SYBYL软件与计算机辅助药物设计.ppt

SYBYL软件和计算机辅助药物设计，zuoweiyanchemaytechnologyltdfeb，23，2004，开封虚拟技术有限公司，国内医学、化学、生命科学和农药领域的科学研究，美国Tripos是业界非常有名的高科技公司。Tripos的主要业务包括三个方面：也就是说，新的联合开发软件产品软件咨询服务新的联合开发和销售世界上最大的15家制药公司作为重要的研究手段购买了Tripos的软件产品。TriposResearchandService，软件产品sybyl/unity，sar navigator.化合物substance lead qst、lead screen、lead hopping 。软件咨询和售后服务chembayserviceinp.r. China，userlists-高等教育机构，北京大学物理化学研究所，化学和分子工程学院，蛋白质工程和植物遗传工程国家重点实验室，医学部药学院清华大学化学系，生命科学和工程研究院北京工业大学环境化学系，生命科学南京大学化学系、环境科学与浙江大学化学系、药大复旦大学化学系、药大中山大学第二军医大学药科、大学中国药大、厦门大学化学系、兰州大学计算机化学研究所华中师范大学农药研究所云南大学现代生物中心、 中国科学院上海药物研究所中国科学院上海有机研究所计算机化学开放实验室中国科学院上海有机研究所国家生物有机和天然产物核心实验室中国科学院贵州省天然产物化学核心实验室中国科学院上海生物工程研究中心中国科学院化学冶金研究所计算机化学开放实验室中国科学院昆明动物研究所中国科学院昆明动物研究所中国科学院武汉物理研究所中国科学院广州化学研究所中国科学院长春应用化学研究所中国科学院上海分校、 UserLists-科学研究机构，中国医学科学院北京药藏机合成室北京医学科学院北京药所国家药物和代谢产物分析研究中心中国医学科学院天津血液学研究所北京医学科学院北京药剂学研究所北京微生物传染病研究所北京微生物传染病研究所上海药工业研究所上海转基因研究所江苏医药研究所东北制药集团山东大学药大学院南京大学药大学院天津药院军事医学科学院，UserLists-研究机构工业部门，*。 bio polymer、composer、genefold、proteable、match maker、leap frog、HIV ol、combilibmaker/leg、Clm 3d opbilib maker 基于配体的设计建模和显示(定量结构-活性关系和药效组分析)化学信息学组合化学库设计和分子多样性结构生物学和生物信息学最初药物设计虚拟筛选核磁数据辅助分析，软件开发，trip OS total solutions，molleleles 包括系统结构图像检索方法、网格结构检索方法、随机搜索方法和基于遗传算法的结构图像分析。帮助用户确定分子的优势低能结构，并提供QSAR、药效团分析等模块用材料。Systematics searchexample，10 conformations，95 conformations，modelling visalisation，qsaraadme定量结构-活动特性预测，QSAR witwittion ADME特性根据模型预测了活性和ADME特性，为筛选和合成新化合物提供了信息，为药物设计提供了新的思路，QSARADME、QSAR工作原理、Quantitivestructureactyrelationships生理活性和可计算分子特性之间的关系建立活性，以数值说明分子特性的合理统计方法说明了活性与描述符和.问题是必须选择这些重要的描述符。QSAR adme、QSAR-3 dqsar-comfa、comparativemoleculatuldnalysis描述符包括静电、三维、氢键、疏水字段、QSAR ADMS，与qsaraadme、adme-volsurf、QSAR一致的方法和想法计算与adme相关的描述符PLSorPCA方法分析描述符的类型72 descriptors-5 classesszeshape(分子的形状)Hydrophilicregions，是-TagametandZantac在体内具有相同生物效应的同一受体whatdotheyhaveincommonin2D？Whatdotheyhaveincommonin3D？pharmacopihorepercision、药效组分析模块的应用、3 data basquerie sand mole cular alignment、pharmacopihorepercision、hitmoleculfromleadscreen、molecular structures、pharmacophoperception、ChemicalInformatics化学信息学、chemical informatics、UNITY(数据库管理和搜索)concord 优化、biopolymer、insulin、BiomolecularSoftware、sequence : fvnqhlcgshlvearlvcgergffytpka、composer、生物界共识： RCSB.ORG)和模板的序列同源性至少为30%，BiomolecularSoftware，GeneFold对所有折叠模式建模，预测新蛋白质折叠模式序列同源性不足30%的导线渗透方式也可能有结构预测理论。折叠模式是有限的，新序列和模型结构的兼容性决定了其折叠模式。模式从PDB数据库中提取。、biomolecular software、knowledgenproteinstructure、biomolecular software和fugue通过高效的PSI-BLAST在目标序列和数据库序列之间建立关联(是否属于同一产品系列)相关性决定其结构的兼容性FUGUE内蛋白质系列分类数据库。通过高效率的匹配和评分矩阵，找到低同源目标蛋白的高质量构建模板。ProTable(合理性分析)、biomolecular software、virtual screening虚拟筛选、虚拟屏幕、flexxfleexx-pharmcsorecomboxg _ scored _ score PMF _ scorechemscoregold程序DOCK程序*GLIDE程序各种评估函数的一致性评估更有参考意义cs核心，虚拟屏幕，PPAR-基因转录因子PPAR兴奋剂是有希望的胰岛素增减剂，两种新药于2000年被FDA批准在美国上市，