA上结合RNA聚合酶的部位，称为启动子(promoter)。,二、原核生物启动子,开始转录,TTGACAAACTGT,-35区,(Pribnowbox),TATAATPuATATTAPy,-10区,RNA-pol辨认位点(recognitionsite),1）转录起始,转录起始需解决两个问题：RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。DNA双链解开，使其中的一条链作为转录的模板。,三、原核生物的转录过程,2.DNA双链解开,1.RNA聚合酶全酶(2)与模板结合,3.在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应，形成转录起始复合物,RNApol-DNA-pppGpN-OH3,转录起始复合物:,5-pppG-OH+NTP5-pppGpN-OH3+ppi,转录起始过程:,2）转录延长,1.亚基脱落，RNApol聚合酶核心酶变构，与模板结合松弛，沿着DNA模板前移；,2.在核心酶作用下，NTP不断聚合，RNA链不断延长。,(NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPi,“转录泡（transcriptionbubble）”,羽毛状现象,在电子显微镜下观察转录现象，可以看到同一DNA模板上，有长短不一的新合成的RNA链散开成羽毛状图形，这说明在同一DNA基因上可以有很多的RNA聚合酶在同时催化转录，生成相应的RNA链。,5,3,DNA,原核生物转录过程中的羽毛状现象,核糖体,RNA,RNA聚合酶,依赖Rho()因子的转录终止(缺少polyU)非依赖Rho因子的转录终止,3）转录终止,指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进，转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。,分类,1.非依赖Rho因子的转录终止,DNA模板上靠近终止处，有些特殊的碱基序列，转录出RNA后，RNA产物形成特殊的结构来终止转录。,茎环(stem-loop)/发夹(hairpin)结构,茎环结构使转录终止的机理,使RNA聚合酶变构，转录停顿；使转录复合物趋于解离，RNA产物释放。,ATP,2.依赖Rho因子的转录终止,四、原核生物RNA的转录后加工,1、mRNA原核生物的mRNA转录后一般不需要加工，转录的同时即进行翻译（半寿期短）。,2.rRNA前体的加工,甲基化作用专一核酸内切酶,30S前体,17S,tRNA,25S,专一核酸外切酶,16SrRNA,tRNA,23SrRNA,5SrRNA,专一核酸外切酶,3、tRNA前体的加工：原核生物的tRNA转录后需要加工。包括：（1）由核酸内切酶切除前体上3和5端上多余的核苷酸；（2）由核酸外切酶逐个在3切去附加序列，进行修剪。（3）3端添加CCAOH序列，由核苷酰转移酶催化。（4）核苷的一些特定的碱基和戊糖进行修饰。,一、真核生物的RNA聚合酶,第三节真核生物基因的转录,结构基因,-GCGC-CAAT-TATA,真核生物启动子保守序列,二、真核生物基因的启动子,三、真核生物的转录过程,1）转录起始,真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化，转录起始时，RNA-pol不直接结合模板，其起始过程比原核生物复杂。,转录起始点,TATA盒,CAAT盒,GC盒,增强子,顺式作用元件(cis-actingelement),1.转录起始前的上游区段,AATAAA,切离加尾,转录终止点,修饰点,外显子,翻译起始点,内含子,OCT-1,OCT-1：ATTTGCAT八聚体,2.转录因子,能直接、间接辨认和结合转录上游区段DNA的蛋白质，现已发现数百种，统称为反式作用因子(trans-actingfactors)。,反式作用因子中，直接或间接结合RNA聚合酶的，则称为转录因子(transcriptionalfactors,TF)。,参与RNA-pol转录的TF,3.转录起始前复合物(pre-initiationcomplex,PIC),真核生物RNA-pol不与DNA分子直接结合，而需依靠众多的转录因子才与DNA分子结合。,TFF,A,B,由RNA-Pol催化转录的PIC,H,E,TBP,TAF,TFD-A-B-DNA复合物,TATA,A,B,TBP,TAF,TATA,H,E,PIC组装完成，TFH使CTD磷酸化,2）转录延长,真核生物转录延长过程与原核生物大致相似，但因有核膜相隔，没有转录与翻译同步的现象。,RNA-pol前移处处都遇上核小体。,转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚现象。,5-AAUAAA-,5-AAUAAA-,核酸酶,-GUGUGUG,RNA-pol,AATAAAGTGTGTG,转录终止的修饰点,5,5,3,3,3加尾,AAAAAAA3mRNA,3）转录终止,和转录后修饰密切相关。,复制和转录的区别,几种主要的修饰方式,1.剪接(splicing),2.剪切(cleavage),3.修饰(modification),4.添加(addition),四、真核生物RNA转录后的修饰,（一）mRNA的加工1.首、尾的修饰,5端形成帽子结构(m7GpppGp)3端加上多聚腺苷酸尾巴(polyAtail),帽子结构,5pppGp,帽子结构的生成,2mRNA的剪接,（1）hnRNA和snRNA,核内的初级mRNA称为杂化核RNA(hetero-nuclearRNA,hnRNA)snRNA(smallnuclearRNA),真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。,断裂基因(splitegene),编码区A、B、C、D,（2）外显子(exon)和内含子(intron),外显子在断裂基因及其初级转录产物上出现，并表达为成熟RNA的核酸序列。内含子隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。,鸡卵清蛋白基因,hnRNA,首、尾修饰,hnRNA剪接,成熟的mRNA,鸡卵清蛋白基因及其转录、转录后修饰,鸡卵清蛋白成熟mRNA与DNA杂交电镜示意图,DNA,mRNA,（二）rRNA的转录后加工,（三）tRNA的转录后加工,tR