NCBI上传序列的方法

1、向 NCBI提交序列常用的程序有两个，一个是在线提交的BankIt，一个是用软件Sequin。用那种办法，根据不同的需要。一BankIt:（在线提交页面：/BankIt/index.html）1 . 适合单个或少量几个的提交2 .喜欢用在线的方式提交，无需下载个软件3 .你的序列的注释不复杂4 .提交你的序列时不需要用到序列的分析1 . 提交的是批量而且比较复杂的序列2 .you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented set

2、s3 .喜欢图形的界面，有更的选项和功能，可以批量修改4 .获得相关的分析工具这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt， Sequin 也是大同小异的。1 ，过入 GenBank2，左栏点击Submit to GenBank3，左边出现几个工具的选择，点击BankIt。在BankIt 提交页面的最下面，填上你要提交的序列的长度，点New4，点New 后，会生成一个bankit 号，记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊，序列之类的5， 填好资料后，你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误，点提交 ( Validate and continue )6，如果你填的资料有误，或漏填了。

3、就会有ERROR的提醒。像名字，电话，Email，序列等都是必须的。最后 NCBI会给您发个邮件，等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了，如果有问题 NCBI会邮件和您联系。如果是用Sequin，填好资料过程中可以随时保存，最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。差不多就是这样，其它细节问题。自己琢磨琢磨去本文详细出处参考：/466/二Sequi(n 下载页面：/Sequin/index.html )Sequin 介绍1. 提交的是批量而且比较复杂的序列2 .you are submi

4、tting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets3 .喜欢图形的界面，有更的选项和功能，可以批量修改4 .获得相关的分析工具5 .随时可以保存Sequin 提交序列图解教程1 ， Sequin 开始界面开始一个新的提交或是选择编辑已有保存的文件(Read Existing Record) ，用 Sequin 的好处就是你可以保存下来，可以随时修改。直到满意后再向NCBI 提交。2，输入Title，作者，联系方式等Title 是必须的。自行添写一个。然后点 Next Page到 Contact菜单

5、， 添加联系方式。再 Next Page，填写作者等。能填写的就填上，越详细当然是越好的。不知道的话可以跳过，因为后面也是可以重新修改的。3，添加序列准备一个Fasta格式的序列。保存在一个文件。可以选择单个序列或是批量序列。其它的 Type都是比较特殊，不常见。4，添加序列的注释信息上传了序列之后，点击Next Page继续添加序列的信息，如属于哪个物种的，序列注释。有没有蛋白序列等。这里也是一样，能填的就填上，不懂就Next。后面也是可以修改的。5， GenBank 格式的界面，最后修改Edit菜单上面的步骤都完了之后。出现一个GenBank 格式的界面，如下图。在这里，一切信息就一目了然。那里不对，需要修改的。双击就行了。另外，在Edit 菜单比较修改作者、联系方式等资料。Annotate 菜单在 Annotate 菜单可以添加序列的注释，也可以批量添加。如加CDS区，exon 区等等。其格式可以参照其它序列的GenBank 格式。6，保存序列如果在中途要临时保存，在File 菜单的Save，保存后的文件是.sqn。全部修改完毕后，选择File/Submission。就会有一个提示框，提示把保存后的发送一封邮件到NCBI。7，发送邮件提