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第五章: 微生物细胞的化学组成:细胞的化学组成决定细胞的化学需要。 1、 元素组成:(1)C、H、O、N:为所有生物体的有机元 素。 (2)主要元素:包括P、S、K、Na、Ca、Mg、 Cl等。 (3)微量元素:包括Fe、Cu、Mn、B、Mo、 Co、Si等 2、 化合物组成:细胞内的化合物可分两类:无机化合物 (水和无机盐);有机化合物。7090%为水分,10 30%为干物质。有机物占干物质质量的9097%,包括 蛋白质、糖类、核酸及脂类。 微生物的营养物质:水、碳源和能源、氮源、无机盐、生长因子(因 素) 微生物的营养类型:(根据碳源和能源的不同) 营养类型能源碳源微生物(例) 光能自养型光CO2 、CO32-藻类 化能自养型无机物CO2硝化细菌 光能异养型光有机物红螺菌 化能异养型有机物有机物大多数细菌等 碳氮磷比:在废水处理中,活性污泥中好氧微生物要求碳氮磷比为 BOD5:N:P=100:5:1 微生物的培养基:根据微生物的营养要求,将各种营养物质按一定比 例配制而成,用以培养微生物的基质。 .培养基的配制:(1)根据不同微生物的营养需要配制; (2)配制时将各营养成分按顺序加入(或分 开溶解); (3)要调节适宜的pH值; (4)配制后的培养基应尽快灭菌(不能过 夜)。 营养物质进入微生物细胞的方式(跨膜运输):某种物质是否能作为 营养物质支持微生物生长,首先取决于这种物质能 否进入细胞,其次是该细胞是否具有分解此物质的能力,这涉 及到物质运输和物质分解两个过程。其中较重要的机制有:单 纯扩散(从高浓度到低浓度)、促进扩散(依靠扩散梯度驱 动)、主动运输(逆浓度梯度)和基团转位(营养物质通过在 运输过程中被磷酸转移酶系统磷酸化而进入细胞内,也需要能 量和特异性的酶)等。 ATP: 在微生物的生物氧化过程中,底物的氧化分解产生能量;同 时,微生物将能量用于细胞组分的合成。在这两者之 间存在能量转移的中心,即ATP。 生物氧化的本质:在微生物体系中,能量的释放、ATP的生成都是通 过生物氧化实现的。 发酵:发酵是指在无外在电子受体时,底物脱氢后所产生的还原力 H不经呼吸链传递而直接交给某一内源性中间产物 接受,以实现底物水平磷酸化产能的一类生物氧化反应。 好氧呼吸:好氧呼吸(aerobic respiration)是有外在最终电子受 体(O2)存在时,对底物(能源)的氧化称为好 氧呼吸。它是一种最普遍和最重要的生物氧化方式。 无氧呼吸:无氧呼吸又称厌氧呼吸,是一类电子传递体系末端的受氢 体为外源无机氧化物的生物氧化。 三种生物氧化类型的比较(以葡萄糖为例): 生物氧化 类型 最终电子 受体 参与反应的酶最终产物 产ATP方 式 释放总能 量/kJ 乙醇发 酵 中间代谢 产物 脱氢酶、脱羧 酶、乙醇脱氢 酶;辅酶:NAD等 低分子有 机物、 CO2、ATP 底物水 平磷酸 化 238. 3 好氧呼 吸 O2 脱氢酶、脱羧 酶、NAD、FAD、 辅酶Q、细胞色素 等 CO2、 H2O、ATP 底物水 平磷酸 化;氧 化磷酸 化 2876 无氧 呼吸 NO3、NO2 、SO42 CO3CO2 脱氢酶、脱羧 酶、硝酸还原 酶、硫酸还原 酶;辅酶:NAD、 细胞色素b、c等 CO2、 H2O、 NH3、N2、 H2S、 CH4、ATP 底物水 平磷酸 化;氧 化磷酸 化 反硝化: 1756 反硫化: 1125 光合作用(photosynthesis):是地球上进行得最大的有机合成反应。 将太阳能转化为化学能的过程经常用CO2固定这一术语来表示。 第六章: 生长繁殖的概念:(微)生物在适宜的环境条件下,不断吸收营养物质, 按照自己的代谢方式进行新陈代谢 活动。正常情况下,同化作用大于异化作用,微生 物的细胞不断迅速增长,细胞长到一定程度时,就 会由一个细胞分裂成细胞。当发生个体数目的增加 时,就称为繁殖。反之,则为生长。 生长曲线的各个时期及其特点 1,停滞期:又称调整期和适应期,指少数微生物接种到新培养液 中 后,再开始培养的一段时间内细胞 数目几乎不增加的时期。停滞期的长短和接种量、种 (菌)龄和培养基等因素有关。处于停滞期的微生物 细胞体积增长快、合成代谢活跃,对外界不良条件的 反应敏感。 2、对数期(指数期):细菌的生长速度达到最大,细菌数以几何 级数增加,在生长曲线上呈直线关系。 处于对数期的细菌,得到丰富的营养,代 谢活力最强,细菌旺盛生长。此时的细菌 比较整齐(群体内比较一致)健壮。对不 良环境条件的抗性也比较强。 3、静止期:由于对数期的细菌迅速生长繁殖,消耗了大量的营养 物质,有害物质的积累及其它物化条 件的恶化静止期。在静止期,细菌总数达到最 大,新生数与死亡数大致相等,保持动态平衡。此时 的细菌开始积累贮存物质,有芽孢的细菌形成芽孢。 4、衰老期:营养物质被耗尽,细菌进入内源呼吸阶段。有害物质 大量积累,不利于细菌的生长繁殖, 此时,死亡率增加,活菌数减少。细菌常出现畸形或 衰退型。 世代时间:微生物两次繁殖之间的间隔时间,称为该生物的世代时间。 环境因子:1、温度:微生物的生长要求有一定的温度范围:最低温 度、最适温度、最高温度。 根据细菌最适温度的不同,可把细菌分为:嗜冷 菌(510)、嗜中温菌(2540)、嗜热菌 (5060)和嗜超热菌(70105)。不同微 生物对温度的要求不同,同一微生物在生长的不 同时期对温度的要求也会不同。 高温的影响:在高温时,微生物的蛋白质会发生凝固变 性,呈不可逆的变性,导致微生物的死亡。通常, 可以利用高温对微生物的影响来达到杀灭 微生物的目的。灭菌是指杀死一切微生生 物;而消毒仅是杀死致病微生物。 低温的影响:低温下,微生物的代谢活力低,生长缓慢 或停止,但不致死。处于低温下的微生物一旦获 得适宜的温度,即可恢复活性。利用这一 特性,各种冰箱成为生物实验中保存生物 样品或试剂的重要手段。 2、 pH:微生物的生命活动、物质代谢与pH有密切关系。不 同微生物对pH的要求有不同。微生物对pH的要 求也存在最高、最低和最适三个点。 过高或过低的pH对微生物的影响: (1)影响蛋白质的解离,从而影响细胞表面的 电荷,影响营养物质的吸收; (2)影响营养物质的离子化,影响其进入细 胞; (3)影响酶的活性; (4)降低对其他因素的抵抗能力(如抗热 性)。 3、氧化还原电位:氧化环境具有正电位,还原环境具有负 电位。各种微生物对氧化还原电位的要 求不同,一般好氧微生物要求Eh在+300 +400mV;专性厌氧的微生物要求在-200 250mV;而兼性微生物,在+100mV以上 时进行好氧呼吸,在+100mV以下时进行无 氧呼吸。 环境中的氧化还原电位受到氧分压和pH等 因子的影响。 4、溶解氧:微生物可分为:好氧微生物、兼性厌氧微生物 和厌氧微生物。 (1)O2的作用:一是作为最终电子受体,二是参与甾醇 类和不饱和脂肪酸的合成。 微生物只能利用溶解于水中的O2,即溶解氧 (DO)。DO与水温、大气压等因素有关,温度 越高,氧的溶解度越小。在好氧生物处理中, 一般曝气池中的DO要求控制在3 4mg/L。 (2)好氧微生物与氧的关系 好氧微生物有:芽孢杆菌属、假单胞菌属、动胶菌 属、黄杆菌属、微球菌属、无色杆菌属、球衣菌属、 根瘤菌、固氮菌、硝化细菌、硫化细菌、无色 硫磺细菌、大多数放线菌、霉菌、原生动物和 微型后生动物等。 好氧微生物和微量好氧微生物在有氧条件下能正常生 长繁殖,是因为它们需要氧作为呼吸中的最终电子受 体,参与部分物质合成。好氧微生物需要溶于水的氧 即溶解氧。 5、太阳辐射:辐射是指通过空气或外层空间从一个地方传 到另一个地方去的能源。 辐射包括:可见光、紫外辐射、近红外、热红外及微 波,另外还有电离辐射等。可见光和红外辐射对进 行光合作用的微生物有影响,能作为光合 作用的能源。 紫外辐射和电离辐射对微生物的影响:紫外辐射(紫 外线)对微生物有致死作用,可用以杀菌, 但穿透力较差,只能用于空气和物体表面的消 毒。电离辐射低剂量时,有促进生长的作用; 高剂量时,则有致死作用,常用于诱变育种。 6、渗透压:微生物在不同渗透压的溶液中呈不同的反应: 等渗溶液,周围溶液=体内(0.50.85%的NaCL溶液,也 被称为生理盐水) 微生物生长良好; 低渗溶液,周围体内(如20%的NaCL溶液) 细胞内的水分 子大量渗出,使细胞发生质壁分离。 第七章: 遗传和变异的物质基础DNA 典型的实验:DNA是遗传的物质基础,可通过格里菲斯(Griffith) 经典的转化实验和大肠杆菌T2噬菌体感染大肠杆 菌等实验得到证明。 DNA的化学组成: 1.碱基:腺嘌呤A,鸟嘌呤G ,胞嘧啶C,胸腺嘧啶T 基本单位核苷酸 2.脱氧核糖核苷酸 3.磷酸基团 DNA的复制 1.DNA具有独特的半保留式的自我复制能力,确保了DNA复制精 确,并保证一切生物遗传性的相对稳定。 2.DNA的自我复制大致如下:首先是DNA分子中的两条互补的多核 苷酸链之间的氢键断裂,彼此分开成两条单链; 然后以各自原有的多核苷酸链为模 板,根据碱基配对原则吸收细胞中 游离的核苷酸,按照原有链上的碱 基排列顺序,各自合成出一条心的 互补的多核苷酸链;新和成的一条 多核苷酸链和原有的多核苷酸链又 以氢键连接成新的双螺旋结构。因 此,在新和成的子代DNA的分子中, 一条链来自亲代的DNA,另一条则是 新和成的。 DNA和RNA的区别:1.DNA中的胸腺嘧啶T在RNA中变成了尿嘧啶U 2.RNA含有的五碳糖是核糖而不是脱氧核糖 生物遗传信息的传递:1.亲代的性状是通过脱氧核糖核苷酸将决定各种 遗传性状的遗传信息传给子代 2.子代根据DNA所携带的遗传信息产生一定形态结 构的蛋白质 变异的实质基因突变:DNA上的碱基对发生差错,出现碱基的缺 失、置换或插入,改变了基因内原有的碱基顺序,导 致后代性状的改变。当这种改变可以遗传 时,就是发生了突变。所以说基因突变是微 生物发生变异的实质。在真核微生物中,变 异也会发生在染色体水平上,如染色体的缺 失、重复、倒位和易位等,都会引起遗传信 息的改变,称为染色体畸变。 变异的类型:1.自发突变:在自然条件下发生的突变。自发突变的概率 很低,如细菌约为10-10。 2.诱发突变:人为地用某种因素处理后造成的突变。诱发 突变的概率大大提高,可以达到约10-4 110-5 蛋白质的合成过程:1.DNA复制:通过半保留复制方式进行自我复制 2.转录mRNA:由DNA转录成mRNA 3.翻译:以mRNA上的碱基顺序为模板,翻译成对应 的蛋白质分子 4.蛋白质合成:通过mRNA的两端识别作用,把特定 的氨基酸送到核糖体上,在多肽合成酶的作用下 合成多肽键,生成具有特定生理 功能的蛋白质。 第八章: 生态系统:在一定时间和空间范围内由生物(包括动物、植物和微生 物)与它们的生境(包括光、水、土壤、空气及其 他生物因子)通过能量流动和物质循环所组成的一个自然 体。生态系统=生物+环境条件 生态系统的组成:环境(无机环境)、生产者、消费者、分解者或转化 者。 生态系统的功能:a生物生产:是生态系统的基本功能之一,只要有太 阳辐射、水、二氧化碳及无机物,植物、藻类及光 合细菌等利用太阳能,将二氧化碳和水 合成糖类,进合成蛋白质、脂肪和核酸 等,构成植物体。 b能量流动:太阳将能量供给植物、藻类和光合细菌 等进行光合作用合成有机物、光能被转化为化学能 而被贮存在植物体内,能量再通过食物 链由种生物转移到另生物体内。 c物质循环:生态系统中生物群落所需的各种营养物 在环境、生产者、消费者和分解者(各营养级)之间 传递,处于不断循环之中形成物质流。 d信息传递:生态系统中的信息传递多种多样,有强 有弱,把各组成联为一个统一整体。有物理信息, 例如声、光、颜色起吸引异性、种间识 别、威吓、警告等信息作用;生物的酶、 维生素、 生长素、抗生素等是化学信息等。 种群:占据特定空间的同一生物种的所有个体的集合体。种群是生物群 落的组成单位。 群落:指一定时间内居住在一定空间范围内的生物种群的集合。 土壤的生态条件(土壤是微生物最良好的天然培养基): a有丰富的营养物质:土壤内有大量的有机和无机物质(动植物的 残体、分泌物、排泄物等) bpH比较适宜微生物生长:多为5.58.5;适合于大多数微生物的 生长繁殖。 c渗透压多为等渗或低渗:土壤是等渗或低渗溶液,有利于微生物 吸收水份和营养。 d保证氧气和水的供应:土壤具有团粒结构,有孔隙,可以通气和 保持水分。土壤中氧气的含量要少于空气中, 一般为78%。 e有良好的保温性:土壤具有较强的保温性,其变化幅度要小于空 气。 f最上面的表土层起到保护的作用:表面几毫米厚的土壤,可以使 下面的微生物免受紫外线的直接照射。 水体自净:河流(水体)接纳了一定量的有机污染物后,在物理、化学 和水生生物(微生物、动物和植物)等因素的综合 作用后得到净化,水质恢复到污染前的水平和状态。 衡量水体自净的指标:(1)P/H指数:P代表光合自养型微生物,H代表 异养型微生物,两者的比即P/H指数。P/H指数 越高,自净效果越好。 (2)氧浓度昼夜变化幅度和氧垂曲线:从溶解氧 浓度大小看,B点高于C点,但C点溶解氧的昼 夜变化幅度大于B点,但C点的自净程度 高于B点。可见,溶解氧昼夜变化幅度能 较好的反映水体中微生物群落的组成和 生态平衡状况。 水体污化系统:毒物或污染物排入水体后水质发生一系列变化,接近污 染源往往污染较严重因河水有自净能力,随距 离增加河水逐渐净化。 水体划分为一系列的带:多污带、中污带、中污带和寡污带。 水体污化指示生物:包括细菌、真菌、藻类、原生动物、轮虫、浮游甲 壳动物、底栖动物有寡毛类的颤蚯蚓、软体动物 和水生昆虫。 水体有机污染指标:(1)BIP指数 BIP=B/(A+B)100 其中:A为有叶绿素的微生物数,B为无叶绿素的微生物数。所以 BIP的含义是无叶绿素的微生物数占总微生物数的百分比。 BIP值 0-8 清洁水 8-20 轻度污染水 20-60 中度污染水 60-100 严重污染水 (2)细菌菌落总数(CFU): 细菌菌落总数是指1mL水样在营养琼 脂培养基中,于37培养24h后所生长出来的细 菌菌落总数。它用于指示被检的水源水受有机物污染的 程度,为生活饮用水做卫生评价提供依据。 (3)总大肠菌群:大肠菌群的测定方法:常用的方法有多管发酵 (MPN)法和滤膜法。 根据我国的国家标准(GB5749-85):生活饮用水中, 细菌菌落总数100个/ml;总大肠菌群数3个/L。 水体富营养化的 (1)发生:由于某些因素,特别是人类的活动,使营养 物质(氮、磷等)大量进入水体,促使水体中 的藻类过量繁殖,造成水体出现富营养 化。在淡水水体中称为“水华”,在海水 中为“赤潮”。在水体中,一般氮和磷是 藻类生长的限制因子,当氮和磷的浓度增 加,就会造成藻类的大量繁殖。 (2)与富营养化有关生物种类藻类 主要是蓝藻中的 微囊蓝细菌属、腔球蓝细菌属和鱼腥蓝细菌属等。 (3)防止天然水体富营养化的根本措施 是将各种污水 和废水中的氮和磷的排放量控制在低水平。加强对 水体富营养化的研究,探索其发生的机理,及 时预报,减少对人类生活和生产的损失。 微生物之间的关系 (1)竞争关系:不同的微生物对于资源发生竞争,互相受到不好的 影响,如对营养物质、空间地位等等。如在活性 污泥中,菌胶团细菌和丝状菌会发生对溶解氧或营 养的竞争。 (2)原始合作关系(互生关系):两种可以单独生活的微生物共 存,互为有利。这是一种可分可合,合比分好的相互 关系。 如在植物根部生长的根际微生物与高等植物之间存在着互 生关系,在人体肠道中,正常菌群与人之间也存在着互生 关系。又如在氧化塘中的藻类和细菌。 (3)共生关系:两种不可以单独生活的微生物共存,互为有利,彼 此分离就不能很好地生活。地衣就是微生物间共 生的典型例子,它是真菌和蓝细菌或藻类的共生 体。藻类利用光能将 CO2和H2O合成有机物供自 身及真菌营养;真菌从基质吸收水分和无机盐供两 者营养。还有根瘤菌和豆科植物根系共生等。 (4)寄生关系:寄生指的是小型生物生活在较大型的生物体内或体 表,从后者获得营养,进行生长、繁殖,并使后 者蒙受损害甚至被杀死的现象。前者为寄生菌,后 者为寄主或宿主。如噬菌体与细菌的关系。 (5)中性关系:乳杆菌和链球菌可以混合培养。 (6)偏害关系(拮抗关系):指一种微生物在其生命活动中,产 生某种代谢产物或改变环境条件,从而抑制其他微生 物的生长繁殖,甚至杀死其它微生物的现象。如乳酸菌产 酸对其他细菌的影响(非特异性),产生抗生素的微生物对 其他微生物的影响等。 (7)捕食关系:一种微生物吞食另一种微生物,如原生动物吞食 细菌等,捕食者与被捕食者之间的关系。 第九章: 碳循环:自然界中含碳物质有CO2、糖类、脂肪、蛋白质等。碳的循 环是以CO2为中心的。在碳循环中,CO2大部分来源于微生物对有机 物的分解,另外,由于CO2同时也参与氧循环,因此,实际上碳和氧 循环是相互关联的。 淀粉的转化:淀粉分直链淀粉和支链淀粉两类。 是由葡萄糖分子脱水缩合,以-D-1,4葡萄糖苷键(不 分支)或-1,6键结合(分支)而成。广泛存在于植物 种子和果实中。淀粉也是人类获取的主要食物来源之 一。 纤维素的转化:纤维素是葡萄糖的高分子聚合物,(C6H10O5)n,n=1400 10000. 参与的微生物:细菌、放线菌和真菌。 分解过程: 纤维素酶 2(C6H10O5)n + nH2O nC12H22O11(纤维二糖) 纤维二糖酶 n C12H22O11 + nH2O 2n C6H12O6 纤维素的转化图解: 脂肪的转化图解: 脂肪的分解: 氮循环: 蛋白质的水解: 蛋白酶 蛋白酶 蛋白酶 肽酶 蛋白质 眎 胨 肽 氨 基酸 蛋白质是生物细胞的主要成分,氨基酸是基本单位。蛋白质的分 解,首先也是水解,才能进入微生物细胞内。能够分解蛋白质的微 生物很多,细菌、真菌、放线菌等。 氨化作用:有机氮化合物在脱氮微生物的作用下脱氨基产生氨。 例如: 氨基酸 不含氮的有机物(酸) + NH3 经脱氨基后形成的有机酸和脂肪酸,在微生物的作用下 继续分解。 硝化作用是指在有氧的条件下,经亚硝酸细菌和硝酸细菌的作用, 将氨转化成硝酸。分两步进行: 2NH3 + 3O2 2HNO2 + 2H2O + 619KJ 2HNO2 + O2 2HNO3 + 201KJ 亚硝酸细菌 硝酸细菌 亚硝酸细菌和硝酸细菌是好氧的,世代时间很长(从十几小时到几 天)。 反硝化作用:反硝化作用在缺氧条件下,硝酸盐被还原为氮气的过 程。发生反硝化的条件是:硝酸盐存在(提供电子受体)、有机物 存在(提供能量)、
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