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文档简介
1、Q-PCR实验流程一、 总RNA抽提1)细胞培养皿中细胞样品用1X PBS洗两次后,用1ml枪将PBS吸干净,加入1ml Trizol (invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5ml RNase free EP管中使细胞充分裂解,室温静置5min;组织样品用液氮充分研磨,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,混匀,室温放置5min使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)2)加入200l氯仿(5X),剧烈振荡混匀1min,使水相和有机相充分接触,室温静置3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好,与第一步的顺序一致)3) 4下,14
2、000g离心5min,可见分为三层,RNA在上层水相,移至另一个新的RNase free EP管;(用20-200ul的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面上层吸取上清,枪头不可碰到、吸到中间层)4)沉淀RNA:加入等体积(1:1)异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次)(不应用振荡器混匀),室温静置10min;5)4下,14000g离心15min,收集RNA沉淀(如离心后仍不见EP管底部有沉淀,应将EP管放置在-80度冰箱过夜,继续在4下,14000g离心10min,收集RNA沉淀),去上清;6)用75%乙醇洗涤两次,12000g离心5min(加入乙醇后只需轻轻颠倒EP管即可,不用振荡器震荡或
3、枪头吸打沉淀),弃去上清液,空甩一次,以完全去除乙醇,开盖晾35min,反复2次,挥干,使样品变透明。 7)视沉淀量加入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。,打散,备用。二、反转录1) 在RNase free的PCR管中配置下列溶液.Oligd T1 ulRNA4 ulDEPC水3 ul2) 将上述溶液吹打均匀,置70保温5min,使RNA变性。随后4,保持5min, 以防止RNA复性;3) 在该PCR管中加入下列试剂(M-MLV Reverse Transcriptate)E1 uldNTP4 ulMgcl23 ulM-MLV RT 5X buffer4 ul4) 将上述20l反应溶液混
4、匀,空甩,开始反转录:25保温10min;42保温60min;70保温15min;4,。三、调cDNA浓度反转结束后,每个样品加入80 ul的超纯水,混匀,用微量分光光度计检测浓度,先用超纯水校准。20 ul(cDNA)+ 80 ul超纯水100 ul(cDNA)然后将各样品的cDNA浓度调至150 ng/ul.初始浓度 X 100 = 150 X (水 + 100) 加水量 = 初始浓度 X 100/150 100.四、PCR:20 ul 体系酶E10 ul模版2 ul引物2.5 ul水5.5 ul离心甩匀后,放入PCR扩增器中,设置反应体系。五电泳 配胶:1.5% 80 ml 1 X TBE + 1.2 g 琼脂微波3 min,使之澄清,加入8 ul Gelred摇匀(与TBE 1:10000),加入板上,
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