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文档简介
1、GAUSSION计算常见错误及解决方案1. 自旋多重度错误2. 变量赋值为整数3. 变量没有赋值4. 键角小于等于0度,大于等于180度5. 分子描述后面没有空行6. 二面角判断错误,造成两个原子距离过近7. 分子描述一行内两次参考同一原子,或参考原子共线运行出错1. 自洽场不收敛 SCFa. 修改坐标,使之合理b. 改变初始猜 Guessc. 增加叠代次数SCFCYC=Nd. iop (5/13=1 )2. 分子对称性改变a. 修改坐标,强制高对称性或放松对称性b. 给出精确的、对称性确定的角度和二面角c. 放松对称性判据 Symm=loosed. 不做对称性检查 iop(2/16=1)3.
2、 无法写大的 Scratch文件RWFa. 劈裂RWF文件%rwf=loc1,size1,loc2,size2,-1- .,locN,b. 改变计算方法 MP2=Direct可以少占硬盘空间c. 限制最大硬盘 maxdisk=N GB4. FOPT出错原因是变量数与分子自由度数不相等。可用POPT或直接用OPT5. 优化过渡态只能做一个STEP原因是负本征数目不对添加iop (1/11 ) =16. 组态相互作用计算中相关能叠代次数不够,增加叠代次数QCISD ( Maxcyc=N )Default.Rou 设置?在Scratch文件夹中的Default.Rou文件中设置G03程序运行的省缺参
3、数:?-M- 200MW?-P- 4?-#- MaxDisk=10GB?-#- SCF=Conventional or Direct?-#- MP2=NoDirect orDirect?-#- OPTCYC=200?-#- SCFCYC=200?-#- lOPs 设置如iop (2/16=1 )Default.Rou设置中的冲突? Default route: MaxDisk=2GB SCF=Direct MP2=Direct OPTCYC=200 SCFcyc=100 iop(2/16=1) iop(5/13=1)# ccsd/6-31G* optL903/L905 and L906 can
4、 only do MP2.问题在于,M P2=Direct !去掉这个设置,CCSD的作业就能进行了。因此,建议在 Default设置中只设置,内存,取大硬盘,等项振动分析的关键词振动分析的选项拉曼光谱Raman非谐性Anharmonic势能函数不是简谐的内转动,受阻转子Hinderedrotor力常数过小的转动振-转耦合VibRot振动圆二色性VCD用于光活性分子问位素效应,温度,压力 ReadIsotopes不影响频率数值算法选项:解析频率Analytic数值频率Numeric二阶导数数值EnonlyFREQ的缺省设置是:有解析方式就计算解析频率,不计算Raman性质MP3, MP4, C
5、ISD,CCSD, QCISD等方法没有解析频率,只能算数值频率。一般各种理论方法下,计算的频率和实验测得频率之间有系统误差,需要用松正因子松正(Scale Factor )各种方法计算频率的Scale因子方法:约化因子约化因子(频率)(ZPE)HF/3-21G0.90850.9409HF/6-31G(d)0.89290.9135MP2(Full)/6-31G(d)0.94270.9646MP2(FC)/6-31G(d)0.94340.9676BLYP/6-31G(d)0.99401.0119B3LYP/6-31G(d)0.96130.9804SVWN/6-31G(d)0.98331.0079
6、Freq=ReadIsotopes输入# 。Freq=ReadIsotopes 。Title0 2HO 1 0.98298.15 1.5 0.8929温度,压力 约化因子H 2用质量数是2 (程序读取精确值)的问位素O 18用质量数是18 (程序读取精确值)的问位素空行Freq=(ReadFC, ReadIsotopes )同一方法基组下计算不同同位素的力常数矩阵(Hessian)相同,因此从前面频率计算的chechpoint文件里读取力常数,计算同位素效应的频率和热力学性质,可以节省许多时间。注:同种元素的不同同位素,几何结构是相同的,电子结构也是相同的。也可以用Freqcheck.exe工
7、具做不同温度,压力,同位素的热力学分析。数值频率问题?数值频率计算不需要很大内存和硬盘空间,但是精度较差,时间也长。Freq=(Numeric,(Step=N)Step用于指定微分步长,缺省为 0.001*5 AngstromFreq=Enonly 计算解析一阶导数。数值二阶导数 振动分析中的问题?振动分析原则上只对稳定点有意义?振动分析一定要在结构优化相同的方法和基组上进行。?理论计算的振动频率和试验结果有系统误差,需要乘以Scale因子校正?考虑相关能方法的解析频率计算需要大的硬盘和内存Warning - explicit consideration of 3 degrees of fre
8、edom as vibrations may cause significant error ?如果出现这个警告,一般来说是出现两个方面的问题:1. 优化的结构不够精确,需要用更严格收敛判据优化。2. 有3个振动模式实际上应该按内转动处理。包括:自由转子模型,受阻转子模型。内转动模式对热力学性质计算有影响,特别是低频模式 稳定点优化中出现小的虚频问题1。 优化的结构还不是局域极小值点,需要用更严格的收敛判据优化。OPT (tight or verytight )2。对应转动模式的虚频,可以用稍微修改转动模式对应的二面角,使之合理。3。用 OPT=CalcAll 来计算结构优化和频率计算中的常见
9、错误1. 自洽场不收敛 SCF Convergence Failurea. 修改坐标,使之合理b. 改变初始猜 Guessc. 增加叠代次数 SCFCYC=Nd. 先用较松的SCF判据优化结束后再用正常SCF判据优化e. 不管不收敛,继续计算,iop (5/13=1 )f. 尝试用SCF=qc算法2. 分子对称性改变a.修改坐标,强制高对称性或放松对称性b.给出精确的、对称性确定的角度和二面角如对Td对称性,二面角值给为,109.47122 度c.放松对称性 判据 Symm=loose d.不做对称性检查 NoSymm 或 iop(2/16=1)可用POPT或直接用OPT3. FOPT出错原因是变量数与分子自由度数不相等。4. 超出最大优化圈数 Step Exceed?检查分子结构是否合理,如合理可增加循环圈数,OPTCYC=N?读取Checkpoint文件最后几何,继续优化。?选取上次优化过程中最好的几何结构继续优化。GEOM=(step=n)5. 无法写大的
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