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文档简介
1、 肌动蛋白的克隆与鉴定 王鹏 邓志康 石绮峰 刘允 刘准鑫 刘斌摘要:肌动蛋白是在真核生物中普遍存在的一种古老的蛋白质之一。肌动蛋白是肌动蛋白家族的一员,广泛表达于真核生物非肌细胞中,是构成细胞骨架的维持、细胞运动、细胞分裂等。作为一种细胞质肌动蛋白,肌动蛋白在所有组织中相对持续稳定表达,因此肌动蛋白基因常用作定量研究的对照基因。由管家基因的身份决定,肌动蛋白基因的启动子为强启动子,对于提高转基因表达具有显著的效果,且其表达不受组织的限制。关键词: 肌动蛋白 克隆 分析 一材料与方法1.1组织DNA的提取1.1.1材料细胞裂解缓冲液 蛋白酶K TE缓冲液 酚:氯仿:异戊烷(25:24:1) 1
2、.1.2 过程1.取新鲜或冰冻动物组织块0.1g,尽量剪碎,置于玻璃匀浆器中,加入1mL的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5mL离心管中,加入蛋白酶K20mL,混均,在65C恒温水浴锅中水浴20min,间歇振荡离心管数次,于台式离心机以12000rpm离心5min,取上清液入另一个离心管中。2.加2倍体积异丙醇,倒转混均后,可以看到丝状物,用100mL吸头挑出,晾干,用200mlTE重新溶解。3.加等量的酚:氯仿;异戊醇振荡混均离心12000rpm,5分钟4.取上层溶液至另一试管加入1/2体积的7.5mol/L乙酸铵,加入2倍体积的无水乙醇,混均后室温沉淀2分钟,离心12000rpm,
3、10分钟。5.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上将附于管壁上的残余液滴除掉。6.用1ml70%乙醇洗涤沉淀物离心12000rpm,5分钟。7.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上将附于管壁上的残余液滴除掉。8.加200mlTE重新溶解沉淀物,然后置于4C 或20C保存备用。1.2 PCR1.2.1过程配制25毫升反应体系在PCR板中依次加入模板DNA1uL下游引物,PCR预混液12.5uL ddH2O 9.5uL设置PCR反应体系程序94 5 32个循环 94 30s 55 30s 72 1s72 10s上样,启动反应程序,扩增产物的产物检测1.3电泳1.3.1材料50xTAE缓冲液 1
4、xTAE缓冲液 溴化乙啶贮存液 6x上样缓冲液 DNA样品 DNALadder 琼脂糖1.3.2过程制备1%琼脂糖凝胶:称取1.5g琼脂糖置于锥形瓶中,假如150mlTAE,瓶口倒扣小烧杯100加热煮沸3次,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶。胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽洗干净,晾干,放入制胶玻璃板,取透明胶带将玻璃与内槽两端边缘封好,形成模子将冷却到65左右的琼脂糖凝胶混匀小心倒入内槽,形成均匀胶层。加样:在点样板伤感混合DNA样品和上样缓冲液。电泳:加样后的凝胶立即通电进行电泳,加压110V,样品由负极向正极方向移动。观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显绿色荧光带,拍照保存。1.4连接
5、1.4.1过程与T载体连接(PUD-18T)PUD-18T取0.5-1.0,回收纯化的DNA2(或3-4)看具体浓度加水互补至5l再加入5l solution (冰上助融)共10l在16放置30min之后4过液转化:大肠杆菌(DH5)1. 从-70冰箱中去除感受态细胞,放入冰水中融化,放置大约10min2. 用冷却后无菌吸头将连接好的DNA混合液加入到感受态细胞中(没100l感受态细胞加连接产物5l)轻旋转,混匀内容物,在冰上放置30min3. 再将离心管放到42的水浴锅中热激90s切勿摇动试管4. 迅速转移到冰浴中,使细胞冷却1-2min5. 每管加400l的LB液体培养基,转移到37摇床上
6、,温浴45min转速不超过125转,使细胞复苏(一般得4-5H菌液才能浑浊)摇完后4000rpm离心2-3min,弃去上清200l,使菌液浓度增加,用枪吹打后,再涂平板(此步可在4保存)6. 涂平板,尽量迅速至菌液被吸收,如吸收不完全正放30min之后倒放在37培养箱过液1.5转化1.5.1过程从-70冰箱中取出感受态细胞,放入冰水中融化,大概放置10min;用冷却的无菌吸头将连接好的DNA混合液加入到感受态细胞中(没100L感受态细胞加连接产物5L)轻轻旋转,混匀内容物,在冰上放置30min;再将离心管放到42的水浴锅中热激90s,切勿摇动离心管;迅速转移到冰浴中,使细胞冷却1-2min;每
7、管加400L的LB液体培养基,转移到37摇床上125转,使细胞复苏,摇完后4000rpm离心3min,弃去上清液200L,然后用枪吹打后涂平板,37培养箱中过夜;用枪头挑单菌落接于5mL液体LB培养基中,摇12h后提取质粒。用EcoR 和Hind进行质粒双酶切或PCR鉴定1.6质粒DNA的提取1.6.1 材料1.X-gal(5-溴-4-氯-3吲哚-D半乳糖)X-gal溶于N,N-二甲基甲酰胺中配20mg/ml原液。-20避光保存2.IPTG(异丙基-D半乳糖苷)0.2g/ml分装贮存于-203.氨苄青霉素(Ampiaillin)1g Ampiaillin溶于5ml灭菌水中。配成母液保存于-20
8、1.6.2 方法平板准备:在40微升 X-gal(中加入4微升 IPTG充分混合,在无菌条件下涂布于含AMP(浓度50微升每毫升)的LB平板上将平板至于37恒温箱中2-3h,意识培养基充分吸收色素底物X-gal涂板:将转化菌在无菌条件下涂布于含抗生素和X-gal IPTG的平板上正面朝上放置30分钟,待菌液完全被吸收后倒置平板。37培养12-18h1.7验证PCR扩增实验实验材料:1. 仪器:吸头,PCR仪器,移液枪2. 材料PCR预混液12.5微升,水9.5微升,上游引物1微升,下游引物1微升,组织DNA1微升实验内容及步骤:1配制25微升反应体系,在PCR板中依次加入下列溶液中模板RNA
9、1微升上游1微升 下游引物1微升,PCR预混液12.5微升,ddH2O0.95微升。2.设置PCR反应程序强变性 94摄氏度 5分钟变性 94摄氏度 30秒退火 58摄氏度 30秒延伸 72摄氏度 1分钟最后延伸 72摄氏度 8分钟共32 个循环3. 上样启动反应程序4. 扩增产物的电泳检测(取5毫升)项目:电泳实验所用设备:水电泳槽,电泳仪,凝胶成像分析系统,微波炉,微量移液器,透明胶带,点样板,锥形瓶,量筒,吸头。50XTAE,Tris溶液,EDTA 溶液,去离子水,1XTAE缓冲液琼脂糖溴化乙叮贮存液,溴化乙啶,溴酚蓝,甘油,其他,DNA 样品。实验内容及步骤:1. 琼脂糖凝胶电泳的制备
10、:称取1.5克琼脂糖置于锥形瓶中,加入150毫升 1XTAE 瓶口倒扣小烧杯100摄氏度加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成百分之1琼脂糖凝胶液。2. 胶板制备:取电泳槽内有机玻璃内槽洗干净晾干,放入制胶玻璃板,取透明胶带将玻璃板与槽两端边缘封好形成模子。将内槽置于水平位置,并固定位置放好梳子,将冷却到65摄氏度左右的琼脂糖凝胶完全凝固垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶剂内槽放入电泳槽中,添加1XTAE电泳缓冲液至没过胶板为止。3. 加样:在点样版上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1x,用1微升微量移液管枪分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品应更换一个加样头,以防止污染,加样时五碰坏样品周围的凝胶面。4. 电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60100伏特,样品由负极向正极方向移动,电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离,范围降低,当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1CM处时,停止电泳。5.观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显示出红色荧光条带采用凝胶成像系统拍照保存。二结果分析实验成功提取出目的基因,进行PCR扩增,然后进行电泳,电泳表现出荧光带并且两条荧光带都处在100200bp之间,证明PCR扩增成功。再进行蓝白斑验证时,由于没有立即涂匀氨苄青霉素导致培养基中心青霉素浓度过高,没有生长菌落。从没有加入X-gal和
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