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文档简介
第二章MaterialStudio的安装,要求:能自行安装MaterialStudioforWindows和Linux,并能进行简单的配置,能查看Gateway,一、客户端系统要求(MaterialsVisualizer):操作系统:Windows2000Professional-SP4WindowsXPProfessional-SP2(Windows2003)WindowsVista-SP1(Windows2008)硬件:IntelPentiumIIIorcompatibleprocessorrunning1GHZ800600分辨率显示系统(推荐1024768)512MBRAM(推荐1GB)730MB硬盘空间(完全安装)16-bit/65536colors(显示卡),系统要求:,一、客户端系统要求:操作系统:Windows2000Professional-SP4WindowsXPProfessional-SP2(Windows2003)WindowsVista-SP1(Windows2008)硬件:IntelPentiumIIIorcompatibleprocessor1GHZ800600分辨率显示系统(推荐1024768)512MBRAM(推荐1GB)730MB硬盘空间(完全安装)16-bit/65536colors(显示卡),二、服务器端系统要求:操作系统:Windowsservers(单机):Windows2000Professional,Server-SP4Rollup1Windows2003Server,alleditions-SP2andR2WindowsXPProfessional-SP2WindowsVista-SP1Windows2008-Sp1Windowsservers(Cluster):MicrosoftHighPerformanceComputing(HPC)Server,作业调度软件LSF(LoadSharingFacility)在无网络连接的机子上要实现并行,则需要安装Loopback,Linux系统比Windows系统效率高,Linux服务器:x86(32-bit)处理器(包括clusters):RedHatEnterpriseLinuxAS,ES,andWS-3.0(update9)RedHatEnterpriseLinuxAS,ES,andWS-4.0(updates5and6)SuSELinuxEnterpriseServer-9(SP4)and10(baseorSP1)x86-64处理器(包括clusters):RedHatEnterpriseLinuxAS,ES,andWS-4.0(updates5and6)RedHatEnterpriseLinux5(baseandupdate1)RedHatEnterpriseLinuxDesktop5(baseandupdate1)SuSELinuxEnterpriseServer-9(SP4)and10(baseorSP1)Itanium2处理器:RedHatEnterpriseLinuxAS,ES,andWS-4.0(updates5and6)RedHatEnterpriseLinux5(baseandupdate1)RedHatEnterpriseLinuxDesktop5(baseandupdate1)SuSELinuxEnterpriseServer10(baseorSP1),推荐:CentOS,我们的系统2:硬件:Intel(R)Xeon(R)CPUE54202.50GHz2493MHz4x2=8核;1.5G/核,SAS硬盘软件:Windows2008(64bit)+hpmpiMaterialStudio4.3,硬件:IntelPentiumIIIorcompatibleprocessor1GHZ512MBRAM(推荐1GB)730MB硬盘空间(推荐10G)视计算对象而定,1G/cpu128原子(CASTEP,Dmol3),我们的系统1:硬件:Intel(R)Xeon(R)CPUE54202.50GHz2493MHz4x2x3=24核;1G/核;千兆双网卡;软件:CentOS5.2(64bit)+hpmpi+torque,Beowulfcluster构架,MaterialStudio4.2,Windows下安装:Setup(ClientandServer)安装完成后,把msi.lic或msilic.lic拷贝到安装目录的子目录.LicensePackLicenses中。Server对应的进程Apache(MaterialstudioGateway)Linux下安装(不能用root账号安装,而用普通帐户比如msemsi):$./Install(如果是在cluster上安装,则运行$./Installtypecluster),按照缺省安装至结束,切换到root账号进行配置:使gateway自启动:cp/./Accelrys/MaterialsStudio42/Gateway/msgateway_control_18888/etc/rc.d/init.d;cd/./Accelrys/MaterialsStudio42/Gateway/;/sbin/chkconfig-addmsgateway_control_18888;复制你的license文件到/./Accelrys/License_Pack/licenses(目录要与安装License管理软件的目录相一致),复制一份license文件为msilicense.dat(网上说把license改名为msilicense.dat,但是对于ms4.2版,必须ms.lic和msilicense.dat都存在),配置运行环境:eval/Accelrys/MaterialsStudio42/share/license/data/lic_setup.sh-ssheval/Accelrys/MaterialsStudio42/share/bin/ms_setup.sh-sshmkdir/usr/temp;chmod777/usr/temp(设置计算的临时目录)TMPDIR=/usr/temp;exportTMPDIRDMOL3_DATA=/./Accelrys/MaterialsStudio42/Data/Resources/Quantum/DMol3exportDMOL3_DATADMOL_TMP=/usr/temp;exportDMOL_TMPMESODYN_HOME=/Accelrys/MaterialsStudio42/Data/Resources/Mesoscale/MesoDynexportMESODYN_HOME/Accelrys/MaterialsStudio42/Gateway/msgateway_control_18888restart;,安装或运行时最重要的是查看出错信息,有些信息不会在客户端显示,这时候可以查看Gateway上的信息比如2:18888,点jobs,会看到正在运行的任务(注意:出错后先不要把出错窗口关掉,因为一关掉,Gateway上的信息就会自动删除),选择出错的任务,然后看std_err.txt,也可能在其它的txt文件里。,可参见:,配置使用Gateway:ServerConsole,Gateway的数据也可以通过修改gw-info.sbd和gwparams.cfg来实现。,查看任务信息:,信息包含文档:fromdsd.txtstd_out.txttodsd.txtstd_err.txt,任务进度信息:ToolsServerConsol,Gateway的权限控制(任务提交权限):IP控制和用户控制,IP控制(只允许特定网址的客户端提交任务):修改allow.conf,用户控制(用户须输入帐户密码才能提交任务):
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