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文档简介

1、一、 实验目的 学习引物设计软件primerpremier5的基本使用方法。二、实验内容 1.从ncbi的数据库 查出hpv-16的e6 e7基因并存为plain text记事本格式。 2.下载并安装primerpremier5,导入key,激活软件.3.打开e6 e7基因序列,显示双链格式.翻译为蛋白序列.找出motif和酶切位点.4.进行primer search,找出sense、antisense及pairs最合适的引物.1.“premier”软件启动界面如下： 2.进行引物设计时，点击“premier”按钮，界面如下：3.进一步点击search按钮，出现“search criteria

2、”窗口，有多种参数可以调整。搜索目的（seach for）有三种选项，pcr 引物（pcr primers） ，测序引物（sequencing primers） ，杂交探针（hybridization probes） 。搜索类型(search type)可选择分别或同时查找上、下游引物（sense/anti-sense primer，或 both） ，或者成对查找（pairs） ，或者分别以适合上、下游引物为主（compatible with sense/anti-sense primer） 。另外还可改变选择区域（search ranges） ， 引物长度 （primer length） ， 选择方式 （search mode） ， 参数选择 （search parameters）等等。使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按 ，随之出现的 search progress窗口中显示 search completed 时，再按 ，这时搜索结果以表格的形式出现，有三种显示方式，上游引物（sense） ，下游引物(anti-sense)，成对显示(pairs)。默认显示为成对方式，

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