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文档简介
1、王镜岩一一生物化学名词解释(2013年2002年)【2013年】1寡聚蛋白质(oligomeric protein ):两条或两条以上具有三级结构的多肽链组成的蛋白 质。(也称多聚蛋白质)。如:血红蛋白(两条a链,两条B链)、己糖激酶(4条a链)。附:仅由一条多肽链构成的蛋白质称为单体蛋白质。如:溶菌酶和肌红蛋白【第三章 蛋白质】(上159)2. 酶的转换数(turnover number,TN):即心,又称催化常数(catalytic constant,K cat)是指在 一定条件下每秒钟每个酶分子转换底物的分子数。(通常来表示酶的催化效率)附:或每秒钟每微摩尔酶分子转换底物的微摩尔数,大多
2、数酶对它们的天然底物的转4换数的变化围是每秒 1到10 (上 321 )【第四章酶】3. 糖的变旋现象(mutarotation ):是当一种旋光异构体,如糖溶于水中转变为几种不同的旋光异构体的平衡混合物时,发生的旋光变化的现象。【第一章 糖类】(上8 ;2013、2008)4. 油脂的酸值(acid number ):是指中和1g油脂中的游离脂肪酸所消耗KOH的毫克数。【第二章脂类和生物膜】(上95)5. 激素受体:位于细胞表面或细胞,结合特异激素并引发细胞响应的蛋白质。【第六章维 生素、激素和抗生素】6. 乙醛酸循环(glyoxylic acid cycle ,GAC ):是一种被修改的三
3、羧酸循环,在两种循环中具有某些相同的酶和产物,但代途径不同,在乙醛酸循环中乙酰CoA首先和草酰乙酸缩合成柠檬酸,然后转变为异柠檬酸,再裂解为琥珀酸和乙醛酸,在这一循环中产生乙醛酸,故称乙醛酸循环。【第八章糖代】(这个循环除两步由异柠檬酸裂合酶和苹果酸合酶催化的反应外,其他的反应都和“柠檬酸循环”相同。)(2013、2012 )资料2:又称三羧酸循环支路,该途径在动物体不存在,只存在于植物和微生 物中,主要在乙醛酸循环体中和线粒体中进行。乙醛酸循环从草酰乙酸与乙酰CoA缩合形成柠檬酸开始,柠檬酸经异构化生成异柠檬酸,与TCA循环不同的是异柠檬酸经异柠檬酸裂解酶裂解为琥珀酸和乙醛酸。乙醛酸与另一分
4、子乙酰CoA在苹果酸合酶的催化下形成苹果酸,最后生成草酰乙酸。该途径中含有两种特异的酶:异柠檬酸裂解酶和苹果酸合酶,其总反应式为:2 乙酰 COA+2NAD +FAD 宀 草酰乙酸 +2CoASH+2NADH+2H +FADH 2。7. 丙酮酸脱氢酶系:8. 呼吸链:由一系列可作为电子载体的酶复合体和辅助因子构成,可将来自还原型辅酶或底物的电子传递给有氧代的最终的电子受体分子氧(也称呼吸电子传递链)【第七章 代总论、生物氧化和生物能学】(2013、2011 )9. 化学渗透学说 (chemios no tic theory ):电子经呼吸链传递的同时,可将质子从膜的基质面排到膜外,造成膜外的电
5、化学梯度,此梯度贮存的能量致使质子顺梯度回流,并使P与ADP生成ATP。【第七章代总论、生物氧化和生物能学】10. 半乳糖血症(galactosemia):人类的一种基因型遗传代缺陷,是由于缺乏1 磷酸半乳糖尿酰转移酶,导致婴儿不能代奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。【第八章糖代】 (2013、2011 )11. 退火(annealing ):热变性的DNA,在缓慢冷却条件下重新形成双链的过程。将热变性的DNA骤然冷却至低温时, DNA不可能复性。退火温度=Tm 25 C【第五章 核酸化 学】12. 柠檬酸穿梭:将乙酰CoA从线粒体转运到细胞质的穿梭循环途径。在转运乙酰CoA的同时,细胞质中 NAD
6、H氧化成NAD + ,NADP+还原为NADPH。每循环一次消耗两分子 ATP.附:柠檬酸循环与柠檬酸穿梭是不同的两中不同代作用,柠檬酸循环就是TCA循环,是乙酰-CoA在线粒体代产生能量的过程【参见王镜岩的生物化学下册,23章P97】,柠檬酸穿梭则是三羧酸转运系统,也叫做柠檬酸-丙酮酸穿梭-是乙酰CoA从线粒体转移到细胞溶胶中【参见王镜岩的生物化学下册, 29章P259】,然后用于合成脂肪酸的物质 的转运过程。TCA是在线粒体消耗乙酰 CoA,而柠檬酸穿梭事将线粒体的乙酰CoA转移。两者根本不同。13. 雷纳综合症(Lesch-Nyhan syn drome ):也称为自毁容貌症,是由于次黄
7、嘌呤 -鸟嘌呤磷酸核糖转移酶的遗传缺陷引起的。缺乏该酶使得次黄嘌呤和鸟嘌呤不能转换为IMP和GMP,而是降解为尿酸,过量尿酸将导致 Lesch-Nyhan综合症。【第十章 氮代】14. 泛素介导的蛋白质降解:15.葡萄糖一丙氨酸循环(也称丙氨酸一葡萄糖循环,alanine-glucose cycle ):肌肉量氨基酸经转氨基作用将氨基转给来自糖代的丙酮酸而形成丙氨酸。后者经血液循环运往肝脏,再经联合脱氨作用将氨放出肝,合成尿素。转氨后生成的丙酮酸可经糖异生作用合成葡萄糖, 它再由血液运到肌肉组织,沿糖代途径转变成丙酮酸,然后再接受氨基形成丙氨酸,如此周而复始地在肌肉和肝脏之间进行氨的转运,将此
8、循环称为“葡萄糖一丙氨酸循环”。【第十章氮代】【2012年】16同源蛋白质(homologous protein ):在不同生物体中行使相同或相近功能的蛋白质称 为同源蛋白质。如:血红蛋白【第三章 蛋白质】 (上181 ; 2012、2010、2003)17. 皂化作用:油脂的碱水解作用称皂化作用。【第二章脂类与生物膜】(上 94 ; 2012、2008)18. 别构效应(allosteric effect):多亚基蛋白质一般具有多个结合部位,结合在蛋白质分子的特定部位上的配体对该分子的其他部位所产生的影响(如改变亲和力或催化能力)称为别构效应。(也称变构效应)资料:当某些寡聚蛋白与别构效应剂
9、发生作用时,可以通过蛋白质构象的变化来改变蛋白质的活性,这种改变可以是活性的增加或减少。 这里的别构效应可以是蛋白质本 身的作用物也可以是作用物以外的物质。【第三章蛋白质】一种分子可以通过分子某一部分的结构改变,而导致激活分子活性改变的现象,即别构效应,也可称变构效应。如:酶的别构效应、血红蛋白的别构效应【第四章 酶】( 上 248; 2012、2008)19. 差向异构体:仅一个手性碳原子的构型不同的非对应异构体称为差向异构体。【第一章 糖类】(上8)20. 酶的催化常数(catalytic number ) (Kcat):也称为转换数。是一个动力学常数,是在底物浓度处于饱和状态下,一个酶(
10、或一个酶活性部位)催化一个反应有多快的测量。催化常数等于最大反应速度除以总的酶浓度(Vmax/EtOtal )。或是每摩酶活性部位每秒钟转化为产物的底物的摩尔数)。【第四章 酶】(2012、2011、2010、2007、2003)21. 柠檬酸循环的双重作用:22. 解偶联剂(uncoupler ):抑制氧化磷酸化过程中的ATP形成,不抑制电子沿呼吸链的传递过程,其结果使氧化作用与ADP的磷酸化作用分开,不再发生偶联,具有上述功能的物质称为解偶联剂。最早发现的一个解偶联剂是2,4-二硝基苯酚(2,4-dinitrophenol,DNP )。【第七章代总论、生物氧化和生物能学】23. Cori循
11、环(也称乳酸循环 Cori Cycle):是指肌肉收缩时(尤其缺氧)通过糖酵解产生大量乳酸,部分乳酸随尿排出, 大部分通过细胞膜弥散入血液,运到肝脏,通过糖异生作用合成肝糖原或葡萄糖补度血糖。血糖可再被肌肉利用,这样形成的循环(肌肉t肝t肌肉)称乳酸循环。【第八章糖代】24. 核糖核苷酸还原酶:25. 氧化磷酸化作用(oxidative phosphorylation) :电子沿呼吸链传递时, 将释放出的自由能 转移并使ADP磷酸化形成ATP,此过程称氧化磷酸化。 【第七章 代总论、生物氧化和生物 能学】26. 增色效应(hyperchromic effect ):当双螺旋DNA熔解(解链)时
12、,260nm处紫外吸收增加的现象。【第五章核酸】(2012、2009、2006、2004、)27. 限制性核酸切酶(restriction en do nuclease ):原核生物细胞存在的一类核酸切酶,能在特异顺序部位切断双链DNA,以破坏入侵的噬菌体DNA,限制其危害。【第一章核酸生物合成】28. 泛素(ubiquitin):是一种存在于真核细胞中的小蛋白,其主要功能是标记需要分解的蛋白质,使其被水解。(2012、2009)也称便在蛋白、泛肽,是一类广泛存在于各种细胞中的高度保守的约含76个氨基酸的小分子蛋白质,参与蛋白质的降解。【蛋白质】29. 脂肪酸合酶系统 (fatty and s
13、ynthase system,FAS ):是一类存在于细胞质中的多酶复合体,能催化脂肪酸合成的一套循环反应。该复合体是由六种酶和脂酰基载体蛋白质组成的。【2011年】30. 酶的比活力(specific activity ):是指每mg酶蛋白具有的酶活力单位。一般用 U/mg蛋 白表示,或用Katal/mg蛋白表示。是衡量酶纯度的一个指标【第四章 酶】(2011、2010)31. 异头物(anomer ):一种糖仅由于端基(羰基)碳原子的构型不同造成的两种立体异构体称为异头物或端基差向异构体。(2011、2004 )仅在氧化数最高的 C原子(异头碳)上具有不同构形的糖分子的两种异构体。32.
14、结构域(domain ):在蛋白质的三级结构的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。也称功能域。【第三章蛋白质】 (2011、200233. 等电聚焦电泳 (IFE, isoelectric focusing electrophoresis ):利用一种特殊的缓冲液 (两性电解质)在聚丙烯酰氨凝胶制造一个 pH梯度,电泳时,每种蛋白质迁移到它的等电点 (pl) 处,即梯度足的某一 pH时,就不再带有净的正或负电荷了。【第三章蛋白质】 (2011、2007)34. 酮体:(acetone bodies):由乙酰CoA在肝进行缩合,水解、还原或脱羧所得的3种产物(乙酰乙酸、B -羟
15、丁酸、丙酮)统称为酮体。酮体为肝脂肪酸代的正常中间产物。(第九章脂代)35. 级联系统(cascade amplification ):在体的不同部位,通过一系列酶的酶促反应来传递一个信息,并且初始信息在传递到系列反应的最后时,信号得到放大,这样的一个系列叫作级联系统。(也称级联放大)【第六章维生素、激素和抗生素】36. 熔解温度(melting temperature,Tm 值):双链DNA熔解彻底变成单链 DNA的温度围 的中点温度。(也称融解温度,变性温度)Tm值就是DNA熔解温度,指把 DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G C含量越高,Tm值越高
16、,成正比关系。【第五章核酸】(2011、2006、2004)【2010年】37. 糖苷(dlycoside ):环状单糖的半缩醛(或半缩酮)羟基与另一化合物发生缩合形成的缩醛(或缩酮)称之为糖苷或苷。【第一章糖类】38. G蛋白(G proteins):是存在于质膜上与GTP结合的一组信号传递蛋白。至今发现有Gs、Gi、Gt、Gp等。激素、递质与受体结合经G蛋白将信号传递给效应器,产生第二信使,从而引起各种细胞效应。【第六章维生素、激素和抗生素】全称鸟苷酸结合蛋白,是细胞质膜上由a、B、丫三种不同分子量亚基组成的三聚体。该三聚体与GDP结合时,G蛋白处于无活性状态,与 GTP结合后a亚基被释放
17、,B、丫亚基 组成二聚体可以分别激活 (Gs)或抑制(Gi)下游信息通路上的靶蛋白。【第十三章 代调控及基因工程】(2010、2007、2005)39. 底物水平磷酸化(substrate phosphorlation ):某些底物(如 1,3二磷酸甘油酸)分子中含有高能磷酸键,可转移至ADP生成ATP,这一过程称为底物水平磷酸化。这种磷酸化与电子传递链无关。【第七章代总论、生物氧化和生物能学】(2010、2009)40. 戊糖磷酸途径(pentose phosphare parhway ):又称为磷酸已糖支(或旁)路(or磷酸戊糖途径)。是一个葡萄糖-6-磷酸经代产生 NADPH和核糖-5-
18、磷酸的途径。该途径包括 氧化和非氧化两个阶段,在氧化阶段,葡萄糖-6-磷酸转化为核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成两分子NADPH ;在非氧化阶段,核酮糖-5-磷酸异构化生成核糖-5-磷酸或转化为酵解的 两用人才个中间代物果糖 -6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。资料:指机体某些组织(如肝、脂肪组织等)以6-磷酸葡萄糖为起始物,在6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化下形成 6-磷酸葡萄糖,进而代生成磷酸戊糖为中间代物的过程,又称为磷酸 己糖旁路。【第八章糖代】41.3-氧化作用(3 -oxidation ):脂肪酸的3 -氧化是脂肪酸的烷基端碳(3-碳原子)被氧化成羟基的反应再进一步氧化成3-羧基,形成a,3 -
19、二羧脂酸,以后可以再二端进行B-氧化而分解。(也称脂(肪)酸的3氧化)【第九章 脂代】(2010、2007 )42. 尿素循环(urea cycle ):是一个由4步酶促反应组成的,可以将来自氨和天冬氨酸的氮 转化为尿素的循环。循环是发生在脊椎动物的肝脏中的一个代循环。即鸟氨酸循环。是将有毒的氨转变为无毒的尿素的循环。肝脏是尿素循环的重要器官。【第十章氮循环】(2010、2005)43. 核苷酸合成补救途径(salvage pathway ):利用体游离的碱基或核苷,经过比较简单的反应过程合成核苷酸。【第十章氮代】【2009年】44. 一碳基团:生物机体合成嘌呤、嘧啶、肌酸、胆碱等化合物时,需
20、要某些氨基酸参与,这些氨基酸提供一个碳原子的化学基团,我们将这种参与生物合成的可以转移一个碳原子的化学基团称为一碳基团或一碳单位。凡事这种有关一个碳原子的转移和代(不包括C02)都统称为一碳基团代。【第十章 氮代】一碳单位(one carbon unit ):某些氨基酸在体可生成含有一个碳原子的基团,如甲基、亚甲基等。45. DNA粘性末端:指环状或线状的双链 DNA分子经限制酶作用后, 都形成线状双链 DNA ,每条单链的一端带有识别顺序中几个互补碱基,这样的末端称为粘性末端。【第一章核酸生物合成】DNA片段或质粒在限制性切核酸酶的切割下,可产生粘性末端,由同一酶切割产生的粘性末端的碱基序列
21、是互补的,在T4DNA连接酶作用下,又可粘接起来。【第十三章代调控及基因工程】【2008年】46. 肽单位(peptide unit ):又称为肽基(peptide group ),是肽键主链上的重复结构。是由参于肽链形成的氮原子,碳原子和它们的4个取代成分:羰基氧原子,酰氨氢原子和两个 相邻a -碳原子组成的一个平面单位。【第三章蛋白质】47. 超二级结构:在球状蛋白质分子里,相邻的二级结构常常在三维折叠中互相靠近,彼此作用,在局部区域形成规则的二级结构聚合体,这就是超二级结构。 常见的超二级结构有aa 3 3 33a3等三种组合形式,另外BaaB和儁结构形式也存在。在超二级结构基础上, 多
22、肽链进一步折叠成球状的三级结构。【第三章蛋白质】(2008、2003 )48. 糖的异生(gluconenogenesis ):由简单的非糖前体转变为糖的过程。糖异生不是糖酵 解的简单逆转。虽然由丙酮酸开始的糖异生利用了糖酵解中的七步进似平衡反应的逆反应,但还必需利用另外四步酵解中不曾出现的酶促反应,绕过酵解过程中不可逆的三个反应。指非糖物质(如丙酮酸、乳酸、甘油、生糖氨基酸等)转变为葡萄糖或糖原的过程。机体只有肝、肾能通过糖异生补充血糖。【第八章 糖代】(2008、2007、2006、2004、2003)49. N 端法则(N-end rude ):天然蛋白被选定为降解蛋白质具有一定的结构特
23、征,被称为N-端法则。【蛋白质的酶促降解】50. 生酮氨基酸(aceto nege nic ami no acid):降解可生成乙酰 CoA或酮体的氨侉酸。【第十章 氮代】(2008、2004、2003 )51. Cot 1/2 (半变cot值):DNA初始浓度(Co)与复性完成一半时的时间的乘积(t1/2)。【第五章核酸化学】附:它对一特定DNA分子(或基因组)来说是个常数,由于此值随复性DNA相对分子质量的增加而增大,因此可用来描述一物种基因组的大小。52. DNA变性(DNAdenaturation) :DNA双链解链,分离成两条单链的现象。【第五章核酸】 (2008、2007、2002
24、)【2007年】53. 蛋白聚糖(proteoglycans ):是指以一种长而不分枝的粘多糖为主体,在糖的某些部位上共价结合若干肽链而生成的复合物。【第一章糖类】是由糖胺聚糖和蛋白质共价结合形成的复合物。【第八章糖代】54. 甘油磷脂(glycerophospholipid ,glycerol phosphatide): 也称磷酸甘油酯(phophoglyceride ),由甘油、脂肪酸、磷酸和其他基团(如胆碱、氨基乙醇、丝氨酸、脂酰基等中的一种或二种)所组成,是磷脂酸的衍生物。【第二章脂类和生物膜】55. 限速酶:指整条代通路中催化反应速度最慢的酶,它不但可以影响整条代途径的总速度,还可改
25、变代的方向。【第十三章代调控及基因工程】56. 半保留复制(semiconservativereplication) : DNA复制是以 DNA的两条链为模版,以dNTP为原料,在DNA聚合酶作用下按照碱基配对规律(AT; GC)合成新的互补链,这样形成的两个子代 DNA分子与原来的DNA分子完全相同,故称之为复制。又因子代DNA分子的双链一条来自亲代,另一条是新合成的,故名半保留复制。【第十一章核酸生物合成】资料2 :指DNA在复制过程中,分别以两条链为模版,合成其互补链,新生的互补链与母 链构成子代DNA分子。这种复制方式称为半保留复制。57. 密码的简并性:同一种氨基酸具有两个或更多个密
26、码子的现象称为密码子的简并性。(也就是多个密码子可以编码同一个氨基酸)编码同一种氨基酸的不同密码子可以称为同义密码子或简并密码子。【第十二章蛋白质生物合成】【2006年】58. 错义突变(missense mutation ):碱基序列的改变引起了产物氨基酸序列的改变,称为 错义突变。59. Leucine zipper(亮氨酸拉链):出现地 DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的一种结构基元(motif )。当来自同一个或不同多肽链的两个两用性的a-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸残基)相互作用形成一个圈对圈的二聚体结构时就形成了亮氨酸拉链。资料1:这是真核生物转录调控蛋白及与DNA结合的模体(mot
27、if )之一。两个蛋白质分子近端肽段各自形成两性a-螺旋,a -螺旋的肽段每隔七个氨基酸残基出现一个亮氨酸残基,两个a -螺旋的疏水面互相靠拢,两排亮氨酸残基疏水侧链排列成拉链状形成疏水键 使蛋白质结合成二聚体,a -螺旋的上游富含碱性氨基酸( Arg、Lys)肽段借Arg、Lys侧链 基团互相结合而实现蛋白质与DNA的特异结合。【第十三章代调控及基因工程】资料2:是反式作用因子 DNA结合结构域中的一种基序结构。由约35个氨基酸残基形成的两性卷曲螺旋型a -螺旋。疏水侧链位于一侧解离基团位于另一侧,每两圈螺旋有一 个亮氨酸,单体通过疏水侧链二聚化,形成拉链。该结构借助N端a-螺旋而与DNA结
28、合起作用。这种结构成为亮氨酸拉链结构。60. Nonsense mutation(无义突变):碱基的改变使编码某种氨基酸的密码子变成了蛋白质合 成的终止密码子,称为无义突变。61. Ribozyme (核酶):是具有自身催化剪接作用的RNA,它催化RNA自身含子切除和外显子的。【第十一章核酸生物合成】可切割特异性 RNA序列的RNA分子。【第十三章代调控及基因工程】附:1982年,Cech首次发现四膜虫的26SrRNA前体的含子具有自我催化剪接的能力。具有催化活性的RNA分子,最早是在研究四膜虫 RNA自我剪接去除含子的过程中发现的。【第五章核酸化学】62. Holliday structur
29、e (霍利迪结构):指发生同源重组的两个 DNA分子双链交叉在一起所 形成的四分支结构,是同源重组中异源链间发生交换所必经的结构模式。63. Heterogeneous nuclear RNA(核不均一 RNA , hnRNA ):在核存在的一大群不同大小的RNA分子,包括 mRNA前体和其他类型的 RNA。【第五章核酸化学】【2005年】64. 抗体酶:利用人工合成的底物过渡态类似物作半抗原免疫动物制得的单克隆抗体具有催化该反应的潜力,这种具有催化能力的抗体称抗体酶或抗体催化剂。是一种具有催化能力的蛋白质,其本质上是免疫球蛋白,但是在易变区被赋予了酶的属 性,所以又称为“催化性抗体”。65.
30、 单糖异头物:66. 还原力:NADH,在还原性生物中起负氢离子供体的作用。67. 限制性切酶(restriction endonuclease ):种在特殊核甘酸序列处水解双链DNA的切酶。I型限制性切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而H型限制性切酶只催化非甲基化的DNA的水解。【第五章核酸】68. 开放阅读框架(open reading frame,ORF ):也称开放读码框。DNA或RNA序列中一段不含终止密码的连续的非重叠核苷酸密码。【第十二章蛋白质生物合成】指DNA或RNA分子中一组连续的不重叠的密码(不包括终止子)。从 DNA序列确定 开放阅读框的方法是
31、,一组不含终止密码的编码序列即为一个开放阅读框。【第十三章 代调控及基因工程】资料2 :指在翻译中,没有部终止密码的阅读序列区域,通常指从起始密码到终止密码 处的序列。由于起始阅读碱基的不同,同一段序列可有三种阅读情况,形成三种阅读框。69. 启动子(promoter ):在DNA分子中,RNA聚合酶能够结合并导致转录起始的序列。 【第十一章核酸生物合成】DNA分子上结合RNA聚合酶并形成转录起始复合物的区域,在许多情况下还包括促进这一过程的调节蛋白质结合位点。【第十三章代调控及基因工程】70. 反转录病毒(Retrovirus):又称逆转录病毒,是 RNA病毒的一种,它们的遗传信息不 是存录在脱氧核糖核酸(DNA),而是存录在核糖核酸(RNA)上,此类病毒多具有逆转录 酶。简明教程:第四类病毒的RNA进入宿主细胞后,要在逆转录酶的作用下,合成与其碱基序列互补的 DNA,称作互补 DNA ( complementary DNA,cDNA ),再由cDNA转录生成 mRNA指导蛋白质的合成,这类病毒被称作逆转录病毒。71. 酵母人工染色体 (
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