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1、附件6 RT-PCR检测汉坦病毒基因及分型材料:(1)急性期病人血清、鼠肺、鼠血或分离的汉坦病毒(2)引物:引物序列(53)位置片段(bp)逆转录引物TAGTAGTAGACTCC114LMS通用外引物AAAGTAGGTGITAYATCYTIACAATGTGG19101939M(+)GTACAICCTGTRCCIACCCC23732354M(-)型特异性引物汉滩病毒GAATCGATACTGTGGGCTGCAAGTGC19581984M(+)GGATTAGAACCCCAGCTCGTCTC23182340M()汉城病毒GTGGACTCTTCTTCTCATTATT19361957M(+)TGGGCAA
2、TCTGGGGGGTTGCATG23312353M()S片段引物ATGTTGCCTGGGGIAAAGAGG12001220S(+)GCGCACTAGTAGTAGTAGACTCCCTAAAGA16701696S(-)方法:(1)病毒RNA的提取:采用TRIzol按说明提取,制备模板RNA;(2)逆转录、合成cDNA:采用SuperScripTMII或AMV逆转录酶,按说明书进行;(3)PCR扩增:反应条件为95预变性10分钟,9460秒、5560秒、7245秒、扩增3035个循环,72延伸12分钟。(4)扩增产物用12琼脂糖凝胶电泳鉴定。若条带的分子量与预期片段大小相同,则表明为特异性扩增产物。必要时,可进行:(5)PCR片段的回收和核苷酸序列测定:切下特异分子量条带,用QIAquick凝胶回收试剂盒回收(按其说明书进行),自动测序仪测序。意义:扩增到特异性条带可
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