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文档简介

1、1 总 RNA 提取(1)液氮研磨或冰上匀浆实验材料;先将 1ml Trizol 加到离心管中待用(2)将研磨好的样品加到离心管中混匀,室温放置5 min;打开离心机预冷(3) 加 200 L 氯仿,振荡 15 sec,室温放置 3 min,分层;(4) 4oC,12,000g,离心 15 min;(5) 取上清,加 500 L异丙醇,混匀,室温放置 10 min;(6) 4oC,12,000g,离心 10 min;(7) 弃上清,加 1 mL75%乙醇,漂浮洗涤沉淀,振荡充分;再用 100%乙醇清洗(8) 4oC,7,500g,离心 5 min;(9) 弃上清,离心,用枪吸取多余液体, 放在

2、超净台里干燥后, 加 50 LDEPC水, 80oC 保存。此操作中所用到的器皿均需经过DEPC 灭活 RNA 酶处理。提取的总RNA需经 RNA 电泳检测质量,并用紫外分光光度计测定浓度。 OD260 值为核酸的吸收值, OD280 值为蛋白的吸收值, OD260/280 值在 1.8-2.0 间一般说明该核酸蛋白含量在允许的范围内,可正常使用;此外还有 OD230 值为多糖和酚类的吸收值,比较干净的核酸 OD260/230 值能达到 2.2 左右。 RNA 浓度计算公式:总 RNA 浓度( g/mL ) =A260稀释倍数 40。供参考2 反转录 /cDNA 第一链的合成纯化 RNA 以去

3、除基因组 DNA ,操作按 TaKaRa公司的 PrimeScript RT reagentwith gDNA Eraser(Perfect Real Time)说明书进行。其体系为:Total RNA1g5gDNA Eraser Buffer2LgDNA Eraser1LRNase Free dHO补齐至 10L2条件为: 42oC,2min;RNA 纯化后,即可进行反转录。其体系为:5PrimeScript Buffer 2( for Real Time)4LPrimeScript RT enzyme mix 1LRT Primer Mix1L上一步的反应液10LRNase Free dH

4、2O补齐至 L20操作条件为:(1) 37oC 放置 15 min; (2) 85oC,5 sec; (3) 4oC 保存。3 PCR按 TaKaRa公司的 Premix Taq Version 2.0 操作, PCR 反应体系如下:Premix Taq25 L模板5L引物 1 (10M)1 L引物 2 (10M)1 LddH2O18LPCR 反应条件为: 94C 预变性 5min;94C 变性 30s,53C 退火 30s,72C延伸 30s,循环 36 次; 72C 延伸 10min。PCR 反应完毕,取 5L反应产物进行 1%琼脂糖凝胶电泳 (若割胶回收则用10L反应产物)。供参考4 基

5、因克隆及测序4.1PCR 产物切胶回收将 PCR 产物用 1%琼脂糖凝胶进行电泳, 在紫外灯下观察并切下预期大小的 DNA 片段。使用 TIANGEN 公司的 Universal DNA Purification Kit 割胶回收试剂盒进行纯化,步骤如下:(1)平衡吸附柱:向吸附柱CB2 中(吸附柱放入收集管中)加入500L平衡液 BL ,13,400 g 离心 1 min,倒掉收集管中的废液,吸附柱 CB2 重新套回收集管中;(2) 按 100 mg agarose胶加入 100L溶液 PC,置于 50oC 中 10 min 左右,中途混匀几次,至胶完全融化;(3) 将样品倒入一个吸附柱 C

6、B2 中(吸附柱放入收集管中) ,室温下 13,400 g 离心 1 min,倒掉收集管中的废液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;(4)向吸附柱 CB2 中加入 600L漂洗液 PW(加乙醇),室温下 13,400g 离心 1 min,倒掉收集管中的废液,吸附柱 CB2 重新套回收集管中;(5) 重复上一步骤;(6) 将吸附柱 CB2 放入收集管中,室温下 13,400 g 离心 2 min,尽量除去漂洗液,将吸附柱置于室温放置数分钟,彻底晾干;(7) 将柱子套入一新的灭菌 1.5 mL 离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50L 洗脱缓冲液,室温放置2 分钟, 13,400g 室温离心 2 m

7、in,收集到的洗脱液即为回收的 DNA 纯化液;(8) 取 5L 的纯化液体进行 1%琼脂糖凝胶电泳,以检查纯度,并测量溶液中 DNA 含量。4.2 目的片段与载体连接(1) 胶回收产物与 T 载体连接体系,参考 Takara公司 pMD18-T 载体的试剂盒说明书。在灭菌的 0.5 mL 离心管中配制如下溶液( 10 L):回收 DNA4LLigation Solution5LpMD18-T Vector1L供参考(2) 16oC 反应 30 分钟,所得产物保存于 4oC 冰箱备用。4.3 连接产物转化 E.coli DH5(1) 将 5 L 连接产物加入到 100LE.coli DH5 感

8、受态细胞中,轻轻旋转离心管混匀内容物,冰上静置30 min;o3 min;(2) 42 C 水浴热激转化 90 sec,立即放回冰上,放置(3) 每管加入 500 L LB 培养基(室温放置),37oC 160-180 rpm 振荡培养45-60 min,使菌体复苏并表达抗性基因;(4) 在含有 Amp (100 g/mL )的选择性平板上加入 60-100 L 菌液,用无菌涂布棒轻轻涂布均匀后,用 Parafilm 膜封好;(5) 将培养皿正放, 37oC 约 50 min,待液体全部吸收后,倒置平板继续培养10-16 h。4.4 转化子的筛选及鉴定(1) 用无菌枪头挑取 LB 平板上 3-5 个单菌落,分别接种到 3.5 mL LB 液体培养基中(含 100 g/mL Amp),37oC,165rpm

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