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文档简介

1、中山大学医学图书馆数据库检索指南Sun Yat-sen University Library Guide SciFinder Scholar (CA)化学文摘网络数据库(学术版)一、数据库介绍化学文摘是化学和生命科学研究领域中不可或缺的参考和研究工具,也是资料量最大,最具权威的出版物。网络版化学文摘SciFinder Scholar,更整合了Medline医学数据库、欧洲和美国等30几家专利机构的全文专利资料、以及化学文摘1907年至今的所有内容。它涵盖的学科包括应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多领域。SciFinder

2、Scholar可检索数据库包括: 数据库内容 Reference Databases (文献数据库)CAPLUSSM包含来自150 多个国家、9000 多种期刊的文献,覆盖1907 年到现在的所有文献以及部分1907 年以前的文献,包括有期刊、专利、会议录、论文、技术报告、书等,涵盖化学、生化、化学工程以及相关学科,还有尚未完全编目收录的最新文献。(目前2,430 万条参考书目记录,每天更新3000 条以上)MEDLINE 包含来自70 多个国家、3900 多种期刊的生物医学文献,覆盖1951 到现在的所有文献,以及尚未完全编目收录的最新文献。(目前1300 万参考书目记录,每周更新4 次)

3、Structure Database (结构数据库)REGISTRYSM涵盖从1957 年到现在的特定的化学物质。REGISTRY 包括了在CASM中引用的物质以及特定的注册。(目前7400 万条物质记录,每天更新约7 万条,每种化学物质有唯一对应的CAS 注册号) Reaction Database (反应数据库)CASREACT 包括从1907 年到现在的单步或多步反应信息。CASREACT 中的反应包括CAS 编目的反应以及下列来源:ZIC/VINITI 数据库,INPI1986 年以前的数据,以及由教授Klaus Kieslich 博士指导编辑的生物转化数据库。(目前800 万条反应记

4、录和403,000 条文献记录 ,每周更新约700-1300 条) Commercial Sources Database (商业来源数据库)CHEMCATS 化学品的来源信息,包括化学品目录手册以及图书馆等内的供应商的地址、价格等信息。(目前740 万条商业化学物质记录,来自655 家供应商的793 种目录) Regulatory Database ( 管制数据库)CHEMLIST 1979 年到现在的管制化学品的信息,包括物质的特征、详细目录、来源以及许可信息等。(22.8 万种化合物的详细清单,来自13 个国家和国际性组织,每周更新50 条新记录)我校也购有CA光盘版,包括1997年至2

5、003年5月的数据。 二、SciFinder Scholar (CA)客户端程序的安装和运行SciFinder Scholar (CA)数据库初次使用需要运行安装客户端程序,其安装步骤如下:(一)安装客户端程序 (1) 客户端程序地址:4/sfs-new.rar,对文件 sfs-new.rar 进行解压缩,可看到ViewerLite5_04.exe, SFS2004-2.exe和site.prf三个文件* 对于曾下载并安装sfs旧版本的用户:sfs2004-2.exe文件为原来的sfs2004.exe的更新版本,用户只需在卸载原程序sfs2004.exe程序后

6、安装程序更新版本sfs2004-2.exe到原安装目录文件夹内。 * 对于未曾下载sfs旧版本的用户:可按照接下来的步骤进行安装;1. 关闭其他应用程序。2. 运行SFS2004-2.exe,按照系统的提示安装客户端软件。建议选用典型安装。3. 安装过程中系统提问“Do you have a disk labeled custom site files?”时,请选择“否”。其它选择项默认,完成客户端软件SFS2004-2.exe的安装。(二)配置客户端软件将解压缩后得到的文件site.prf复制到客户端软件安装的目录区内(默认路径为C:SFSCHLR)。如果用户在安装过程中选择了其他路径,请注

7、意路径和目录。(三)安装ViewerLiteViewerLite是一个观看三维结构的工具,在SciFinder Scholar检索出的物质结果中,有很多都是提供3D视图的,如果安装了ViewerLite,直接点击物质名上的三维图像按钮即可查看。用户可自行选择是否安装:运行解压缩后得到的文件ViewerLite5_04.exe,按系统提示完成安装。(四)访问SciFinder Scholar数据库(1) 专线访问。(2) 运行SciFinder Scholar客户端程序:开始程序SciFinder Scholar 2004 EditionSciFinder Scholar(3)开始检索。(五)需

8、经由代理访问的IP使用 SciFinder Scholar 方法凡非正式IP,需经由代理服务器访问校外网络的用户,经与学校网络中心的老师沟通,目前只能通过架设代理层访问SciFinder Scholar。步骤如下:(1) 下载 SocksCap 软件并安装,SocksCap 需要定期更新,请留意更新时间。目前提供其一下载地址:SocksCaP(4/sc32r237.exe)(2) 启动 SocksCap 软件,File中选择“Setting”,在 SOCKS Server 中填写所使用的代理服务器,如;在Port中填写端口,如

9、1080。(因各校区代理服务器地址和端口各不相同,请用户查阅网络中心发的校园网用户管理手册)。 Protocol选择 SOCKS 5,其他默认。(3) 启动 SocksCap 软件,点击“New”,出现“新运行程序”对话框后,点击“Browse.”,在弹出选择框内选择在客户端软件所安装的目录区(默认路径为C:SFSCHLR),然后在其中选择 sfschlr.exe 程序,然后确定即可。在 SocksCap 内运行 sfschlr 即进行连接。注意:本数据库并发用户为5人,北校区等通过代理访问的用户连接速度较慢,如果暂时连接不上,请耐心等候。三、SciFinder Scholar 使用的简单介绍

10、:(一) 进入数据库双击SciFinder Scholar图标,在License Agreement的弹出窗口中,用户选择Accept按钮, 关掉Message of day的弹出窗口,就进入了Science Finder Scholar的Explore主检索界面,见图2。点击工具条的第一个图标New task,也可以得到Explore界面,见图1。工具条包括常用的一些功能:新任务,后退,向前,打印,保存,全文获取,参数设置,数据库,历史纪录,网址,帮助,退出程序。参数设置新任务数据库网址图1 公司名称和研究机构浏览目录研究主题文献情报著者姓名化学物质或化学反应图2 (二) SciFinder

11、 Scholar的检索方法SciFinder Scholar提供六种基本检索途径(见图二),下面简要介绍各种途径的使用:1、 化学物质或化学反应(Chemical Substance or Reaction)用户可以选择三种途径检索: 化学结构式(Chemical Structure)您可以在CAS的2200万种有机和无机物质的注册中,查找结构匹配项。要按结构检索,只需使用结构绘图窗口绘制、导入或者“粘贴”您要检索的化学结构。如图3,画出Ibuprofen 的结构,单击“Get Substances(获取化学物质)”,然后选择确切的匹配项或相关结构,单击OK。图3您可单击CAS注册号上方显示的

12、任何按钮,查看相关物质的更多信息。点击AB,弹出窗口,选择该物质在反应中的位置,如选择Product,则将Ibuprofen作为产物的反应检索出来。如下图4:获取反应管制化学品商业来源信息物质的引文物质的3D 模型图4图5也可以点击反应式中的任何物质获取更多信息,如果点击Reactions,则弹出选项,这里我们选择了Substance Detail,提供CAS Registry 记录,点击其中的超链接,可以查看得到此结果的参考文献内容。图5、6。Get References 可以获取相关文献,Analyze/Refine 可以对结果进行分析或二次检索。图6您可以通过绘制化学结构,限定反应中的作

13、用,从700多万种反应中查找相匹配的信息。使用结构绘图板绘制您的反应查询。添加反应箭头,制定反应参与项的作用。请单击“Get Reaction(获取反应)”。单击任何反应参与项,获得该物质的更多详情。要确认该物质是否已投入市场、购买地点、销售价格,请单击“Commercial Sources(商业资源)”。您将看到供应商列表。单击“显微镜”图标,屏幕将提供有关供应商的详细信息,包括地址、电话、传真号码、电子邮件地址等连连信息。如果您选择部分结构检索功能,SciFinder Scholar为您提供新的结构检索可能性。使用机构绘图板绘制相关子结构。定义立体结合、环状构造、链锁结构、替换和取待基团。

14、单击“Get Substances(获取物质)”并指定子结构。单击OK。如果结构绘图包含立体结构。SciFinder Scholar将通过与您的查询进行比较自动分析您的答案。选择所需的组要进一步精确查明答案,单击“Analyze/Refine(分析/精调)”。“Analyze”为您提供若干选项。例如可选择“Ring Skeletons(环状构造)”。单击OK。SciFinder Scholar将根据同一环状构造中特定的原子和结合,对答案集中的物质进行分析和分组。 物质标识符 (Substance Identifier)您可以从2200万种有机和无机的物质中按化学名称或CAS注册号查找相关物质。

15、通过物质标识符进行检索,输入一个或多个通用名称、物质别名或CAS注册号,例如:50-00-0;Acetaminophen,单击OK。SciFinder Scholar将检索与您的物质标识符相对应的CAS注册记录。 分子式 (Molecular Formula)通过分子式进行检索,SciFinder Scholar 会分析您所输入的分子式,并重新编排原子,使之成为能被计算机识别的Hill System Order,搜索CAS Registry 数据库,并显示匹配结果;如果输入的原子是模糊的,则弹出窗口提示修改,如元素符号的上标、下表,元素符号之间以空格隔开等(多数情况下会自动修正);如果是多组分

16、的物质如聚合物,盐类等,则各个组分之间以英文的句号 . 隔开。如Component1.Component2。2、 研究主题(Research Topic)您可以使用描述相关主题的词句或词语,查找CAS数据库中的2300万参考文献和MEDLINE中的1340万种参考文献。在“Explore by Research Topic”框中输入描述您的研究主题的单词或短语,例如:the effect of antibiotic residues on dairy products。选择Additional Options按钮可以从出版年、文献类型、语种、著者、公司名称五个方面进行限制。Remove Opt

17、ions按钮可以回到原来的简单主题检索。得到若干候选主题主题词之间的逻辑组配,见图7。可进行多选。选择合适主题,单击Get Reference以检索全部参考文献。图7图8截取了部分相关文献结果,单击右边有“显微镜”的图标,可以查看完整的书目详情及相关参考文献的摘要。单击“电脑”图标,可以查看全文。SciFinder Scholar通过ChemPort连接杂志和专利原文。如果是已经订阅或开放的电子文献,就可以直接查看全文,当然也有可能出现要求付费才能查看的页面。Chemport提供了SciFinder收录的100多年来的许多期刊的全文链接,其中核心期刊1870余种(即每一期每篇文章都有链接,最新

18、的核心期刊列表请访问/sent.html 查看)SciFinder Scholar 是每天更新的数据库,所以很多最新的全文链接也一直被添加进来。SciFinder Scholar中包含了近五百万条专利记录,其涵盖范围请参看/EO/caspat.html 。大部分专利全文都可以在网上免费获得,Chemport也提供了相应的链接。文摘全文图8Analyze/Refine按钮,可以Analyze对所选文献按照年、机构来源、著者等进行分析得到直方图(histogram);或者Refine从研究主题、机构名称、著者名称、出版年、文献类型

19、、语种、数据库、是否可获取全文八个方面对已有的结果进行二次检索。Get Related可以查看关联信息:所选文献引用的文献(Cited Reference),引用所选文献的文献(Citing Reference), 所选文献中的物质(Substance), 所选文献中的反应(Reactions),eScience 可以将您的检索扩展到整个网络。3、 著者姓名(Author Name)1907年至今化学和相关领域内任何作者出版的研究文献,均可通过SciFinder Scholar检索。输入作者姓名时,请记住一定要输入姓氏(Last Name),名字或中间名是可选项。SciFinder Schol

20、ar将提供您所需作者姓名的所有姓氏,包括其它拼写。对于复姓如OSullivan, Chace-Scott, or Johnson Taylor可直接输入;如果带有元音变音的,输入字母即可,或在后面接一个e,会同时搜索名、姓以及姓、名;对于不确认的名,可以输入首字母。4、 文件标识(Document Identifier)如果您可提供专利号,SciFinder Scholar能够将您连接到其电子版本。用专利号进行检索,单击“Document Identifier(文献情报)”,在检索框中键入专利号,一次可输入多个,分行输入。也可以按单击“Read from file”按钮从文件中导入专利号。单击

21、“显微镜”图标,可以查看专利的详情。单击“电脑”图标,可以通过ChemPort Connection SM链接至网站中的电子版专利。下表列出了一些常用的文件标识:NumberExamplesCA Accession Number120:152971994:15297Patent numberCA 2107100Patent application numberJP 1992-502228Priority application numberIT 1998-BO661PubMed ID(National Library of Medicine)20041235、 公司名称和研究机构(Company Name/Organization)SciFinder Scholar让您可轻易地寻找所在研究领域的竞争对手或同事。要按公司或组织进行检索,单击“Company Name/Organization”,输入您要检索的组织名称。要查找该组织是否针对相关主题进行了研究,请使用SciFinder Sch

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